BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291N21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 92,212,821 - 92,364,604
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545, LOC100039286, Car10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291N21.bB6Ng01-291N21.g
ACCGA088646GA088647
length1,199315
definitionB6Ng01-291N21.b B6Ng01-291N21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,363,408 - 92,364,604)(92,212,821 - 92,213,141)
sequence
gaattctgtatatgcaaatctgctatgtttgatccatcattccattacaa
acacattttccagctttttaatcccccattttatttggctcttgagtaag
aatgcttatgaaatagtatgttgttttctttttatctttcaagcaaaaca
tctatgtggcatatacacaccacactacatatgtggagagatggaaatat
caaaatacataatgttgaattaacaatagttgatgcttatttaagaagtt
agtctgaacacagtgcatgagatgggaaatctttttttttctcaattaaa
catagatagcatctatggaattccagttttgttaggcataagttgaaaac
ttttttttttgtcttgtacatttgtctgtctctctattgttcaaacaggt
aagttttccaggcctgataacacaaatctgcaatcctgtcactctggatg
ttgccacaagttcagtatttcagggactgcatgagcaacacaccaacttc
cagtagtctaggtttgctatctcaaacagttaaataaaacatacaaattt
attgactgttttgatattttcaattatctattagaccaaggaactgctct
ttataaattcaataatataatcaataatttttccaaataatgaaatcact
gaatcttagttttaaaagtctatttggaatttttattatatacaaattta
tagattacttgaaatgatttattatttttaaacactacatctttatagat
gatataataaaatataaaacgtgtcctatggtcagaaattctataataaa
gtatcctgacacactcaaacttttagttctaatcttcatatctttacaaa
attatataaattcatgatcagtgtactggctagttttgtgtcaacttgac
acaagctggagttatcacagagaaaggagctttcagttgaggaaatgcct
ccatgagatccaactgttaagacatttttctcattagtgatcaaggggga
aaagcgccttgtgggtggaccatctctggcttgtagttcttggattctaa
taagagagcagatgagctagccagggagccaggccagttaagaacatccc
tccatggctctgcatcagcttctgctttctgacctgtatgaacttcagtc
tgacttcctttggttgaatcaacagcactgtggaagtgttaagcctgaa
tctgcaagagtagcaagcactcttaaccactgagctttcttaccagcttc
catatatatatgtatacaaagataggattgtaaatcccacagcatatcca
atctaactattgcaagttacattctgaaagcaatatagtacccaaaccta
acagcaagacttcatctatggattactgtgtgtcctggaattgagcacct
gtgaaaaaatgatgagattagcaaatttgatatcttatgaaatgagctaa
tgtttttaaacatatacatatgtatgtatatatgtatgtatatatgtatg
tatatatgtatatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_92363408_92364604
seq2: B6Ng01-291N21.b_46_1244 (reverse)

seq1  TTCA-GCTT-ACACTTCCACATTGCTGTTGAT--CACCAAAGGAAGTCAG  46
      |||| |||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| 
seq2  TTCAGGCTTAACACTTCCACAGTGCTGTTGATTCAACCAAAGGAAGTCA-  49

seq1  GACTGAAACTCAAACAGGTCAGGAAGCAGGAGCTGATGCAGAGGCCATGG  96
      |||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||
seq2  GACTGAAGTTCATACAGGTCAGAAAGCAGAAGCTGATGCAGA-GCCATGG  98

seq1  AGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCCCCTGGCTTGCTCATCCTGCTCTC  146
      |||||||||||| |||||| ||  | |||||||| |||||| ||||||||
seq2  AGGGATGTTCTTAACTGGCCTGGCT-CCCTGGCTAGCTCAT-CTGCTCTC  146

seq1  TTA-TAGAATCCAAG-ACTACCAGCCCAGAGATGGTCCCACCCACAAGGC  194
      ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTATTAGAATCCAAGAACTACAAG-CCAGAGATGGT-CCACCCACAAGGC  194

seq1  GCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAG-AAAATGTCTT-ACAGTTGGATC  242
      || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||
seq2  GCTTTTCCCCCTTGATCACTAA-TGAGAAAAATGTCTTAACAGTTGGATC  243

seq1  TCATGGAGGCATTTCCTCAACTG-AAGCTCCTTTCTCTGTGATAACTCCA  291
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAAGCTCCTTTCTCTGTGATAACTCCA  293

seq1  GCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGTACACTGATCATGAATTTA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAGTACACTGATCATGAATTTA  343

seq1  TATAATTTTGTAAAGATATGAAGATTAGAACTAAAAGTTTGAGTGTGTCA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTTTGTAAAGATATGAAGATTAGAACTAAAAGTTTGAGTGTGTCA  393

seq1  GGATACTTTATTATAGAATTTCTGACCATAGGACACGTTTTATATTTTAT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACTTTATTATAGAATTTCTGACCATAGGACACGTTTTATATTTTAT  443

seq1  TATATCATCTATAAAGATGTAGTGTTTAAAAATAATAAATCATTTCAAGT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCATCTATAAAGATGTAGTGTTTAAAAATAATAAATCATTTCAAGT  493

seq1  AATCTATAAATTTGTATATAATAAAAATTCCAAATAGACTTTTAAAACTA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATAAATTTGTATATAATAAAAATTCCAAATAGACTTTTAAAACTA  543

seq1  AGATTCAGTGATTTCATTATTTGGAAAAATTATTGATTATATTATTGAAT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCAGTGATTTCATTATTTGGAAAAATTATTGATTATATTATTGAAT  593

seq1  TTATAAAGAGCAGTTCCTTGGTCTAATAGATAATTGAAAATATCAAAACA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAAGAGCAGTTCCTTGGTCTAATAGATAATTGAAAATATCAAAACA  643

seq1  GTCAATAAATTTGTATGTTTTATTTAACTGTTTGAGATAGCAAACCTAGA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATAAATTTGTATGTTTTATTTAACTGTTTGAGATAGCAAACCTAGA  693

seq1  CTACTGGAAGTTGGTGTGTTGCTCATGCAGTCCCTGAAATACTGAACTTG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGGAAGTTGGTGTGTTGCTCATGCAGTCCCTGAAATACTGAACTTG  743

seq1  TGGCAACATCCAGAGTGACAGGATTGCAGATTTGTGTTATCAGGCCTGGA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAACATCCAGAGTGACAGGATTGCAGATTTGTGTTATCAGGCCTGGA  793

seq1  AAACTTACCTGTTTGAACAATAGAGAGACAGACAAATGTACAAGACAAAA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACCTGTTTGAACAATAGAGAGACAGACAAATGTACAAGACAAAA  843

seq1  AAAAAAGTTTTCAACTTATGCCTAACAAAACTGGAATTCCATAGATGCTA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGTTTTCAACTTATGCCTAACAAAACTGGAATTCCATAGATGCTA  893

seq1  TCTATGTTTAATTGAGAAAAAAAAAGATTTCCCATCTCATGCACTGTGTT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGTTTAATTGAGAAAAAAAAAGATTTCCCATCTCATGCACTGTGTT  943

seq1  CAGACTAACTTCTTAAATAAGCATCAACTATTGTTAATTCAACATTATGT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTAACTTCTTAAATAAGCATCAACTATTGTTAATTCAACATTATGT  993

seq1  ATTTTGATATTTCCATCTCTCCACATATGTAGTGTGGTGTGTATATGCCA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGATATTTCCATCTCTCCACATATGTAGTGTGGTGTGTATATGCCA  1043

seq1  CATAGATGTTTTGCTTGAAAGATAAAAAGAAAACAACATACTATTTCATA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGATGTTTTGCTTGAAAGATAAAAAGAAAACAACATACTATTTCATA  1093

seq1  AGCATTCTTACTCAAGAGCCAAATAAAATGGGGGATTAAAAAGCTGGAAA  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTCTTACTCAAGAGCCAAATAAAATGGGGGATTAAAAAGCTGGAAA  1143

seq1  ATGTGTTTGTAATGGAATGATGGATCAAACATAGCAGATTTGCATATACA  1191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTGTAATGGAATGATGGATCAAACATAGCAGATTTGCATATACA  1193

seq1  GAATTC  1197
      ||||||
seq2  GAATTC  1199

seq1: chr11_92212821_92213141
seq2: B6Ng01-291N21.g_66_386

seq1  GAATTCTCTGCAAGAGTAGCAAGCACTCTTAACCACTGAGCTTTCTTACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGCAAGAGTAGCAAGCACTCTTAACCACTGAGCTTTCTTACC  50

seq1  AGCTTCCATATATATATGTATACAAAGATAGGATTGTAAATCCCACAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCATATATATATGTATACAAAGATAGGATTGTAAATCCCACAGCA  100

seq1  TATCCAATCTAACTATTGCAAGTTACATTCTGAAAGCAATATAGTACCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCAATCTAACTATTGCAAGTTACATTCTGAAAGCAATATAGTACCCA  150

seq1  AACCTAACAGCAAGACTTCATCTATGGATTACTGTGTGTCCTGGAATTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAACAGCAAGACTTCATCTATGGATTACTGTGTGTCCTGGAATTGA  200

seq1  GCACCTGTGAAAAAATGATGAGATTAGCAAATTTGATATCTTATGAAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTGTGAAAAAATGATGAGATTAGCAAATTTGATATCTTATGAAATG  250

seq1  AGCTAATGTTTTTAAACATATACATATGTATGTATATATGTATGTATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAATGTTTTTAAACATATACATATGTATGTATATATGTATGTATATA  300

seq1  TGTATGTATATATGTATATGT  321
      |||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTATATATGTATATGT  321