BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298H07
Chromosome11 (Build37)
Map Location 91,996,278 - 92,158,571
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545, LOC100039286, Car10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298H07.bB6Ng01-298H07.g
ACCGA093556GA093557
length1,1521,142
definitionB6Ng01-298H07.b B6Ng01-298H07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,996,278 - 91,997,435)(92,157,437 - 92,158,571)
sequence
gaattcaatctgtactccaagtacagctgaacatgtgactttgatgttct
tcctgctccagcctctagagaccctgggattgcaggcttgggctgccaag
cctgactcacattgaggacttctatagtatacttctttgtccttagcctg
gactgctgtgtggaaaggagaggggagatctgcagggagctgaagtcaca
gcaggataggatatcccttgggatgacaaatgtagagaagatgaccatga
tgtgaagggcaagaagacctttttctacagaattctttatgctgtggaaa
accttagttatttggggagaaagggtgccatacaaatgcaaatggttgga
ttactaaattagcttctgctaccattgtctttctcccccttgtcttctga
gagcatgattaatgcaggtcacattattggactgtgaaataaagaaatag
aatggcactttcccctgggtaagaagtacagtattcagaatgaacaaagc
tgcaaacccctcatccttcacttccagtctcagattcacatttaaaaaga
aaaaaagtcacctttggagaattgattatttgattctctctacttacact
gatgatgtgcaaagcaaacaaaattatttcaaacaagcagagagttgtgc
taatagttaagcgcctcaggatttattctattgtcctgaaaaacttcaat
attgaaactccatggtcaagctctctttatttttaatcttgaaagcattt
aaaaactcatgcaggctgaacaatatacacaataggctccgtgacaattg
tcctgtcatgtgtagtcttattacttgatatattgcaaaggggattggat
gcccaggcctaaaaagcctctattactaaggtttggttgcttagttattt
ttcagtactgatccctttggatcaaatttacataagaatgtagtggtttt
ggtctgcctttgctaattgagtcttcattggacatgagagggcagtattt
tcctagctttgcttagagtcatgtcactcctacaaggttaggaacttatt
ctaatcagtcttcacattactctaacttgtgacaatgtaatatttccatg
tgtttattttcttaactagttcgttatacatacaaaaatattttgaagca
ca
gaattccaaatcatggagtgggccttaaatccaatcagttattggttggc
tacttccacaagctttgcaccagcaaggcatgactatgtctcacaggcag
gtgactgctatagatctaaaatttaaaactgtgttggtgtttacctttct
attttggtggtgttcagagtaccttcagtaccagaacaataatcagcagg
ggtaaaggtttttggtaggcactagctagacttctctgtgtttaatgagt
tgtgtaagtgctgtcttcagtaatagggctttaccatcagtttgtgggga
atcaatcaatagtctggttgtttgggagttactaaagggcccctttggtc
aataactcaattaaatgtaaccaatcctggaactggcagcttcatttcat
tgtgagatatgtctggttggcaatttcctaaggtggaccacttttacttc
agactttagtaacaaccaccttctccttctccacacactccatgctactg
ctgaagtcacacaacactttctgcctggcatgactttttccatttttcgt
taaataggctgtaagattttcttgtatttcttaagagtttctcttaatta
ctcgtgtaataatatcctttctgtattttcttattctactatgtgaaaac
tgcaatgttatgattgaaaatatcattacttatttttgtgggcataacaa
ctgattgaaaaaagactattgtagttagagttctattgctgtgaagggac
agcatgaccaaagcaagtctttcaaagtaaatattgaattgggagtggct
tacaatttcagaggtttattcaattatccttatggtggaaagcatgtctt
catgcagacagattttgtgctggaggagccaagagttccacatcttcatc
ttaaggcagccaggaggaggctgtattccacagctaggatgaggtgctca
taccaccactgtgtagagcttcatcttttgaaacttcaaagcctgccaac
aggtgacacactttttcttcaaccaggtcccctccctcctccaacaggtc
atacctttctagtagcgtcattctctcttatggcctgaacattccaacac
ccacaatctccgagggattaccttttttaaccaccacatcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_91996278_91997435
seq2: B6Ng01-298H07.b_49_1200

seq1  GAATTCAATCTGTACTCCAAGTACAGCTGAACATGTGACTTTGATGTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCTGTACTCCAAGTACAGCTGAACATGTGACTTTGATGTTCT  50

seq1  TCCTGCTCCAGCCTCTAGAGACCCTGGGATTGCAGGCTTGGGCTGCCAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTCCAGCCTCTAGAGACCCTGGGATTGCAGGCTTGGGCTGCCAAG  100

seq1  CCTGACTCACATTGAGGACTTCTATAGTATACTTCTTTGTCCTTAGCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACTCACATTGAGGACTTCTATAGTATACTTCTTTGTCCTTAGCCTG  150

seq1  GACTGCTGTGTGGAAAGGAGAGGGGAGATCTGCAGGGAGCTGAAGTCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTGTGTGGAAAGGAGAGGGGAGATCTGCAGGGAGCTGAAGTCACA  200

seq1  GCAGGATAGGATATCCCTTGGGATGACAAATGTAGAGAAGATGACCATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGATAGGATATCCCTTGGGATGACAAATGTAGAGAAGATGACCATGA  250

seq1  TGTGAAGGGCAAGAAGACCTTTTTCTACAGAATTCTTTATGCTGTGGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGGGCAAGAAGACCTTTTTCTACAGAATTCTTTATGCTGTGGAAA  300

seq1  ACCTTAGTTATTTGGGGAGAAAGGGTGCCATACAAATGCAAATGGTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAGTTATTTGGGGAGAAAGGGTGCCATACAAATGCAAATGGTTGGA  350

seq1  TTACTAAATTAGCTTCTGCTACCATTGTCTTTCTCCCCCTTGTCTTCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAAATTAGCTTCTGCTACCATTGTCTTTCTCCCCCTTGTCTTCTGA  400

seq1  GAGCATGATTAATGCAGGTCACATTATTGGACTGTGAAATAAAGAAATAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGATTAATGCAGGTCACATTATTGGACTGTGAAATAAAGAAATAG  450

seq1  AATGGCACTTTCCCCTGGGTAAGAAGTACAGTATTCAGAATGAACAAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCACTTTCCCCTGGGTAAGAAGTACAGTATTCAGAATGAACAAAGC  500

seq1  TGCAAACCCCTCATCCTTCACTTCCAGTCTCAGATTCACATTTAAAAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACCCCTCATCCTTCACTTCCAGTCTCAGATTCACATTTAAAAAGA  550

seq1  AAAAAAGTCACCTTTGGAGAATTGATTATTTGATTCTCTCTACTTACACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGTCACCTTTGGAGAATTGATTATTTGATTCTCTCTACTTACACT  600

seq1  GATGATGTGCAAAGCAAACAAAATTATTTCAAACAAGCAGAGAGTTGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATGTGCAAAGCAAACAAAATTATTTCAAACAAGCAGAGAGTTGTGC  650

seq1  TAATAGTTAAGCGCCTCAGGATTTATTCTATTGTCCTGAAAAACTTCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGTTAAGCGCCTCAGGATTTATTCTATTGTCCTGAAAAACTTCAAT  700

seq1  ATTGAAACTCCATGGTCAAGCTCTCTTTATTTTTAATCTTGAAAGCATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAACTCCATGGTCAAGCTCTCTTTATTTTTAATCTTGAAAGCATTT  750

seq1  AAAAACTCATGCAGGCTGAACAATATACACAATAGGCTCCGTGACAATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTCATGCAGGCTGAACAATATACACAATAGGCTCCGTGACAATTG  800

seq1  TCCTGTCATGTGTAGTCTTATTACTTGATATATTGCAAAGGGGATTGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTCATGTGTAGTCTTATTACTTGATATATTGCAAAGGGGATTGGAT  850

seq1  GCCCAGGCCTAAAAAGCCTCTATTACTAAGGTTTGGTTGCTTAGTTATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGGCCTAAAAAGCCTCTATTACTAAGGTTTGGTTGCTTAGTTATTT  900

seq1  TTCAGTACTGATCCCTTTGGATCAAATTTACATAAGAATGTAGTGGTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTACTGATCCCTTTGGATCAAATTTACATAAGAATGTAGTGGTTTT  950

seq1  GGTCTGCCTTTGCTAATTGAGTCTTCATTGGACCATGAGAGGGCAGTATT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GGTCTGCCTTTGCTAATTGAGTCTTCATTGGA-CATGAGAGGGCAGTATT  999

seq1  TTCCTAGC-TTGCTTAGAGTCATGTCACCTCCCTAC-AGGTTAGGGAACT  1048
      |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||
seq2  TTCCTAGCTTTGCTTAGAGTCATGTCAC--TCCTACAAGGTTA-GGAACT  1046

seq1  TATTCTAATCCAGTCTTCACATTACCTCTAAACTGTGAC-ATGTAATATT  1097
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||
seq2  TATTCTAAT-CAGTCTTCACATTA-CTCTAACTTGTGACAATGTAATATT  1094

seq1  TTCATGTGTTTATTTTCTTTTACTTATTTCTTTATACATTCCAAAAATAT  1147
      | |||||||||||||||  |||  || ||| ||||||| | |||||||||
seq2  TCCATGTGTTTATTTTC--TTAACTAGTTCGTTATACA-TACAAAAATAT  1141

seq1  TTTGAAGCACA  1158
      |||||||||||
seq2  TTTGAAGCACA  1152

seq1: chr11_92157437_92158571
seq2: B6Ng01-298H07.g_66_1207 (reverse)

seq1  CTGATGTGGTGGTTTAAAAAGGTTAATCCCCCGGAGATT-TGTGTGTTTG  49
      |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |
seq2  CTGATGTGGTGGTTAAAAAAGG-TAATCCCTCGGAGATTGTGGGTGTTGG  49

seq1  AATGTTCA-GCCAT---AGAGAATGACGCTACTAG-AAGGTATGACCTTG  94
      |||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  AATGTTCAGGCCATAAGAGAGAATGACGCTACTAGAAAGGTATGACC-TG  98

seq1  TTGGAGGAGG--AGGGACCTTGTTGAAG-AAAAGTGTGTCACCTTGTTGG  141
      ||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  TTGGAGGAGGGAGGGGACCTGGTTGAAGAAAAAGTGTGTCACC-TGTTGG  147

seq1  CAGGCTTTGAAGTTTCAAAAGATGAAGCTCTACACAGT-GTGGTATGAGC  190
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CAGGCTTTGAAGTTTCAAAAGATGAAGCTCTACACAGTGGTGGTATGAGC  197

seq1  ACCTCATCCTAGCTGTGGAATACAGCCTCCTCCTGGCTGCCTTAAGATGA  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATCCTAGCTGTGGAATACAGCCTCCTCCTGGCTGCCTTAAGATGA  247

seq1  AGATGTGGAACTCTTGGCTCCTCCAGCACAAAATCTGTCTGCATGAAGAC  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGGAACTCTTGGCTCCTCCAGCACAAAATCTGTCTGCATGAAGAC  297

seq1  ATGCTTTCCACCATAAGGATAATTGAATAAACCTCTGAAATTGTAAGCCA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTCCACCATAAGGATAATTGAATAAACCTCTGAAATTGTAAGCCA  347

seq1  CTCCCAATTCAATATTTACTTTGAAAGACTTGCCTTGGTCATGCTGTCCC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTCCCAATTCAATATTTACTTTGAAAGACTTGCTTTGGTCATGCTGTCCC  397

seq1  TTCACAGCAATAGAACTCTAACTACAATAGTCTTTTTTCAATCAGTTGTT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCAATAGAACTCTAACTACAATAGTCTTTTTTCAATCAGTTGTT  447

seq1  ATGCCCACAAAAATAAGTAATGATATTTTCAATCATAACATTGCAGTTTT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCACAAAAATAAGTAATGATATTTTCAATCATAACATTGCAGTTTT  497

seq1  CACATAGTAGAATAAGAAAATACAGAAAGGATATTATTACACGAGTAATT  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGTAGAATAAGAAAATACAGAAAGGATATTATTACACGAGTAATT  547

seq1  AAGAGAAACTCTTAAGAAATACAAGAAAATCTTACAGCCTATTTAACGAA  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAACTCTTAAGAAATACAAGAAAATCTTACAGCCTATTTAACGAA  597

seq1  AAATGGAAAAAGTCATGCCAGGCAGAAAGTGTTGTGTGACTTCAGCAGTA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAAAAAGTCATGCCAGGCAGAAAGTGTTGTGTGACTTCAGCAGTA  647

seq1  GCATGGAGTGTGTGGAGAAGGAGAAGGTGGTTGTTACTAAAGTCTGAAGT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGAGTGTGTGGAGAAGGAGAAGGTGGTTGTTACTAAAGTCTGAAGT  697

seq1  AAAAGTGGTCCACCTTAGGAAATTGCCAACCAGACATATCTCACAATGAA  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGGTCCACCTTAGGAAATTGCCAACCAGACATATCTCACAATGAA  747

seq1  ATGAAGCTGCCAGTTCCAGGATTGGTTACATTTAATTGAGTTATTGACCA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCTGCCAGTTCCAGGATTGGTTACATTTAATTGAGTTATTGACCA  797

seq1  AAGGGGCCCTTTAGTAACTCCCAAACAACCAGACTATTGATTGATTCCCC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGCCCTTTAGTAACTCCCAAACAACCAGACTATTGATTGATTCCCC  847

seq1  ACAAACTGATGGTAAAGCCCTATTACTGAAGACAGCACTTACACAACTCA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACTGATGGTAAAGCCCTATTACTGAAGACAGCACTTACACAACTCA  897

seq1  TTAAACACAGAGAAGTCTAGCTAGTGCCTACCAAAAACCTTTACCCCTGC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACACAGAGAAGTCTAGCTAGTGCCTACCAAAAACCTTTACCCCTGC  947

seq1  TGATTATTGTTCTGGTACTGAAGGTACTCTGAACACCACCAAAATAGAAA  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTATTGTTCTGGTACTGAAGGTACTCTGAACACCACCAAAATAGAAA  997

seq1  GGTAAACACCAACACAGTTTTAAATTTTAGATCTATAGCAGTCACCTGCC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAACACCAACACAGTTTTAAATTTTAGATCTATAGCAGTCACCTGCC  1047

seq1  TGTGAGACATAGTCATGCCTTGCTGGTGCAAAGCTTGTGGAAGTAGCCAA  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGACATAGTCATGCCTTGCTGGTGCAAAGCTTGTGGAAGTAGCCAA  1097

seq1  CCAATAACTGATTGGATTTAAGGCCCACTCCATGATTTGGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATAACTGATTGGATTTAAGGCCCACTCCATGATTTGGAATTC  1142