BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-304P24
Chromosome11 (Build37)
Map Location 13,344,509 - 13,344,667
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneCobl, LOC627244
Downstream geneLOC432535
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-304P24.b
ACCGA098404
length159
definitionB6Ng01-304P24.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
cacatatgggtagtattcttatttaattgtcccattcttagtccatccaa
ctcctcccatgacccacgtggcctcttacatttttatctatttatgcatc
tatgtttttatgcacctatgtttctaagtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatgtat
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_13344509_13344667
seq2: B6Ng01-304P24.b_50_208

seq1  CACATATGGGTAGTATTCTTATTTAATTGTCCCATTCTTAGTCCATCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATGGGTAGTATTCTTATTTAATTGTCCCATTCTTAGTCCATCCAA  50

seq1  CTCCTCCCATGACCCACGTGGCCTCTTACATTTTTATCTATTTATGCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCCATGACCCACGTGGCCTCTTACATTTTTATCTATTTATGCATC  100

seq1  TATGTTTTTATGCACCTATGTTTCTAAGTATGTATGTATGTATGTATGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTTTTATGCACCTATGTTTCTAAGTATGTATGTATGTATGTATGTA  150

seq1  TGTATGTAT  159
      |||||||||
seq2  TGTATGTAT  159


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |