BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305K21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 92,820,463 - 92,924,519
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC382545
Downstream geneLOC100039286, Car10, LOC629636, Utp18, Mbtd1, Nme2, Nme1, Spag9, LOC100039431
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305K21.bB6Ng01-305K21.g
ACCGA098910GA098911
length1,183779
definitionB6Ng01-305K21.b B6Ng01-305K21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,820,463 - 92,821,648)(92,923,747 - 92,924,519)
sequence
gaattctacctcaattctatttccccagaggccctatgacgtttcctacc
tgatattttttcaaagcattttaaaaggaagttcccaagtcctatcagag
aatagatttctgtacaaaatgcaccatgactgatgttagcattattggtt
aagatgaaatctgccaaatgtctccagcataaaataactatcattttccc
tgcaatattttacctatatctgcactgtccaggaaaaataagtaagctca
gcttcttggaagattacaaatgaattgtgggaggatgctaaaataattgc
agtattttaaactatttaagaggagatgatttgaaacaatgtaaatatcc
caatttctctttaaaggtttgcacatgaacatttgcaggaggcaatgaat
ctaacctgtagaaataactgcctctgtgtactgatatggccactctctca
gtgttgcgtatttacggatcagaatgtgtcatggtttgtatatgcttgga
ccagggagtggcaccatttggaggtgtggccttgttggaataggtgtgtc
actgtggctgtgggcttaagatcctcaccctagttgcctggaagtcagtc
ttccagtagcagcctttggatgaagatgtagaactctcagctctgccttc
accatgcctgcctggatgccgccatgctctcaccttgatggtaatggact
gaacctctgaatctgtaagccagccccaattaaatgttgttttttataag
acttgccttggccatggtgtccgttcacagcagtaaaaccctaaccaata
cagaatgcttctggaaaaaaagatgtatcctgtcgttcatggttaattat
tctttaaaacatcaatttatgttggtagaaacttgtgaataacaacatgt
gaatgatttttcattcctataattttcaaaatcatgagaatacatcctga
gacatccaaattgggggttggggcgtatttattaaaacatctaattacac
cattcaaagtgcaagatcataaagatcatagaaaatattcacaaactgaa
ctgactagaggaaacacagcttaatttaaaaattataccctccactggag
tccaggacgcgaatatatacacaggactggagtttactgtggttgcatgt
aatcctaatttttgtatagagtggttcattttg
gaattcaatgttcttcaagaatttcaaaagcttttaacttcagagtcata
gcctcagtctgatgactcctacattagatttaggaagccacccttgatta
attagttgtaaacatcactactatcagaccgaccaagggctgtctctgat
tttgttgcctacctttggattcctttctcctaactgggctgccttgttga
gcctcagtaggagaagatgcttgtgtttaacgcaacttattatgcctaga
ttggttgatatccacgggagacctctcctctgagaaaaactggttggggg
gttaggtgaggtgagcttaggatgtgaagtaaataaattaatggggacaa
aaagaagccacatttgctggttatgtccagctaagttgaatctgaaggta
ggaatactatcatttgctaggcagaagagcataatccattgatatttgct
tcagtgatctaaagtggacccaactatagatttttttgcttcagggaaga
taggcataagactttgcttggtcacatgacacagcatgcactgtagatgt
cattcagagataaagttggtctaagtaaagaagactgtatttactatcaa
cattcatgcataaaatacttagttgatttggggatatttgaatgtaacta
ctgttcgtaaacattcaatcattgctattccatttctacagttacatgcc
attaagattctggtagaagttagagtagtggatactgaagaaggaagaat
aatagatccttcaaagatgcctccatagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_92820463_92821648
seq2: B6Ng01-305K21.b_45_1227

seq1  GAATTCTACCTCAATTCTATTTCCCCAGAGGCCCTATGACGTTTCCTACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACCTCAATTCTATTTCCCCAGAGGCCCTATGACGTTTCCTACC  50

seq1  TGATATTTTTTCAAAGCATTTTAAAAGGAAGTTCCCAAGTCCTATCAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATTTTTTCAAAGCATTTTAAAAGGAAGTTCCCAAGTCCTATCAGAG  100

seq1  AATAGATTTCTGTACAAAATGCACCATGACTGATGTTAGCATTATTGGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGATTTCTGTACAAAATGCACCATGACTGATGTTAGCATTATTGGTT  150

seq1  AAGATGAAATCTGCCAAATGTCTCCAGCATAAAATAACTATCATTTTCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGAAATCTGCCAAATGTCTCCAGCATAAAATAACTATCATTTTCCC  200

seq1  TGCAATATTTTACCTATATCTGCACTGTCCAGGAAAAATAAGTAAGCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATATTTTACCTATATCTGCACTGTCCAGGAAAAATAAGTAAGCTCA  250

seq1  GCTTCTTGGAAGATTACAAATGAATTGTGGGAGGATGCTAAAATAATTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTGGAAGATTACAAATGAATTGTGGGAGGATGCTAAAATAATTGC  300

seq1  AGTATTTTAAACTATTTAAGAGGAGATGATTTGAAACAATGTAAATATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTTAAACTATTTAAGAGGAGATGATTTGAAACAATGTAAATATCC  350

seq1  CAATTTCTCTTTAAAGGTTTGCACATGAACATTTGCAGGAGGCAATGAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTCTCTTTAAAGGTTTGCACATGAACATTTGCAGGAGGCAATGAAT  400

seq1  CTAACCTGTAGAAATAACTGCCTCTGTGTACTGATATGGCCACTCTCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCTGTAGAAATAACTGCCTCTGTGTACTGATATGGCCACTCTCTCA  450

seq1  GTGTTGCGTATTTACGGATCAGAATGTGTCATGGTTTGTATATGCTTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGCGTATTTACGGATCAGAATGTGTCATGGTTTGTATATGCTTGGA  500

seq1  CCAGGGAGTGGCACCATTTGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAATAGGTGTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAGTGGCACCATTTGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAATAGGTGTGTC  550

seq1  ACTGTGGCTGTGGGCTTAAGATCCTCACCCTAGTTGCCTGGAAGTCAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGCTGTGGGCTTAAGATCCTCACCCTAGTTGCCTGGAAGTCAGTC  600

seq1  TTCCAGTAGCAGCCTTTGGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTAGCAGCCTTTGGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCTGCCTTC  650

seq1  ACCATGCCTGCCTGGATGCCGCCATGCTCTCACCTTGATGGTAATGGACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCCTGCCTGGATGCCGCCATGCTCTCACCTTGATGGTAATGGACT  700

seq1  GAACCTCTGAATCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTTTTTTATAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCTGAATCTGTAAGCCAGCCCCAATTAAATGTTGTTTTTTATAAG  750

seq1  ACTTGCCTTGGCCATGGTGTCCGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACCAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCCTTGGCCATGGTGTCCGTTCACAGCAGTAAAACCCTAACCAATA  800

seq1  CAGAATGCTTCTGGAAAAAAAGATGTATCCTGTCGTTCATGGTTAATTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGCTTCTGGAAAAAAAGATGTATCCTGTCGTTCATGGTTAATTAT  850

seq1  TCTTTAAAACATCAATTTATGTTGGTAGAAACTTGTGAATAACAACATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAAACATCAATTTATGTTGGTAGAAACTTGTGAATAACAACATGT  900

seq1  GAATGATTTTTCATTCCTATAATTTTCAAAATCATGAGAATACATCCTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGATTTTTCATTCCTATAATTTTCAAAATCATGAGAATACATCCTGA  950

seq1  GACATCCAAATTGGGGGTTGGGGCGTATTTATTAAAACATCTAATTACAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATCCAAATTGGGGGTTGGGGCGTATTTATTAAAACATCTAATTACAC  1000

seq1  CATTCAAAAGTGCAAAGATCATAAAAGATCATAGAAAATA-TCACAAACT  1049
      ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CATTC-AAAGTGC-AAGATCAT-AAAGATCATAGAAAATATTCACAAACT  1047

seq1  GAAACTGACTAGA-GAAACACAGCTAAATTTAAAAA-TATACCCTCCACT  1097
      | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  G-AACTGACTAGAGGAAACACAGCTTAATTTAAAAATTATACCCTCCACT  1096

seq1  GAGTTCCAGGACAGCAAAAAATATACACAGAACT-GAGTTTACTGT-GTT  1145
      |   |||||||| ||  || |||||||||| ||| ||||||||||| |||
seq2  GGAGTCCAGGAC-GC-GAATATATACACAGGACTGGAGTTTACTGTGGTT  1144

seq1  GCATGTTATCTTAAATATTTTGTATAGAGTGGTTCATTTTG  1186
      |||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTAATCCTAA--TTTTTGTATAGAGTGGTTCATTTTG  1183

seq1: chr11_92923747_92924519
seq2: B6Ng01-305K21.g_68_846 (reverse)

seq1  ACTATGGATGCATCTTTG-AGGATCTATTATTCTTCCTTCTTCAGTAT-C  48
      |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACTATGGAGGCATCTTTGAAGGATCTATTATTCTTCCTTCTTCAGTATCC  50

seq1  ACTACTCTAACTTCTACCAGAATCTTAATGGCATGT-ACTGTAGAAATGG  97
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACTACTCTAACTTCTACCAGAATCTTAATGGCATGTAACTGTAGAAATGG  100

seq1  AATAGCAATGA-TGAATGTTTACGAACAGTAGTTACATTC-AATATCCCC  145
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATAGCAATGATTGAATGTTTACGAACAGTAGTTACATTCAAATATCCCC  150

seq1  AAATCAACTAAGTATTTTATGCATG-ATGTTGATAGTAAATACAGTCTTC  194
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAACTAAGTATTTTATGCATGAATGTTGATAGTAAATACAGTCTTC  200

seq1  TTTACTTAGACCAACTTTATCTCTGAATGACATCTACAGTGCATGCTGTG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTAGACCAACTTTATCTCTGAATGACATCTACAGTGCATGCTGTG  250

seq1  TCATGTGACCAAGCAAAGTCTTATGCCTATCTTCCCTGAAGCAAAAAAAT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGACCAAGCAAAGTCTTATGCCTATCTTCCCTGAAGCAAAAAAAT  300

seq1  CTATAGTTGGGTCCACTTTAGATCACTGAAGCAAATATCAATGGATTATG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGTTGGGTCCACTTTAGATCACTGAAGCAAATATCAATGGATTATG  350

seq1  CTCTTCTGCCTAGCAAATGATAGTATTCCTACCTTCAGATTCAACTTAGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTGCCTAGCAAATGATAGTATTCCTACCTTCAGATTCAACTTAGC  400

seq1  TGGACATAACCAGCAAATGTGGCTTCTTTTTGTCCCCATTAATTTATTTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATAACCAGCAAATGTGGCTTCTTTTTGTCCCCATTAATTTATTTA  450

seq1  CTTCACATCCTAAGCTCACCTCACCTAACCCCCCAACCAGTTTTTCTCAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACATCCTAAGCTCACCTCACCTAACCCCCCAACCAGTTTTTCTCAG  500

seq1  AGGAGAGGTCTCCCGTGGATATCAACCAATCTAGGCATAATAAGTTGCGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAGGTCTCCCGTGGATATCAACCAATCTAGGCATAATAAGTTGCGT  550

seq1  TAAACACAAGCATCTTCTCCTACTGAGGCTCAACAAGGCAGCCCAGTTAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACAAGCATCTTCTCCTACTGAGGCTCAACAAGGCAGCCCAGTTAG  600

seq1  GAGAAAGGAATCCAAAGGTAGGCAACAAAATCAGAGACAGCCCTTGGTCG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGGAATCCAAAGGTAGGCAACAAAATCAGAGACAGCCCTTGGTCG  650

seq1  GTCTGATAGTAGTGATGTTTACAACTAATTAATCAAGGGTGGCTTCCTAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGATAGTAGTGATGTTTACAACTAATTAATCAAGGGTGGCTTCCTAA  700

seq1  ATCTAATGTAGGAGTCATCAGACTGAGGCTATGACTCTGAAGTTAAAAGC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATGTAGGAGTCATCAGACTGAGGCTATGACTCTGAAGTTAAAAGC  750

seq1  TTTTGAAATTCTTGAAGAACATTGAATTC  773
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAAATTCTTGAAGAACATTGAATTC  779