BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307D06
Chromosome11 (Build37)
Map Location 14,698,346 - 14,833,370
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC432535, 1700046C09Rik, 1700054H16Rik, LOC100042542, LOC100041673
Downstream geneLOC432537
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307D06.bB6Ng01-307D06.g
ACCGA100034GA100035
length1,1331,155
definitionB6Ng01-307D06.b B6Ng01-307D06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,698,346 - 14,699,461)(14,832,217 - 14,833,370)
sequence
gaattctacatcatgaaacatttccttgggaagtattaagccatgtgtga
tggctaaaattaattaggttgctcctaatcaaccagatggaaattaaggt
gcatggaagatgaaactgcattctctgtgggggccattactccctgtcat
gtgtctggtatattgtggatgcagagctactgaggcgagactctcttaaa
gacccccactgtaatgttacaatacagcaattcatctagagcccattaag
acctgctcttgtcacattcattccaaagggccctgctgcctcacctctcc
tctaatgaaggcattttcacattagggatcacaagatgtaaaagaatgct
tgatgtgatacttgttgattctttaaagtctctgcacacttagaagttcc
tgaattctaaaatcttaacttctgacttcacccatgtaggcaggagtaca
tatactcacagagagtcaatcaaatgtattccacataatgatatataatt
taaatgactaaataataattgctatcatgtattttctagaacttattctc
atggatttgtgttttaccatgtttgattcttataatatcccaacaaagga
agtatatttgaaaagcatacataccttctgactagagtttaagattacat
taactatgccattctgacttgtattaaaatttaagtataagcagtaatac
cacttttgtctgaatttagttaataatagactattcattcccactttcat
acattcctaaaatttagaattattaggtatacaatgcatcccttgtattt
gcctgatctcattcttacagcaattttttattatatccactgaacaggat
acaatctatcagacgtaattgttgtgtagagaggaatagaggactcagat
gtgaataagctcagagtttacctgcaaatattacatgaacagtggaaaga
caacactgccaaaggtaggacaacagagacaatatcataaaaaagaaagg
ccaagctgaggagacagtaggtaataaaaaatggacgagaaggccccaga
aggaagaaggatagagccagagtctgcttaacagctggttgcatctaatt
cagtgctcttttcaaaaagattcccagagctat
gaattcagcccataatgatagaatgtcataggaataggtttcatggctga
gctttttcatcccttgtttaacctacataataggtgagaaaaagagggag
atataaatcatgcagaaatgggtttacatattattaaccactagatgaac
ctggatgcctacagggcccaggtggataccgtggcccctgggtgaggccc
agaggatgatgaggttggcttatataccactctaataatgtgagtctccg
tgtctgctggcatatcaactgacacaagatagaggatcctagcaaactaa
ccatcctcggattgggactggaatagagctatgattccttcctccgtctt
tatagaagtcccttctgttgctgataacctggtaccttcccatactgaca
gtaggataactggctactacagaactcatttgaatcccccattggtctaa
aggctgtataaaacctcttgatactgggtaatacagtagatacacaaatc
aatgttggttcctggagattgtttcccatgttgatgactctgaccgcctc
actcccttctggatccttgattccaaagtcttacagttactcaagttact
caatattacatctctatatatgcactatataagttttgctactgtaaaaa
aaccctaatatagataaaacagaaatagagtgataaatattttaactatc
tgtaatagactttccaatttaccaacatctataagtactgaagcatctct
ggctaccatagcctttcttggtaacttggagtgtattaaaagcccctgat
gggaactacattacaaactgagggagattcctttaattattcttattaaa
caattttggaaagtaatttatgactctacataaaacttttgacactttat
ggaaaaataaagaaaatgatgatgatgtagatgattaactaattgattga
tcttagcattcctgggataaactgataaagatgagcaatatgattttatg
agcacttacagcatttcacaatccagtgtaggaaaccataaacagtatta
aaaatgactggactcaagatacattacaaaaatataaggcttccaagtgg
ggctaagaagagaaggccagaaatctttatagcgcccattaagctctcaa
attgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_14698346_14699461
seq2: B6Ng01-307D06.b_46_1178

seq1  GAATTCTACATCATGAAACATTTCCTTGGGAAGTATTAAGCCATGTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACATCATGAAACATTTCCTTGGGAAGTATTAAGCCATGTGTGA  50

seq1  TGGCTAAAATTAATTAGGTTGCTCCTAATCAACCAGATGGAAATTAAGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAAAATTAATTAGGTTGCTCCTAATCAACCAGATGGAAATTAAGGT  100

seq1  GCATGGAAGATGAAACTGCATTCTCTGTGGGGGCCATTACTCCCTGTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGAAGATGAAACTGCATTCTCTGTGGGGGCCATTACTCCCTGTCAT  150

seq1  GTGTCTGGTATATTGTGGATGCAGAGCTACTGAGGCGAGACTCTCTTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGGTATATTGTGGATGCAGAGCTACTGAGGCGAGACTCTCTTAAA  200

seq1  GACCCCCACTGTAATGTTACAATACAGCAATTCATCTAGAGCCCATTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCCACTGTAATGTTACAATACAGCAATTCATCTAGAGCCCATTAAG  250

seq1  ACCTGCTCTTGTCACATTCATTCCAAAGGGCCCTGCTGCCTCACCTCTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCTCTTGTCACATTCATTCCAAAGGGCCCTGCTGCCTCACCTCTCC  300

seq1  TCTAATGAAGGCATTTTCACATTAGGGATCACAAGATGTAAAAGAATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGAAGGCATTTTCACATTAGGGATCACAAGATGTAAAAGAATGCT  350

seq1  TGATGTGATACTTGTTGATTCTTTAAAGTCTCTGCACACTTAGAAGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGATACTTGTTGATTCTTTAAAGTCTCTGCACACTTAGAAGTTCC  400

seq1  TGAATTCTAAAATCTTAACTTCTGACTTCACCCATGTAGGCAGGAGTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTCTAAAATCTTAACTTCTGACTTCACCCATGTAGGCAGGAGTACA  450

seq1  TATACTCACAGAGAGTCAATCAAATGTATTCCACATAATGATATATAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTCACAGAGAGTCAATCAAATGTATTCCACATAATGATATATAATT  500

seq1  TAAATGACTAAATAATAATTGCTATCATGTATTTTCTAGAACTTATTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGACTAAATAATAATTGCTATCATGTATTTTCTAGAACTTATTCTC  550

seq1  ATGGATTTGTGTTTTACCATGTTTGATTCTTATAATATCCCAACAAAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTTGTGTTTTACCATGTTTGATTCTTATAATATCCCAACAAAGGA  600

seq1  AGTATATTTGAAAAGCATACATACCTTCTGACTAGAGTTTAAGATTACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATATTTGAAAAGCATACATACCTTCTGACTAGAGTTTAAGATTACAT  650

seq1  TAACTATGCCATTCTGACTTGTATTAAAATTTAAGTATAAGCAGTAATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTATGCCATTCTGACTTGTATTAAAATTTAAGTATAAGCAGTAATAC  700

seq1  CACTTTTGTCTGAATTTAGTTAATAATAGACTATTCATTCCCACTTTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTTGTCTGAATTTAGTTAATAATAGACTATTCATTCCCACTTTCAT  750

seq1  ACATTCCTAAAATTTAGAATTATTAGGTATACAATGCATCCCTTGTATTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCTAAAATTTAGAATTATTAGGTATACAATGCATCCCTTGTATTT  800

seq1  GCCTGATCTCATTCTTACAGCAA-TTTTTATTATATCCACTGAACAGGAT  849
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGATCTCATTCTTACAGCAATTTTTTATTATATCCACTGAACAGGAT  850

seq1  ACAATCTATCAGACGTAATTGTTGTGTAGAGAGGAATAGAGGACTCAGAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTATCAGACGTAATTGTTGTGTAGAGAGGAATAGAGGACTCAGAT  900

seq1  GTGAATAAGCTCAGAGTTTACCTGCAAATATTACATGAACAGTGGAAAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATAAGCTCAGAGTTTACCTGCAAATATTACATGAACAGTGGAAAGA  950

seq1  CAACACTGCC-AAGGTAGGACAACAGAGACAATATCATAAAAA--GAAGG  996
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  CAACACTGCCAAAGGTAGGACAACAGAGACAATATCATAAAAAAGAAAGG  1000

seq1  CCAAGCTGAGGAGACAGTAGG-AAT--AAAATGGACGAG-AGGCCCCAGA  1042
      ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||
seq2  CCAAGCTGAGGAGACAGTAGGTAATAAAAAATGGACGAGAAGGCCCCAGA  1050

seq1  AGGAAG-AGGATAGAG-CAGAGTCTGCTT-ACAGCTG--TGCATCTAA-T  1086
      |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |
seq2  AGGAAGAAGGATAGAGCCAGAGTCTGCTTAACAGCTGGTTGCATCTAATT  1100

seq1  CAGTGCTCTTTTC-AAAAGAT--CCAGAGCTAT  1116
      ||||||||||||| |||||||  ||||||||||
seq2  CAGTGCTCTTTTCAAAAAGATTCCCAGAGCTAT  1133

seq1: chr11_14832217_14833370
seq2: B6Ng01-307D06.g_65_1219 (reverse)

seq1  ACAATTTGA-AG-TTTATGGGCGCTATAAAGATTCTCT-GCCTTCTCTTC  47
      ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  ACAATTTGAGAGCTTAATGGGCGCTATAAAGATT-TCTGGCCTTCTCTTC  49

seq1  TAGGCCACACTTTGGAGCCTTTATA-TTTTGT-ATGTATCTTGAGT-CAG  94
      |  ||| ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||
seq2  TTAGCCCCACTTGGAAGCC-TTATATTTTTGTAATGTATCTTGAGTCCAG  98

seq1  TCAATTTTATTACTGTTTATGGTTTCCCTACACTGGATTGTGAAATGCTG  144
      ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTTTAATACTGTTTATGGTTT-CCTACACTGGATTGTGAAATGCTG  147

seq1  TAAGTTGCTTCATTAAATCATATTGCTCATCTTTTATCAGTTTAT-CCAG  193
      |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  TAAG-TGC-TCATAAAATCATATTGCTCATC-TTTATCAGTTTATCCCAG  194

seq1  GAATGCTAAGATCAATCAATTAGTTAATCATCTACATCATCATCATTTTC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCTAAGATCAATCAATTAGTTAATCATCTACATCATCATCATTTTC  244

seq1  TTTATTTTTCCATAAAGTGTCAAAAGTTTTATGTAGAGTCATAAATTACT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTTCCATAAAGTGTCAAAAGTTTTATGTAGAGTCATAAATTACT  294

seq1  TTCCAAAATTGTTTAATAAGAATAATTAAAGGAATCTCCCTCAGTTTGTA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAAATTGTTTAATAAGAATAATTAAAGGAATCTCCCTCAGTTTGTA  344

seq1  ATGTAGTTCCCATCAGGGGCTTTTAATACACTCCAAGTTACCAAGAAAGG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGTTCCCATCAGGGGCTTTTAATACACTCCAAGTTACCAAGAAAGG  394

seq1  CTATGGTAGCCAGAGATGCTTCAGTACTTATAGATGTTGGTAAATTGGAA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGTAGCCAGAGATGCTTCAGTACTTATAGATGTTGGTAAATTGGAA  444

seq1  AGTCTATTACAGATAGTTAAAATATTTATCACTCTATTTCTGTTTTATCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTATTACAGATAGTTAAAATATTTATCACTCTATTTCTGTTTTATCT  494

seq1  ATATTAGGGTTTTTTTACAGTAGCAAAACTTATATAGTGCATATATAGAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAGGGTTTTTTTACAGTAGCAAAACTTATATAGTGCATATATAGAG  544

seq1  ATGTAATATTGAGTAACTTGAGTAACTGTAAGACTTTGGAATCAAGGATC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATATTGAGTAACTTGAGTAACTGTAAGACTTTGGAATCAAGGATC  594

seq1  CAGAAGGGAGTGAGGCGGTCAGAGTCATCAACATGGGAAACAATCTCCAG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGGGAGTGAGGCGGTCAGAGTCATCAACATGGGAAACAATCTCCAG  644

seq1  GAACCAACATTGATTTGTGTATCTACTGTATTACCCAGTATCAAGAGGTT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAACATTGATTTGTGTATCTACTGTATTACCCAGTATCAAGAGGTT  694

seq1  TTATACAGCCTTTAGACCAATGGGGGATTCAAATGAGTTCTGTAGTAGCC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAGCCTTTAGACCAATGGGGGATTCAAATGAGTTCTGTAGTAGCC  744

seq1  AGTTATCCTACTGTCAGTATGGGAAGGTACCAGGTTATCAGCAACAGAAG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATCCTACTGTCAGTATGGGAAGGTACCAGGTTATCAGCAACAGAAG  794

seq1  GGACTTCTATAAAGACGGAGGAAGGAATCATAGCTCTATTCCAGTCCCAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTCTATAAAGACGGAGGAAGGAATCATAGCTCTATTCCAGTCCCAA  844

seq1  TCCGAGGATGGTTAGTTTGCTAGGATCCTCTATCTTGTGTCAGTTGATAT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGGATGGTTAGTTTGCTAGGATCCTCTATCTTGTGTCAGTTGATAT  894

seq1  GCCAGCAGACACGGAGACTCACATTATTAGAGTGGTATATAAGCCAACCT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCAGACACGGAGACTCACATTATTAGAGTGGTATATAAGCCAACCT  944

seq1  CATCATCCTCTGGGCCTCACCCAGGGGCCACGGTATCCACCTGGGCCCTG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCCTCTGGGCCTCACCCAGGGGCCACGGTATCCACCTGGGCCCTG  994

seq1  TAGGCATCCAGGTTCATCTAGTGGTTAATAATATGTAAACCCATTTCTGC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCATCCAGGTTCATCTAGTGGTTAATAATATGTAAACCCATTTCTGC  1044

seq1  ATGATTTATATCTCCCTCTTTTTCTCACCTATTATGTAGGTTAAACAAGG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTATATCTCCCTCTTTTTCTCACCTATTATGTAGGTTAAACAAGG  1094

seq1  GATGAAAAAGCTCAGCCATGAAACCTATTCCTATGACATTCTATCATTAT  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAAAAGCTCAGCCATGAAACCTATTCCTATGACATTCTATCATTAT  1144

seq1  GGGCTGAATTC  1154
      |||||||||||
seq2  GGGCTGAATTC  1155