BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307N21
Chromosome11 (Build37)
Map Location 61,217,171 - 61,344,514
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC626150, Zfp179, Mfap4, Mapk7, 3110043A19Rik, Eppb9, Epn2
Upstream geneAtpaf2, 4933439F18Rik, LOC674310, Drg2, Myo15, Alkbh5, LOC100042448, LOC624403, LOC624424, OTTMUSG00000007757, LOC668206, Llgl1, Flii, Smcr7, Top3a, LOC100042517, Smcr8, Shmt1, LOC625958, LOC637900, Dhrs7b, Tmem11, Gtlf3b, Map2k3, Kcnj12, LOC668228, Tnfrsf13b, Usp22, LOC668239, Aldh3a1, Aldh3a2, 4933429E10Rik, 1300013J15Rik, LOC100042602
Downstream geneGrap, Slc5a10, 2310040C09Rik, Prpsap2, Ulk2, Akap10, D630015H07, LOC626325, LOC100041558, Specc1, Adora2b, 2410012H22Rik, Ttc19, Ncor1, Pigl, Prr6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307N21.bB6Ng01-307N21.g
ACCGA100521GA100522
length6761,104
definitionB6Ng01-307N21.b B6Ng01-307N21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,217,171 - 61,217,842)(61,343,410 - 61,344,514)
sequence
gaattctgaggaacacagagaagcacaaagaagcctgaacgcttcgctgc
ctgaaagcagtgcctaggtttctcaggaaatgcagggcacacagtgcccc
aggagccatgaactcaaacctgaaaaccctatgacacgtgcttctcaagg
cagctagaccatggttttccacaacatcccaaactatgaactaagtaaat
ctcttcacaagatgagccctcagcctcccgtatgttttcttttagtgata
gaaaatagactcctgcaaaggtccaagaatttgagtttatatttgacctg
taaagtaatattgagatgaattaaaaaaaaaaaaaaagaggctgaggtat
ttttgttgttgctgttgttaattctgtttataagaggctaatttttgtag
gttttcaaatttgtttgaggggttttgtttttgttgttggatgatagagt
ttatttgtttgttttgtacatggtctcattatgcagcctttggatggcct
agactgatgtagtccaggcggggtaaaatccagagatctgtttgcctctg
tctctgggtgctgggattaaaggagtgccctgcctggctgaaacctcata
gtcttccaaattaagcttagcttttctaaatttggtcagagacaatagct
ctgaatggcacgtatgctttgatttg
gaattcctagtgggtcggaccagggtcgcatacagaggctgtgacaggga
gcctgagtaggacacggcctgctgtgggaacaggtaccaagagctctgtt
tggatatgtcctttgcttgctcttcaaatggagatgaaatttgccattcc
gactatttaacaaaactggaatatttaacaaaacaaaacaataaacccca
cacattcacagagctgtataactattgttactaggtagaatggaacttgt
ttccattactccagaaagaatccatactcaactcctagccaccagcttgc
tattattatgccttggttcatgaagacttgtttgatgtggacattatcat
attattagcaaagtcacattactgtggccttcatttgttggcagcatgtc
tgcaatatagtaggtgtttagtcttttcctggccagaagtatcccctgtg
gatgtggcaactcatggtacactctcctcccattggacatttgcattgtg
tttagttcctggccattgtgaatctaattttcaaaagagaagattgaact
aaagcccaaatgatcactatctgtttttacatggtggtgaggattaaagc
tatcctgaacaagggtgctgctcatggtcggctccttgaggctggtccct
gtgcctgttctctgtggacctgcccactctcggctcccacacagttgaca
cttttactggtgactggaggaatacacagatcaccaaagcccagaaatgt
cccctccccacctctccccgccagctcagagcttgtggtaggacatctta
gattgctgggaggttgtgcaccctgataagttaaagtgtatccttccagc
atggagatagctgttgggtaaatctgaactacctatccacttctttcccc
cttacattgtgtaaccgaatttgaggtcacattgtgtattgttacgctca
gacacacatacatttccacttgtgctgtgctgtgtatgtgccccatgtag
tgtcattggaaaccgtgtagtacctcatttgtgtgtatggttggcacttt
gtgatgggccactagcctcttaagcagctatggtgttcctgatgtaggtg
ctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_61217171_61217842
seq2: B6Ng01-307N21.b_47_722

seq1  GAATTCTGAGGAACACAGAGAAGCACAAAGAAGCCTGAACGCTTCGCTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGAGGAACACAGAGAAGCACAAAGAAGCCTGAACGCTTCGCTGC  50

seq1  CTGAAAGCAGTGCCTAGGTTTCTCAGGAAATGCAGGGCACACAGTGCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAGCAGTGCCTAGGTTTCTCAGGAAATGCAGGGCACACAGTGCCCC  100

seq1  AGGAGCCATGAACTCAAACCTGAAAACCCTATGACACGTGCTTCTCAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCCATGAACTCAAACCTGAAAACCCTATGACACGTGCTTCTCAAGG  150

seq1  CAGCTAGACCATGGTTTTCCACAACATCCCAAACTATGAACTAAGTAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAGACCATGGTTTTCCACAACATCCCAAACTATGAACTAAGTAAAT  200

seq1  CTCTTCACAAGATGAGCCCTCAGCCTCCCGTATGTTTTCTTTTAGTGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCACAAGATGAGCCCTCAGCCTCCCGTATGTTTTCTTTTAGTGATA  250

seq1  GAAAATAGACTCCTGCAAAGGTCCAAGAATTTGAGTTTATATTTGACCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATAGACTCCTGCAAAGGTCCAAGAATTTGAGTTTATATTTGACCTG  300

seq1  TAAAGTAATATTGAGATGAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAGGCTGAGGTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTAATATTGAGATGAATTAAAAAAAAAAAAAAAGAGGCTGAGGTAT  350

seq1  TTTTGTTGTTGCTGTTGTTAATTCTGTTTATAAGAGGCTAATTTTTGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTGTTGCTGTTGTTAATTCTGTTTATAAGAGGCTAATTTTTGTAG  400

seq1  GTTTTCAAATTTGTTTGAGGGGTTTTGTTTTTGTTGTTGGATGATAGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAAATTTGTTTGAGGGGTTTTGTTTTTGTTGTTGGATGATAGAGT  450

seq1  TTATTTGTTTGTTTTGTACATGGTCTCATTATGCAGCC-TTGGATGGCCT  499
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTATTTGTTTGTTTTGTACATGGTCTCATTATGCAGCCTTTGGATGGCCT  500

seq1  AGACTGATGTAGTCCAGGCGGGGTAAAATCCAGAGATCTGTTTGCCTCTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGATGTAGTCCAGGCGGGGTAAAATCCAGAGATCTGTTTGCCTCTG  550

seq1  TCTCTGGGTGCTGGGATTAAAGGAGTGCCCTGCCTGGCTGAAACCTCATA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGGTGCTGGGATTAAAGGAGTGCCCTGCCTGGCTGAAACCTCATA  600

seq1  GTCTTCCAAATT-AGCTTAGC-TTTCTAAATTTGGTCAGAGACAATAGC-  646
      |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GTCTTCCAAATTAAGCTTAGCTTTTCTAAATTTGGTCAGAGACAATAGCT  650

seq1  CTGAATGGCACGTATGCTTTGATTTG  672
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGGCACGTATGCTTTGATTTG  676

seq1: chr11_61343410_61344514
seq2: B6Ng01-307N21.g_67_1170 (reverse)

seq1  ATAGCACCTACA-CAGG-ACA-CATAGCTGCTAAAGA-GCTAGTGGCCCA  46
      |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| 
seq2  ATAGCACCTACATCAGGAACACCATAGCTGCTTAAGAGGCTAGTGGCCC-  49

seq1  ACCACAAAGTGCCAACCCATACCACACAAATGA-GTACTACCACGGTTTC  95
      | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  ATCACAAAGTGCCAA-CCATA-CACACAAATGAGGTACTA-CACGGTTTC  96

seq1  CAATGACACCTACATGGGGCACATACACAGCACAGCACAAGTTGGGAAAT  145
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  CAATGACA-CTACATGGGGCACATACACAGCACAGCACAAGT--GGAAAT  143

seq1  GTATGTGTGTCTGAGCGTAACAATACACAATGTGACCTC-AATTCGGTTA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTATGTGTGTCTGAGCGTAACAATACACAATGTGACCTCAAATTCGGTTA  193

seq1  CACAATGTAAGGGGGAAAGAAGTGGATAGGTAGTTCAGATTTTACCAACA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  CACAATGTAAGGGGGAAAGAAGTGGATAGGTAGTTCAGATTTACCCAACA  243

seq1  GCTATCTCCATGCTGGAAGGATACACTTTAACTTATCAGGGTGCACAACC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCTCCATGCTGGAAGGATACACTTTAACTTATCAGGGTGCACAACC  293

seq1  TCCCAGCAATCTAAGATGTCCTACCACAAGCTCTGAGCTGGCGGGGAGAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCAATCTAAGATGTCCTACCACAAGCTCTGAGCTGGCGGGGAGAG  343

seq1  GTGGGGAGGGGACATTTCTGGGCTTTGGTGATCTGTGTATTCCTCCAGTC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGAGGGGACATTTCTGGGCTTTGGTGATCTGTGTATTCCTCCAGTC  393

seq1  ACCAGTAAAAGTGTCAACTGTGTGGGAGCCGAGAGTGGGCAGGTCCACAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTAAAAGTGTCAACTGTGTGGGAGCCGAGAGTGGGCAGGTCCACAG  443

seq1  AGAACAGGCACAGGGACCAGCCTCAAGGAGCCGACCATGAGCAGCACCCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGGCACAGGGACCAGCCTCAAGGAGCCGACCATGAGCAGCACCCT  493

seq1  TGTTCAGGATAGCTTTAATCCTCACCACCATGTAAAAACAGATAGTGATC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGGATAGCTTTAATCCTCACCACCATGTAAAAACAGATAGTGATC  543

seq1  ATTTGGGCTTTAGTTCAATCTTCTCTTTTGAAAATTAGATTCACAATGGC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGGGCTTTAGTTCAATCTTCTCTTTTGAAAATTAGATTCACAATGGC  593

seq1  CAGGAACTAAACACAATGCAAATGTCCAATGGGAGGAGAGTGTACCATGA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTAAACACAATGCAAATGTCCAATGGGAGGAGAGTGTACCATGA  643

seq1  GTTGCCACATCCACAGGGGATACTTCTGGCCAGGAAAAGACTAAACACCT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCCACATCCACAGGGGATACTTCTGGCCAGGAAAAGACTAAACACCT  693

seq1  ACTATATTGCAGACATGCTGCCAACAAATGAAGGCCACAGTAATGTGACT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATATTGCAGACATGCTGCCAACAAATGAAGGCCACAGTAATGTGACT  743

seq1  TTGCTAATAATATGATAATGTCCACATCAAACAAGTCTTCATGAACCAAG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAATAATATGATAATGTCCACATCAAACAAGTCTTCATGAACCAAG  793

seq1  GCATAATAATAGCAAGCTGGTGGCTAGGAGTTGAGTATGGATTCTTTCTG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAATAATAGCAAGCTGGTGGCTAGGAGTTGAGTATGGATTCTTTCTG  843

seq1  GAGTAATGGAAACAAGTTCCATTCTACCTAGTAACAATAGTTATACAGCT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAATGGAAACAAGTTCCATTCTACCTAGTAACAATAGTTATACAGCT  893

seq1  CTGTGAATGTGTGGGGTTTATTGTTTTGTTTTGTTAAATATTCCAGTTTT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAATGTGTGGGGTTTATTGTTTTGTTTTGTTAAATATTCCAGTTTT  943

seq1  GTTAAATAGTCGGAATGGCAAATTTCATCTCCATTTGAAGAGCAAGCAAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAATAGTCGGAATGGCAAATTTCATCTCCATTTGAAGAGCAAGCAAA  993

seq1  GGACATATCCAAACAGAGCTCTTGGTACCTGTTCCCACAGCAGGCCGTGT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATATCCAAACAGAGCTCTTGGTACCTGTTCCCACAGCAGGCCGTGT  1043

seq1  CCTACTCAGGCTCCCTGTCACAGCCTCTGTATGCGACCCTGGTCCGACCC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTCAGGCTCCCTGTCACAGCCTCTGTATGCGACCCTGGTCCGACCC  1093

seq1  ACTAGGAATTC  1105
      |||||||||||
seq2  ACTAGGAATTC  1104