BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-315P17
Chromosome11 (Build37)
Map Location 64,777,424 - 64,967,882
singlet/doubletdoublet
Overlap geneElac2, AU040829, 1700086D15Rik
Upstream geneCox10, 2810001G20Rik, EG544785, Hs3st3a1, LOC626959
Downstream geneLOC100041790, Myocd, Map2k4, Zkscan6, Dnahc9
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-315P17.bB6Ng01-315P17.g
ACCGA106491GA106492
length4311,016
definitionB6Ng01-315P17.b B6Ng01-315P17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,967,446 - 64,967,882)(64,777,424 - 64,778,444)
sequence
tcttgtgattcttgggttcattttgtcctgctctgagtgttcaagcttgc
atgttgtatgtgaggataggtcagactgctatgggaactctctagtgaca
tactgtcacagtccttcattttgggctcattactaatgagttgatgtgga
gagtcgtgtcatcaaggtccttgctcctctttgaagggtctggaatctca
tgtgaccccctctactctttctccagtactgctgaaggtgaagagagaat
agcaaaatggcatttattggttggtattcaggctctttgatctttcactt
agaatccagaaaggttgctatgctaacatgtcactggctggaactcgtca
cagagttcccctggatgtggctggaccgggctccctcctctcagctgaat
caccagggatttcattctttctccacatatc
gaattctgctgtggcctctagccttcatatatacagagatccagatagat
ttatagggtgccgtataatgtgtgatctgagagttagcagtagttaaaat
gggaataaaagaacctgtgttcaccttggccggagttggggggaaaacac
gaatagctggcaaactgctgtcattgaaaccaccacatcttgtaaagttt
ttgttattccataaatcctaacagggtagaaagacacgaatggggtcctg
acattgggctctcacaccactaagatgctcatttatcacctgtgagctca
gcttgatccaagtaaatcaacaagcagataatttttagtgtaaacttata
gtaggctactgaactatagtaatgtcatctcatgaaagtactcccaagaa
gactttacatgctaaaaatatcttgggtaaaactggtctctagaccagcc
ctacattcctacagtaaactggtctctaaattcctctacactgtgaccct
gagctaaaggttaactacctgaccattaactcttatctctctgcttctgt
aaataatgcttgctttctggatatatcacaattgcttattttgcccttca
aatctcagaccaactagaggttagggttgcttcctactactctgcttgga
cagtcccactggcagttagtaatgactccattcaaattaatcaggcctcg
ttaggaatttttctcttcaggtccccaaaacaaacttacattgctagact
gtttaagacaaaattgttccatggagacaacctgatacccaggggctcag
ggcaagctgggggctgggatgagaccaggacagcattcaccactctcaaa
gcatttgaaaagtgacagtctttgagggcaacaattacactgatgtatga
aaggaagatgaccaggtcttgttgggttgcctgaaaagactctgagttgg
agaatcctaagccaaagctaccacatatgagatacctgtagagagtagac
gtagattgggagaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_64967446_64967882
seq2: B6Ng01-315P17.b_48_484 (reverse)

seq1  GATATGTGGAGAAAGAATGAAATCCCTGGTGATTCAGCTGAGAGGAGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGTGGAGAAAGAATGAAATCCCTGGTGATTCAGCTGAGAGGAGGGA  50

seq1  GCCCGGTCCAGCCACATCCAGGGGAACTCTGTGACGAGTTCCAGCCAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCGGTCCAGCCACATCCAGGGGAACTCTGTGACGAGTTCCAGCCAGTG  100

seq1  ACATGTTAGCATAGCAACCTTTCTGGATTCTAAGTGAAAGATCAAAGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTAGCATAGCAACCTTTCTGGATTCTAAGTGAAAGATCAAAGAGC  150

seq1  CTGAATACCAACCAATAAATGCCATTTTGCTATTCTCTCTTCACCTTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATACCAACCAATAAATGCCATTTTGCTATTCTCTCTTCACCTTCAG  200

seq1  CAGTACTGGAGAAAGAGTAGAGGGGGTCACATGAGATTCCAGACCCTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTGGAGAAAGAGTAGAGGGGGTCACATGAGATTCCAGACCCTTCA  250

seq1  AAGAGGAGCAAGGACCTTGATGACACGACTCTCCACATCAACTCATTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAGCAAGGACCTTGATGACACGACTCTCCACATCAACTCATTAGT  300

seq1  AATGAGCCCAAAATGAAGGACTGTGACAGTATGTCACTAGAGAGTTCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGCCCAAAATGAAGGACTGTGACAGTATGTCACTAGAGAGTTCCCA  350

seq1  TAGCAGTCTGACCTATCCTCACATACAACATGCAAGCTTGAACACTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGTCTGACCTATCCTCACATACAACATGCAAGCTTGAACACTCAGA  400

seq1  GCAGGACAAAATGAACCCAAGAATCACAAGAGAATTC  437
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGACAAAATGAACCCAAGAATCACAAGAGAATTC  437

seq1: chr11_64777424_64778444
seq2: B6Ng01-315P17.g_68_1083

seq1  GAATTCTGCTGTGGCCTCTAGCCTTCATATATACAGAGATCCAGATAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTGTGGCCTCTAGCCTTCATATATACAGAGATCCAGATAGAT  50

seq1  TTATAGGGTGCCGTATAATGTGTGATCTGAGAGTTAGCAGTAGTTAAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGGGTGCCGTATAATGTGTGATCTGAGAGTTAGCAGTAGTTAAAAT  100

seq1  GGGAATAAAAGAACCTGTGTTCACCTTGGCCGGAGTTGGGGGGAAAACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATAAAAGAACCTGTGTTCACCTTGGCCGGAGTTGGGGGGAAAACAC  150

seq1  GAATAGCTGGCAAACTGCTGTCATTGAAACCACCACATCTTGTAAAGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGCTGGCAAACTGCTGTCATTGAAACCACCACATCTTGTAAAGTTT  200

seq1  TTGTTATTCCATAAATCCTAACAGGGTAGAAAGACACGAATGGGGTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATTCCATAAATCCTAACAGGGTAGAAAGACACGAATGGGGTCCTG  250

seq1  ACATTGGGCTCTCACACCACTAAGATGCTCATTTATCACCTGTGAGCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGGCTCTCACACCACTAAGATGCTCATTTATCACCTGTGAGCTCA  300

seq1  GCTTGATCCAAGTAAATCAACAAGCAGATAATTTTTAGTGTAAACTTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGATCCAAGTAAATCAACAAGCAGATAATTTTTAGTGTAAACTTATA  350

seq1  GTAGGCTACTGAACTATAGTAATGTCATCTCATGAAAGTACTCCCAAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCTACTGAACTATAGTAATGTCATCTCATGAAAGTACTCCCAAGAA  400

seq1  GACTTTACATGCTAAAAATATCTTGGGTAAAACTGGTCTCTAGACCAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTACATGCTAAAAATATCTTGGGTAAAACTGGTCTCTAGACCAGCC  450

seq1  CTACATTCCTACAGTAAACTGGTCTCTAAATTCCTCTACACTGTGACCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTCCTACAGTAAACTGGTCTCTAAATTCCTCTACACTGTGACCCT  500

seq1  GAGCTAAAGGTTAACTACCTGACCATTAACTCTTATCTCTCTGCTTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAAAGGTTAACTACCTGACCATTAACTCTTATCTCTCTGCTTCTGT  550

seq1  AAATAATGCTTGCTTTCTGGATATATCACAATTGCTTATTTTGCCCTTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATGCTTGCTTTCTGGATATATCACAATTGCTTATTTTGCCCTTCA  600

seq1  AATCTCAGACCAACTAGAGGTTAGGGTTGCTTCCTACTACTCTGCTTGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCAGACCAACTAGAGGTTAGGGTTGCTTCCTACTACTCTGCTTGGA  650

seq1  CAGTCCCACTGGCAGTTAGTAATGACTCCATTCAAATTAATCAGGCCTCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCACTGGCAGTTAGTAATGACTCCATTCAAATTAATCAGGCCTCG  700

seq1  TTAGGAATTTTTCTCTTCAGGTCCCCAAAACAAACTTACATTGCTAGACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAATTTTTCTCTTCAGGTCCCCAAAACAAACTTACATTGCTAGACT  750

seq1  GTTTAAGACAAAATTGTTCCATGGAGACAACCTGATACCCAGGGGCTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAGACAAAATTGTTCCATGGAGACAACCTGATACCCAGGGGCTCAG  800

seq1  GGCAAGCTGGGGGCTGGGATGAGACCAGGACAGCATTCACCACTCTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCTGGGGGCTGGGATGAGACCAGGACAGCATTCACCACTCTCAAA  850

seq1  GCATTTGAAAAGTGACAGTCTTTGAGGGCAACAATTACACTGATGTATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTGAAAAGTGACAGTCTTTGAGGGCAACAATTACACTGATGTATGA  900

seq1  AAGGAAGATGACCAGGTCTTGTTGGGTTGCCTGAAAAGACTCTGAGTTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGATGACCAGGTCTTGTTGGGTTGCCTGAAAAGACTCTGAGTTGG  950

seq1  AGAATCCTAAGCCAAAGCTACCACATATGAGATACCTGTAAGAGAGTAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  
seq2  AGAATCCTAAGCCAAAGCTACCACATATGAGATACCTGT-AGAGAGTA--  997

seq1  GAAGGTAGGATGGGGAGAAGG  1021
        | ||| ||| |||||||||
seq2  -GACGTA-GATTGGGAGAAGG  1016