BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-319H17
Chromosome11 (Build37)
Map Location 92,269,419 - 92,364,604
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545, LOC100039286, Car10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-319H17.bB6Ng01-319H17.g
ACCGA109099GA109100
length1,1161,092
definitionB6Ng01-319H17.b B6Ng01-319H17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,363,483 - 92,364,604)(92,269,419 - 92,270,516)
sequence
gaattctgtatatgcaaatctgctatgtttgatccatcattccattacaa
acacattttccagctttttaatcccccattttatttggctcttgagtaag
aatgcttatgaaatagtatgttgttttctttttatctttcaagcaaaaca
tctatgtggcatatacacaccacactacatatgtggagagatggaaatat
caaaatacataatgttgaattaacaatagttgatgcttatttaagaagtt
agtctgaacacagtgcatgagatgggaaatctttttttttctcaattaaa
catagatagcatctatggaattccagttttgttaggcataagttgaaaac
ttttttttttgtcttgtacatttgtctgtctctctattgttcaaacaggt
aagttttccaggcctgataacacaaatctgcaatcctgtcactctggatg
ttgccacaagttcagtatttcagggactgcatgagcaacacaccaacttc
cagtagtctaggtttgctatctcaaacagttaaataaaacatacaaattt
attgactgttttgatattttcaattatctattagaccaaggaactgctct
ttataaattcaataatataatcaataatttttccaaataatgaaatcact
gaatcttagttttaaaagtctatttggaatttttattatatacaaattta
tagattacttgaaatgatttattatttttaaacactacatctttatagat
gatataataaaatataaaacgtgtcctatggtcagaaattctataataaa
gtatcctgacacactcaaacttttagttctaatcttcatatctttacaaa
attatataaattcatgatcagtgtactggctagttttgtgtcaacttgac
acaagctggagttatcacagagaaaggagcttcagttgaggaaatgcctc
catgagatccaactgtaagacatttttctcaattagtgatcaagggggaa
aggcgccttgtggggtgggacatctctggctgtagtcttggattctataa
gagagcagatgagcagccaggggtagcagcagtaaggaacatccctccat
gctctgccatcagctc

gaattccatcattagtaaaagcatggataaactatagtttgtactgtcat
gtaaaataaaccagaaaaagacatttgccatgtgatctcataggtggtaa
aacatgaaactcatagcaacaaaatgtagattgctggttagtaggagctg
tggtcaggaagagaatacattgacatcaaccaaagtctctaaaatttctg
tttggaagaaccacatgattaatggtacaacatggcaactgcagttggaa
taacatctggtatgcttgaaaatactcagaagatgacagaaaatgacttc
tcagcacaaataacatgatcacggaaagccatgctaacaatagcttcatt
cacagcatacatttctttttaaagatctggttgtatctcataaaatatac
aacatgtacttgtcaaagataaaaattaaatgctgaaatggtacatagta
ctttattactgaaacaagacactttttcctgcttattgcttcaccaaaga
agtattttggatgttttaagatctttttttttttaactaaagatgcaacc
ttgtaagtttctaagtgtctccttgtacatttggcaataggttttctagg
gaaatagctggctgtggaatcactgtgcctaaggatattggatcttttga
ttaactagaatctgctaaatgaagtggcatttagacttattctcagtaga
aggaaactcttgaaggacattgaagtagggcatcagtatgatcaaattat
gtctcagaactctctgccagcatatgaagacttacttagagacaggtgaa
gatagaagacttgacccaggcagggctcaagggagatggggatgtaggga
gagagaattgccagagatggtgattttgggcctaagtgctcatgggagtt
tcctgagatgatctctgagtctcttcacatacagataggctgattatctt
tttttttctttctttcttcacatccttacaactacctcagacagcatttt
tttgtttgttgtttggaatgtgacatatatcaatggtgcttcaattctgt
tctccagtcaggtgcactaattgaaactcttaggatgtgtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_92363483_92364604
seq2: B6Ng01-319H17.b_46_1161 (reverse)

seq1  GAGCTGAT-GCAGAGGCCATGGAGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCCC  49
      |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   |||| |||
seq2  GAGCTGATGGCAGAG--CATGGAGGGATGTTCCTTACTG--CTGCTACCC  46

seq1  CTGGCTTGCTCATCCTGCTCTCTTATAGAATCCAAGACTACCAGCCCAGA  99
      ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
seq2  CTGGC-TGCTCAT-CTGCTCTCTTATAGAATCCAAGACTA-CAG-CCAGA  92

seq1  GATGGTCCCA-CCCACAAGGCGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAG-A  147
      ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAT-GTCCCACCCCACAAGGCGCCTTTCCCCCTTGATCACTAATTGAGAA  141

seq1  AAATGTCTTACAGTTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCTTACAGTTGGATCTCATGGAGGCATTTCCTCAACTGAAGCTCC  191

seq1  TTTCTCTGTGATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTGTGATAACTCCAGCTTGTGTCAAGTTGACACAAAACTAGCCAG  241

seq1  TACACTGATCATGAATTTATATAATTTTGTAAAGATATGAAGATTAGAAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTGATCATGAATTTATATAATTTTGTAAAGATATGAAGATTAGAAC  291

seq1  TAAAAGTTTGAGTGTGTCAGGATACTTTATTATAGAATTTCTGACCATAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTTTGAGTGTGTCAGGATACTTTATTATAGAATTTCTGACCATAG  341

seq1  GACACGTTTTATATTTTATTATATCATCTATAAAGATGTAGTGTTTAAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACGTTTTATATTTTATTATATCATCTATAAAGATGTAGTGTTTAAAA  391

seq1  ATAATAAATCATTTCAAGTAATCTATAAATTTGTATATAATAAAAATTCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAATCATTTCAAGTAATCTATAAATTTGTATATAATAAAAATTCC  441

seq1  AAATAGACTTTTAAAACTAAGATTCAGTGATTTCATTATTTGGAAAAATT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGACTTTTAAAACTAAGATTCAGTGATTTCATTATTTGGAAAAATT  491

seq1  ATTGATTATATTATTGAATTTATAAAGAGCAGTTCCTTGGTCTAATAGAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTATATTATTGAATTTATAAAGAGCAGTTCCTTGGTCTAATAGAT  541

seq1  AATTGAAAATATCAAAACAGTCAATAAATTTGTATGTTTTATTTAACTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAAAATATCAAAACAGTCAATAAATTTGTATGTTTTATTTAACTGT  591

seq1  TTGAGATAGCAAACCTAGACTACTGGAAGTTGGTGTGTTGCTCATGCAGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATAGCAAACCTAGACTACTGGAAGTTGGTGTGTTGCTCATGCAGT  641

seq1  CCCTGAAATACTGAACTTGTGGCAACATCCAGAGTGACAGGATTGCAGAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAAATACTGAACTTGTGGCAACATCCAGAGTGACAGGATTGCAGAT  691

seq1  TTGTGTTATCAGGCCTGGAAAACTTACCTGTTTGAACAATAGAGAGACAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTATCAGGCCTGGAAAACTTACCTGTTTGAACAATAGAGAGACAG  741

seq1  ACAAATGTACAAGACAAAAAAAAAAGTTTTCAACTTATGCCTAACAAAAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTACAAGACAAAAAAAAAAGTTTTCAACTTATGCCTAACAAAAC  791

seq1  TGGAATTCCATAGATGCTATCTATGTTTAATTGAGAAAAAAAAAGATTTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTCCATAGATGCTATCTATGTTTAATTGAGAAAAAAAAAGATTTC  841

seq1  CCATCTCATGCACTGTGTTCAGACTAACTTCTTAAATAAGCATCAACTAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCATGCACTGTGTTCAGACTAACTTCTTAAATAAGCATCAACTAT  891

seq1  TGTTAATTCAACATTATGTATTTTGATATTTCCATCTCTCCACATATGTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATTCAACATTATGTATTTTGATATTTCCATCTCTCCACATATGTA  941

seq1  GTGTGGTGTGTATATGCCACATAGATGTTTTGCTTGAAAGATAAAAAGAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGTGTGTATATGCCACATAGATGTTTTGCTTGAAAGATAAAAAGAA  991

seq1  AACAACATACTATTTCATAAGCATTCTTACTCAAGAGCCAAATAAAATGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACATACTATTTCATAAGCATTCTTACTCAAGAGCCAAATAAAATGG  1041

seq1  GGGATTAAAAAGCTGGAAAATGTGTTTGTAATGGAATGATGGATCAAACA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATTAAAAAGCTGGAAAATGTGTTTGTAATGGAATGATGGATCAAACA  1091

seq1  TAGCAGATTTGCATATACAGAATTC  1122
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGATTTGCATATACAGAATTC  1116


seq1: chr11_92269419_92270516
seq2: B6Ng01-319H17.g_65_1156

seq1  GAATTCCATCATTAGTAAAAGCATGGATAAACTATAGTTTGTACTGTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCATTAGTAAAAGCATGGATAAACTATAGTTTGTACTGTCAT  50

seq1  GTAAAATAAACCAGAAAAAGACATTTGCCATGTGATCTCATAGGTGGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATAAACCAGAAAAAGACATTTGCCATGTGATCTCATAGGTGGTAA  100

seq1  AACATGAAACTCATAGCAACAAAATGTAGATTGCTGGTTAGTAGGAGCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGAAACTCATAGCAACAAAATGTAGATTGCTGGTTAGTAGGAGCTG  150

seq1  TGGTCAGGAAGAGAATACATTGACATCAACCAAAGTCTCTAAAATTTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGGAAGAGAATACATTGACATCAACCAAAGTCTCTAAAATTTCTG  200

seq1  TTTGGAAGAACCACATGATTAATGGTACAACATGGCAACTGCAGTTGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAAGAACCACATGATTAATGGTACAACATGGCAACTGCAGTTGGAA  250

seq1  TAACATCTGGTATGCTTGAAAATACTCAGAAGATGACAGAAAATGACTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTGGTATGCTTGAAAATACTCAGAAGATGACAGAAAATGACTTC  300

seq1  TCAGCACAAATAACATGATCACGGAAAGCCATGCTAACAATAGCTTCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCACAAATAACATGATCACGGAAAGCCATGCTAACAATAGCTTCATT  350

seq1  CACAGCATACATTTCTTTTTAAAGATCTGGTTGTATCTCATAAAATATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCATACATTTCTTTTTAAAGATCTGGTTGTATCTCATAAAATATAC  400

seq1  AACATGTACTTGTCAAAGATAAAAATTAAATGCTGAAATGGTACATAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGTACTTGTCAAAGATAAAAATTAAATGCTGAAATGGTACATAGTA  450

seq1  CTTTATTACTGAAACAAGACACTTTTTCCTGCTTATTGCTTCACCAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTACTGAAACAAGACACTTTTTCCTGCTTATTGCTTCACCAAAGA  500

seq1  AGTATTTTGGATGTTTTAAGATCTTTTTTTTTTTAACTAAAGATGCAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTTGGATGTTTTAAGATCTTTTTTTTTTTAACTAAAGATGCAACC  550

seq1  TTGTAAGTTTCTAAGTGTCTCCTTGTACATTTGGCAATAGGTTTTCTAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGTTTCTAAGTGTCTCCTTGTACATTTGGCAATAGGTTTTCTAGG  600

seq1  GAAATAGCTGGCTGTGGAATCACTGTGCCTAAGGATATTGGATCTTTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAGCTGGCTGTGGAATCACTGTGCCTAAGGATATTGGATCTTTTGA  650

seq1  TTAACTAGAATCTGCTAAATGAAGTGGCATTTAGACTTATTCTCAGTAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTAGAATCTGCTAAATGAAGTGGCATTTAGACTTATTCTCAGTAGA  700

seq1  AGGAAACTCTTGAAGGACATTGAAGTAGGGCATCAGTATGATCAAATTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACTCTTGAAGGACATTGAAGTAGGGCATCAGTATGATCAAATTAT  750

seq1  GTCTCAGAACTCTCTGCCAGCATATGAAGACTTACTTAGAGACAGGTGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGAACTCTCTGCCAGCATATGAAGACTTACTTAGAGACAGGTGAA  800

seq1  GATAGAAGACTTGACCCAGGCAGGGCTCAAGGGAGATGGGGATGTAGGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGAAGACTTGACCCAGGCAGGGCTCAAGGGAGATGGGGATGTAGGGA  850

seq1  GAGAGAATTGCCAGAGATGGTGATTTT-GGCCTAAGTGCTCATGGGAGTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAATTGCCAGAGATGGTGATTTTGGGCCTAAGTGCTCATGGGAGTT  900

seq1  TCCTGAGATGATCTCTGAGTCTCTTCACATACAGATAGGCTGATTATCTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGATGATCTCTGAGTCTCTTCACATACAGATAGGCTGATTATCTT  950

seq1  TTTTTTTCTTTCTTTCTTCACATCCTTACCAACTA-CTCAGGCAGCATTT  998
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||
seq2  TTTTTTTCTTTCTTTCTTCACATCCTTA-CAACTACCTCAGACAGCATTT  999

seq1  TTTTGTTTGTTTGTTTTGGAAATGTGACATATATC-ATGGTGTTTCAAAA  1047
      ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||  ||
seq2  TTTTGTTTG-TTGTTT--GGAATGTGACATATATCAATGGTGCTTC--AA  1044

seq1  TTCTGTTCTTCCAGTCA-GTGCGCTAAATTGGAATCTCTTTAGGATGTGT  1096
      |||||||| |||||||| |||| ||||  | ||| ||| |||||||||||
seq2  TTCTGTTC-TCCAGTCAGGTGCACTAA--TTGAAACTC-TTAGGATGTGT  1090

seq1  AA  1098
      ||
seq2  AA  1092


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |