BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-320O05
Chromosome11 (Build37)
Map Location 72,284,545 - 72,448,509
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9830002I17Rik, LOC432577, Ube2g1
Upstream gene9230020A06Rik, Wscd1, Aipl1, 6720460F02Rik, Pitpnm3, 4933427D14Rik, Txnl5, Med31, 4930563E22Rik, Slc13a5, Fbxo39, LOC628100, Tekt1, D130058I21Rik, Ggt6, Mybbp1a
Downstream geneAnkfy1, Cyb5d2, Zzef1, LOC627119, Atp2a3, P2rx1, LOC100043309, Camkk1, 1200014J11Rik, Itgae, Gsg2, P2rx5, Tmem93, Tax1bp3, Ctns, Carkl, Trpv1, Trpv3, Aspa, Spata22, Olfr20, Olfr376, Olfr377-ps1, Olfr1, Olfr75-ps1, Olfr378, Olfr379-ps1, Olfr380, Olfr381, Olfr382, Olfr383-ps1, Olfr385, Olfr386
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-320O05.bB6Ng01-320O05.g
ACCGA110142GA110143
length1,0801,061
definitionB6Ng01-320O05.b B6Ng01-320O05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,447,425 - 72,448,509)(72,284,545 - 72,285,614)
sequence
gaattcattcacttctcaactgatctatcttttctctatttctaccatta
tcctgtcctgcagcagttcatatactcagtgcaagtaagtcaaagaatga
acctgtgaaaatgtcactcctgtgtgtaattgtatcacttctatatggaa
atatctctaatggtagctcactcaaagtaaaagccaacactctcactgac
taataacaagactctttcctaggcttccatgtgccccaggctgtataaaa
gcccctctgcccacttcaaggcttctgtgcttgttattctctccacctag
aaagctagtccctcagacaatcaacatgtcacccccaacctatccacatc
accaatcttactttccctgaagggcactcatcactaataggttagacctt
ttaacttaattgtctggcttattatctctcttatgctagcaagaatttta
tgctgttcattaaaatgttgctatttttagaagtatgcactcaagttatt
tgttaaacttggatttagatctaaagatttcattttatttatcagaagtt
taaggctagcaagtctaaattttacatgatcctatgacttaagatatcaa
gactataacaagggcaaacccccttggcctacttaggaaaagtagataat
tttactactgtttttcaaacttttatttttgcaggagggggagggggatt
ccactggtaaatttctcttcaactgcaacagatagccccagggcttttgt
ctctagagtagctacctctggggaaaaaaaaataatgattattaggatta
aaacaaaactaaggaaaacaaatgttagaactccactgggtttctaaaac
acactaacacttgaggcagggccaaattactattcaaaagtaaaaataga
tctgttaatgtgaggaattattaagaaataacaagtataacaagaaaccc
aatcaggaataatataagaaatattttcttaatttcctaaatcgaaatag
tgtgtggttgtgatgtgtgtgatgcactaggaatttttttgcatgtaaaa
tacagccacatgagttcctcctttcctttt
gaattcaatctgtagtccaggctagcccaaaattcagagccttcttaaat
gcttgagatttcagatgtgagctaccatgcctggctagttatatctattt
ttaaaatcttcttaaaaaaaaaaaaaacaagcctattatctatagctctt
caggctgcttccaggaccagctgccagctctcacaaaggtgagttgcctg
tggcatctgtatttttcccctggtgctgggaatggaccggaaggccttgt
gcctgtggggtaagcactctaccactacatcatacattcttcatgtagtc
tgtcctgctgtgcactgttcacttcgaatgtgagtttgtcttcagggaga
gccgtcactgtgtccatgtcagttttggatcacgaaggcttccctaaaga
gccatttggatttgctctcactggggtccctggaaacagatggcttctat
ggaaaaaagaggccggaggccactgggactggcaccaggctctctgcaaa
aagtcagaggcaacatctgctgggagtgggacctctaccagctgaactgt
ctgccagcctggacaagcttgggatccgggagcttgcctgagtcctggca
ggaaactgagtctgtcttgtgaccctgaaagtctaagctagcaccggtct
gagctttgggtaaaaagccgccaacctggaagatgaccagcaatgcacag
ggagctatagaaccagcattcaggggaagcctgctttgatatcctgtgct
gcgtgtgtttgaaaattttgtgaaaatgtcattatgaacactgccaagtg
cccagcagatacaactgccctccgagctctgaaacatgacttcagctcca
tctcccacaccagcttttgactttagctctttgcttctggcacctgggaa
ttccctgttagctttagctttcaagtgcagctatgtaatttaacaggttt
ttctcttcatattttccttgagcttgagagccagtgtggtggttggggcg
gctctgaattatctactatgactgacagatggtcttgccaagcatgaaaa
gccccactgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_72447425_72448509
seq2: B6Ng01-320O05.b_53_1132 (reverse)

seq1  AAAAGGAAGAGAGG-ACTCATGGTGGTTTGTATTTTACACTGCAAAAAAT  49
      ||||||||  |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| 
seq2  AAAAGGAAAGGAGGAACTCAT-GTGG-CTGTATTTTACA-TGCAAAAAAA  47

seq1  TTCCTAGTGGCATTCACACACATCACAAACACACACTAATTTCGATTTAG  99
      |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  TTCCTAGT-GCA-TCACACACATCACAACCACACACT-ATTTCGATTTAG  94

seq1  GAAATTAAGAAAATATTTCTTATATTATTCCTTGATTGGGTTTCTTGTTA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAAGAAAATATTTCTTATATTATTCC-TGATTGGGTTTCTTGTTA  143

seq1  TACTTGTTATTTCTTATTAATTCCTCACATTAACAGATCTA-TTTTACTT  198
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TACTTGTTATTTCTTAATAATTCCTCACATTAACAGATCTATTTTTACTT  193

seq1  TTGAATAGTAATTTGGCCCTGCCTCAAGTGTTAGTGTGTTTTAGAAACCC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAGTAATTTGGCCCTGCCTCAAGTGTTAGTGTGTTTTAGAAACCC  243

seq1  AGTGGAGTTCTAACATTTGTTTTCCTTAGTTTTGTTTTAATCCTAATAAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAGTTCTAACATTTGTTTTCCTTAGTTTTGTTTTAATCCTAATAAT  293

seq1  CATTATTTTTTTTTCCCCAGAGGTAGCTACTCTAGAGACAAAAGCCCTGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTTTTTTTTCCCCAGAGGTAGCTACTCTAGAGACAAAAGCCCTGG  343

seq1  GGCTATCTGTTGCAGTTGAAGAGAAATTTACCAGTGGAATCCCCCTCCCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATCTGTTGCAGTTGAAGAGAAATTTACCAGTGGAATCCCCCTCCCC  393

seq1  CTCCTGCAAAAATAAAAGTTTGAAAAACAGTAGTAAAATTATCTACTTTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCAAAAATAAAAGTTTGAAAAACAGTAGTAAAATTATCTACTTTT  443

seq1  CCTAAGTAGGCCAAGGGGGTTTGCCCTTGTTATAGTCTTGATATCTTAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGTAGGCCAAGGGGGTTTGCCCTTGTTATAGTCTTGATATCTTAAG  493

seq1  TCATAGGATCATGTAAAATTTAGACTTGCTAGCCTTAAACTTCTGATAAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGGATCATGTAAAATTTAGACTTGCTAGCCTTAAACTTCTGATAAA  543

seq1  TAAAATGAAATCTTTAGATCTAAATCCAAGTTTAACAAATAACTTGAGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGAAATCTTTAGATCTAAATCCAAGTTTAACAAATAACTTGAGTG  593

seq1  CATACTTCTAAAAATAGCAACATTTTAATGAACAGCATAAAATTCTTGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTCTAAAAATAGCAACATTTTAATGAACAGCATAAAATTCTTGCT  643

seq1  AGCATAAGAGAGATAATAAGCCAGACAATTAAGTTAAAAGGTCTAACCTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAAGAGAGATAATAAGCCAGACAATTAAGTTAAAAGGTCTAACCTA  693

seq1  TTAGTGATGAGTGCCCTTCAGGGAAAGTAAGATTGGTGATGTGGATAGGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGATGAGTGCCCTTCAGGGAAAGTAAGATTGGTGATGTGGATAGGT  743

seq1  TGGGGGTGACATGTTGATTGTCTGAGGGACTAGCTTTCTAGGTGGAGAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTGACATGTTGATTGTCTGAGGGACTAGCTTTCTAGGTGGAGAGA  793

seq1  ATAACAAGCACAGAAGCCTTGAAGTGGGCAGAGGGGCTTTTATACAGCCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAGCACAGAAGCCTTGAAGTGGGCAGAGGGGCTTTTATACAGCCT  843

seq1  GGGGCACATGGAAGCCTAGGAAAGAGTCTTGTTATTAGTCAGTGAGAGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCACATGGAAGCCTAGGAAAGAGTCTTGTTATTAGTCAGTGAGAGTG  893

seq1  TTGGCTTTTACTTTGAGTGAGCTACCATTAGAGATATTTCCATATAGAAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTTTTACTTTGAGTGAGCTACCATTAGAGATATTTCCATATAGAAG  943

seq1  TGATACAATTACACACAGGAGTGACATTTTCACAGGTTCATTCTTTGACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACAATTACACACAGGAGTGACATTTTCACAGGTTCATTCTTTGACT  993

seq1  TACTTGCACTGAGTATATGAACTGCTGCAGGACAGGATAATGGTAGAAAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGCACTGAGTATATGAACTGCTGCAGGACAGGATAATGGTAGAAAT  1043

seq1  AGAGAAAAGATAGATCAGTTGAGAAGTGAATGAATTC  1085
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAAGATAGATCAGTTGAGAAGTGAATGAATTC  1080

seq1: chr11_72284545_72285614
seq2: B6Ng01-320O05.g_68_1128

seq1  GAATTCAATCTGTAGTCCAGGCTAGCCCAAAATTCAGAGCCTTCTTAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCTGTAGTCCAGGCTAGCCCAAAATTCAGAGCCTTCTTAAAT  50

seq1  GCTTGAGATTTCAGATGTGAGCTACCATGCCTGGCTAGTTATATCTATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGATTTCAGATGTGAGCTACCATGCCTGGCTAGTTATATCTATTT  100

seq1  TTAAAATCTTCTTAAAAAAAAAAAAAACAAGCCTATTATCTATAGCTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATCTTCTTAAAAAAAAAAAAAACAAGCCTATTATCTATAGCTCTT  150

seq1  CAGGCTGCTTCCAGGACCAGCTGCCAGCTCTCACAAAGGTGAGTTGCCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGCTTCCAGGACCAGCTGCCAGCTCTCACAAAGGTGAGTTGCCTG  200

seq1  TGGCATCTGTATTTTTCCCCTGGTGCTGGGAATGGACCGGAAGGCCTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCTGTATTTTTCCCCTGGTGCTGGGAATGGACCGGAAGGCCTTGT  250

seq1  GCCTGTGGGGTAAGCACTCTACCACTACATCATACATTCTTCATGTAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGGGGTAAGCACTCTACCACTACATCATACATTCTTCATGTAGTC  300

seq1  TGTCCTGCTGTGCACTGTTCACTTCGAATGTGAGTTTGTCTTCAGGGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGCTGTGCACTGTTCACTTCGAATGTGAGTTTGTCTTCAGGGAGA  350

seq1  GCCGTCACTGTGTCCATGTCAGTTTTGGATCACGAAGGCTTCCCTAAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGTCACTGTGTCCATGTCAGTTTTGGATCACGAAGGCTTCCCTAAAGA  400

seq1  GCCATTTGGATTTGCTCTCACTGGGGTCCCTGGAAACAGATGGCTTCTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTTGGATTTGCTCTCACTGGGGTCCCTGGAAACAGATGGCTTCTAT  450

seq1  GGAAAAAAGAGGCCGGAGGCCACTGGGACTGGCACCAGGCTCTCTGCAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAAGAGGCCGGAGGCCACTGGGACTGGCACCAGGCTCTCTGCAAA  500

seq1  AAGTCAGAGGCAACATCTGCTGGGAGTGGGACCTCTACCAGCTGAACTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGAGGCAACATCTGCTGGGAGTGGGACCTCTACCAGCTGAACTGT  550

seq1  CTGCCAGCCTGGACAAGCTTGGGATCCGGGAGCTTGCCTGAGTCCTGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAGCCTGGACAAGCTTGGGATCCGGGAGCTTGCCTGAGTCCTGGCA  600

seq1  GGAAACTGAGTCTGTCTTGTGACCCTGAAAGTCTAAGCTAGCACCGGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACTGAGTCTGTCTTGTGACCCTGAAAGTCTAAGCTAGCACCGGTCT  650

seq1  GAGCTTTGGGTAAAAAGCCGCCAACCTGGAAGATGACCAGCAATGCACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTTGGGTAAAAAGCCGCCAACCTGGAAGATGACCAGCAATGCACAG  700

seq1  GGAGCTATAGAACCAGCATTCAGGGGAAGCCTGCTTTGATATCCTGTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTATAGAACCAGCATTCAGGGGAAGCCTGCTTTGATATCCTGTGCT  750

seq1  GCGTGTGTTTGAAAATTTTGTGAAAATGTCATTATGAACACTGCCAAGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGTGTTTGAAAATTTTGTGAAAATGTCATTATGAACACTGCCAAGTG  800

seq1  CCCAGCAGATACAACTGCCCTCCGAGCTCTGAAACATGACTTCAGCTCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCAGATACAACTGCCCTCCGAGCTCTGAAACATGACTTCAGCTCCA  850

seq1  TCTCCCACACCAGCTTTTGACTTTAGCTCTTTGCTTCTGGCACCTGGGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCACACCAGCTTTTGACTTTAGCTCTTTGCTTCTGGCACCTGGGAA  900

seq1  TTCCCTGTTAGCTTTAGCTTTCAAGTGCAGCTATGTAATTTAAACAGG-T  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  TTCCCTGTTAGCTTTAGCTTTCAAGTGCAGCTATGTAATTT-AACAGGTT  949

seq1  TTTCTCTTCATATTTT-CTTGAGCTTGGAGAGCAAGGTGTGGGTGGGTGG  998
      |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||| |||
seq2  TTTCTCTTCATATTTTCCTTGAGCTT-GAGAGCCA-GTGT-GGTGGTTGG  996

seq1  GGGCGGGGCTCTGA--TATCTACCTATGAACTGACCAGATGTCCTTTCCC  1046
      |   | ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||  | || ||
seq2  G---GCGGCTCTGAATTATCTA-CTATG-ACTGA-CAGATGGTC-TTGCC  1039

seq1  AAGCATGAAAAAAGCCCCACTGAA  1070
      |||||||  |||||||||||||||
seq2  AAGCATG--AAAAGCCCCACTGAA  1061