BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-327D13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 91,750,301 - 91,857,356
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-327D13.bB6Ng01-327D13.g
ACCGA114827GA114828
length1,0041,117
definitionB6Ng01-327D13.b B6Ng01-327D13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,750,301 - 91,751,212)(91,856,236 - 91,857,356)
sequence
gaattctttaattttagcagacagtatgattaaaggacagattgaaggag
ttaagaaagaacagtttcagttttatgcagcctacccaaactacaaaaac
gtttttaaagtgtagccaaaacaggctgcatgataataaacacaggtttt
ctgaagtaatttttaaaaatctaggcaaagggcaaagataggcatcatat
aatcatataacagcatactcatatatcacacatacacatacacacacaga
gagacacaccacacacatacacaccacacaaacacacacacacacacaca
caaacacacatacacacacacaccacacacacacacacacaaacacacat
acacaccacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cttctgaagtggcagtgtatccaggcagaacattttttggtttctcccac
gacatttgtggcactattgcaacagtagacatggtttggcatggcagtta
ttgttgatgcttgcatggttcatagctatataagacaggtaattctttga
cttctctggaagtatgcatagaatctcccagcacaaaatctacctactca
agatgaaactcctagggcaggacagaaccatcctgattttcccatgtggt
atgactcaagtatattccatcatcagcattggttgaaatccataccatgt
gttattatttacagcaatatgttatgtagacacaggccatagcctctgag
agagaacctagtgctataactacaattatttgctaagtggacatagtatt
aattgcctccctaatgagtatgcacagattagagcatcggtctacccgcc
tcagagaagcttcttttctgtattatggtaaatatcatgaagagtttatt
accctttcaagacagaaaacacataacacagataaattatatgtttccct
aaatggggacatctatatcatttgcccttttcctaagactctgagaccat
agtg

gaattccttggggacaagtggtttgtgttcaattttgtttgttgtatgag
tttgtgtttgcagtacacaagacactcaccaatacaaaaactggcttaca
aaacctgcatatgtagtgactaaaagaataaatgcatgaataaaggaagt
ggcattattcataacagagctgaacagtcaccttctgtgagtgtgttttc
tctgtatccctgtcaagttgcctttgggtagtatgaggacagaaggggaa
cttcttaaacacacagatgctgtgtaggtgtggggaacacctaaagcaca
cacacatgcatacatagtgagagaattcaatatttatgtatctagtttag
cataaagaatctttcaaagatttcaacacacttcttatgttcttgaggga
aagctgactaggacatattgagagagcactggcgtgaaagcaagggatgg
gaagaaacaggagtcagtgaatcgtgggaataaacttaacatgtgcagtg
catggatgccagcataacagaacccctgagaatatcctgaaggtagagat
ggcaaactgggcaaagctctcaatggataaagcaccacctctgaaaggct
atgggctcaagtgaacatcctcaaagctgatgtaaaatcctgatgtggtg
accatgtctgaaacttcaggacagagtagagtgtcaggagtatcttggga
gctcattggctagccaatctagcaaagataatgatttcccagctcagaag
ataccctgtattcaatgtaatacagcaaccagaggaagaagcccctgatg
tctactttggggttccatatgatcaaatcaaggaaacttgcacacatata
tgcatacacggtacatatacacagaaagaaaaaatgtgacagatatgagt
tgttctcatagaacattgaacctgataatttaacagatttgagccttaga
ttttgaaatgtttagatcattttcccctacaatcccagtaatataacact
caaacctctgaacttatttagtttatgcttcatgacatagttttatatgc
taattgtgcctattatgagctaataattttttctgtggttttgaactatt
tttacaaaattactgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_91750301_91751212
seq2: B6Ng01-327D13.b_45_960

seq1  GAATTCTTTAATTTTAGCAGACAGTATGATTAAAGGACAGATTGAAGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAATTTTAGCAGACAGTATGATTAAAGGACAGATTGAAGGAG  50

seq1  TTAAGAAAGAACAGTTTCAGTTTTATGCAGCCTACCCAAACTACAAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGAAAGAACAGTTTCAGTTTTATGCAGCCTACCCAAACTACAAAAAC  100

seq1  GTTTTTAAAGTGTAGCCAAAACAGGCTGCATGATAATAAACACAGGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAAAGTGTAGCCAAAACAGGCTGCATGATAATAAACACAGGTTTT  150

seq1  CTGAAGTAATTTTTAAAAATCTAGGCAAAGGGCAAAGATAGGCATCATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGTAATTTTTAAAAATCTAGGCAAAGGGCAAAGATAGGCATCATAT  200

seq1  AATCATATAACAGCATACTCATATATCACACATACACATACACACACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATATAACAGCATACTCATATATCACACATACACATACACACACAGA  250

seq1  GAGACACACCACACACATACACACCACACAAACACACACACACACACACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACACACCACACACATACACACCACACAAACACACACACACACACACA  300

seq1  CAAACACACATACACACACACACCACACACACACACACACAAACACACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACACATACACACACACACCACACACACACACACACAAACACACAT  350

seq1  ACACACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  400

seq1  CTTCTGAAGTGGCAGTGTATCCAGGCAGAACATTTTTTGGTTTCTCCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGAAGTGGCAGTGTATCCAGGCAGAACATTTTTTGGTTTCTCCCAC  450

seq1  GACATTTGTGGCACTATTGCAACAGTAGACATGGTTTGGCATGGCAGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTTGTGGCACTATTGCAACAGTAGACATGGTTTGGCATGGCAGTTA  500

seq1  TTGTTGATGCTTGCATGGTTCATAGCTATATAAGACAGGTAATTCTTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGATGCTTGCATGGTTCATAGCTATATAAGACAGGTAATTCTTTGA  550

seq1  CTTCTCTGGAAGTATGCATAGAATCTCCCAGCACAAAATCTACCTACTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTGGAAGTATGCATAGAATCTCCCAGCACAAAATCTACCTACTCA  600

seq1  AGATGAAACTCCTAGGGCAGGACAGAACCATCCTGATTTTCCCATGTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAAACTCCTAGGGCAGGACAGAACCATCCTGATTTTCCCATGTGGT  650

seq1  ATGACTCAAGTATATTCCATCATCAGCATTGGTTGAAATCCATACCATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTCAAGTATATTCCATCATCAGCATTGGTTGAAATCCATACCATGT  700

seq1  GTTATTATTTACAGCAATATGTTATGTAGACACAGGCCATAGCCTCTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTATTTACAGCAATATGTTATGTAGACACAGGCCATAGCCTCTGAG  750

seq1  AGAGAACCTAGTGCTATAACTACAATTATTTGCTAAGTGGACATAGTATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACCTAGTGCTATAACTACAATTATTTGCTAAGTGGACATAGTATT  800

seq1  AATTGCCT-CCTAATGAGTATGCACAGATTAGAGCATCGGTCTACCCGCC  849
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCCTCCCTAATGAGTATGCACAGATTAGAGCATCGGTCTACCCGCC  850

seq1  TCAGAGAAGCTTC-TTTCTGTATTATGGTAAATATCATGAAGAG-TTATT  897
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCAGAGAAGCTTCTTTTCTGTATTATGGTAAATATCATGAAGAGTTTATT  900

seq1  A-CCTTTCAAGACAGA  912
      | ||||||||||||||
seq2  ACCCTTTCAAGACAGA  916


seq1: chr11_91856236_91857356
seq2: B6Ng01-327D13.g_65_1181 (reverse)

seq1  ATCAGTAAATTTTGTAAAAAAATAGTTTAAAA-CACAGAAAAATATTA--  47
      |||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||  
seq2  ATCAGT-AATTTTGT--AAAAATAGTTCAAAACCACAGAAAAA-ATTATT  46

seq1  AGCTCAATAATA-GCAC-ATTAGCATATAAAACTATGTCCATTGAAGCAT  95
      ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||
seq2  AGCTC-ATAATAGGCACAATTAGCATATAAAACTATGTC--ATGAAGCAT  93

seq1  AAACTAAATAAGTTCAGAGG-TTGAGTGTTTATATTACTGGGATTGTAGG  144
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAATAAGTTCAGAGGTTTGAGTG-TTATATTACTGGGATTGTAGG  142

seq1  GGAAAATGATCTAAAACATTTCAAAATCTAAGGCTCAAATCTGTTAAATT  194
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAATGATCT-AAACATTTCAAAATCTAAGGCTCAAATCTGTTAAATT  191

seq1  ATCAGGTTCAATGTTCTATGAGAACAACTCATATCTGTCACATTTTTTCT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGTTCAATGTTCTATGAGAACAACTCATATCTGTCACATTTTTTCT  241

seq1  TTCTGTGTATATGTACCGTGTATGCATATATGTGTGCAAGTTTCCTTGAT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGTATATGTACCGTGTATGCATATATGTGTGCAAGTTTCCTTGAT  291

seq1  TTGATCATATGGAACCCCAAAGTAGACATCAGGGGCTTCTTCCTCTGGTT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCATATGGAACCCCAAAGTAGACATCAGGGGCTTCTTCCTCTGGTT  341

seq1  GCTGTATTACATTGAATACAGGGTATCTTTCTGAGCTGGGAAATCATTAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTATTACATTGAATACAGGGTATC-TTCTGAGCTGGGAAATCATTAT  390

seq1  CTTTGCTAGATTGGCTAGCCAATGAGCTCCCAAGATACTCCTGACACTCT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTAGATTGGCTAGCCAATGAGCTCCCAAGATACTCCTGACACTCT  440

seq1  ACTCTGTCCTGAAGTTTCAGACATGGTCACCACATCAGGATTTTACATCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGTCCTGAAGTTTCAGACATGGTCACCACATCAGGATTTTACATCA  490

seq1  GCTTTGAGGATGTTCACTTGAGCCCATAGCCTTTCAGAGGTGGTGCTTTA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGAGGATGTTCACTTGAGCCCATAGCCTTTCAGAGGTGGTGCTTTA  540

seq1  TCCATTGAGAGCTTTGCCCAGTTTGCCATCTCTACCTTCAGGATATTCTC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTGAGAGCTTTGCCCAGTTTGCCATCTCTACCTTCAGGATATTCTC  590

seq1  AGGGGTTCTGTTATGCTGGCATCCATGCACTGCACATGTTAAGTTTATTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTTCTGTTATGCTGGCATCCATGCACTGCACATGTTAAGTTTATTC  640

seq1  CCACGATTCACTGACTCCTGTTTCTTCCCATCCCTTGCTTTCACGCCAGT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGATTCACTGACTCCTGTTTCTTCCCATCCCTTGCTTTCACGCCAGT  690

seq1  GCTCTCTCAATATGTCCTAGTCAGCTTTCCCTCAAGAACATAAGAAGTGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTCAATATGTCCTAGTCAGCTTTCCCTCAAGAACATAAGAAGTGT  740

seq1  GTTGAAATCTTTGAAAGATTCTTTATGCTAAACTAGATACATAAATATTG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAATCTTTGAAAGATTCTTTATGCTAAACTAGATACATAAATATTG  790

seq1  AATTCTCTCACTATGTATGCATGTGTGTGTGCTTTAGGTGTTCCCCACAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTCTCACTATGTATGCATGTGTGTGTGCTTTAGGTGTTCCCCACAC  840

seq1  CTACACAGCATCTGTGTGTTTAAGAAGTTCCCCTTCTGTCCTCATACTAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAGCATCTGTGTGTTTAAGAAGTTCCCCTTCTGTCCTCATACTAC  890

seq1  CCAAAGGCAACTTGACAGGGATACAGAGAAAACACACTCACAGAAGGTGA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGGCAACTTGACAGGGATACAGAGAAAACACACTCACAGAAGGTGA  940

seq1  CTGTTCAGCTCTGTTATGAATAATGCCACTTCCTTTATTCATGCATTTAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCAGCTCTGTTATGAATAATGCCACTTCCTTTATTCATGCATTTAT  990

seq1  TCTTTTAGTCACTACATATGCAGGTTTTGTAAGCCAGTTTTTGTATTGGT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAGTCACTACATATGCAGGTTTTGTAAGCCAGTTTTTGTATTGGT  1040

seq1  GAGTGTCTTGTGTACTGCAAACACAAACTCATACAACAAACAAAATTGAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTCTTGTGTACTGCAAACACAAACTCATACAACAAACAAAATTGAA  1090

seq1  CACAAACCACTTGTCCCCAAGGAATTC  1121
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACCACTTGTCCCCAAGGAATTC  1117


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |