BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328H09
Chromosome11 (Build37)
Map Location 92,092,260 - 92,217,214
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG664976, Kif2b
Downstream geneLOC382545, LOC100039286, Car10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328H09.bB6Ng01-328H09.g
ACCGA115718GA115719
length1,137569
definitionB6Ng01-328H09.b B6Ng01-328H09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,092,260 - 92,093,403)(92,216,640 - 92,217,214)
sequence
gaattcttgtttaagctgaagctaaaccattctataagtcaacaggagtg
tgatgttcctggtttaaagaatgtaatctgctttatgggcattgccctta
aatgtattctatatgttggacatcctaattagtttaggtggtttttaatt
ccactcttttgactcagaagagcttaggtactcacacagggtgcagatag
tgaacaaaatttgagagaacaacaaatttttaagctggatttatacctta
gctgcctcatcaaatgtggttacagtaaaatagcaatgaattacaaagaa
aaaaataaaagtgcattctctgtcatcattgctgtggacactgatttctt
tactcaacctttttattataagaacaagttggttttgcttacctgcacct
cactatgcaaataatctttcaaacctcatttatcagacaggcgactgtaa
tatggaaggaaggctgaaggtaggttttagtactgttggtggtggttggg
gaataatgctagcagacattttttgtattaagatttgactacaattgaaa
caaaagatctgaaatttagatcaatattggaatcacttttgtgtgtgtgt
gtatatacatattatatatgtatataatgtatacatatataatatgtata
taatgtatataatgtatacatatataatatgtatacacacatacataaga
gtctatgctgcaacattggggattattatttaattaattgattattatta
tttaattaataattatttaattattatttaaggttcagttttggcaaaaa
aaatgtttaaaatacccagtaattgtaatagataactaaaattggaaatc
tctgcaaaaactaataccttaccacagcaaaaacacataattaaatatac
acagtggttgtctttcttcagtgaatgactgcaagagttctattgcttta
caattttgttttagacactgcaaatatctttttgttttatttgtaataac
catgattactaagtccagttagatcatgttgtggggcagtctctgctcca
catttgattctcctgtaactcattcatgggtattttgctccccttctaga
agcatgcaagatccacacgtttggtctttcttcttga

cttcagtgagagcttggaactccataattgcagatctgaagttgtgagtg
ttgttggttcatttttggactgatatctgtttacatgtcacaaccggatg
gtaaggtatgagcttatatgccaaaagcaatatttctgtatcaagaatcc
attcaaagactatgtgaaattgggcagaataatttcccaagtgaactaaa
atattaaaacagaacttttgatcatatacatagcctttaacacttattct
ttcccaacataaaatatgcagttttatcatctcaaaaagtgtgcctaatt
ttttagcagtgttcattgaaaactgtctgctcaaggtcagatatataata
aaattgaaaacctcatttgaggatgcctttctttgctaagtattggtggt
ggcacacacctttaatcccagcgtttgggaggcagaagcaggcaaatttc
tgaattcaaggccagcctggtttatagagtaagttccagcatggccaggg
tcacacagagaaaccctgtctttaaaatcagacaatggagagagagagag
agagagagagagagagata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_92092260_92093403
seq2: B6Ng01-328H09.b_47_1183

seq1  GAATTCTTGTTTAAGCTGAAGCTAAACCATTCTATAAGTCAACAGGAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTTTAAGCTGAAGCTAAACCATTCTATAAGTCAACAGGAGTG  50

seq1  TGATGTTCCTGGTTTAAAGAATGTAATCTGCTTTATGGGCATTGCCCTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTCCTGGTTTAAAGAATGTAATCTGCTTTATGGGCATTGCCCTTA  100

seq1  AATGTATTCTATATGTTGGACATCCTAATTAGTTTAGGTGGTTTTTAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATTCTATATGTTGGACATCCTAATTAGTTTAGGTGGTTTTTAATT  150

seq1  CCACTCTTTTGACTCAGAAGAGCTTAGGTACTCACACAGGGTGCAGATAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTTTTGACTCAGAAGAGCTTAGGTACTCACACAGGGTGCAGATAG  200

seq1  TGAACAAAATTTGAGAGAACAACAAATTTTTAAGCTGGATTTATACCTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAAAATTTGAGAGAACAACAAATTTTTAAGCTGGATTTATACCTTA  250

seq1  GCTGCCTCATCAAATGTGGTTACAGTAAAATAGCAATGAATTACAAAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCTCATCAAATGTGGTTACAGTAAAATAGCAATGAATTACAAAGAA  300

seq1  AAAAATAAAAGTGCATTCTCTGTCATCATTGCTGTGGACACTGATTTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAAAAGTGCATTCTCTGTCATCATTGCTGTGGACACTGATTTCTT  350

seq1  TACTCAACCTTTTTATTATAAGAACAAGTTGGTTTTGCTTACCTGCACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAACCTTTTTATTATAAGAACAAGTTGGTTTTGCTTACCTGCACCT  400

seq1  CACTATGCAAATAATCTTTCAAACCTCATTTATCAGACAGGCGACTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGCAAATAATCTTTCAAACCTCATTTATCAGACAGGCGACTGTAA  450

seq1  TATGGAAGGAAGGCTGAAGGTAGGTTTTAGTACTGTTGGTGGTGGTTGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAAGGAAGGCTGAAGGTAGGTTTTAGTACTGTTGGTGGTGGTTGGG  500

seq1  GAATAATGCTAGCAGACATTTTTTGTATTAAGATTTGACTACAATTGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATGCTAGCAGACATTTTTTGTATTAAGATTTGACTACAATTGAAA  550

seq1  CAAAAGATCTGAAATTTAGATCAATATTGGAATCACTTTTGTGTGTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGATCTGAAATTTAGATCAATATTGGAATCACTTTTGTGTGTGTGT  600

seq1  GTATATACATATTATATATGTATATAATGTATACATATATAATATGTATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATACATATTATATATGTATATAATGTATACATATATAATATGTATA  650

seq1  TAATGTATATAATGTATACATATATAATATGTATACACACATACATAAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTATATAATGTATACATATATAATATGTATACACACATACATAAGA  700

seq1  GTCTATGCTGCAACATTGGGGATTATTATTTAATTAATTGATTATTATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGCTGCAACATTGGGGATTATTATTTAATTAATTGATTATTATTA  750

seq1  TTTAATTAATAATTATTTAATTATTATTTAAGGTTCAGTTTTGGCAAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTAATAATTATTTAATTATTATTTAAGGTTCAGTTTTGGCAAAAA  800

seq1  AAATGTTTAAAATACCCAGTAATTGTAATAGATAACTAAAATTGGAAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTTAAAATACCCAGTAATTGTAATAGATAACTAAAATTGGAAATC  850

seq1  TCTGCAAAAACTAATACCTTACCACAGCAAAAACACATAATTAAATATAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAAAACTAATACCTTACCACAGCAAAAACACATAATTAAATATAC  900

seq1  ACAGTGGTTGTCTTTCTTCAGTGAATGACTGCAAGAGTTCTATTGCTTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACAGTGGTTGTCTTTCTTCAGTGAATGACTGCAAGAGTTCTATTGCTTT-  949

seq1  ACAATTTTGTTTTAGACACTGCAAATATCTTTTTGTTTTATTTGTAATTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
seq2  ACAATTTTGTTTTAGACACTGCAAATATCTTTTTGTTTTATTTGTAAT--  997

seq1  ACCCATTATTACTAAGTTCAGTTAAGATCATTGTTGTGGGGGCAGTCTCT  1050
      | |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||
seq2  AACCATGATTACTAAGTCCAGTT-AGATCA-TGTTGT-GGGGCAGTCTCT  1044

seq1  GCTCCACATTTGA-TCT-CTGTAACTCCTTCCATGGGTATTTTGTTCCCC  1098
      ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||
seq2  GCTCCACATTTGATTCTCCTGTAACTCATT-CATGGGTATTTTGCT-CCC  1092

seq1  CTTCTAAGAAGGATTGAAGTATCCACAC-TTTGGTCTTTCTTCTTGA  1144
      ||||| ||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTTCT-AGAAGCATGCAAG-ATCCACACGTTTGGTCTTTCTTCTTGA  1137


seq1: chr11_92216640_92217214
seq2: B6Ng01-328H09.g_67_641 (reverse)

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATTGTTTGATTTTAAAG  50
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATTGTCTGATTTTAAAG  50

seq1  ACAGGGTTTCTCTGTGTGACCCTGGCCATGCTGGAACTTACTCTATAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGTTTCTCTGTGTGACCCTGGCCATGCTGGAACTTACTCTATAAAC  100

seq1  CAGGCTGGCCTTGAATTCAGAAATTTGCCTGCTTCTGCCTCCCAAACGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGGCCTTGAATTCAGAAATTTGCCTGCTTCTGCCTCCCAAACGCT  150

seq1  GGGATTAAAGGTGTGTGCCACCACCAATACTTAGCAAAGAAAGGCATCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATTAAAGGTGTGTGCCACCACCAATACTTAGCAAAGAAAGGCATCCT  200

seq1  CAAATGAGGTTTTCAATTTTATTATATATCTGACCTTGAGCAGACAGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAGGTTTTCAATTTTATTATATATCTGACCTTGAGCAGACAGTTT  250

seq1  TCAATGAACACTGCTAAAAAATTAGGCACACTTTTTGAGATGATAAAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGAACACTGCTAAAAAATTAGGCACACTTTTTGAGATGATAAAACT  300

seq1  GCATATTTTATGTTGGGAAAGAATAAGTGTTAAAGGCTATGTATATGATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATTTTATGTTGGGAAAGAATAAGTGTTAAAGGCTATGTATATGATC  350

seq1  AAAAGTTCTGTTTTAATATTTTAGTTCACTTGGGAAATTATTCTGCCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTTCTGTTTTAATATTTTAGTTCACTTGGGAAATTATTCTGCCCAA  400

seq1  TTTCACATAGTCTTTGAATGGATTCTTGATACAGAAATATTGCTTTTGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATAGTCTTTGAATGGATTCTTGATACAGAAATATTGCTTTTGGC  450

seq1  ATATAAGCTCATACCTTACCATCCGGTTGTGACATGTAAACAGATATCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGCTCATACCTTACCATCCGGTTGTGACATGTAAACAGATATCAG  500

seq1  TCCAAAAATGAACCAACAACACTCACAACTTCAGATCTGCAATTATGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAAATGAACCAACAACACTCACAACTTCAGATCTGCAATTATGGAG  550

seq1  TTCCAAGCTCTCACTGAAGGAATTC  575
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAGCTCTCACTGAAGGAATTC  575


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |