BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-340A15
Chromosome11 (Build37)
Map Location 51,436,171 - 51,580,477
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNola2, Rmnd5b, C330016O10Rik, D930048N14Rik, 0610009B22Rik, Sec24a, LOC100040402, Sar1b
Upstream geneAdamts2, Zfp354c, 9630041N07Rik, Grm6, Zfp454, Zfp2, Zfp354b, Prop1, Olfr1379-ps1, Olfr1378, Olfr1377, Olfr226-ps1, Olfr51, Olfr54, Olfr1375-ps1, Zfp354a, LOC100040275, LOC382518, Olfr1374-ps1, 5133400J02Rik, LOC622699, BC049762, Clk4, Col23a1, Agxt2l2, Hnrpab
Downstream genePhf15, D11Ertd497e, Ube2b, Cdkl3, LOC100040437, Ppp2ca, Olfr1373, Olfr1372-ps1, Olfr1371, Skp1a, Tcf7, Vdac1, 9530068E07Rik, LOC667659, LOC667667, LOC100040523, Fstl4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-340A15.bB6Ng01-340A15.g
ACCGA123865GA123866
length1,1701,114
definitionB6Ng01-340A15.b B6Ng01-340A15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,436,171 - 51,437,343)(51,579,354 - 51,580,477)
sequence
gaattcttaggtctgggtggcttgtttttctttttgagatggcatctcag
ctaggactaaagtacatagcacatggctggcaggcttccttcctgtaaga
tggggatcgtctgtatgctaagaatatttgaacacgtgtaaagggtgtca
gagacttatataacagaggtgaatatttgaacatgtgtgaagggtgtcag
agactttatataacagaggtactgccctgcctacagggataccctcatag
gccatgtgggaatattcagtattggcttggaggaccatggcttgagagct
tagtgtacatgatggcaaacaactgaagtatttttaaatgtaatgtttac
caacgggacatggctgcgtgccaggttagggctgtgactcctgttcccag
cagctctcttctctcctgtgtaggacttgggtgcagccacaggctccaag
cgtcccacttgtgtgatcatggtgaagccccatgaagaatatcaggagac
ctacgacaagtgcctggaggaggtgcaggcactgcctacacctctgtgag
agacttgggctgcaacccagcccctttccaagagatctggctggctgcag
gcagctgcccaccctaacagcatctccccgatttcttgctgtgtgagtct
tcccaggcagctccagcagtgttggaggtggagcctgcatctctgccatc
tcctcctgagctttgatgaagacagttccaagaatgtgggatagaagtaa
atgctaaggcgaaaacgtggcaagtgtgtgggtgttcttgaagttggcag
gaggagcaaaagcagcctttcagcacagagcctcaagggtgtacctggca
aatgttctgcactggctctacagcccacccgtcttcatttcccactctag
gacagttggggtgaggagatgaggcatcaaggcccaaaccccacttcaca
cacctccaagagtgatacgcatatatatacacacaagaccatgcaatcat
ggtaaaggagagggctatgaatatatttgcctcaaagttataaaacagca
ttcagttctaacggctatttacagtgagaatgatggtagaatacagtgga
gaactgtacaggtagaaagtgggccacagctggaaaccctttgatgcagg
atagaaagaatgtctgcatt
gaattcactgtgtagatcaggctggctttgaactcagagatctgcctgct
tctgccttcccagtgctggaattaaatgtgtataccactattcttggagt
atggtgtgcttataagtccagcatttgtgacatgacagatcatagtgaat
taaggccagcttggactaatgagattctgtctccaacagacaacaatgac
gaccaaaaacagcacagcaaatataagcaagatacacgaagatgaaaatg
ttaacacaggggctggggaggcagttcagacgttaagacctcttgttctt
gctgacccaggctcagttcccagcacctacatggtggctcacaacatctg
taactctaattccaggggatctgatggctacttctggtccacaggcatca
ggcatgcatgcagtacaaatgcatatatgtaggcaaaagacccatacaca
taaatagatgcaggcaaaatacccataacatagagcttttaaaaagtcac
aataaaactcattattttgtatgctaacttccccaggttgtactctgatc
tctacatgctcaacatggcatacacaatccctcccccacatacaagacaa
agagatagcatgctatctgtaatctaatttaccactagaaatacaaagga
caggctggagacatagctcagttagtagagtgcttgcttagcttgcagtt
tgacagcacataagccaggcatgggatagcacacaggcctgtaatctact
cacttgggaggtagacatgagatccaaagttcaaggccagcctgtgctac
caggtaaaactatgcttgaccaagttctgttattgttgtttgtttgttga
cagggtgccactatgtagctggcctgggactttccgtgagccccagccac
ccctgcctgagggctgcactaagggatgcacaaccccatctgccttgcac
ctcggtgttctgcacactaatctcagaagtgctctgcttcacacatctac
ctaaacagcttacgggacaatactgactccagctcattcccaatacaaag
caattgtatgaataaactttttaaaagattattagtttatatattgagca
actgttcagtgtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_51436171_51437343
seq2: B6Ng01-340A15.b_47_1216

seq1  GAATTCTTAGGTCTGGGTGGCTTGTTTTTCTTTTTGAGATGGCATCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGGTCTGGGTGGCTTGTTTTTCTTTTTGAGATGGCATCTCAG  50

seq1  CTAGGACTAAAGTACATAGCACATGGCTGGCAGGCTTCCTTCCTGTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGACTAAAGTACATAGCACATGGCTGGCAGGCTTCCTTCCTGTAAGA  100

seq1  TGGGGATCGTCTGTATGCTAAGAATATTTGAACACGTGTAAAGGGTGTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGATCGTCTGTATGCTAAGAATATTTGAACACGTGTAAAGGGTGTCA  150

seq1  GAGACTTATATAACAGAGGTGAATATTTGAACATGTGTGAAGGGTGTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTTATATAACAGAGGTGAATATTTGAACATGTGTGAAGGGTGTCAG  200

seq1  AGACTTTATATAACAGAGGTACTGCCCTGCCTACAGGGATACCCTCATAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTATATAACAGAGGTACTGCCCTGCCTACAGGGATACCCTCATAG  250

seq1  GCCATGTGGGAATATTCAGTATTGGCTTGGAGGACCATGGCTTGAGAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGTGGGAATATTCAGTATTGGCTTGGAGGACCATGGCTTGAGAGCT  300

seq1  TAGTGTACATGATGGCAAACAACTGAAGTATTTTTAAATGTAATGTTTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTACATGATGGCAAACAACTGAAGTATTTTTAAATGTAATGTTTAC  350

seq1  CAACGGGACATGGCTGCGTGCCAGGTTAGGGCTGTGACTCCTGTTCCCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGGGACATGGCTGCGTGCCAGGTTAGGGCTGTGACTCCTGTTCCCAG  400

seq1  CAGCTCTCTTCTCTCCTGTGTAGGACTTGGGTGCAGCCACAGGCTCCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTCTTCTCTCCTGTGTAGGACTTGGGTGCAGCCACAGGCTCCAAG  450

seq1  CGTCCCACTTGTGTGATCATGGTGAAGCCCCATGAAGAATATCAGGAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCCCACTTGTGTGATCATGGTGAAGCCCCATGAAGAATATCAGGAGAC  500

seq1  CTACGACAAGTGCCTGGAGGAGGTGCAGGCACTGCCTACACCTCTGTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGACAAGTGCCTGGAGGAGGTGCAGGCACTGCCTACACCTCTGTGAG  550

seq1  AGACTTGGGCTGCAACCCAGCCCCTTTCCAAGAGATCTGGCTGGCTGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTGGGCTGCAACCCAGCCCCTTTCCAAGAGATCTGGCTGGCTGCAG  600

seq1  GCAGCTGCCCACCCTAACAGCATCTCCCCGATTTCTTGCTGTGTGAGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGCCCACCCTAACAGCATCTCCCCGATTTCTTGCTGTGTGAGTCT  650

seq1  TCCCAGGCAGCTCCAGCAGTGTTGGAGGTGGAGCCTGCATCTCTGCCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCAGCTCCAGCAGTGTTGGAGGTGGAGCCTGCATCTCTGCCATC  700

seq1  TCCTCCTGAGCTTTGATGAAGACAGTTCCAAGAATGTGGGATAGAAGTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTGAGCTTTGATGAAGACAGTTCCAAGAATGTGGGATAGAAGTAA  750

seq1  ATGCTAAGGCGAAAACGTGGCAAGTGTGTGGGTGTTCTTGAAGTTGGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAGGCGAAAACGTGGCAAGTGTGTGGGTGTTCTTGAAGTTGGCAG  800

seq1  GAGGAGCAAAAGCAGCCTTTCAGCACAGAGCCTCAAGGGTGTACCTGGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCAAAAGCAGCCTTTCAGCACAGAGCCTCAAGGGTGTACCTGGCA  850

seq1  AATGTTCTGCACTGGCTCTACAGCCCACCCGTCTTCATTTCCCACTCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTCTGCACTGGCTCTACAGCCCACCCGTCTTCATTTCCCACTCTAG  900

seq1  GACAGTTGGGGTGAGGAGATGAGGCATCAAGGCCCAAACCCCACTTCACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTGGGGTGAGGAGATGAGGCATCAAGGCCCAAACCCCACTTCACA  950

seq1  CACCTCCAAGAGTGATACGCATATATATACACACAAGACCATGCAATCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCCAAGAGTGATACGCATATATATACACACAAGACCATGCAATCAT  1000

seq1  TGGTAAGGAGAAGGGCTATGAATATATTTG-CTCAAAGTTATAAAACAGC  1049
       |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGGAG-AGGGCTATGAATATATTTGCCTCAAAGTTATAAAACAGC  1049

seq1  ATTCAGTTCTAACGGGTTATTTACAGTGGAGAATGAATGGGTAG-ATACA  1098
      ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||   ||||| |||||
seq2  ATTCAGTTCTAAC-GGCTATTTACAGT-GAGAATGA--TGGTAGAATACA  1095

seq1  GTTGAG-ACTGTACA-GTAGGAAGTGGGCCACAGCTGGAAACCCCTTTGA  1146
      || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGGAGAACTGTACAGGTAGAAAGTGGGCCACAGCTGGAAA-CCCTTTGA  1144

seq1  TGCCAGGAGTAGAAAG-ATGTCTGCATT  1173
      || ||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TG-CAGGA-TAGAAAGAATGTCTGCATT  1170

seq1: chr11_51579354_51580477
seq2: B6Ng01-340A15.g_65_1178 (reverse)

seq1  AGACACTG-ACAGTGTGCTCAAATATATAAAATAAATAAATCTTTTAAAA  49
      |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||   ||||||||||||
seq2  AGACACTGAACAGT-TGCTC-AATATATAAACTAA--TAATCTTTTAAAA  46

seq1  AGTTTAATTCATACAATTGCTTTGTATTGGGGATTGAGCTGGAGTCAGTT  99
      ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
seq2  AGTTT-ATTCATACAATTGCTTTGTATT-GGGAATGAGCTGGAGTCAG-T  93

seq1  ATTGTCCCGTAAGCTGTTTTAGGTAAGATGTGTGAAGCAGAGCACTTCTG  149
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCCCGTAAGCTG-TTTAGGT-AGATGTGTGAAGCAGAGCACTTCTG  141

seq1  AGATTTAGTGTGCAGAACACCGAGGTGCAAGGCAGATGGGGTTGTGCATC  199
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGA-TTAGTGTGCAGAACACCGAGGTGCAAGGCAGATGGGGTTGTGCATC  190

seq1  CCTTTAGTGCAGCCCTCAGGCAGGGGTGGCTGGGGCTCACGGAAAGTCCC  249
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CC-TTAGTGCAGCCCTCAGGCAGGGGTGGCTGGGGCTCACGGAAAGTCCC  239

seq1  AGGCCAGCTACATAGTGGCACCCTGTCAACAAACAAACAACAATAACAGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAGCTACATAGTGGCACCCTGTCAACAAACAAACAACAATAACAGA  289

seq1  ACTTGGTCAAGCATAGTTTTACCTGGTAGCACAGGCTGGCCTTGAACTTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGTCAAGCATAGTTTTACCTGGTAGCACAGGCTGGCCTTGAACTTT  339

seq1  GGATCTCATGTCTACCTCCCAAGTGAGTAGATTACAGGCCTGTGTGCTAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTCATGTCTACCTCCCAAGTGAGTAGATTACAGGCCTGTGTGCTAT  389

seq1  CCCATGCCTGGCTTATGTGCTGTCAAACTGCAAGCTAAGCAAGCACTCTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGCCTGGCTTATGTGCTGTCAAACTGCAAGCTAAGCAAGCACTCTA  439

seq1  CTAACTGAGCTATGTCTCCAGCCTGTCCTTTGTATTTCTAGTGGTAAATT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTGAGCTATGTCTCCAGCCTGTCCTTTGTATTTCTAGTGGTAAATT  489

seq1  AGATTACAGATAGCATGCTATCTCTTTGTCTTGTATGTGGGGGAGGGATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTACAGATAGCATGCTATCTCTTTGTCTTGTATGTGGGGGAGGGATT  539

seq1  GTGTATGCCATGTTGAGCATGTAGAGATCAGAGTACAACCTGGGGAAGTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGCCATGTTGAGCATGTAGAGATCAGAGTACAACCTGGGGAAGTT  589

seq1  AGCATACAAAATAATGAGTTTTATTGTGACTTTTTAAAAGCTCTATGTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATACAAAATAATGAGTTTTATTGTGACTTTTTAAAAGCTCTATGTTA  639

seq1  TGGGTATTTTGCCTGCATCTATTTATGTGTATGGGTCTTTTGCCTACATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTATTTTGCCTGCATCTATTTATGTGTATGGGTCTTTTGCCTACATA  689

seq1  TATGCATTTGTACTGCATGCATGCCTGATGCCTGTGGACCAGAAGTAGCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATTTGTACTGCATGCATGCCTGATGCCTGTGGACCAGAAGTAGCC  739

seq1  ATCAGATCCCCTGGAATTAGAGTTACAGATGTTGTGAGCCACCATGTAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGATCCCCTGGAATTAGAGTTACAGATGTTGTGAGCCACCATGTAGG  789

seq1  TGCTGGGAACTGAGCCTGGGTCAGCAAGAACAAGAGGTCTTAACGTCTGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGAACTGAGCCTGGGTCAGCAAGAACAAGAGGTCTTAACGTCTGA  839

seq1  ACTGCCTCCCCAGCCCCTGTGTTAACATTTTCATCTTCGTGTATCTTGCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCTCCCCAGCCCCTGTGTTAACATTTTCATCTTCGTGTATCTTGCT  889

seq1  TATATTTGCTGTGCTGTTTTTGGTCGTCATTGTTGTCTGTTGGAGACAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGCTGTGCTGTTTTTGGTCGTCATTGTTGTCTGTTGGAGACAGA  939

seq1  ATCTCATTAGTCCAAGCTGGCCTTAATTCACTATGATCTGTCATGTCACA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATTAGTCCAAGCTGGCCTTAATTCACTATGATCTGTCATGTCACA  989

seq1  AATGCTGGACTTATAAGCACACCATACTCCAAGAATAGTGGTATACACAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTGGACTTATAAGCACACCATACTCCAAGAATAGTGGTATACACAT  1039

seq1  TTAATTCCAGCACTGGGAAGGCAGAAGCAGGCAGATCTCTGAGTTCAAAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCCAGCACTGGGAAGGCAGAAGCAGGCAGATCTCTGAGTTCAAAG  1089

seq1  CCAGCCTGATCTACACAGTGAATTC  1124
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTGATCTACACAGTGAATTC  1114