BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062B02.T7 (MSMg01no062_b02.b1) | MSMg01-062B02.TJ (MSMg01no062_b02.g1) |
ACC | AG288129 | AG288130 |
length | 1,105 | 1,154 |
length of high quality (start - end) | 274 (124 - 397) | 514 (112 - 625) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_b02.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_b02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_b02.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_b02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGTCTCCCTNNCTTCATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCACTAGAAAAAGGCTACTTTTAAGCCTCCTTATTTCTAAGC
TAAGCTTTGTGGCTTTCCTCTGCACCCAGGAGACTGAGTTATTGGGGGTT
ATTGGGATAACCTTGGCTACTTGTCAGAAACAAGTAGAATTAATAATCCC
AAATCTCTCTGTATGGAGGGTTGAGGGTGCAAGAATAATATTTAATTCTA
GCTTTTCACTGTGAAGATGCACCAAGGAAAAAATGAAGCCTCAGGCAGTA
GTGTTTGATGAGCCTGCTGCCTTTCCTGAGTCATCTACTCCATTGAGTTC
CTCAGAATGTGAACCACCCGGGACCTACTCATCAGTCCCACTGGTTTAAT
CTTCTCATGTGCAGGCCTGCAGAGCAGGCGTTGGTGTGGTTTAGGGAAGC
AGGGCACAGCCACGCCTCCCGATCCATCAAGGACTTCCCTGAAGCACAGC
ACTTCTGGATGGGTTTAGTATTCCTCACTTCTGGCAGCAGCAGCAAGATC
AAAGATACCCCTGGGCGTCCAGTTTCCAGGCGCTGCTTCTGTCATGGGAG
GCAAGATAAGAGGAGTCGTGTCGCAGACGAAGAAGTAGGGCCTGAGAACG
CCGGAGAAGAGATGGTTGAATGTGTAGATGTAAGACCCATTTGTGACATT
GTAGAAGGAGATTTCACCAGCTTCGTATTCCAAAAAGATCCCGATGCGGC
GAGGTCGCTCATCTTGGAGCACAGGCTCCGAGGTAGAGGACAGGACCCTG
TACTCGTTCCCCCTCAGCAGCCACATGGTCCAAAACGCGTTCTCTTGGGA
ACGGGTGGTCTCTCCCTTTTCTCAGCATTGATCCTCGTCATAACCTTAGC
CCCCTCTTCTGCTCTTTTCCCCCATGATGATTTCTCATTTATTGCCTCCC
CGTAAATAAATCCCTGCATGCCTCGTTATGCTATGGTTTGTGTCTTAACG
CTTCTATGTTTTGGTGGGAATTTCTCCTCCAAACTTCGTGATTCCGGTAC
CCTGGCTCAGTTTCGTAATTTTAAATATTAGTTTTGTTTTTTATCTTGGG
CCCTT
| CAGATGGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXTCCTATAAAACCCCTTTNAAAGANGAGCTAACACCAATACTCC
TATTCAATTTGTTTCACCAAACAGAAATAAGAGGAAAAAATTTATGAGAC
CTCAATTACCCCATTTCCCAAACCACACAAAGACTCAACAAAGAAAGAGA
ATTACTGATCATTTCCCTTATGAACATATATGCAAAAATACTCAATAAAA
TTCTCACAAACTGAATCCTAGAATATATCACAAAGATCATCCATCATGAT
CAAGTAGGCTTTATCCCAGAGACACTAGGTTGGTTCAATATTAGAAAATC
AGTCAATGTAATTCATCAAATAAAGAAAAATAAACCCCCTTGAGCATCTC
ATGAGATCCCAGAAAAGTTTTTGACAAAGTCTAACACCCCTTTTATGGTA
ATAATATTGGAGAAACTAGGGATAAAAGGAGACATACCTCAACAAAATAA
AGGCAATTTGCAGCAAGCCTATAGCTAACATATTAAATGAAGAGAGATTC
ATACCAACTCCACTAAAATCTGGAACAAAACAAGGCTGTCCCTTCTCTCC
ATATATATTCAATATATTAATTGATGTTCTAGTTAGGGCAGTAAGACAGC
TAAAGGAGGAGGTAGGTCCCAGAGCCTGACACTATTACTGAGGCTATGGA
GTGCTCACATAAAGGACCCTATCATGAACACCCTCCAGAAGACCCACCAA
GCAGTCTGAAAGAGTCAGATACCGATATTTGCACCCCACCAATGGACAGA
AGCACCTGACCCCTGTTGTTGAAATTAAGAAAAGCCTTGAAAGAAGCTTA
GGGAGAAGGGGTGACCCCTGTAGGAGGGACCCAGTCAGTCTTCAATTTAA
TCCTGGGACCCCCCCCAAGAATCTCTCCAAACCCTAGGGATTCCCCACAA
TGGAATAGGCAAAACCACCCACGCTGTAATTGGAGGCCCCTCCGCATCAC
CACCTTACCCTTAAAAGGCATATGGCCCCAGGTCCCGGGGGTTTCTCTTT
CTCCAAGAAACGATAGGGCCCCCCTAAACCCTTTTCACAGAAAAACAAGG
GCTAAGAGCCCTCCCTAAAAAACACTTTTAATAAAAGTTTTCGTGAGGTG
GGGT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 7 9 13 3 0 0 3 9 8 8 7 8 12 10 10 17 17 15 15 10 10 6 8 8 19 21 28 20 18 14 13 18 18 24 24 35 28 28 28 33 33 33 37 43 43
47 48 47 47 47 47 36 36 50 36 36 36 31 31 31 31 37 21 25 10 9 7 7 8 7 9 9 10 16 14 22 12 9 9 9 9 9 19 19 30 33 41 39 33 33 36 36 38 38 38
36 36 31 31 50 31 31 29 23 16 10 10 12 11 11 10 10 11 10 10 10 10 10 16 30 30 30 28 24 31 34 30 27 28 28 24 31 32 43 50 50 53 53 57 57 57 48 48 48 50
50 53 51 59 54 54 54 54 46 48 47 47 47 42 42 43 41 41 41 41 41 50 50 50 50 57 57 57 59 48 48 48 48 42 42 42 42 43 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 59
57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 54 54 54 52 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 43 43 37 35 35 44
44 47 47 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 54 54 47 48 43 43 43 46 46 47 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 48 47 47 57 57 57 48 48 42 47 47 54 48 48 48 48 48 47 39 39 36 39 39 47 48 43 47 43 47 59 59 59 59 48 47 59 47 32 30 10 9 8 8 8 8 10 8 11
10 9 11 10 11 12 19 34 34 57 57 57 57 59 48 48 46 59 39 33 30 30 30 32 30 33 30 30 31 33 43 46 48 48 48 47 47 47 47 57 44 44 28 28 28 32 32 32 32 39
36 32 20 20 20 24 28 36 37 35 33 33 33 42 42 44 44 44 43 57 57 59 59 44 43 42 44 33 33 32 43 43 57 57 50 50 43 43 43 43 44 43 37 37 43 38 43 33 31 31
44 44 59 57 57 57 57 54 52 44 43 35 35 35 42 42 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 44 35 35 35 35 35 33 33 35 43 44 43
43 43 44 42 57 47 44 44 40 40 44 44 42 43 43 42 42 39 42 37 37 37 57 57 46 46 39 40 32 28 28 37 40 46 47 42 46 43 43 43 44 59 59 57 32 32 20 20 20 32
24 23 21 18 18 23 19 28 26 35 35 39 39 46 43 46 46 43 32 29 19 19 15 22 12 12 12 18 18 20 17 25 17 17 18 18 17 17 17 19 19 25 27 20 15 10 10 11 15 27
28 35 24 25 17 17 17 24 24 28 28 28 37 33 28 22 18 25 24 28 25 10 10 8 8 8 10 17 27 27 23 20 20 28 27 25 20 28 28 32 36 37 32 31 21 21 12 15 15 27
19 22 12 12 11 19 13 14 15 12 12 21 28 28 17 17 19 21 21 16 12 11 23 20 24 17 14 14 14 28 22 24 24 24 17 13 12 11 11 13 13 26 26 37 37 22 19 10 10 10
10 13 15 12 11 11 13 18 15 11 12 12 15 15 23 12 11 11 11 19 16 16 19 11 12 7 6 8 10 19 9 9 9 10 9 9 11 11 11 13 11 11 11 18 10 10 8 8 8 8
10 12 18 15 15 13 16 9 9 11 14 16 15 15 12 11 16 10 10 10 10 10 11 11 11 12 14 11 10 10 10 9 9 9 8 8 8 9 10 10 9 9 11 8 8 7 7 7 8 8
8 8 8 8 8 16 11 19 16 17 10 6 6 6 11 12 22 23 22 22 12 10 9 9 9 10 8 10 11 11 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8
8 12 12 12 11 12 12 15 23 22 12 12 11 10 10 10 11 17 16 26 22 11 11 11 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 6 8 8 11 13 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 10 13 13 11 10 10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
9 10 10 11 12 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 9 11 10 12 10 10 10 9 10 8 8 10 16 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 10 13 12 12 11 10 10 12 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 11 10 9 8 9 8 8 8 9 10 6 7 6 6 8 8 12 10 12 12 10
10 10 13 13 12 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 7 8 6 6 11 8 6 6 6 6 8 8 19 19 13 7 6 6 7 13 15 14 11 10 12 10 10 9 9 15 13 21 11 13 11 23 27 43 39 39 37 37 41 34 29
29 3 0 3 23 12 12 9 9 8 6 9 9 8 7 8 8 8 8 9 9 13 13 3 0 3 23 29 29 3 0 3 23 21 33 33 33 33 39 48 48 39 33 36 26 23 18 17 13 16
13 13 10 17 15 18 15 13 12 16 13 12 16 24 33 40 40 25 23 23 44 44 48 48 48 47 47 47 42 41 41 43 47 47 43 43 43 46 46 54 57 57 47 47 47 47 57 57 46 46
42 42 35 28 32 37 42 44 48 48 47 47 47 50 50 57 57 57 57 50 50 50 43 43 43 43 50 50 52 43 43 43 52 43 43 43 37 37 37 52 52 54 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 54 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 45 45 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57
44 57 52 52 52 62 62 62 52 52 52 52 62 62 52 52 52 43 43 35 43 43 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 45 43 43 43 43 62 62 52 52 62 62 62
52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 43 44 43 43 39 43 43 52 62 52 52 52 52 43 43 43 43 52 52 43
43 31 31 31 43 43 52 52 52 52 62 62 62 52 52 44 43 39 35 44 44 43 43 43 43 43 39 43 43 43 43 34 15 13 11 12 11 11 10 10 11 33 38 62 52 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 43 52 52 43 43 41 41 57 59 57 57 57 57 52 45 45 52 42 42 35 42 35 35 26 26 26 43 43 57 59 59 59 43 39 34 34 19 22 22
33 33 43 47 52 57 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 38 38 38 50 50 52 52 52 52 52 37 42 32 32 32 20 20 32 32 42 42 46 43 43 33 33
33 32 32 32 43 43 50 50 44 43 32 28 23 28 28 37 32 24 24 18 18 17 32 32 48 47 44 38 23 23 20 34 32 44 43 43 36 37 32 30 30 37 37 42 37 39 37 36 44 30
30 30 37 37 36 36 36 36 44 43 36 36 43 42 42 35 35 35 39 39 43 39 37 28 25 25 32 32 20 17 17 20 20 24 36 32 35 32 35 31 31 43 59 59 39 39 36 35 35 39
39 28 31 20 20 19 19 12 12 12 21 24 23 23 30 30 28 32 32 39 39 19 22 9 9 9 14 22 18 15 15 18 12 14 14 28 28 32 30 19 15 15 19 21 21 28 22 22 23 28
24 25 18 16 19 26 25 31 35 32 29 22 22 22 29 33 37 36 37 37 36 30 31 23 20 20 31 31 28 22 21 12 16 11 13 11 26 26 35 35 19 18 12 15 12 10 10 14 19 19
14 14 19 21 24 15 8 8 8 8 8 10 13 13 15 10 10 9 9 9 15 16 20 25 14 13 8 8 8 11 10 15 15 19 22 17 14 10 9 9 11 10 8 11 9 9 9 10 10 13
23 10 13 10 10 10 10 17 13 14 14 12 17 12 12 12 15 10 10 8 8 8 8 12 15 13 10 8 8 8 11 8 10 9 9 8 9 10 8 9 8 8 8 8 9 10 20 13 15 10
10 10 10 12 11 12 15 13 18 22 22 22 12 19 15 16 19 19 19 15 10 12 15 12 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 10 9 11 10 13 11 11 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 7 7 10 8 11 12 11 11 10 11 13 21 18 19 18 11 9 9 9 9 11 11 11 10 10 12 12 12 25 19 13 10
13 10 12 16 14 14 14 17 17 17 23 37 37 33 26 21 15 13 13 12 12 13 10 9 9 9 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 13 13 12 11 11 12 11 9 10 9 6 8 8
9 9 9 9 9 8 9 9 9 10 10 9 9 9 9 10 10 14 12 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 10 8 12 8 10 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8
6 6 6 6 6 6 6 8 12 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 12 16 11 8 8 8 8 8 10 10 10 12 13 17 12 15 10 10 6 7 6 6 6 12 19 10
9 9 10 10 7 6 6 6 8 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 10 11 11 10 10 10 8 8 14 8 8 12 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 10 10 10 11 8
8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 8 9 9 9 11 12 14 17 26 19 10 8 6 6 8 8 13 10 8 6 8 7 7 7 7 6 6 8 8 11 10 10 10 8 6 6 6 6 6 9
8 9 9 9 |