| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-064H19.T7 (MSMg01no064_h19.b1) | MSMg01-064H19.TJ (MSMg01no064_h19.g1) |
|---|
| ACC | AG289946 | AG289947 |
|---|
| length | 1,208 | 1,099 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 420 (29 - 448) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_h19.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_h19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_h19.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_h19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:27 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NNNGGTCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CCCAAAGGCCTGAGTGACTTGAAAAATTCCATCACCATACATATTTTAAT
AGTGTATTACTTTGATTTTTTTCCTCTATTTCTCCTTCTCTCTCTCTCCT
ACCCAATCCTTTTCAGTACCTCTAGAAAAGATTTTTTTTTAGATTTATTT
ATTTATCTATTTATTATATGTAAGTATACTGTAGATGTCTTCAGACACTC
CAGAAGAGAGAGTCAGATCTTGTTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG
TTGCTGGGATTTGAACTCAGCACCTTCGGAAGAGCAGTCGGTGCTCTTAA
CCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCTAGAAAAGATTTTTGTACCAAGGGATA
TTCTAGGTATCTTTGAGTAGGCAAATGCCAACTCAGAGGATAAGAACTTT
TTTTTTTCCCCCCCCCCAACTGTCCCGAAATAGCTAAAAAAGAGGGGGGG
TCAATATAAATCTATTTGAGTCTCCAAAATAGAAACCTAATAGCAAAAAT
CTATTTCAGAATTCTGTGGTAATCCCAAAATTTCAAACTTTTATAAAACC
ATGAAAGCATTAGACAGAAGCGTGGTAGAAACCTTTCAAACATACAATTT
ACTGCCTAGTCTAACCATCTGGTCATGGTTAGTAACTTAAAGTGCATTCT
TAACGTTGGCTGTTAATCATACCATGTGTGATTTTTTTTTTTCCTTTTAG
GGGTCTTTCTGGGAACCACGGGTACTGCAGGGGTCTGTTTTGGCTTTAGA
AGGGCTTTCCTTAGACCATATTTATCAGGTTTAATCTACTTAATTCTTCA
GAGCCCTTATAAGAATACTATATTCATTGCCGATTTTCAGAATAAGGCCT
TCCCCTAGCGGGAACCCATTAGGTTCTGCTCCCTTGGTGGGTCCCCACCC
CAGTTTTCTCTTAACCCTTTACTTTTCAGAAATTTGATGGTTTCTCACCC
TGGGTCTCTTTCTGGGATATTTGGATGGAATTTTCTTTTTTTTATTAATT
TTTTGGTTTCCTATTATGAGTTCTCTGGGGGGCTGGCTGTTTATTTCTCC
GAGGTTAAGATCCCCTCGCTTTGCTTTTATCGAATGGTGAAACTTTTTCT
ACTTGTATATTCTTGGTGGGTGTGATCTCTTTTCTGTATATGTACCTTTT
CCTCCTTC
| CTTGTGCGGTAAGGTCCTGGGCNNGGGCCGCCTGGGNCNCTGTCGACATC
TTACCGTGGNAACACTATCAGAAGGGGATCCCGGCGGNNAATCTCTTTGG
GTNTNNTTTTGGTTTTGGGTTTGTTATGATTTGGTTATGGTTGTGGTTTT
GGGGTTTGGTTTTCTCAAGGATGGGGCGGTTCTTCTCTGGGCTTGGTCTC
TGGGAACTCCACTTCTGGTACGACCGAGGTCAAGACGCTCTGAAGCTCAG
AGAATCGCTGCCTGGCCTGCTGGCCCTCCCAGTGTGCGTGGAGACTTAAA
CGCGCATCGTCGCCACGCACGTCGCCTCATTTTGTGGACGGACGTTCCTT
GTTGTTTTCTTTCACCGATTTCGACAGTGCGTGTCGCACTCGCTTAGATC
ACCTCGACGCGCGTATTTTCTTTTTTTGTCTTTTCGGACTCGACCCTTCT
GCGGNAGCGAGGAGGAAATATTTAGGGGGTGGGGACTCCCCAAAGAACAA
AAGACCCCCTTTGTTTTTTTTTTGTTTGTGGTATAGTTTTTGNNNGGGCG
CCCCCCCCCCNAAATCTCTCCTACTCTTNCAAAGCCGGCGTGGGGCGGGG
GGGGGGGCTNCCTGCTTTCCCTTTTCCTTACCCCTCTTTTAGCGTCCACA
TTCCTTCGCGTATACTACCCTCACCCCCATTTCCCATGATGTATCGCTTT
ATCCTCATTATAACCATACTCAACTGTCCTATTCTCCACACTCCTCCCCN
CTTCCCTCTCACCACTATACGACTATCTCCCCTGTACAACAGCCACACAT
TATGTCGAGTATACTCCATTCCCACTCCGCGTGCAGCTTTACTTATGTAA
TCCCCGCCCTCCTTCACTCGTCGTATTAACGATCTCGATAGACACTTCTA
CTCGCTGTCTGTGTCCTTATACCCTGATCACATTATAATTTCTTTACCTA
CGTCCGAGCAATGTATCTACTCTCTGTGTGCGCGCGGTGTTAATACTCCT
CTATATCCTGTCGCACGTCTGAACGCTATCATAATTCACAGCTAATATAA
GTTCGTTAAACCCGCCGGCCGCTGCCATCCCACACATTTATTAGCCGCC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 9 9 15 12 14 12 8 8 8 8 8 8 8 15 15 9 8 8 8 12 10 24 25 36 47 36 36 36 36 33 33 33 33 33 37 37 37 32 28 28 28 24
13 12 10 22 23 41 59 48 47 36 36 35 35 36 37 37 37 50 50 50 50 50 50 57 59 57 68 51 47 42 42 42 42 50 50 47 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 54 57 57
57 43 43 43 57 57 68 51 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 48 42 35 37 43 43 37 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 62 62 62 62 68 62 62 57 57 57 45 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 59 52 52 52 52 52 59 57 57 52 52 52 52 52 59 57 57 59 59
59 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 47 57 44 48 48 57 48 54
54 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 59 59 59 57 48 48 48 57 48 48 48 57 59 59 59 59 59 57 57 50 53 47 47 47 47 40 43 43 48 48 46 34 25 23 15 8 8 6
6 8 6 8 10 17 28 47 59 39 39 48 59 48 48 48 48 43 43 46 46 48 59 48 47 47 37 33 32 30 32 32 39 39 43 57 57 47 47 47 41 41 39 41 36 28 18 13 13 10
10 10 12 14 24 14 13 9 10 10 11 14 17 12 12 11 10 15 22 39 33 37 32 35 35 37 30 26 15 12 12 19 19 30 28 28 19 13 9 10 9 9 11 15 16 14 15 12 12 9
12 12 25 30 47 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 54 47 46 43 43 43 46 46 59 59 59 59 59 43 39 30 30 30 30 35
39 39 57 57 59 57 48 48 48 57 59 59 57 44 44 35 37 28 28 28 28 32 19 28 28 44 37 48 47 57 57 43 43 28 29 29 33 32 37 42 42 32 32 27 41 41 42 41 41 41
42 42 43 37 37 36 36 23 23 23 36 28 28 30 24 24 24 36 37 43 47 43 46 43 43 43 43 43 31 30 19 20 23 23 34 27 24 16 16 16 21 23 23 28 20 28 28 43 43 43
48 39 37 30 24 24 26 24 19 19 19 28 31 30 24 24 24 22 27 21 18 18 23 28 28 31 27 19 15 14 14 10 12 12 20 26 43 37 37 28 24 17 24 17 13 8 8 8 8 8
15 12 14 14 10 13 10 10 12 16 12 20 16 16 11 10 21 23 16 12 10 10 10 10 8 8 8 6 8 8 9 9 13 10 15 16 27 26 39 39 36 15 15 11 10 15 19 23 19 19
13 10 12 10 10 8 8 8 12 11 13 14 14 10 12 12 10 17 22 16 11 9 9 9 16 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 11 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8
7 8 8 10 10 10 13 13 13 12 8 8 8 10 10 13 10 10 10 12 12 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 9 9 14 10 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 11 11 11 11 12 16 10 10 10 19 12 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 13 8 8 7 8 6 6
8 8 8 10 10 8 10 9 8 9 11 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 8 9 12 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 9 10 10 11 11 10 10 10 13 13 12 10
11 15 10 10 10 10 8 7 9 10 12 14 10 12 8 8 8 10 10 11 11 12 11 22 23 21 15 11 11 11 11 9 8 8 8 8 10 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
6 7 7 8 10 8 8 8 8 8 7 9 12 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 13 9 9 8 11 11 12 17 16 12 12 10 12 9 10 8 8 6 6 8 8 10 10 11 16
12 8 9 10 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 6 9 10 10 9 9 9 9 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 9 7 10 8
9 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 12 8 10 8
8 8 8 8 10 10 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 7 6 7 9 11 8 10 9 11 7 7 7 15 10 11 8 8 3 0 0 3 7 7 19 44 47 41 18 13 11 11 3 0 3 0 3 6 6 15 15 23 20 15 11 6 6
6 15 10 10 11 8 8 7 3 0 3 7 7 19 29 19 15 6 6 6 15 25 19 9 9 9 9 9 19 11 11 11 11 11 8 17 3 0 0 3 14 6 6 6 15 19 19 11 11 8
11 3 0 3 0 0 3 14 14 11 11 11 11 19 19 9 9 9 9 9 18 32 20 17 10 8 8 7 7 7 17 10 11 8 8 8 6 6 10 8 7 8 6 6 7 7 11 18 18 9
9 9 9 9 19 16 11 11 11 11 15 15 6 7 9 17 15 11 11 11 9 9 9 7 7 8 6 6 15 15 6 6 8 6 6 8 11 6 6 11 13 6 6 6 9 7 7 6 6 6
9 9 9 9 15 12 11 6 6 6 13 6 6 8 13 7 8 8 8 9 9 10 15 15 8 6 6 13 8 6 6 8 8 8 6 6 6 10 19 8 8 8 13 8 7 8 12 12 12 14
10 10 16 15 13 8 8 8 8 10 6 13 7 9 13 19 15 9 10 8 10 9 10 9 12 9 9 17 15 15 13 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 13 9 9 9 12 12 15 12
6 6 6 6 10 11 9 9 10 10 9 9 15 15 13 8 8 8 8 8 10 8 8 8 13 8 7 6 10 8 6 6 6 6 8 11 11 6 6 6 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 8 8 8 8 12 8 6 6 8 10 8 6 6 8 10 10 11 12 10 10 8 8 8 8 9 9 9 13 13 13 10 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 10 9 9 6 6 7
6 8 8 8 8 8 8 10 15 15 8 8 8 6 6 12 10 9 9 9 6 8 10 11 10 10 9 6 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 6 6 7 7 13 10 10 6 6 6 6 8
8 9 9 3 0 3 8 8 8 6 6 8 10 9 9 8 10 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 9 9 9 9 9 11 11 10 9 9 6 6 6 6 6 6 9 9
7 3 3 7 9 12 17 12 12 10 17 10 11 11 18 21 37 31 31 30 19 15 11 11 14 15 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 19 8 8 7 3 0 0 0 3 6 6 8 17
11 11 11 11 12 12 19 16 12 3 0 3 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 6 6 3 0 3 8 12 9 9 9 7 8 11 15 8 8 8 8 8 6 7 9 15 15 19
19 17 17 15 13 13 7 7 3 0 3 15 15 19 8 8 8 8 9 10 13 8 8 7 8 9 9 9 9 10 13 10 8 8 8 10 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 9 10 10 8 10 10 10 11 11 16 10 11 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 10 13 10 8 6 6 6 6 8 8 12 11 11 9 8 8 8 10 12 8 8 11 8 7 9 10 9 9 9 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 13 3 0
3 8 8 8 8 8 12 12 14 14 10 10 8 8 8 13 13 13 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 13 10 11 16 11 11 11 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10
9 9 9 10 8 8 8 9 9 9 10 8 6 6 11 12 10 6 6 8 8 8 8 8 7 7 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8
10 10 8 7 7 6 6 10 15 10 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 13 10 14 12 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 7 7 8 6 6 6 6 8 6 9 8 8
8 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 9 10 10 10 10 10 12 10 12 8 8 8 10 6 6 6 12 8 10 10 8 8 8
8 11 10 10 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 10 19 11 11 10 15 13 13 8 8 9 10 9 11 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 12 9 11 11 11 12 12
9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 10 11 13 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 12 15 8 10 8 8 8 8 6
6 6 10 6 6 8 6 6 6 10 10 7 7 6 8 8 11 8 6 6 6 8 8 6 6 7 6 7 6 10 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 |
|---|
