| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107J23.T7 (MSMg01no107_j23.b1) | MSMg01-107J23.TJ (MSMg01no107_j23.g1) |
|---|
| ACC | AG321334 | AG321335 |
|---|
| length | 1,301 | 1,221 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 303 (124 - 426) | 652 (76 - 727) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_j23.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_j23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_j23.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_j23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:46 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCATTATTTNNAATCATTCGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCCTCACTATCACTGACCCTTATAAAAATCTCTATCTCTATATC
AAGTAGTATTTGGTTCCTGAAACTGTGTGCACCCATGTTTTGGAATTATG
TTTAAAATTATAATTTACTCTTGAAAGTTCCTTCCTTACTAAGTATAAAA
TGACCTCATTTTTTTTTCTGGTTAGCTTTGGCTTGAAGTCTATTTCATCA
GATATCAGATGCCTTATTCCTTTCTGTCCCTCAGTTCCTTTGTTTGGAAT
ATCTTTTTCTATTCTTTTTAACCTAAGATGCTATCTATCTATCTATCTAT
CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATCTAAATCTAATT
TATTTCTATATATGTATCTTTGACAGTGATGTGCATTTGTGTATTACTGG
CTATCATCATAAAGTATGGTCTTTTTTATACCTAGTGTGCTATTTGTGTT
TGTTGAAATAGTCTACTTGTTAAAATGAGGCTATTAATATATGAAGAGTT
TTTTTAAATTATTTTCTTTTACATCCTGCTCAATGTCCTCTTTCATTTAT
CCCTCCCACAATTCCTCCTATCCCCTTCCCTTCTCTAATATGATGTTATT
CTTCTCTCTTATCTATCTTCCCTATCTTGTTAATAACCCCTTCCCTTTCA
TCCTCAATTATAATATTTTTCTTTTTATTATTCTTTACCTTTTTTGATAT
ACTCTCTTGTTCCTTTCTGCTTCTTATTTCTATTTTATAATCTCTATTTG
TTTATTTTGTTACTATAAATTGTCACTATACTACTGTATTTTTTTACCCT
CTACTTTCTCATCTTTTTCATTGTCTATATTCTAATATCTTGTATTATCC
ACATCACCTCTCCTTCTTTTTATTTCCTTTCCTACCTTCTCAATTTTCCT
CTTGATAGTATATCCTATTCTTTCTTTTCTATGTTTTATGCCAATATCTT
TTTATTCTATACTTTCCTTTCAATATATATCTTTCTCCCATTCTTTTTTA
TTCTGTCTTTTTTTACATTTGTTTTCTATCTTATTCTCCTCTAATATTAC
TTTTTCATACTTTATTCGACAATTCTCTCTCCATAATGTAACTATATTAT
CTGATCCTTCTATTATGTCTTATATTTATTCTCTATTTCAATATATTTTT
CTACTTCCTAATTTCCACTCTCATTTTCATTTCTTCTTTCCTCTTATTAT
TTCTATCTTACGATCTACCTTATTTCTTCTCCTTTCTCCTCTTATTTATC
T
| CCAATTTTTNNNTAATCATTGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTTAAATACTAAGCCAGGCAC
ATAGAAAATATTGGAAACCCATTCATCAGTCATAAGAGAAGGACAAACAC
AGCCTAAAGGTCACAGGGAATAAATAAATAACACCAGGACAGCTGTCCAA
AGCAGTTGATTTAGTTATCATTGCTGTGGCCATGACCATAGCAAGGTGGG
GAGGAAAAGGTTTATTTGGCTTATATTTCCATATCACCATTTGTCATTGA
AGTTAGTCAGGATAGGGACTCACACAGAACTGATATCTGGAGGCAGGAGC
TGATGCAGAGGCCATGGAGGAGAGCTACTTACTGGCTTGTGCCTCTTGAG
TTGCTCAGCCTGCTTTCTTACAGGGCCCAGGACCACCAGCCCAGGGATGG
CACTACCCACAGTAGACTGGGCTTTCCTCCATCAATCATTAAGAAAATGC
CCTATTAGTTTGCCCACAGCCAGATCTTATAGAAGCATTTTCTTAATTGA
TGTTTCCTCCTCTCTGATGACTTTAGCTTTCATCAAGTTGATATAAAACT
ATTCAGCATACAGGTTTAAAAAATACCACAAAATCAACAGAATGGCAGGA
GTTAGCACACGTCTTTTAATAAAAAATCTCAATATAAACTATCTTAATGG
TCAAATTACAGAATTATGGACTGGATTAGAAAATAGAATCTATCATTTTT
TAACTCAAAACAAAAGAAAACAAACAAACAAACCAATCCCAACCTCACCA
CCATTGGTATATGCTACCCCTGGAGGAAAAGATGGGCAAAATAATTCCAA
GCAGCTGGAACTAAGAAAAACCAGGTGTTAACTCATCTAATATTTACAAA
AAAATATTTTGAACCCCCCCCTTTTCGAAGAATATAAAGGAGGGTCATAT
CATACTTTACTAAAGAACAGTTAACCGAGAGGGAGGCTACATTCCCTAAA
GACATTATCCCCAAACACCTTGTAAACCCCAAAATTTATTTAAAAAACCG
GCCTAAAAAAAAAACCCTACGGAATTAATTTCCAGCCAAATTTCGTAATT
GGGAGAAACTTTAAATTTGTTTTAATAAACCGTGGTTTATCCTAAAAATA
TAACCTTATCTCCCCGAAAAGATATTTGAACTTTTACAAAAGCATCTCTC
TTAAATTCCTAATAATACACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 9 11 11 9 11 11 11 3 0 0 3 9 9 9 10 11 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 19 15 13 20 18 13 15 8 8 8 21 19 19 22 14 17 17 29 37 37 37 37
33 32 32 28 18 19 11 10 10 22 26 33 33 33 33 33 33 33 21 15 9 10 10 10 8 8 8 8 9 9 8 12 13 17 19 24 30 31 31 30 29 30 30 30 35 36 36 36 42 42
35 33 30 30 28 30 28 28 28 21 23 11 8 7 7 8 8 8 12 12 18 16 16 19 26 26 36 36 37 37 37 39 33 24 24 34 34 37 37 37 40 35 35 42 43 48 53 50 50 48
42 42 37 41 37 42 43 57 57 57 46 43 43 37 37 41 41 41 41 47 47 57 57 57 44 39 35 35 42 44 57 54 54 54 57 32 32 17 17 12 19 18 18 30 32 38 42 40 40 40
46 44 57 43 43 43 43 43 47 44 44 43 43 43 59 59 43 32 32 36 36 43 19 24 12 14 16 38 38 35 35 35 43 43 24 24 14 14 14 32 38 57 50 57 41 37 37 24 27 12
15 15 38 38 30 28 14 24 24 32 21 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 44 43 37 37 26 38 21 27 27 32 36 43 52 43 57 43 37 36 43 23 23 23 43 43
52 57 57 57 57 52 57 52 44 44 50 50 43 43 43 44 36 41 36 30 29 35 42 32 31 27 18 16 18 18 32 44 44 57 46 46 43 44 44 46 46 47 47 47 57 57 57 57 57 48
47 47 47 48 48 50 57 54 54 54 54 54 54 57 54 59 48 42 42 42 42 37 42 34 36 43 43 42 43 43 43 47 47 48 48 48 42 28 28 28 28 28 33 39 39 39 39 36 34 34
26 17 12 10 9 11 11 23 20 28 28 32 32 37 37 37 37 33 35 35 26 24 22 17 24 15 17 17 25 30 27 23 19 15 15 23 29 29 19 15 10 10 10 13 12 13 13 24 16 24
19 14 15 10 10 8 8 8 8 10 11 11 11 11 11 11 11 12 12 11 18 19 31 37 37 37 39 37 37 30 28 18 18 10 9 8 8 8 8 13 15 37 28 30 18 18 18 15 24 15
13 11 13 13 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 10 15 13 7 6 8 8 10 12 13 14 22 19 12 12 11 11 11 18 18 30 16 16 15 21 17 13 11 11 11 11 11 11 11 12 16
11 15 13 19 11 10 10 10 15 10 14 16 15 24 24 24 28 21 22 16 13 10 10 8 8 8 10 15 19 19 19 10 10 12 13 14 14 14 10 10 8 8 8 13 10 10 8 8 8 9
8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 12 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 12 12 12 12 12 15 15 15 18 11 11 11 12 12 10 10 9 9 10 10 10 10 9 9 9 9 10
12 21 21 32 23 28 18 21 11 11 10 16 16 16 17 11 11 11 11 11 9 10 10 10 10 10 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 13 11 11 11 11 11 11 6 6 6
6 8 6 6 8 8 10 9 10 12 8 8 8 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 12 11 11 11 18 13 10 12 8 8 8 8 8 11 10 13 15 15 18 10 10 6 6 8 8 8 8
10 13 11 11 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 11 8 7 7 8 8 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 10 13 12 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 9 11
9 8 8 8 8 11 15 9 9 9 10 9 9 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 9 10 19 16 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 11 11
10 10 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 8 6 7 8 8 8 8 9 9 12 11 10 10 13
13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 11 10 13 11 13 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 19
11 9 9 9 9 9 10 9 9 10 10 10 8 15 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 11 9 9 9 12 9 9 9 9 11 10 10 12 10 10
8 12 9 9 9 9 9 9 9 10 10 15 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 9 12 12 13 13 10 10 10 10 16 13 13 9 9 8 8 14 8 11 8 8 8 8 8 9 9
9 9 8 10 15 13 12 8 8 8 10 10 12 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 9 8 8 7 7 12 12 10 10 10 8
8 6 6 8 8 8 8 9 10 9 9 11 11 8 8 7 7 8 8 13 13 16 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 6 7
7 6 8 6 10 11 8 8 10 8 10 10 15 12 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 7 6 8 8 10 8 8 11 11 16 11 10
10 8 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 10 8
7 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 8 8 10 3 0 0 0 3 8 7 6 6 6 6 6 6 6 7 6 7 8 6 6 6 6 8 13 15 17 8 9 8 15 11 19 23 23 25 28 31 31 31 31 32 24
28 24 28 28 35 37 37 37 37 36 36 36 38 38 53 53 44 44 39 37 42 34 27 16 10 10 11 9 9 13 12 13 12 21 22 28 29 29 29 30 35 37 53 53 53 53 53 53 53 53
53 50 50 50 50 53 36 53 41 41 33 33 37 26 23 9 9 9 9 9 12 18 27 29 37 37 33 33 33 33 33 36 43 48 48 50 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 54
54 54 42 42 43 42 42 48 54 54 54 54 54 54 57 57 57 48 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 47 41 43 57
57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 45 62 43 44 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 44 41 23 23 13 14 39 29 29 31 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 43 43 52 43 43 45 45 45 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 44 44 35 35 31 43 43 44 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 62 62 68 62 62 52 52 52 62 59 62 62 39 39 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 32 32 23 44 44 57 57 57 57 57 57 43 39 39 37 41 43 43
57 57 57 54 54 59 59 57 57 44 43 43 43 43 46 59 48 48 48 48 48 47 47 43 43 43 43 43 37 37 30 30 28 32 23 30 30 32 37 35 35 37 37 32 30 35 35 39 34 34
30 29 29 21 28 25 28 28 35 35 39 39 37 41 37 29 29 21 21 12 15 15 23 23 22 24 28 34 32 28 25 34 33 32 32 29 29 21 22 30 28 28 33 32 30 25 25 27 27 25
25 28 33 37 34 34 24 24 14 18 28 34 43 43 48 39 34 33 28 28 28 30 15 12 10 10 10 10 13 16 21 19 22 18 11 11 18 19 18 22 19 16 16 30 30 48 59 43 33 33
33 33 33 33 30 28 31 24 24 31 28 24 24 28 18 14 13 9 9 10 8 10 10 10 10 11 11 22 15 14 14 22 26 30 19 19 10 8 8 6 6 8 7 12 21 20 16 18 24 24
33 28 29 21 15 10 10 10 10 10 10 13 15 18 21 23 18 19 24 19 15 8 8 8 8 8 10 9 9 11 8 9 9 12 9 9 8 8 8 10 10 10 22 22 14 19 15 12 12 12
15 14 11 10 10 10 13 13 18 19 11 10 9 8 10 15 19 13 9 8 8 8 10 12 12 10 10 10 9 12 10 8 8 8 8 8 10 23 26 24 24 25 28 17 17 11 11 9 9 17
11 8 8 10 8 8 8 10 17 8 10 8 8 9 11 11 10 10 12 9 9 13 10 8 9 9 9 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9
11 9 8 10 11 12 9 8 10 8 8 8 8 10 10 11 10 11 12 13 12 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 7 6 10 10 16 16 14 10 10 8 8 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 13 12 11 8 8 8 8 8 19 11 13 8 11 8 8 8 8 9 10
10 10 10 10 10 14 10 10 10 16 16 16 11 10 11 11 11 11 13 11 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 14 7 7 8 15 11 8 9
9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 12 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 14 14 10 10 9 9 11 14 13 10 10 8 8 8 8 15 12 12 11 8 8 6 6
6 6 8 8 13 10 8 8 8 8 6 6 10 10 11 13 10 11 13 6 6 6 6 6 8 9 9 9 6 8 8 8 11 8 8 6 6 6 11 11 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8
8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 6 6 8 6 |
|---|
