BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107O16.T7 (MSMg01no107_o16.b1) | MSMg01-107O16.TJ (MSMg01no107_o16.g1) |
ACC | AG321509 | AG321510 |
length | 1,281 | 1,290 |
length of high quality (start - end) | 303 (94 - 396) | 263 (141 - 403) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_o16.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_o16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:10:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_o16.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_o16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:10:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCAAATCTTNNNCAAACATTGGGCGCTAAGACTCACTATGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCACATCTCATACCTACCCCTTAAGAACACTGGCTTCCAGG
GAGCTAGGATGAGGGCCCCTTAAACCACCCCCACAATGACACACTTCTTC
CAACAAGGCCACACCTAATAGTGCCACTCCCTGGACCAAGCATATTCAAA
CCATCACAGTGACTTTAAAAAAAAAATTTTATCCACAAGACCAAGAACCT
GCAAAAGAGACTCTGTGCCCTTTAGTGACACTCTGGTCAGTTTTAAATGT
ATTATTATGATTCAAATACTGTAAAACAAGGGTGTGAGATTTTTATGCTT
ATCAAAAAAAGAGAAACTTTATAAAAGCATCTCAAGTGTTATCTACGTGT
GGAAGAATTTTTATTGTGGCACAGAGGAATTTCTCCGTCCCTCACTCACC
CAGTGCGTGTTTTTTTTTCCCCCCGCCCGCCCACCTGAATACGACCACAA
AAAAAAGAGGGATTTTGACTTGCTTAAAAATCTGACTTGGAAGCAATTAA
AGAACTTTACTGCGTGGAACCCCCCATCTTTTACCTCACGCTTAGAACCC
CTATGTAGATGGGCTCTTGAGGTAAGAGATCTCATAATTATCCTTGTCTT
GTATGGTAGGAATCACAACTTTCTCACTACCCTTTATCATTCTTAACCGG
CACTTTCCGGTCCAACTACTCAAGGTAACTAACATGTTTCTTTACTTTTT
TCTCTTCCAACCTTCTGCAGACACTCTAAGAAATTTCAATCCCTCCTCTT
TCAAATGCACCCTCAATTCCCAAAACCTAATAACCCCGCGCTCTAATACT
CATTCCCCCTCTTACAACTTCAGACATTTCTTCTCTCTCTATATACTATA
ACCATTTTTTTCTTTACATTTTTCTATTAACACTTAATTTGCTATTTATT
TCTTCTTTTACAACTCAAAACCCCGTTTTCTACATCCCAATACATTATCT
TTTTTCTTATTTCTCCCCCTTTTTTTTTTTTTTAATCCCCCCCCCCCCCC
CCCCTTATTGTTTTAAATAAATTTCTCTTATCTCTCACCATCCTTCCTAC
TTTTTATCTATTCACATCATTTAACTCCCCCCATACTAATATTTTGGGAT
CTTTCTCCATACTCTCTTACACATAGTCACTACTACTTATACTTCAATAT
CTATTAGACTACTTATACCATCTTCTTTAAAATCTAATCTCTCTGACTGC
TACTTCTACTTTCGTCATCTTCATAATCCTA
| CGAAGTCTTNNNNGAAACATGTGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTTTAACTGCCAAATACCAA
ATGGCTGAGAAGCACCTGACCCCTTGAACCCCATCTTTAATCATCAGAGA
AATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCATCTCACACCAGTCAGAATGG
CTAAGTTAAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGTCGAGGATGTGAGGAA
ACAGGAACACTCCTTCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACT
CTGGAAATCAGTCTGGTGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACTGG
AGGATCCCGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACC
GGTAAGAAGGATTTTTGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTACCAGAAGC
TGGAAAGAACCCTTATTTCTCCTCCCCCACGAATGGATACCCCCCCCGTC
AAAACAAGGAGGGGGTGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAGGAATGAATTT
ATGAAATTCCTAGGCAAATGGTTGGACATGGAGGGCATCTTCCTGAGTGA
GGCAATACAATCACAAAAGAACTCCAATGATATGTACTCACTGATACATG
GATATTATCCCACAACTTTAGTATACCCCGAGATATATCGACACCTTTTG
TTACTACACTTGAAACTGAACAAAACTGAAGACCAACACCGTGCACCCCT
TTGCCCCCTTCTTAAATTTGCAATACATTCACCCCTGCAAGGCAGTTACC
TTAAACCAGATTGTCAGCTCTAAACCAATACGCTGGTTCCTCCTACACAC
CGCCATATTCCACGTATTCTCTCCCATCCTTACTCCCCCCTATAGTATGA
ACACCATTTGCTTATACCAATCTAATCTTTGGCCTTTAAAAACCCCTTAA
AATTTCCTGTTCTCTTTTGTATACTATTTCGTGTCCCCGTTCTTCACCCC
TACACTTACATCTCTCTAATTCTTCTTATTTCATGGAATTCAACGTTCCC
CCCTTTGTGCCGTTCTTTTCTCTTCTTTTTCCCTACTCTCTCACAGTACA
ATCTCTCATCCTCGTTATTTCGTCACCACTCTTAATTAATACTCACCTTT
GTAACCCCATAATCCCCCATTATTCTTATTCGTCATTTGGTCCTTCATTA
AATCCGCCTCTTCTTCTTTCCACAATCTGGTCCCTACGTCTACACTCCCT
CTCTTCAACATTCCACTCGTCTTCTTCTTCCTCACCACAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 9 9 9 3 0 0 0 3 9 9 11 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 19 17 20 24 28 15 15 8 8 8 22 22 36 29 29 22 22 22 33
33 47 39 39 43 43 43 34 19 21 12 12 10 19 21 28 24 19 16 10 10 9 21 8 8 8 8 11 10 10 10 10 8 10 10 9 9 9 10 15 13 12 13 19 22 22 33 29 22 22
25 22 20 28 31 24 20 28 28 34 30 34 28 22 18 12 8 8 8 8 8 8 12 9 10 10 19 26 39 39 29 29 18 23 18 22 22 22 29 37 39 39 39 39 33 39 37 48 42 36
42 42 48 42 48 34 34 23 23 22 31 31 31 31 34 36 36 21 25 25 16 16 11 12 12 28 28 47 47 47 36 40 25 25 28 36 30 32 28 30 32 37 32 37 32 36 36 23 23 28
44 44 57 50 44 43 28 28 19 13 17 38 38 50 57 48 48 52 52 52 52 43 43 43 43 38 38 32 25 27 23 36 36 37 37 37 32 30 24 28 32 28 21 14 14 24 36 42 57 57
35 35 37 42 39 39 39 35 43 43 25 25 22 27 15 17 17 24 28 43 43 43 34 34 11 13 11 24 24 47 38 38 32 15 15 11 13 12 32 30 35 32 38 32 31 31 32 32 12 12
12 27 27 32 32 32 43 43 35 28 28 33 43 36 19 17 18 24 32 41 27 41 41 43 43 43 44 44 44 40 22 18 11 11 11 13 25 18 26 30 40 42 35 35 35 42 42 42 42 42
30 32 22 22 22 19 23 20 25 24 24 27 28 28 36 36 37 36 36 25 25 28 41 32 24 20 20 23 31 37 39 37 43 19 19 13 13 13 28 28 39 39 34 28 19 13 13 18 19 28
23 19 21 11 10 9 10 10 10 10 10 10 8 8 10 10 17 13 10 12 12 20 26 26 24 17 17 17 30 32 35 35 33 33 32 28 18 24 14 18 18 24 28 28 32 32 47 47 41 39
28 25 12 11 9 12 8 8 8 8 8 8 9 15 15 22 25 25 30 30 30 19 15 8 7 7 9 10 13 15 15 20 17 23 23 24 21 17 12 11 11 6 6 6 6 8 8 10 8 14
25 27 29 24 12 11 11 11 11 12 12 12 16 19 30 30 33 37 39 37 39 31 20 13 16 10 12 15 19 19 15 15 13 20 10 12 10 12 10 10 11 12 11 11 12 15 18 22 21 19
28 18 20 24 24 16 16 14 14 13 13 9 9 9 9 9 10 12 12 14 19 24 18 16 14 17 17 23 23 28 24 20 20 20 20 21 28 20 18 15 11 10 11 8 8 8 13 10 12 12
9 8 8 8 8 10 12 13 12 12 15 12 9 10 9 10 10 10 16 11 11 10 8 8 9 8 10 14 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 8 10 10 12 10 12 8 10 10 10 10
10 8 8 8 8 8 9 10 10 11 12 12 11 9 9 10 10 8 8 10 15 28 12 11 9 9 13 15 10 14 12 9 8 10 8 8 8 8 15 22 12 11 11 8 8 8 8 6 6 8
8 11 11 12 12 10 10 9 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 10 11 10 8 8 7 7 8 8 15 15 15 9 9 8 8
6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 6 7 10 8 11 9 8 7 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 11 16 16 17 15 12 10 10 8 8
9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 10 10 9 9 11 13 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 6 6
8 8 11 11 11 10 10 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 11 9 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 8 10 17 23 24 17 13 12 10 8 8 8 8 8 10 12 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 11 11 10 12 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
10 10 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 15 12 9 9 9 13 9 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8
11 18 16 13 13 10 11 7 7 8 8 8 8 8 8 10 16 15 22 22 34 34 37 32 29 12 16 12 12 14 14 15 9 9 9 10 11 11 14 13 13 16 16 18 18 11 11 18 23 23
29 34 24 18 10 6 6 8 8 8 9 9 9 13 8 8 8 8 8 11 10 8 10 8 10 10 8 8 8 8 10 13 15 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8
9 9 10 8 8 8 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 11 10 10 9 10 11 11 10 10 11 9 7 7 6 8 8 8 8 10 10 10 12 11 12 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 12 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 7
8 10 8 13 13 12 11 11 11 11 11 11 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 15 8 10 8 8 8 8 10 12 15 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
8 6 6 8 8 6 6 6 9 11 13 8 8 8 10 8 8 8 12 16 18 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide.10 10 10 10 9 10 9 10 3 0 0 0 0 3 9 9 9 9 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 15 8 8 9 8 8 9 19 19 22 17 9 8 10 10 14
15 10 13 12 10 10 14 18 28 30 26 28 28 29 29 35 39 37 37 37 40 40 41 39 21 15 8 7 7 9 8 11 8 8 9 10 8 9 9 9 9 13 13 19 34 37 41 40 43 43
43 39 36 28 35 33 35 35 28 33 37 36 41 33 31 21 15 9 13 9 9 8 11 12 12 12 11 11 10 10 10 10 10 10 13 18 17 19 24 21 16 22 31 31 36 36 47 48 48 48
59 59 59 59 39 36 32 39 33 33 35 39 39 43 39 40 40 41 41 41 29 30 28 36 42 44 39 43 37 44 44 44 44 44 46 46 47 47 42 37 32 28 31 42 42 43 57 42 42 35
35 35 42 39 37 35 37 39 46 50 50 50 48 57 57 57 50 50 35 35 35 50 43 52 43 43 32 32 29 41 41 43 43 35 43 31 33 33 43 44 52 57 57 43 43 52 52 52 57 52
52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 52 52 43 44 43 45 36 36 32 18 18 24 32 35 43 43 52 52 57 52 52 52 57 57 35 35 35 43 43 52 52 52 52 52 52
52 52 52 52 52 52 52 43 43 23 23 23 32 43 43 43 52 52 43 43 37 43 43 38 32 14 14 18 32 43 57 47 42 32 32 29 35 27 32 14 14 14 18 28 31 42 33 33 28 36
36 47 47 47 57 57 42 43 43 37 41 39 37 37 43 44 47 48 48 47 41 46 39 39 39 43 43 48 47 47 35 39 39 32 39 32 32 21 21 18 24 22 33 32 32 30 28 28 37 30
28 23 19 24 18 15 15 15 15 12 12 13 13 15 15 10 10 11 12 25 25 35 35 37 32 39 35 32 39 32 28 29 22 19 19 20 20 20 32 30 43 34 34 25 34 28 35 35 35 36
36 39 39 36 33 33 28 24 28 10 13 6 6 8 8 8 11 6 6 6 6 6 6 12 20 22 16 12 9 9 12 18 26 20 18 18 17 17 15 12 10 10 10 10 8 10 10 10 10 9
11 11 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 26 15 19 10 8 8 8 17 17 11 11 12 16 15 15 15 15 15 17 25 25 32 32 30 30 30 19 19 18 16 15
21 21 22 22 18 20 15 15 14 13 15 15 19 21 18 18 18 23 12 13 12 12 16 22 12 12 12 18 16 12 12 13 13 15 18 13 19 19 17 17 17 29 20 16 16 16 22 15 15 15
19 15 13 8 8 8 8 10 10 13 13 10 13 10 10 10 11 10 10 10 13 10 10 8 8 8 10 10 10 11 10 10 10 10 13 13 10 20 12 13 16 12 13 10 10 9 9 9 10 10
10 9 12 12 12 19 20 24 20 17 10 10 10 8 10 6 6 8 10 12 11 10 11 10 11 17 19 14 12 13 13 12 11 12 11 10 8 8 6 6 8 10 14 10 8 8 8 10 8 8
8 8 8 10 9 13 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 15 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 11 11 18 10 10 12 16 10 10 11 12 13 9 10 9 9 9 9 10 11
11 11 10 18 18 20 19 20 14 15 15 15 10 15 15 13 18 10 12 10 10 8 8 7 7 10 8 9 9 11 11 11 15 12 11 12 10 10 10 10 11 11 11 11 10 10 11 11 11 8
8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 10 11 11 9 9 9 10
10 9 10 10 10 10 10 15 10 10 10 10 10 10 11 13 10 8 10 11 8 8 8 10 12 15 9 9 9 13 10 10 13 16 22 23 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9
10 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 13
13 13 15 12 12 11 11 11 8 8 6 6 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 10 10 9 9 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 10 11 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 10 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 15 8 10 10 10 9 9 9 8 10 8 9 9 9 11 11 9 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 11 8 8 8 15 14 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 10 11 8
8 6 6 8 11 13 12 9 8 10 8 8 8 11 12 12 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 11 13 11 16 11 10 11 9 9 9 9 9
9 10 10 10 9 8 8 6 6 6 10 8 8 8 7 7 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 9 8 8 8 8 9 9
10 10 15 10 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 9 11 9 9 9 10 10 7 6 8 8 6 6 8 8 6 7 8 6 6 6 6 7 8 6 |