BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-121L04.T7 (MSMg01no121_l04.b1) | MSMg01-121L04.TJ (MSMg01no121_l04.g1) |
ACC | AG331745 | AG331746 |
length | 719 | 816 |
length of high quality (start - end) | 294 (70 - 363) | 58 (76 - 133) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no121_l04.b1 PHD_FILE: MSMg01no121_l04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:29:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no121_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no121_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:29:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCTCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCCAGGACTGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAATCAAT
CAATCAATCAATCAATCAATAAATAATCTACCCAGCAAAAAAATCTCAAG
TGTTCTGTTGAAGTGATTTTGTTGAGTTTGAAGTTTATTGTTTTCCTTAA
GGAAGACATCAGACTGCCCACATCACAACCTTAGTTGTGAATCCTGGGAA
CTTGATGACACCACAGACTATCTCAACTCTGGTTTATGAATTCTTTTTTT
TTTTTTTTTGGGTTGGTGTCATGTGTGTAGCTCACTCCCCAGAGCAAATA
TGATTCTAGACATTTCAAATTACCCGGACCTCAGATCCCACTAGCTTCCT
CTGCTCTACAAATAGATCCTAGACTTAATTAGGTATACAAGACAACTCAC
CTTAGGTCTCAGAGGATGCAAGGGGTAAGTCTCATAAACCCCAGCTCCCC
TCGACATCATCAAATTCCACTTGCCAGCTGGGCTGTGGCTACTCTGCCTA
TTCGTCCTGAAGAAAAATTGCCTCTCTGGCTAACGTCTCAACTTCCACAT
TTGCTTGCTCCTTGCTCTACATCCCTTCCCTTCTTCCTCAATCTGGGTAA
ATCGTATGGTCTTCCAAGGCCTCCACGGGGCGGCAAATATAATACCTTCC
CCTTCCTATCTTAACTCAA
| ACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGCGTGCAGATGTATGTATGTATGT
ATGTATGTATGTATGTATGTATGTATAGGTGCCCCCCTTCCTTCCTCTTC
CCTCTTCTCTCCCCCCTCTCCCGGTCGCTGCATTACACTCTTCCTCTCTC
TCTCTTTTATCCCCTTCTTTCTACCCCTATTTTTCCTCTTTACACTCGCC
CACATACAACCACCACTCTCACTCCTCCTAACAATAACCCACCAACCACA
TTTTTCTTTTCGCACCGCGCCTATCCCCAAACATACCCACAACCCTTTTT
TCCCCCTCAAGCCTCCCCACCCTATAACAACCCCCAAAACTATTTTTTTT
TCCCCCCANGCAANCCCCTCTCCCTATAAACATAAGAATTGACCCAATAC
AGAATCGCTCCCAAAATAAAAAAAAAACAACAATACCGCCGTGGGGGGGG
ACGCTCCCCATAAACCACAATCTCCCCCCGACCTCCACCCGCCCACCCTT
ATTTCGTCATTCTTCCACCACACTCCCCGACCACACCCCGCCACCACATA
CCCCAACTTCCCTATTACCCCCCCCACCATATCCTCCCCCTTTATCCCAT
CCCCTCCCATCCTCCCCTATTCTCACTACCCTCCACCCCCCTCAATCTAC
CACCCACAAACCCCACTACACAACCCCATCCTCATAATCCCCGCCCCATC
CTATACATTTTCTCCCACCCCCTACCCACCCCTCTCTCCCTTCCCTATCA
CCCCACTCCATCTTTA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 6 6 6 6 6 10 20 27 29 30 29 27 25 24 19 19 9 9 9 21 21 42 39 41 22 17 9 9 12 15 21 14 13 14 14 26 27 37 42 31 31 31 35 35 35 57 57
57 53 53 44 48 41 28 28 22 21 10 8 8 8 8 8 10 11 11 13 23 34 25 30 33 31 31 35 36 36 53 57 57 48 47 43 43 43 43 57 37 42 42 42 42 37 37 37 42 37
39 41 28 28 13 12 11 26 26 37 42 41 41 41 48 41 47 26 28 13 14 14 30 30 44 47 47 47 47 57 47 41 41 41 42 48 57 68 68 68 50 50 50 42 42 42 41 37 42 41
50 50 57 57 57 57 50 57 38 27 15 11 11 23 23 50 50 51 50 50 50 50 47 50 50 50 50 50 50 57 50 50 43 43 28 32 25 38 38 47 50 57 57 57 57 38 27 12 11 9
28 28 57 57 68 68 68 68 57 28 28 11 11 16 28 38 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 13 13 13 38 27 57 52 52 52 57 57 57 54 57 57 52 52 43 44 42 52 52 52 57
57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 50 57 50 57 50 50 50 57 57 57 57 57 32 32 25 21 19 32 35 54 57 57 59 48 48 48 48 48 54 59 59 59 59 59
59 59 59 59 34 34 14 12 12 21 11 15 19 26 32 41 30 23 18 18 23 23 36 41 28 28 34 37 46 40 40 28 37 31 42 35 39 39 47 43 40 40 35 35 35 39 39 43 43 43
48 48 48 48 47 47 37 26 21 12 9 9 8 8 8 8 12 21 15 15 11 10 10 10 10 10 10 12 12 15 23 23 18 30 24 34 34 48 48 39 36 28 35 36 33 37 39 43 43 43
43 43 39 39 30 32 25 32 32 47 47 48 57 48 37 37 32 32 32 37 34 39 39 39 39 47 47 47 25 28 13 11 13 11 21 18 29 13 13 13 28 28 39 39 30 39 39 39 39 35
37 23 23 11 11 11 16 20 20 20 11 11 11 16 16 30 32 35 37 37 43 37 33 28 28 28 32 28 30 24 30 20 20 11 15 15 30 30 48 57 47 43 23 17 9 9 10 19 23 41
42 21 21 15 15 15 32 30 32 22 23 23 25 23 28 28 28 25 28 33 34 39 25 25 12 12 11 22 12 16 12 18 19 15 12 8 8 8 8 8 8 22 22 39 39 36 39 43 43 39
28 28 14 14 13 28 21 28 20 23 12 12 10 12 15 15 10 12 12 18 12 12 11 18 15 19 18 17 17 25 11 12 8 8 8 10 13 19 19 20 20 25 28 12 12 11 15 13 22 20
25 15 10 10 13 19 23 30 30 30 30 32 28 22 18 23 14 10 13 16 16 19 23 30 28 26 10 9 9 8 8 8 8 8 18 11 14 14 11 11 11 11 11 14 10 10 10 11 10 10
12 10 10 8 8 8 10 10 8 10 8 8 11 20 14 15 13 14 12 12 11 8 8 6 6 8 6 9 10 10 10 10 10 9 8 7 7 9 7 10 6 11 13 14 19 17 22 20 12 11
8 8 8 10 15 11 11 10 12 8 8 8 10 10 10 9 10 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 17 13 8 8 8 17 3 0 3 9 10 26 24 27 22 25 32 33 29 29 30 27 25 30 41 47 47 43 34 22 20 31 31 19 19 11 15 13 21 21 36 36 36 36 36 36
36 48 43 43 47 47 53 53 53 53 50 26 26 13 14 14 19 19 16 11 24 27 41 37 40 48 50 50 50 50 53 53 53 51 50 50 50 50 48 48 48 48 48 48 51 51 51 51 68 68
68 68 54 54 54 54 54 54 54 54 54 53 47 42 42 42 42 50 47 50 47 50 47 47 47 50 39 39 24 23 12 11 18 18 33 28 18 14 12 12 10 8 10 10 8 8 8 8 8 19
17 13 10 9 9 9 9 12 10 11 11 12 12 20 17 12 12 11 11 11 12 12 9 10 9 9 9 9 9 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8
8 8 10 6 6 8 8 10 12 12 12 13 13 19 12 13 13 13 9 8 8 6 6 8 8 8 17 11 12 11 15 10 9 8 8 8 8 8 8 15 15 15 14 14 13 13 10 10 10 15
12 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 12 12 11 11 9 9 9 10 10 10 12 10 10 10 8 8 8 8 8 10 12 12 9 9 9 9 10 10 10 14 10 10 9 10 9 9 6 6 6
6 8 8 9 10 13 10 10 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 9 10 9 9 10 12 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 12 13 15 10
10 10 9 10 11 11 16 13 13 10 10 10 10 16 12 10 10 12 12 9 8 8 8 8 8 8 10 8 10 15 12 14 13 10 10 10 10 11 8 8 6 6 6 8 9 24 19 13 12 10
12 12 16 21 11 11 8 3 0 3 8 8 3 0 3 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 6 10 8 9 10 10 10 10 12 18 19 17 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11
10 9 8 8 8 8 8 10 12 12 11 12 12 12 18 13 14 12 15 13 15 25 27 18 22 15 7 7 7 6 6 8 6 6 8 8 10 10 9 10 11 12 11 13 11 14 11 11 12 8
8 8 8 8 8 10 16 12 11 11 11 10 10 10 10 10 10 8 11 8 10 10 10 9 14 15 10 10 6 6 6 8 9 9 10 14 13 13 17 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 10 8 8 8 10 8 10 8 9 9 9 9 9 8 10 10 10 8 6 6
8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 18 18 28 32 37 30 12 10 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 16 14 13 8 8 6 6 8 6 8 8 8
10 13 10 12 11 10 10 12 9 10 10 9 9 9 11 11 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 11 10 10 10 8 8 8 6 8 6 6 6
8 10 10 12 8 6 6 8 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8 12 8 8 9 9 13 14 22 12 13 12 10 10 10 9 9 9 10 12 12 12 15 18 11 11 11 10 13 13 15 10 11
11 11 12 9 9 9 9 9 10 10 10 13 12 13 12 8 8 8 13 15 17 13 6 6 8 8 9 11 11 19 20 10 10 8 8 8 8 8 9 13 12 14 14 10 17 12 10 9 10 10
10 10 10 8 6 6 8 6 6 8 12 13 13 13 10 10 |