BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123C06.T7 (MSMg01no123_c06.b1) | MSMg01-123C06.TJ (MSMg01no123_c06.g1) |
ACC | AG332824 | AG332825 |
length | 1,287 | 1,215 |
length of high quality (start - end) | 335 (133 - 467) | 684 (90 - 773) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c06.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_c06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c06.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_c06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:27 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAATATTGNNNNNAAACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCAAGGCCCATACCTAAACCTGTTAAAAGCAATCTACAGCA
AACCAGTAGCCAACATCAAACTTTATGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCCCA
CTAAAACCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTCAA
CATAGTACTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTCGACAACAAAAGGAGATCA
AGGGGATACAAATTGGAAAAGAGGAAGTCAAAATATCACTTTTTGCAGAT
GATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCTACCAGAGAACTCCT
AAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAAAATAAACTCAA
ACAAGTCAATGGCCTTTCTCTATACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGAA
ATTAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATATCT
TGGCGAGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTTCA
AATCTCTGAAGAAAGAAATTAAGGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATCTC
CCATGCTCATGGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAATGGCTATCTTGCC
AAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCAAT
TCTTCAACGAATTGGAAGGAGCAATTTGCAAATTTGTCTGGAATAACACA
AAACCTAGGATAGCCAAAAGTCTTCCCCAGGATAAAAGAACTTCCTGGGT
AATCACCATGCCAGACCTACAGCTTTACTACGGTAGCATTGTGATAAAAA
CTGCCTGGCACTGGTATACAGACAGACAAGTATACTCATGCAACTACAAT
TGTAGAACCTCAAAATGACCCCCCCCCCCTAGGGTCCCTTGAACTTTCCA
CCAGGCATCTAAACCCACCCAGGGGACCAATCACCCCATTTTTCAACACT
TGGGGCTGGCCCCAACCGGGTTGCTATCCCGCTCTAACAAGGCCAATCCA
ATCCCTACTATCCCCCTTTGTACTCACCGCCCAATCCCTATTGCAATCAG
GTAATCTTCCCCTTCAAACCCTAACAACCCTGGACCCCTTTCACCTCGTG
CAAACGCGGCCGTAAACCCTCTTCTCCAAATCTGGTCACCCCCCGTACAA
ATTTTCTCTTACTACATACTACCCCTGCTCTTTGTCCTGGTCCTAACCCT
CACATCTCTCTCCCAGGCGTACTCCCTGTCCTCTATC
| CGTCTTTTTNNNNCATGATGGNAGNCGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTGAAGGGAAGGCAGCATTA
AGCCATTTGGGCTACACTCTAATTTCTTAGATGGATCAATCCAGAAGCCA
AAACCCAACTGTAGGGCTTAAATGCTGTTAAAAGCATCCAGTCAATTTCT
TGGGCTTGACAGGCATGGAAACTGAGGCTGGAACCACCTCAGTTAGGAAT
GAAGTGGGAACACAAATCATAGTTCTATATTTCTTTTGCTTCATTCCCTC
CACCTTTCATTTAGAATTTCCTTAGGGTTTTCTCCACTTATCTAATATAA
AAATGCATAAAAATGAAGCCATAGTCCCTTGTTGCTGACTAAGAGTCAGA
AGTCAGGCATCCTGAGAGGAGTGGGACTTGCTGCCCTTTACTTTGGGGGA
ACAGGACCACTCATCCTGTGGAACCAGATGTAGGCACAGACTCCTAGGTT
CTCTGGAATGATAATTCCATGTGGTCTGCCTGGGGCCATGCACTAAATGG
CTTGTTGAGGAAGAGATGACCCATTCAGAGACCTTACTAGGATCTCCTCC
TCTTCCTGGCTCACACCACCTCCATTCCCAAGCCATACTCAAGCCATAAC
CACGTCTGTATGTTCTGCTTTTTCTTTAGTTTTTTTTAAAATAATTTCGT
CTTCTTTTATGAATAAGTCTGCCATTAATATGAAAGTCTATAAAACAAGC
CATTAAAACCTGTGTTCCAGCATCTCAAACATGCTTCCAACCTTTAGAAG
TCCCTTTGGATAGGGAAGCTCCAACATGGGGCCCTTTCAGGGCCCCTTTA
ATAGCAAGGCGAGGTCAGGGTACCCTATTCAAGTTCCCCAAAATAGGTCA
AGGTCAGTGCATATTTCCTAGGTATGAACCAAGTGATAATTTTCAAAATA
ACTTTGCCTTGGACTTTTGGGGAACCAGTTTTTTTGTCCCCCATTCCCTA
AAATAACCGTTAACCTTGGTGTTTCTCATTTATAAAACCCTTTCCTATTC
CCTCCTTTGACCATCCCCTTAATAACTCTATCTGATCTCGAACTCCTTAT
CTCCCTTTTTAAAAAAAATTGTTCCCCTTCATCCCAAGGTTCTCTTTCTT
TTTTTAACACTCTTTCTCCATAGTATTCCCTGCTATTTCCCTGGACCACA
ACCTCTTCTTACTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 11 9 3 0 0 0 0 0 3 11 6 7 8 9 12 10 11 14 13 12 10 8 8 8 8 8 19 17 9 8 8 12 10 10 22 23 35 30 30 32 32 36 36 37 40
40 32 24 24 24 24 42 42 42 43 39 35 30 30 43 32 29 29 29 31 42 42 41 43 43 27 22 10 13 10 10 10 10 15 21 34 30 29 17 17 17 24 21 23 19 21 21 47 47 47
47 34 41 19 19 14 27 27 36 37 30 33 30 37 43 41 32 23 15 11 10 10 10 12 12 16 18 22 24 18 20 22 22 19 21 31 33 34 34 43 41 41 25 25 28 34 37 37 28 22
22 25 23 20 14 12 12 11 11 11 22 23 37 30 30 28 37 37 30 30 28 37 41 37 37 43 41 43 33 30 35 43 43 48 48 48 42 48 48 68 48 48 48 48 48 43 43 43 43 40
43 43 37 37 28 24 29 29 30 43 44 44 57 68 68 57 57 57 54 42 44 42 42 43 57 57 57 57 57 57 46 43 43 43 43 42 43 43 43 48 57 59 59 59 57 57 50 50 43 41
37 47 43 57 57 57 44 44 33 33 33 44 43 52 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 50 50 37 37 42 57 59 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 44 42 33 33 39 44
57 57 57 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59 44 57 42 38 27 38 41 57 59 38 44 27 27 29 38 32 35 35 44 44 44 50 43 52 52 52 43
42 43 43 52 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 37 50 44 44 28 24 14 38 32 57 46 46 46 57 57 43 50 50 57 57 57 57 54 54 54 54 57 59 57 57 57 47 41 41 41 41
44 44 44 48 57 47 48 44 44 32 32 12 12 12 24 32 39 41 37 59 59 59 57 57 54 47 42 39 39 43 43 47 48 43 43 43 39 30 28 28 30 34 36 36 36 43 47 48 48 48
48 44 44 48 48 48 48 43 37 37 37 26 19 12 11 11 11 12 12 24 21 23 15 14 13 15 15 17 17 30 30 43 48 59 57 59 59 59 48 43 40 35 35 35 39 39 39 42 37 26
23 12 11 11 12 12 12 12 15 15 24 21 23 25 28 32 41 44 57 43 44 43 48 48 48 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43 42 44 42 37 37 47 42 48 48 48 57 44 39 35 35
43 43 43 43 43 43 59 44 57 48 50 50 57 50 50 44 44 39 39 32 32 31 42 42 43 43 39 43 44 44 36 40 24 24 25 30 38 32 33 28 30 30 32 31 37 32 32 20 25 28
44 44 47 47 47 47 47 47 43 43 43 46 48 46 46 37 37 28 29 28 33 28 28 28 29 29 28 30 28 34 26 25 25 28 34 33 36 36 31 28 20 20 21 30 28 22 24 25 21 24
28 28 30 20 24 26 26 24 19 28 25 25 25 25 24 37 28 24 12 12 12 10 8 6 6 8 10 15 20 29 19 18 16 19 14 17 30 30 19 20 32 20 20 34 34 28 30 30 34 31
24 22 18 21 13 14 14 24 21 20 20 28 30 24 13 13 18 18 16 16 9 9 9 15 23 28 21 21 11 11 11 16 18 22 19 8 8 8 11 8 12 24 19 18 13 13 8 8 8 8
10 10 16 16 19 19 12 10 10 9 9 10 10 11 11 11 18 22 22 18 11 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 8 8 8 8 10 10 10 10 12 13 14 12 12 8 11 8 8 9 9
10 19 16 10 10 10 10 9 10 14 15 9 8 8 8 17 10 10 8 8 8 11 15 15 11 12 13 22 24 24 12 12 10 8 8 10 10 13 11 11 11 8 8 8 6 8 12 18 12 12
9 9 12 9 9 12 7 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 11 14 13 10 10 10 10 10 11 11 11 13 11 11 11 8 8 8 8 8 10 10 6 8 7 6 8 8 6 6 7 10
15 8 6 6 8 6 6 11 6 6 6 7 9 8 8 8 8 10 10 10 15 10 12 16 22 12 12 11 12 10 10 10 9 7 8 8 8 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 7
6 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 10 10 10 10 8 11 10 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 17 12 12 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 9 9 8 8 8 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 10 12 10 12 11 10 11 12 10
10 10 8 8 8 10 8 8 8 9 10 10 12 12 23 12 10 8 6 7 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 12 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 6
11 11 10 11 9 8 8 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 9 8 8 9 10 10 8 8 12 12 12 9 9 8 8 8 8 11 14 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 6
7 8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 9 10 10 10 8 8 8 10 10 12 7 7 6 6 8 8 11 11 10 11 11 16 12 8 8 6 6 8 6 6 7 6
9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 15 13 8 8 8 8 8 7 7 10 8 8 8 10 10 8 9 10 9 8 8 8 8 8 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 9 8 8 8 6 6 8 6 8 6 6 6 7 8 8 8 9 9 9 12 10 8 8 6 6 8 6 | Open.Hide. 7 7 7 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 3 9 9 9 9 9 9 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 9 9 10 11 8 8 9 8 9 9 13 13 12 8 8 8 22 19 24 15
18 24 33 35 35 35 37 37 37 37 35 36 36 35 36 36 53 44 44 37 40 41 37 25 19 8 8 8 8 8 11 17 11 12 12 18 18 18 20 16 19 32 37 57 57 57 50 53 53 53
53 48 43 43 48 40 47 42 47 47 47 47 47 47 27 27 11 18 18 16 19 19 20 27 29 37 23 25 16 22 22 44 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59
59 59 59 41 41 20 20 19 16 28 13 28 28 42 50 59 50 50 50 51 68 57 57 57 57 57 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 37 41 52 57 57 68 68 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 45 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52
62 62 62 44 39 39 29 23 23 23 23 29 39 39 21 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 24 19 19 19 23 43 38 38 35 35 35 43 43 39 35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
47 43 43 43 35 35 43 44 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 45 52 57 57 57 57 57 43 57 57 57 43 44 43 52
52 59 59 59 59 57 57 54 54 52 57 52 52 52 52 52 44 44 52 52 52 52 52 59 44 43 35 32 43 32 32 50 50 57 57 57 57 59 59 48 48 50 50 50 50 50 54 59 59 59
59 59 59 57 57 57 59 57 48 48 48 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 54 54 59 59 57 57 57 54 57 57 54 50 47 47 47 47 47 59 57 57 54 54 48 57 48 48 48 57
48 48 48 48 57 42 43 36 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 46 47 47 47 37 37 41 29 29 34 34 37 37 37 37 31 31 39 39 44 47 47 47 43 28 24 12 12
12 23 23 14 14 14 27 24 32 28 28 28 32 34 43 34 22 16 18 16 18 19 23 23 34 34 34 34 39 39 39 39 33 34 32 20 20 20 28 28 36 31 31 35 37 37 30 28 25 30
19 16 10 11 10 17 26 34 34 19 17 10 10 10 17 22 30 34 28 28 21 22 15 15 15 16 12 10 10 15 15 13 15 22 12 8 8 8 8 8 17 13 23 15 23 12 17 22 23 16
8 8 10 10 14 21 21 13 13 11 17 12 15 15 14 18 9 9 9 6 8 6 6 8 8 10 12 13 8 12 10 10 8 8 10 10 13 10 10 9 9 9 12 13 13 13 22 17 13 8
8 8 8 8 10 13 15 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 12 9 9 9 9 9 9 13 15 10 10 8 7 8 8 10 10 12 6 7 7 7 9 9 14 10 9
9 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 7 8 8 8 10 9 10 14 9 9 9 12 12 22 16 10 8 8 8 8 8 8 6
8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 10 11 11 25 22 19 10 10 10 10 10 10 8 8 10 10 15 12 15 16 10 10 8 7 7 8 9 10 10 10 10 11 13 15 10 10 12
8 8 8 8 8 8 10 12 11 11 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 8 6 6 6 8 6 11 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 11 11 10 10 8 10 7 6 8 6 8 8 8 10 8 6 6 6 6
8 8 10 10 8 10 10 20 11 11 11 11 10 12 15 10 8 8 8 8 8 12 11 11 8 9 7 7 6 8 6 8 8 8 12 12 11 11 11 11 13 9 11 12 9 10 9 9 9 11
12 18 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 13 10 8 8 8 11 11 11 12 18 24 12 8 8 8 8 8 8 9 10 10
10 8 10 10 10 10 12 18 18 10 10 10 12 12 12 |