BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-128P17.T7 (MSMg01no128_p17.b1) | MSMg01-128P17.TJ (MSMg01no128_p17.g1) |
ACC | AG337113 | AG337114 |
length | 701 | 700 |
length of high quality (start - end) | 513 (70 - 582) | 286 (73 - 358) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_p17.b1 PHD_FILE: MSMg01no128_p17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:42:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no128_p17.g1 PHD_FILE: MSMg01no128_p17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:42:15 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NAATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCTCAGGCTTCCGCCAACACCACAATTCACAGACAAAAATCTCTC
CTTAATTAGGGGACCCTTAGATTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATC
TATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTA
TCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATGAGACAGGGTCTCACTGTCTC
ACTAACAGGGTCTAGCCTTGGCTGGGCTAGAACTTGCTATATAGACCAGG
CTGACTTGGAACTGCCTCTGCCCTCGAAGCACTGGGACTGAAGGTGTGCA
CCACCACCACGCTCTGTGCCACGAACCTGATTTTATCTGTAGCTATGCAA
ATTAGTTATTTCCCCCCTATGGAAGGGATTCTAGGTGCCCTGTTGGAGGC
AGACCCTGGATTTTTCAAAGATGTCTACATCCTAGTCCCTGTAACCTTCC
GCCCTGCAGGCCAAAGAGGCTTCTGTGTGATGCGCTGATGCTAATGATCT
GGACAGGGGAAGTTTTCCTAGATCATCAGAGGAAGGCCCCGTGACGTCTC
TTAAGGTCTTACCAGGGGGAGGCATGGCTACGGAAGCAGACGGCGTAATG
ATGCAGGGTCAGGGGTCTAGAAATAAAGGCAGCTGCTAGGTATAAAGAAA
A
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGA
AGCACCTGAAAAAATGCTCACCATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATC
AAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAA
AAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACAC
TCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAGATCA
GTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCAGC
AATACCTCTTCTGGCCATATCCCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGG
ACACATGCTCCACCATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGC
TGGAAGGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAGATGTG
GTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTA
TGAAATTCCTGGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAG
GTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGG
ATATTAGCCCAAAACCTAAGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 8 8 10 10 18 11 19 30 25 20 18 16 14 11 17 10 8 8 22 22 33 37 37 28 27 20 15 13 8 8 6 8 6 8 8 11 16 16 19 13 14 14 14 19 32 36
36 36 33 33 33 33 31 25 22 19 10 7 7 7 8 8 8 9 10 17 20 27 33 33 29 25 25 28 29 29 28 32 32 32 37 37 37 37 36 43 50 48 48 50 50 53 68 68 68 68
68 57 57 54 57 54 68 68 68 68 57 59 68 68 68 57 57 57 43 36 28 23 18 12 12 12 32 32 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 62 62 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 52 52 52 59 59 59 59 52 52 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57
54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 54 54 59 59 38 38 32 20 20 20 32 32 44 43 43 42 37 43 50 50 57 54 47 47 57 57 57 57 54 54 57 57 57 59 59 68 59 59
54 57 44 32 27 14 13 13 13 14 14 14 15 30 32 37 30 28 28 25 23 25 36 30 37 43 43 48 54 54 54 48 48 43 48 48 43 59 48 48 57 40 40 43 43 34 37 34 47 39
47 39 39 36 37 37 37 32 34 22 22 22 22 28 27 34 41 41 37 39 39 39 39 33 33 28 32 37 43 47 48 48 48 43 43 36 39 43 43 43 57 48 57 48 48 48 48 48 48 43
39 36 39 39 46 46 57 48 43 43 43 43 48 44 44 48 48 44 44 46 46 47 46 46 43 42 42 30 31 35 44 47 57 57 57 54 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 57 57 57 57
32 32 20 31 30 34 30 19 19 13 24 24 47 47 44 44 32 43 43 43 43 48 57 57 48 43 43 43 40 37 28 23 23 37 37 47 48 43 43 39 39 30 30 30 39 39 48 48 48 40
39 34 28 25 25 31 29 31 35 37 37 30 30 39 39 43 48 43 43 36 36 36 39 39 39 37 31 23 23 20 25 22 21 12 12 11 17 17 25 22 16 16 24 24 31 18 15 15 10 8
8 8 8 11 13 15 26 13 20 21 14 14 14 24 22 21 21 20 16 14 18 22 23 18 16 9 8 8 8 8 8 14 16 22 22 19 19 15 15 19 16 16 11 11 11 12 12 14 13 14
14 13 10 9 10 11 13 15 19 23 18 14 12 9 9 9 9 9 10 11 11 13 15 24 25 34 27 14 14 11 11 11 19 21 15 15 16 12 10 10 10 10 10 10 10 10 18 19 19 19
15 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 9 9 19 21 12 13 10 23 23 36 36 36 53 50 41 50 50 50 42 47 37 27 23 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 19 21 33 33 33 33 33 36 36 36 33 33
33 33 33 27 21 11 11 11 10 11 10 10 19 17 21 15 10 10 27 27 35 35 36 36 36 36 37 57 57 57 48 36 36 37 40 40 42 57 68 68 50 50 50 48 48 47 42 42 48 57
57 57 57 57 57 57 57 53 50 48 48 33 31 31 29 29 17 19 9 9 9 13 22 29 33 47 50 50 41 31 36 36 36 36 38 50 50 50 57 43 50 50 50 50 50 50 50 48 48 48
54 42 48 48 48 54 50 50 57 68 57 57 48 48 50 53 53 68 68 50 50 50 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 46 46 50 50 46 50 57 57 57 57 48 47 50 50 48 57
57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 50 37 35 35 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 57 59 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57
47 47 41 47 47 46 59 59 59 47 47 41 30 30 21 11 11 11 12 15 23 29 37 37 47 48 48 48 48 57 57 48 48 57 59 59 59 59 57 57 48 50 53 53 53 53 50 59 57 48
28 28 15 18 16 18 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 16 16 19 30 30 59 57 57 43 57 48 48 48 48 48 48 39 39 35 47 47 47 47 48 43 43 43
46 46 43 41 41 34 34 32 21 22 11 11 11 12 15 28 32 32 32 37 28 28 20 18 18 28 28 35 39 39 48 50 50 57 57 57 48 43 43 43 36 36 43 43 43 39 47 43 43 43
59 43 47 43 47 43 43 47 47 48 43 43 39 39 43 47 59 59 59 59 57 57 47 47 47 41 42 42 48 48 48 57 57 57 54 54 57 57 57 48 48 48 57 48 54 47 57 47 47 47
43 48 35 42 42 37 44 42 42 35 42 42 37 41 41 59 43 48 48 48 43 47 46 54 46 44 37 28 28 43 40 42 46 46 43 43 43 43 43 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48
48 57 48 57 48 48 48 48 59 32 19 11 11 10 15 21 37 37 31 28 32 37 39 39 37 30 26 23 16 16 19 28 26 30 36 37 37 37 39 39 43 43 39 39 39 39 35 30 39 37
32 28 23 24 23 25 22 25 23 32 19 25 27 27 19 22 23 24 18 15 15 19 24 21 22 10 10 10 17 21 29 25 24 12 12 16 22 15 22 22 11 14 11 19 19 32 36 37 24 19
22 18 16 11 11 10 10 11 14 13 18 18 16 18 22 19 15 15 10 13 13 12 12 13 23 15 15 12 18 18 28 32 30 23 19 11 11 16 17 12 11 11 18 19 30 30 30 30 32 27
|