| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-161G16.T7 (MSMg01no161_g16.b1) | MSMg01-161G16.TJ (MSMg01no161_g16.g1) |
|---|
| ACC | AG360826 | AG360827 |
|---|
| length | 1,230 | 1,263 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 381 (74 - 454) | 385 (72 - 456) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_g16.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_g16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_g16.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_g16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:00 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NNTTGCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
AGTAAGAATGCTGCCTACTCTTTGACATTCAGAATTGCCTCTAGTATTGT
AAGAGAGATAGTTAAAGAAATCAGGCATTACTGTCTACTACATAGAGTTA
GAAAACTCAGGGCAAGCTACTCCTATATGCAGGAATTTATCACTATCTAG
GAAGAAGGAAGGCTGTGGTCTAAGGAAGAACCAGAATAGATACTTAAAAC
TATAGATAGCTGAGTTACACCCATACACAGGAATTTACAATGGCCTGGGG
GGAGGTGGACTATACAATAGACTAGAATAGGAACTACGGCAAGGGCACGA
AGCCCTTGCCCCTGACTTCTAAGATTAAGTTGACCTTAGGTGGGGCTGCT
TTTGATCCCAGTTGTTAACATTGATTTTTATCCCAGTTGATTCCTGTTAG
TTTTTTTTCCCCCCCCCCTCTGTTTTGTGTAAAAGTCACTTATAAAACGG
GTGCTTGCTTTGAGACCCATTACATTCAGATTCACACTCCCTTGTGTCTG
TTTGTCACCCCTTTTCATTGCCCACTCCATTGCCCACCTGTCCGGAACCC
TGAGTTCTCCCTGAGGCCCATCTGCAGCAGTTTTCTGCTGTGTGTGCTTT
GGTTTTGTTTGGTTTTTGAGACAGGGTCTCACTATATACCCTGGCTAGTC
TGTACCAGACAGACCTCAGACATGAAGTGCTCCATCTGTCTCTCTCCTCC
ACCTTAGCATTAAAGGCGACACCATTACTCCTGGTTAAAGGGAGGGACTT
TGCTAACACATTTCACACATGCATAAACTACTTTGGTTATTAGCTTCCTC
ATTTTGTCTCCTTTTCTCTGTCCCGTCCTCTATGGCATGCTTCTGCAGGA
TGGTATCCAGTCGAGCTGACGTCTGAACCCCGAGGGCCATAATTCACCTA
CATGACATGGTAAACGTTCCCTCATGTTCCTGGAACTCTGGACCCTGCCT
TAAGAACCACCTTCCCATAGCCCCCTTAAAAAAAAATGGGTCCTTTATTT
TGTTTAACAAAATGCTTCATTCTTTTGAACTTTCTAGGTAAAATTCCCCT
CCCATTATTTTTGCACCTGTAAAAACAATATAAAGGGGTTGTTATATCTC
CTCATTTTACACTCCTTACAATCTTGTGTTTTTTACTTCTTAACCATCTC
ATTTTTCTCCCCACTCCCTTTATGTTCTCT
| NNNAAGTCAAGTGAGNCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCTTTGAGATCTACATAGTACAAGGAA
GAAAAATTGACTCCTGCAAGTTGTCTTTTGATCTCTACATGTGCGAGTGG
CATTTACCTCACCCCCACAAAATAAATAAATAAGAAGAATACAAGAGCAA
TGATGTTCTGATTATTACTACATACAAATAAATTTCAATTAGACTACAAA
TTCAGTGTTAATGCAGAGGAAACAATCCAAAGGGAGGGGGACTTAAAAGA
GTAAGTAGGATATTTTTAGAGGGGCTCTATCATACAAGACCAAGGAAACC
TAAGATAAATGCATAAGAAGACTAACACATTAAATACACAAAATTTAAAA
TCCTGATTAAAAATTGCATCATTAATAAAGTCTAAATGGTAATCCCTAGG
TTTATTTTTTCTCCCCCCCCCCCCTGTAAATTGATGAAAACTAAAAAAGA
ATTCAATAGAAGGTAACAGGCACAAGATGTCAGCATAGGTAACTGAGAAG
AGTCCATGTCAACAGATGCTGGACATATGACAACACTCCCACTAACAGAC
AAAAGAATACAGAGCAAAATAATCCTAAGAATCTGTTTATGACTAGGCTG
AGAGAAATGGAAGTCTTCAGGGATGGCAAGGATGTAGGCAAAGGAACAGA
ATGCACTGTGGATAGAGGGGGAGTGACTACAGCCTTCTGAACAACAGCCC
AATAATCAGTAATTAAAATAAAAATATGGGATAGAGTGCATGTTCTGTGT
AAGGAAGACCCTAATTCCCACTGCAAAGCCCAAAATAAAATATGCAAAAT
CAGCTGGGGGTGGGGGGGATGTCACATGCCTTTTACCCCTTTTTTTGAAA
GGTACAAGTAGTTAAATCTCTGTGTATTTCAGGGCCAGCCTGGTTAATAA
TAATTCCTGTACTTCTCTAGCATCCCAAAAAAACCTCGTCTTGGAAAAAA
AAAATAAGCCCGAGGTTGTTGGGTCCCAACTCTTTTTTTCTCTTTTATTG
TTGAGTTTAAAAACCACTCTGTTTTTATTAGATGGATTCCCGTGATATTC
CAGGACTTCACCATAAAAAACCCTTGTTCTCTCAATATACTCTTTCTATC
ATCTCTTATAATTCTTTCATATCTTTATTTTAATTCTTATTATTAATAAC
TTGTATAGCTTTTTTGGGTGCTATTTCATAAGTATATTGTTCTCATCTTA
ATGTTTATATCAA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 9 10 9 10 15 23 16 13 10 10 8 12 15 19 12 10 10 14 15 17 26 28 42 37 34 34 34 36 36 42 42 42 47 50 50 50 47 47 47 42 50 37
37 35 35 36 36 50 53 50 44 44 39 37 29 25 15 16 11 10 10 13 15 19 18 21 13 28 28 37 37 47 47 47 47 53 53 53 53 53 43 37 34 29 28 19 21 24 31 28 29 29
29 29 42 46 42 36 33 28 30 30 32 32 33 42 43 48 57 57 54 57 57 54 54 57 57 47 47 48 48 48 48 50 50 50 50 50 50 50 50 50 46 47 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 57 50 43 41 41 43 43 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 62 62 62 62 62 62 62 62 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 59 59
57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 43 44 43 43 43 37 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 44 41 41 41 43
34 34 15 13 13 12 24 23 37 44 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 47 30 25 12 12
12 14 25 21 20 11 10 9 17 15 15 20 24 24 24 17 17 9 9 9 15 12 28 31 59 59 59 59 59 59 43 37 32 32 32 26 26 18 12 12 12 11 11 11 12 12 11 11 11 15
12 12 13 30 30 59 59 59 59 50 48 53 53 35 28 18 12 12 12 34 41 48 48 48 57 57 57 43 43 37 43 37 30 30 33 37 47 48 47 54 59 34 34 12 12 12 32 34 59 54
54 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 48 42 37 41 59 59 40 42 30 30 30 37 44 57 54 54 48 59 48 48 48 50 50 54 54 57 57 57 57 57 57 57 54 57 50 47 47
46 57 50 50 57 57 57 57 57 57 59 34 34 12 12 12 13 20 22 31 44 44 57 57 57 37 37 37 42 44 44 37 44 44 57 57 68 57 59 48 48 44 47 43 43 43 48 48 50 50
50 32 26 13 15 15 30 30 39 25 23 15 12 18 26 26 42 36 37 39 39 35 39 39 43 43 46 46 57 57 57 43 43 43 43 41 41 41 41 43 34 33 24 24 33 34 39 41 46 46
33 30 30 20 17 13 11 11 17 23 28 35 39 36 31 24 17 11 11 11 15 19 24 31 31 32 29 26 20 20 23 28 28 33 30 39 39 59 39 41 37 37 30 28 18 15 15 8 8 8
8 8 8 8 10 9 12 12 12 11 18 11 11 11 12 19 16 14 15 10 9 9 15 16 25 19 22 14 12 11 12 22 12 11 16 11 11 12 22 22 28 28 28 27 19 19 24 19 21 10
10 10 13 13 21 18 13 18 11 11 11 21 23 18 18 18 25 19 22 19 26 19 25 22 37 24 29 19 24 28 16 14 10 10 9 12 12 9 14 16 21 15 13 15 15 22 9 10 10 10
12 14 34 28 30 25 20 13 14 10 10 13 18 12 10 8 8 9 9 13 15 30 28 28 22 28 24 27 19 23 23 19 18 13 13 11 11 11 13 10 9 12 10 15 15 10 10 10 8 10
15 13 13 13 13 13 21 19 11 11 11 10 10 10 13 13 10 15 8 8 8 8 8 8 9 9 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 11 11 11 15 15 14 9 9 8 8 17 13 13
8 8 9 13 10 10 14 10 9 9 9 9 11 9 9 10 10 15 19 13 10 11 10 10 10 8 13 15 8 8 8 8 8 11 12 10 10 8 8 12 10 9 9 13 14 14 8 8 6 6
8 6 9 9 9 9 9 10 11 11 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 12 12 15 15 10 10 8 8 8 8 9 15 16 12 8 8 8 9 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 10
10 11 8 9 12 15 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 12 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 12 13 13 10 10 8 8 8 8 6 6 8 15 9 9 9 11 10 12 12 11
8 8 6 6 8 8 10 10 12 16 13 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 11 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 11 12 17 18 15
10 8 12 12 12 12 8 8 8 8 8 10 10 13 8 6 8 8 8 8 8 7 7 6 10 8 8 6 8 8 9 13 13 12 12 9 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 8 10
8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 7 8 9 9 9 8 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 8 3 0 3 6 6 13 9 11 12 13 9 8 8 8 8 11 10 19 19 15 8 9 11 19 21 31 26 26 28 38 42 42 50 37 37 37
37 37 42 42 50 57 48 57 57 57 57 57 59 57 54 42 42 42 34 42 40 39 39 39 47 43 50 39 47 42 47 47 36 36 33 33 33 37 30 27 18 13 13 11 12 15 24 28 36 28
28 28 37 37 48 48 48 57 57 47 42 42 42 39 40 39 43 34 48 48 42 36 36 36 36 40 40 42 48 48 42 47 42 47 41 42 42 47 33 43 43 43 43 47 43 44 43 43 43 43
43 44 57 57 57 46 46 41 48 47 48 57 59 59 68 57 57 57 57 57 47 47 47 48 47 47 44 57 57 57 59 59 54 50 50 47 47 48 57 57 57 43 50 38 43 43 57 47 47 35
35 35 43 43 52 57 57 52 52 54 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 44 44 35 35 35 44 44 57 57 57 57 57
57 57 52 57 52 52 52 57 57 57 52 52 43 44 33 35 35 44 44 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 59 59 59 52 52 52 52 52 57 52 52 52 43 42 42
43 43 57 52 52 52 57 52 52 52 59 59 68 68 68 57 57 48 48 48 59 59 59 59 47 47 57 57 57 57 48 48 43 47 47 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 47 43 43 47 59 43 43 43 43 47 48 47 59 37 37 35 42 42 48 48 48 48 48 54 59 48 48 48 59 48 48 48 57 57 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41
28 18 19 11 15 11 10 11 16 22 34 59 59 47 47 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 43 41 39 39 39 39 48 59 59 59 59 48 48 46 46 46
25 21 11 11 11 15 16 29 25 11 11 11 16 17 22 27 28 28 28 26 22 22 22 18 27 28 59 41 41 41 48 48 48 48 48 40 41 34 25 18 16 12 12 14 18 20 25 14 11 11
12 12 12 11 9 11 12 22 28 59 59 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 43 43 43 43 43 43 43 43 43 47 43 43 43 43 48 46 48 48 48 48 47 46 37 44 28 44 44 48 43
48 48 47 57 48 48 54 48 48 57 48 54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 59 59 54 54 54 57 57 57 57 48 48 43 43 43 43 46 48 47 47 39 32 33 37 37 43 48 43 43 43
43 43 43 43 43 43 40 40 34 25 25 36 36 43 43 40 41 41 47 47 48 48 46 47 47 36 34 25 24 20 26 30 37 37 47 59 41 47 48 48 48 48 57 57 46 46 46 46 37 43
30 30 30 37 37 48 43 43 43 42 39 36 36 36 42 42 42 34 42 42 42 34 39 43 39 42 48 48 48 57 39 39 39 21 21 24 24 31 34 34 41 47 43 44 37 31 37 30 30 25
30 37 35 30 30 37 39 33 33 28 28 28 36 37 37 39 47 43 48 43 43 43 43 32 37 28 28 28 32 26 31 28 22 15 28 19 28 23 16 14 16 19 17 17 30 27 32 29 29 32
29 31 32 32 32 32 30 16 16 14 12 12 19 27 33 33 33 33 33 30 19 17 16 13 13 17 24 26 20 19 10 15 10 20 15 15 15 30 30 37 37 37 37 39 26 19 10 8 8 13
22 22 19 18 22 22 22 19 30 29 31 26 12 12 12 13 13 16 14 11 10 12 21 14 8 8 8 13 12 15 17 18 15 16 18 22 28 24 17 29 32 37 37 37 40 24 19 16 9 9
10 10 11 11 12 17 16 21 14 10 10 10 11 14 14 12 11 9 9 10 8 8 8 11 11 9 13 10 13 20 21 34 30 28 28 18 17 11 11 9 9 9 9 9 10 15 15 12 10 8
8 10 13 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 14 17 11 8 8 12 8 8 8 10 11 11 10 9 10 10 8 8 8 9 9 9 10 10 9 11 13 11 11 10 10 8 10 10 9 9
9 9 15 14 7 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 10 6 9 8 9 9 9 8 8 9 10 10 12 12 13 12 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 15 19 22 12 9 9
9 10 8 10 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 19 14 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 7 6 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 9 9 9 9 8 8 8 10 10 8 8 9
10 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 7 7 7 6 6 8 10 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 7 10 8 7 8 10 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 11 11 14 13 10 10 10 10 12 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 8 9 8 10 10 8 9 9 11 18 11 11 11 11 8 8 10 8 8 6 8 8 8 10 7 6 6 10 10 8 8 7 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 6 6 6 8 10 11 9
7 7 7 7 8 8 9 11 8 8 8 8 8 |
|---|
