BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161G22.T7 (MSMg01no161_g22.b1) | MSMg01-161G22.TJ (MSMg01no161_g22.g1) |
ACC | AG360838 | AG360839 |
length | 1,188 | 1,234 |
length of high quality (start - end) | 429 (29 - 457) | 384 (70 - 453) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_g22.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_g22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_g22.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_g22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NNGGTCACTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TTTGTTTAGCTCTGAGCCCCTTTTATTCTTGAAAAAGAAAGATTAGAAAC
TCGCTGTCATTTTCTGGTGACTCAGGACATGATTGAATATAGCTATGAGC
ACCAAAAACAATCAATCAATCTGCTCTTTGTAACACCTTAAAATGAACTT
AAAGATAAAGATAACACTGTTGATCTCTCAGATGTCTCTGGCTTTGGAAC
TTATCTTCCACATCAATCTAATTAATTTGAGACAGAAATATTATTCTCAA
GTAATTGTTGGATAGAACACACTTTTTGTTCTCAAAGGAAGCTATCTGTG
GACACTCACCAAACACTCTGATCTGTATGAGCCATCAGGATATGTAAGTG
ATTTTCATAAAAATCTGAACTACTTTGCATTCAAATCAAACTTGTCAGAT
TTTTTTGCCCCCCCCCTGGTATAGTGTTTACCCTAGGAATGAAAGCGGAA
CAAGATTTTGTTGTTTATTCATCCTGCCCTCCTAGCAAAATATTTTTTTT
TGTCTCATAATTTTCTTGTTGAAAAATCTAACCCAGACATTTTCTGCTCA
TGGTCCAATATTTTATTTGAAATCAGTCAGAGACTTATACATTATCATTC
AGAGATCCAATGTCTTTGAAAAAAGGAACCCCTGAAAGGCATGGAATACT
GCTATTTGCCTTGGTTTCTCTAGTACACATAACACCATGCATCCACTCTA
CAGATTCTTGAAAATAAATAAAAACTTAAATAAAAGAATAAAGGGAAACT
AGATAGTCTCACACGTATCAAGGAAGATTTATTAACTCACTCAATGACAA
TTTCCAAAGCAGGTTCTGACTTTGAAAAGGCACAATTTGGTAGTTCAAGC
ATGAGAGTCTTCTCTCAGCATGATAGCCTCTGTGGTTACCAAAACCCTTA
TTATAATTCCTCAGGAGGAAAATGGATTGTCTCCATAAAAAGAAAAACTG
GTTTTCAAAAAAAATTCTTTCTAACATAAAATGGGGAATAATCATGTTCC
CATTTCTGACATCAACCTGGGGGTCAGGAGATTAAAAATTTTGGGGAAAT
AATAATTCTCACCATTCTTGTTTACAAAGAAAAACCCCAACCGGCGCCTT
TTTTTTGTATTTTAAAAACTAAAAACTCTCGTTTATAA
| NNAAGTGAGGTGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCTGAGAAGC
ACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAA
ACAACCTTGAGATTCCACTTCACTCCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAA
TTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCC
TCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTC
TGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAAT
ACCTCTCCTGGGCATATGGGCATATATCCAGATGTCCCAACCGGTAAGAA
GGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCTTTATTTATAATAGCCAGAA
TTTGTTTTTCCCCCCCCCCCCCCTCAACAGAGGAATGGATAAAAAAAATG
TGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAAAATGAATT
TATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTG
AGGTAACCGAAACACAAAGGAACTCGCACAATATGTACTCACTGATAAGT
GGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAAATACAATTTGC
TAAATGTGTGAAATTCAAGAAGAACGAAGACCAAAGTGTAGACACTTTGC
CCCTTCTTAGAAATGGGAACAAAACACCCATTGAAGGAGTTACAGAGACA
AAATTTGCAGCTGTGACGAAAGGATGGACCATCTAGTGATTGCCATATGC
AGGGATCCATCCCATAATCAGCTCCCAAACGCTGACCCCATTGCATAACC
TAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCCAAAATAATTGGTCTCTTGGGAAAA
TATGTCCGGGGCCCTACAAAACACCAAGTGGAGTGACCCCGTCCGCTTTA
GGAAGGGCTCCCATGGGCCCCCACATGGAGGAACTTGAAAAAATTATTTC
CCGCATCTTTATGGGGAAATGTCTCCCCTCAATTGTGGGAAAACCCTTTT
GAAAATAACCACTTACCCCTGGGAGTTTTTTTTCCTTANCATGTTTTATT
TATTCAATATAAGGGCTCTTGACCCGTCCCTCTTTTTATATAAAATCTTC
TCTTGTGTTCTCTCACACATTTTATTTCTCTCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 17 25 23 16 8 8 8 8 8 8 15 10 8 8 10 11 13 15 16 35 36 36 36 34 36 36 43 47 50 57 53 57 53 47 43 43 43 53 53
53 53 53 53 35 28 29 26 28 28 35 25 24 24 12 12 11 14 14 10 10 10 19 22 36 37 37 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 37 37 28 37 42 57 57 68
68 68 68 50 50 48 42 36 33 37 46 48 48 50 50 50 50 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 47 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 47 47 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 48 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 32 32 13 18
19 32 44 44 44 43 43 44 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 50 50
25 34 28 31 21 17 13 12 10 10 12 16 15 13 16 12 12 9 11 16 24 41 59 59 59 59 59 59 59 59 48 46 34 34 32 23 16 22 12 12 12 15 25 24 28 28 28 37 34 39
39 59 59 59 59 59 59 59 59 43 32 28 30 30 43 43 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 34 34 28 28 28 28 30 30 59 59 68 68 68 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 44 32 18 12 12 32 34 59 68 59 59 57 57 57 57 59 59 57 57 27 27 11 11 15 27 32 57 57 59 57 57 54 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 34 44 28 28 30 36 37 43 43 44 59 59 59 68 59 59 47 46 37 42 42 42 31 31 23 28 28 42 42 50 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 57 59 59 47
34 34 25 31 31 39 39 41 37 37 39 39 39 39 39 41 59 44 41 41 44 37 37 37 37 37 30 29 32 30 33 33 36 32 26 30 32 37 37 37 39 39 37 37 39 41 41 47 47 46
47 48 48 48 48 47 41 40 37 37 37 32 30 29 37 37 32 32 41 37 32 32 31 37 28 37 37 43 43 47 47 38 36 36 33 33 33 37 40 30 25 19 8 6 6 8 8 18 18 59
43 46 48 48 48 48 48 48 57 57 57 42 38 36 32 32 30 37 37 40 39 39 26 16 9 11 8 15 11 13 17 22 37 39 23 15 10 11 11 21 27 39 39 39 37 39 39 28 27 19
11 11 23 27 33 37 36 35 39 39 43 43 39 34 34 25 19 21 25 24 24 28 37 31 25 30 30 37 34 41 39 34 24 18 18 20 28 30 32 32 20 18 18 24 24 27 37 39 37 20
24 12 8 8 8 8 8 10 25 34 24 20 11 11 11 14 16 20 29 27 19 19 9 15 8 8 8 15 10 18 13 13 12 10 12 17 16 11 9 8 8 8 13 11 15 21 21 20 32 30
30 13 11 7 7 7 9 11 19 17 10 10 10 10 8 10 9 9 13 10 12 12 11 11 9 12 9 9 10 10 12 10 10 13 21 19 17 10 8 9 13 10 10 18 22 10 13 10 10 8
8 8 8 11 9 9 6 6 6 6 8 10 10 10 10 11 11 11 15 21 21 16 16 14 18 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 9 18 17 16 11 11 11 13 12
17 11 23 14 10 10 10 14 19 14 19 17 17 12 10 10 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 9 6 7 6 6 6 8 10 9 9 9 9 10 10 15 13
10 8 8 8 8 10 9 8 8 6 6 8 6 6 10 10 8 8 8 9 11 12 12 11 9 9 6 6 6 6 8 6 8 8 10 26 30 19 16 14 12 12 11 8 8 6 7 8 8 11
11 11 12 10 14 10 11 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 8 8 10 10 10 10 10 22 27 28 19 19 11 13 13 10 10 12 10 8 8 7 7 7 10 8 8
8 9 11 14 18 12 10 10 11 11 10 15 10 8 9 10 10 8 8 8 8 10 15 15 8 8 8 8 8 7 8 8 12 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 9 6 6 6 6 10 10 7 6 6 6 7 6 9 10 15 9 8 9 9 12 11 19 19 19 8 9 10 21 21 33 32 35 32 33 34 36 36 37 37 42 42 47
40 43 48 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 46 46 54 48 48 48 47 47 47 48 48 47 47 48 47 57 57 57 50 47 57 42 39 35 35 35 37 28 32 20 21 21 24 24 35
42 42 47 47 47 50 50 57 59 59 47 47 47 57 57 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 52 52 54 57 57 57 57 57 52 52 43 50 43 52 52 59 57 57 54 57 57 57 57 68
59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 42 42 35 43 43 43 44 35 35 35 44 44 59 59 59 59 59
59 62 62 62 62 43 39 39 43 62 62 44 44 35 35 35 44 43 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 57 52 52 43 52 52 52 52 52 52 52 57 57 52 59 59 68 59 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 50 43 39
43 43 43 43 52 59 47 48 57 57 44 44 32 33 33 44 44 59 50 47 47 57 57 57 57 57 40 39 39 37 42 44 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57
59 59 59 57 57 57 48 43 43 39 44 44 59 46 47 46 46 43 43 47 54 54 57 59 59 48 48 47 43 43 43 39 43 43 59 59 59 59 57 48 48 47 47 39 34 30 20 18 11 12
12 12 12 12 15 24 28 39 39 47 47 48 59 59 48 48 48 48 48 59 57 57 57 57 48 57 59 59 43 43 43 47 48 48 59 57 57 48 59 59 46 46 43 59 59 59 39 23 23 10
8 8 7 7 7 12 9 14 14 14 17 24 14 14 14 10 9 10 12 12 33 33 59 59 59 59 59 43 39 39 39 37 37 30 22 22 12 12 9 11 11 16 16 22 28 21 21 12 12 11
12 12 25 25 41 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 37 43 39 59 43 48 48 48 59 59 48 48 48 47 46 43 43 43 43 48 59 59 68 68 68 59 54 54 54 54 54 54 59 59 59
59 59 59 59 59 54 54 47 57 44 42 42 44 44 48 48 44 57 44 44 40 46 44 48 47 47 47 47 44 37 44 46 47 57 57 46 43 43 44 47 47 48 48 48 46 42 39 37 37 37
44 44 43 37 37 37 37 43 43 48 44 40 30 30 30 40 40 54 59 57 57 54 48 43 43 43 43 46 47 57 48 48 43 43 43 39 39 37 37 30 35 35 34 34 40 40 41 47 41 41
27 34 33 37 37 34 34 35 39 35 39 39 37 37 22 28 22 28 22 26 26 37 37 37 33 33 33 33 33 35 39 39 39 39 39 39 39 44 48 48 43 39 37 35 35 35 47 39 41 41
39 36 36 35 37 30 31 31 35 35 39 59 59 59 47 36 36 36 37 29 16 21 11 12 12 25 25 29 17 17 26 26 33 37 37 30 30 23 30 18 16 16 12 12 14 28 30 43 48 39
37 35 26 30 22 22 16 23 16 17 10 9 10 10 11 20 22 25 29 33 31 34 41 41 34 34 31 24 25 23 23 27 24 22 22 24 37 41 39 40 39 37 32 30 28 25 17 17 16 16
10 15 15 11 9 9 10 10 10 15 17 17 12 12 12 17 16 14 12 16 16 25 30 32 32 15 15 16 19 19 25 28 24 22 27 15 16 16 27 28 35 32 32 28 22 22 22 22 21 19
15 10 10 8 13 13 17 14 14 22 30 25 27 35 25 15 12 10 10 12 10 10 11 18 12 15 16 22 21 21 19 10 8 8 8 8 9 10 15 13 8 10 8 8 8 10 10 9 8 8
12 10 10 10 10 12 15 19 28 32 28 23 16 8 8 6 6 6 8 7 7 8 8 8 6 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 9 10 12 14 14 14
19 17 10 9 10 10 10 10 14 10 10 10 6 6 6 10 8 9 9 13 12 9 9 10 9 9 9 9 10 11 8 8 8 8 8 10 8 10 8 12 8 8 10 8 8 8 8 10 7 9
9 9 9 9 8 6 6 6 6 10 6 9 10 8 8 8 8 8 10 15 13 8 8 8 8 8 8 8 9 11 13 10 8 6 6 8 8 10 11 14 11 10 8 8 8 8 7 7 6 6
8 8 8 8 8 8 9 8 11 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 13 10 10 10 10 11 11 13 11 11 11 13 11 11 11 11 11 12 11 12 12 8 13 8
8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 8 11 10 12 9 9 9 9 9 8 3 0 3 8 6 6 8 10 7 7 9 9 11
9 6 6 8 8 10 8 8 8 9 11 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 15 11 11 6 6 6 7 8 8 14 23 10 7 7 7 7 7
11 8 8 6 6 6 8 8 10 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 12 12 15 14 11 11 8 7 7 7 6 8 8 10 8 |