BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-180D21.T7 (MSMg01no180_d21.b1) | MSMg01-180D21.TJ (MSMg01no180_d21.g1) |
ACC | AG373778 | AG373779 |
length | 713 | 708 |
length of high quality (start - end) | 300 (377 - 676) | 288 (68 - 355) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no180_d21.b1 PHD_FILE: MSMg01no180_d21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:53:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no180_d21.g1 PHD_FILE: MSMg01no180_d21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:53:26 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CCAGCACTTGCAAGAGGCACAGGGAGAAGAATGGCAGCCAAGTGCAAGAC
CACGTTGGTCTACACTGCACGCTCAGGCCAGCCCACACTACACAGTGAGA
TCCTGTCTCCAAAACTAGAAAAAGAAAAAGGAAGAAAACCAAAGAAAATG
AAAACTAGATTTCTGAGCATGGTATCATACTACAATCCCAAACACATGGG
AGACAGAAGCAGAAACATTAACTACTGAGGCAGCCTGAACTATACAGCAA
GACTGTGTCAAAGCAGGAACTTCTCAAAACACCACGACCACACAACACAG
TAACAATTTGTACTTGCCCCACCACAGTTTTCCTCTCTAGTTCTTAAGGC
AGCTCGAGCCCAACTCACCGAGACAACACAGCAGTCTACCACAACTCACC
GAGACAACACAGTCTACCACAGGCTTCTTAAGAACACTCTCTGCTGTCTC
CTTCAGTTTCGACAAAAGCATGGCAGTCACTTGTTCCGTGGTAAAATTCC
TCTCTTCTTCCATATATGTAACCTGCAACAAAACAAAAGGATCCAATTTT
AGTCCACTTCATGTCCTAGTCAATGGGGCAGTATCTCAGGAGGGGACTGA
AGAACGTTATCTTTACAAAGAATGTTACCTTTTTGTTTAATATACATGAC
ATTTAGCACAAGA
| ATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXACTATGTAGACCAGGCTGTCTCAAACTGACAAG
AGAGCCGCCCACGCCCGCTTCTCGTGTGCTGGGATTAAAGGTGCGCTCCA
GCACACTCTGCTAAAACTTTTTTTTTTTTTTAAATTATTGTATGTGTCTG
GGTGTTTTGCCTGCATGAATGTTTGTGCCACCTGTATGTGCCTGGAGCTC
ATGAAGGCCAGAAAAGGACATCAAATCCCTGGAACTCTGAGGTACCCCAT
GGGTGCATGGCACTGAGCCCAGGTCCTCTGGGAAAGCAGCCAGTGCTCTG
TCTGATTTGCTGACCCACCCTTCCAGCCCTTGGAACAAACTTTCAACACA
ACATTTGACAATGGATTGGATATTTACCTCAGGTCTTCACAATTGGTTTT
TCACTTGGAGTTTTGTTTGTTTGGATTCTTTTTCTTGGAGCATGCATATA
TGGTGTGCATGTGTGAGTGTGCACATACATGTGCACATACATGTGGGGGC
AGAGCCCAGAGGTCCTCAAGCATTCTCCACAGTACTTTTTTTTTTTTTTA
AAGATTTAATTATTGGCTATATGTAAAGACACTGTAGCTGTCTTCAGAAT
CTCCACAATAGGGTGTCAGATCCCGTTACAGAAGGTTGCGAACCACTATG
TGTTTGCN
|
quality values | Open.Hide.19 19 28 28 44 39 30 30 25 24 24 32 32 32 28 28 37 37 37 36 36 29 29 28 28 18 16 19 10 10 9 9 9 16 22 30 30 30 30 30 30 30 41 53 57 36 35 35 31 31
28 28 28 21 21 11 11 11 11 12 11 11 11 18 29 34 47 42 37 41 41 35 35 53 53 53 53 59 50 37 37 40 40 47 57 59 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53 53
53 53 53 53 53 50 50 50 41 34 26 22 8 8 8 8 8 6 9 10 10 10 22 25 42 42 47 48 48 48 48 57 57 53 53 50 50 50 53 53 53 53 53 53 47 47 57 47 47 47
47 47 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 54
52 52 52 57 57 57 59 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 44 34 23 18 18 23 25 36 32 32 34 32 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 57 57 57 53 53 53 50
43 43 39 39 43 43 28 30 25 24 20 20 20 23 26 32 23 10 7 6 6 6 6 8 8 14 12 18 28 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 54 54 54 54 59 59 46 43 43 43 37 37 37 37 37 46 44 48 57 46 48 57 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 59 59 59 57 57 57
59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 59 57 46 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 68 57 57 47 57 57 57 44 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59
68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 39 37 37 37 37 37 37 28 28 35 37 37 41 41 41 43 43 48 46
47 46 39 39 43 39 48 43 43 36 32 32 37 37 30 25 25 18 22 22 34 30 34 39 37 37 39 39 34 34 25 25 25 34 30 47 37 31 25 32 39 39 37 30 30 22 24 24 25 20
20 23 22 18 19 19 14 14 19 32 37 39 37 30 30 22 18 18 34 34 36 28 32 18 18 20 32 24 18 18 9 9 9 19 14 15 15 19 22 22 23 30 28 28 28 34 34 34 28 30
30 30 17 17 11 8 8 8 8 8 13 13 8 | Open.Hide. 6 6 11 13 11 8 8 10 17 27 41 37 39 50 50 50 53 53 53 53 53 42 37 42 33 22 22 23 23 18 14 11 11 12 21 21 48 50 50 23 23 11 12 11 26 26 50 50 50 50
35 34 24 25 31 31 42 42 42 42 42 36 41 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 53 53 53 68 68 68 68 68 68 59 50 50 50 50 50 50 57 57 42 37 37 38 50 50
59 59 59 59 59 59 34 24 20 23 15 15 10 9 9 9 10 13 23 34 47 47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 36 36 37 37 47 50 59 53 53 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 47 47 47 57 57 57 43 43 43 43 43
27 43 43 50 57 57 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 54 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 57 52 52 52 57 57 52 52 52 59 59 54 57 43 50 42 43 43
57 57 57 57 57 52 52 57 57 43 43 43 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 59 43 43 46 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 59 57 47
43 44 43 44 46 48 54 48 43 44 36 24 30 30 32 17 17 19 32 43 57 57 57 54 54 57 57 57 48 48 48 48 48 44 43 43 43 40 40 43 43 43 48 48 46 46 43 47 28 30
12 12 12 12 12 14 16 22 22 23 15 12 11 10 14 14 11 11 12 21 21 24 26 25 26 41 41 47 43 43 43 43 43 43 57 43 39 47 35 43 43 44 42 47 42 42 48 57 57 57
68 68 57 46 46 46 47 43 42 39 30 30 16 16 12 21 19 12 12 12 12 21 30 37 47 46 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 48 57 57 59 59 59 59 57 43 43 43 48 50
50 48 50 48 43 43 42 43 43 47 47 54 59 57 54 52 52 52 52 52 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 50 38 38 35 35 35 43 43 59 43 43 33 42 42 44
41 57 50 43 35 42 42 57 59 50 43 41 41 42 44 37 35 35 42 42 32 34 32 42 37 35 35 32 32 32 36 41 27 32 32 42 32 41 41 41 41 47 48 47 47 43 44 39 39 39
44 44 39 39 35 36 40 30 30 19 19 10 10 10 21 24 36 30 37 32 34 23 33 33 43 42 31 31 20 18 15 17 17 28 33 33 34 34 34 36 36 36 48 48 48 39 28 24 24 17
17 12 20 20 16 15 10 8 8 10 13 16 16 22 13 13 12 12 21 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 10 11 11 16 15 18 13 9 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 11 10 10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 12 11 11 13 11 10 10 10 10 15 8 10 8 8 8 11 11 11 9 8 8 8 8 8 13 10 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 11 11 3 0 |