BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-193G21.T7 (MSMg01no193_g21.b1) | MSMg01-193G21.TJ (MSMg01no193_g21.g1) |
ACC | AG382739 | AG382740 |
length | 1,252 | 1,179 |
length of high quality (start - end) | 424 (31 - 454) | 377 (72 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_g21.b1 PHD_FILE: MSMg01no193_g21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:51 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no193_g21.g1 PHD_FILE: MSMg01no193_g21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:11:51 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNGAAGCACTGCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAAT
TCAACACCACACCCTCATCAATGGACAGATCATGGAAACAGAAACTAAAA
AGAGATACAGTGAAACTAACAGAAGTAATGAACCAAATGTATTTAACAGA
TATCTATAGAACATTTCATCCTAAAATAAAGGAAAATACCTTTTTTTCAG
CATGTCATGGTATCTTCTTCAAAATTGGCCATATAATTGGTCACAAACAG
GCCTCAACAGATTCAAGAAGACTGAAATAATACCATGAATCCTATCAGAT
CACCAAAGACTAAGGCTGGTCTTCAATAACAAGAAGATCAACAGAAAGCC
CACATACAAATGGAAGCTGAAAGATGATCTGCTCAATGATAACTTGGTCA
AGGAAGAAATAAATGACAAAATTAAAGACATTTTAGAATTTACTGACAGT
GAATTTTTAACTCACCCAACGTATGGGACACAAAGAAAGCTGTGATAAGA
GGGAAACTCATAGCTCTTTAGTGCCTCCAAAAAGAAACTGGAGAGCACAC
ACTAGCTGCTTGACAGCATATCTGAAATCTCTAGAACAAAAAGAAGCAAA
TACACCCAAGAGGAATAGATGGCAGGAAATAATTGAACTCAGGGCTGAAA
TCAACCAGGTAGAAATATAAAGAACTATAAAAAGAATGAACAAAACCAGG
AGCTGGTTCCTTGAGAAAATCAACAAGATAGATAAACCTTTAGGCAGACA
AAACAGAAGGCATGGAGACAGTACCCAAATTATGAAAATCAGAACTAANA
AGGGAGACAGAATCCGAGGAAATGCAACAACATCAACAATGAAAAAATCA
TAAGATGCTACTACAAAAGCTGGAAAATCTGGATGAAATGGGCAATTTTC
TATACAGATACCAAGTATCAAAGTTAAATCAGGATTAGATAAACCATCTA
AACATTCCATAACCTCTAAAGAAATTAGAAGTATTCATTAATAGTCTCCC
CAACCAAAAAAGTCCAGGTGGGGTTTCAGGCAAAATTTCTATCACACCCT
TCAAAGTTCTAATAACAACACTCCTTTAAAATATTTCCCCAAAATAAAAA
AAACACTATTGCAATTCTTTCTATGAAACCCCATTTTCATATATTTCCCT
AACANTACCAAAAACCCCCCCAAAAAAAAAAAACTTTCGGCCAATTTCCC
CTATAAAAATAAAAGCGCAAAAAAAGCCAAAAAATTCCTATAACCCAATC
CC
| NNNTTATTGATGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATGATCTTGAATTTCATAATTGTGGTTC
TTCTTAGGAAATATTTCTATGAGGTTGATTTCTGGAGGGGATATAATGTC
TTGGCTTACTGTAGTGCTGTGCTTTTTAAATGTCTGGACATAGATATTGG
TTATCTACTTAAATATGAATTATTAGAACACCCAGCTGGAATACCAGGCA
GAAGTGGGAATATGGGTGCTGAAGTGGGCCGAGTCTGATCATACTTTCCA
CTCTTCTGGCTCCTCTCATATCCTTCTTGACCTCTCTATCTCCTCAGCTT
TGGGCTCCCATTTTCTCTCCATCTCTAAGCCCTCTACATACACACAAGCT
TAAACAAGCAGCAGGGACAGCAAAATCAAGACTAAAAATACCAAAACTTT
TTTTTTTTCCCCCCCCCAAAAANAAAACCCCCCCCACAAAAAAAAGGGGG
GGGGTTTNTGNNNTTCNTTTTGTGTTGGTCNNCTGCTGGGCCCTNGGCCT
GCCCTGGNGTGCTTTTGATCTCCCCNGTTCGCTTCCTTTTCCTTCTTTCN
TCTTCCCTTTGCCCCTGCGTCTTATTTGGCTTGNGATCTTGCGTCCCTTT
TGCTTTGCCTTGCTTGGACTCCGTTTGNCTTCGTCCCTCTGATTTCCTGT
GCTTTCTGCCCCTGTCTCTTTGACTCTTTATGTTTCCCTTTATCTCTTGC
CTTCAACACTCCCCCTTGTTTCTCTTCCTCCCCTCCTTTTTTTTCTTCCC
CTTTCTTCTACCCCTCCTCCCTCCTTTTCCCTTTTCCTATCTTTTACTCC
TTTTCCTTTTCTTTCCCTTCCTTTTTTCTCCTTCCTCCTTTCCCCCCCTT
CCCTCTTTTCTCCCCTTCTCTTTCCTCTTCTCTCTTTCCTCTTTCTCTCT
CTTTCTTCTTCTCTTCTTCTTTCTTTCCCTTACTACTCTCCTCTCCTCCT
CTCCCTTTTTCCTCTCTTCTCTTTCTCCTATTTTCTCCCTCCTCTTCCTC
CTCTCCTCCTCCTTTCTCCTTTCCTCTCTCCTCCTTTTCTCTCTCCTTTC
CTTTCTTTCCTCCTTTTTCTCTTCTCCCCCCTCCTCCCTTTCTCTTACTC
CTCCTTTCTTTCCCTTTCCCTCTTCCTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 7 9 9 9 7 8 8 8 11 13 12 9 8 8 8 8 8 11 8 8 8 11 12 13 22 22 36 28 22 24 24 33 34 42 42 47 50 40 48 48 48 53 53 42
51 42 42 42 47 48 51 42 42 50 50 50 50 68 68 53 51 48 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 51 51 51 68 68 68 68 57 57 54 57 48 57 57 68
68 68 68 68 57 57 57 50 50 50 50 50 51 57 50 50 50 50 50 50 57 44 43 30 30 35 37 42 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59
59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 30 32 37
43 43 37 37 39 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 53 53 50 50 50 43 41 26
15 13 13 9 9 9 11 12 16 16 12 12 12 12 12 12 11 12 18 24 32 36 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 39 39 33 30 23 24 15 12 11 10 10 10 10 13 26 30 34
37 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 54 54 68 68 68 54 57 59 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 57 59 59
59 48 47 43 43 48 39 39 44 43 57 57 54 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 48 59 59 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 48 48 43 43 39 47 59 47 41 41 43 41 41 43
43 47 41 41 39 39 35 47 41 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 39 40 31 23 20 35
32 46 46 54 57 44 44 43 47 47 57 43 43 40 47 47 57 43 57 43 43 43 46 59 57 47 47 44 44 39 41 40 41 37 39 38 34 34 39 34 34 30 30 30 39 39 39 39 39 34
37 41 41 37 37 24 22 22 22 24 28 44 44 37 31 32 37 37 37 37 40 41 43 43 47 43 46 46 59 59 47 39 39 37 31 32 37 41 32 32 20 20 28 32 39 25 25 3 0 3
25 25 36 36 37 39 35 37 37 35 30 31 31 31 25 28 24 28 28 30 27 31 39 39 37 37 37 37 29 29 35 37 35 31 26 32 39 37 37 41 41 41 41 37 37 30 30 24 22 15
15 10 9 9 12 19 29 37 37 46 43 34 34 28 24 25 37 37 33 25 25 19 14 19 19 17 22 24 24 12 11 11 14 19 23 37 30 18 9 9 9 9 19 17 31 28 26 29 28 25
30 37 28 37 25 21 21 17 26 26 34 34 34 31 39 26 26 14 10 9 9 15 11 11 11 12 13 24 15 16 14 9 10 10 12 12 10 10 9 13 10 16 16 22 26 32 32 37 35 32
32 31 37 35 31 29 21 16 11 11 11 16 16 24 24 25 25 20 25 21 22 9 9 6 6 6 6 9 9 10 11 14 19 21 14 12 9 10 17 16 16 19 14 12 12 10 13 11 18 14
10 9 9 10 14 14 17 19 19 9 9 9 9 10 11 19 13 10 10 10 9 9 9 9 9 9 13 12 9 9 9 9 8 9 9 8 9 8 9 9 9 10 9 6 6 6 6 7 7 10
12 11 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 9 10 10 10 12 8 8 8 8 8 10 9 9 17 14 10 10 10 10 9 14 16 16 15 9 6 6 6 7 6 10 10 13 8 11 11
9 10 9 9 9 6 8 6 6 6 6 10 6 8 8 10 10 14 12 6 8 6 6 6 9 18 19 20 24 24 27 14 8 8 9 10 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9
9 10 8 3 0 3 8 9 10 11 14 21 13 10 11 14 12 12 18 14 18 22 11 11 11 11 18 16 21 24 21 18 11 12 8 8 8 8 8 9 18 16 16 15 11 12 15 13 13 11
11 11 11 11 12 13 18 8 6 6 6 10 10 10 8 6 6 8 7 9 9 9 7 6 6 6 6 10 10 10 13 21 12 7 6 6 6 6 6 10 9 13 13 11 9 9 10 10 11 11
14 14 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 10 9 9 9 9 9 8 6 8 6 8 8 9 9 13 9 7 8 3 0 3 17 19 22 22 10 18 18 32 25 36 33 36 33 47 36 36 37 37 37 47
47 47 47 47 42 48 48 57 57 59 57 48 39 37 37 37 50 39 37 33 30 30 16 15 10 10 10 19 25 41 42 50 50 44 44 47 47 47 47 47 47 42 57 57 48 48 40 40 39 42
43 48 48 40 40 43 43 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 48 36 28 18 14 14 24 28 42 57 57 46 46 37 46 42 42 32 35 42 44 57 57 68 68 68 57 59 59 57
57 57 57 57 50 50 51 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 52 52 52 52 57 52 57 57 57 44 44 28 28 28 43 43 50 50 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 44 44 43 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 57 52 57 57 59 52
52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 43 32 32 20 32 32 43 50 50 54 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 68 57 57 57 57
57 57 59 68 68 59 68 68 68 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59
59 47 43 43 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 59 59 48 47 59 28 28 12 8 8 8 8
8 8 11 13 17 23 32 32 48 48 48 48 57 57 57 48 48 46 46 48 47 43 43 43 43 47 43 39 39 35 35 43 39 47 47 48 48 48 48 50 50 59 59 33 25 12 12 11 11 16
21 18 18 19 19 19 12 12 12 12 17 18 32 30 16 12 11 11 11 21 27 3 0 3 18 9 9 9 20 18 19 22 13 13 10 10 12 12 17 18 19 18 16 16 15 14 14 14 12 11
12 12 9 9 9 9 3 0 3 3 0 0 0 3 25 3 0 3 27 23 47 31 31 43 37 30 26 12 12 3 0 0 3 23 23 43 34 37 23 20 9 9 9 3 0 3 11 12 12 23
22 36 36 25 23 20 3 0 3 18 9 9 9 27 23 41 23 15 7 7 7 7 9 23 3 0 3 11 9 9 9 16 22 15 9 9 9 15 19 13 13 6 6 6 6 6 6 9 3 0
3 8 6 15 15 18 18 21 23 14 13 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 23 23 37 30 19 11 10 10 8 11 3 0 3 10 15 14 14 14 11 12 12 11 12 12 12 13 15 17
15 15 21 21 28 18 10 8 8 8 8 10 10 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 13 18 3 0 3 8 8 7 7 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 10
9 9 7 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 13 16 10 8 8 8 8 6 6 6 8 11 12 13 10 10 10 10 13 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8
6 6 8 8 8 8 9 9 11 17 10 10 10 10 16 22 10 10 10 9 8 8 10 10 8 8 10 10 13 12 10 10 11 11 11 15 12 10 8 9 12 10 10 10 8 8 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 7 6 8 8 11 8 10 11 16 16 10 8 8 8 8 9 9 13 19 19 10 9 10 13 10 8 8 8 8 13 13 11 10 10 8 8 10
10 8 8 15 15 10 10 10 9 9 9 9 9 9 12 9 9 9 10 9 9 8 8 8 9 8 8 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8
8 8 9 9 9 10 10 10 10 11 13 18 11 8 8 8 8 8 11 12 12 11 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 12 10 10 10 15 10 8 8 8 13 15
8 8 8 8 10 8 8 6 7 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 8 8 8 10 8 10 8 10 10 10 12 8 8 11 11 11 11
16 11 11 11 12 12 11 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 9 9 13 9 9 10 8 10 8 6 6 8 8 8 8 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10
8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 11 11 18 22 15 11 11 11 11 17 11 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12
18 11 10 10 10 10 10 11 11 9 8 8 8 12 8 8 10 11 11 13 10 13 12 12 11 8 9 11 11 9 9 9 9 12 9 10 10 11 10 13 13 14 15 12 8 7 6 8 8 10
8 6 7 9 8 8 10 11 11 8 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 7 8 9 7 8 8 8 6 |