BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-196J19.T7 (MSMg01no196_j19.b1) | MSMg01-196J19.TJ (MSMg01no196_j19.g1) |
ACC | AG384662 | AG384663 |
length | 811 | 759 |
length of high quality (start - end) | 281 (45 - 325) | 557 (77 - 633) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no196_j19.b1 PHD_FILE: MSMg01no196_j19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:16:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no196_j19.g1 PHD_FILE: MSMg01no196_j19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:16:13 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTTGGTGGAAATTTTAGGGTCACACACACATATATACATTATCATA
TCACCGGCAAAAAGTGATATTTTGACTTCTTCCTTTCCAATTTATATCCC
CTTGATCTCCTTTTGTTGTCGAATTGCTCTGGCTAGGACTTCAAGTACAA
TGTTGAATAGGTAGGGAGAGGGTAGGCAGCCTTGTCTAGTCCCTGAATTT
AGTGGGATTGCTTCTAGCTTCTCACCATTTACTCTGATGTTGGCTACTAG
TTTGCTGTAGATTGCTTTTATCATGGTTAGGTATGGGCCTTGAATTCCTG
ATCTTTCTATTATTTTTATCACGCCCGCCCGCTGGATTTTGTCATATGCT
TTCTTTGCGTTTTTCCCCCCTCATAAAAAAAAAAATTAATTTTTGGGGTG
GGTTCCCTTTTGCCCACTCCTACATACTTAATCCTTTTTCTCCCAGCGTG
TTTTGATCTTCTTATTCCCTCCCTTTTTTTCCCTTCCCTGTTTTTTCTCC
CCGCTTCTTCACACCTTTTTTTCCATCCTTTTTCTCGCTTCATTCTACTT
AATTTACTCTCTATTTTTTCTTTCTCATTGCTTCCCCTTTTTCTCTCTTT
TTTATTTATTTGTTCACCCTTTTTTTTCCCCTCCTCTCTCTATCTAACTA
TTTATTTGCACCCACCTATTTTTCATTACCCTCCTCTTTCCAACGATGAT
CCCCAATATTATTTTCCTTCTCTAATTCCCCCCCTTTTTACTTTTAATAT
ATATATTATCT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATTGACTGTAGCTATATGGGGCA
TAAAAGCACCTTAAAAACAAATACTTGCCAAAAGTCCTGTTTCACCATTG
GTCAATACAAAGGTTCTTGGTTATATGTTGGTCATGGTAAGCAATGAAGA
AACTCTAGAGTCTGAGAGAAATAACAGGGTCATGTATAAGGAAATTAATT
TCCCAAAGGCCAGATGGTAATTCTACAGTCCAAGTCTATCTTGGTGTGAT
GTTTATTAAGTCCTGAGCATCAGCAATCACATTTAGGAAGGTACAAAGAT
TCTGTAGGTATAATGCATAATGTCTACCTCACCTGAAAGATAGAAAACCT
AGGTAAAGCAAAGATAAGGAAAGTAGAGCAGAGAAGTCTTAAAGCATGTT
AAGTAAAGACTTTTCACTTAGAATGTTTAAGAATCAAGAGAAGTGAGTTC
AGTTTCCTCTCCCATCATTTGCAAGTAAAGTAGGAAAAAAAAAGAGCAGA
TTGGCATGTGCCTTTGGGTATTAGGTTTTCAGAATCTTGATAAAAAGCTC
TTATCTTCCTCACTGTTCCACTCTACTGTGATAAATAAAGATGAAATATT
TGCCAACACTAAAGAGAATAGTTTACAAATTGTCAGGTATACTCTCTACA
ATTCTCTAAGGGCTGTCCAATGTTTGCCTAAAATCCTTCATTGGCCAAAA
ATTTTCCTA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 9 9 11 14 28 35 34 37 37 37 29 31 37 23 23 24 28 28 30 44 48 35 30 30 30 35 36 44 43 43 43 36 36 36 43 44 33 32 22 22 22 37 41 68 68 51 51
47 47 68 68 68 68 68 68 50 48 47 43 37 37 37 44 44 40 48 57 57 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 50 48
48 48 48 48 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 42 38 43 29 35 32 43 43 57 57 57 68 68 68 68 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57 68 68 68 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 52 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 47 48 57 57 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 47 44 43 43 43 57 57 57 44 44 27
27 17 30 30 41 32 30 30 30 37 37 57 46 54 54 48 57 48 48 40 44 30 24 24 23 22 26 17 18 15 20 17 20 30 28 23 23 23 28 43 40 46 43 43 43 43 39 39 28 32
25 34 34 48 39 32 20 15 11 12 11 11 12 16 25 25 11 11 10 10 10 10 10 8 11 8 8 8 9 12 12 11 16 10 13 9 9 9 13 11 11 10 10 10 10 14 10 9 9 22
23 23 24 14 12 13 8 10 6 6 8 10 10 13 14 18 19 8 7 6 6 6 8 10 10 10 10 15 16 10 10 10 11 10 10 8 6 6 8 8 9 11 17 12 12 15 11 9 9 6
6 7 6 8 8 9 9 8 12 17 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 10 9 9 9 8 9 9 8 10 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6
7 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 15 12 11 8 8 6 10 9 14 13 9 13 6 6 8 8 8 10 12 10 8 7 7 7 11 10 12 8 10 10 10 10 8
8 6 6 6 8 8 10 10 18 10 10 9 9 9 9 9 15 18 12 11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 13 12 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 11 13 10 6 6 8 8
8 8 10 10 8 6 6 8 8 8 10 9 11 11 16 15 17 10 11 11 11 16 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 13 12 26 23 32 22 18 12 9 9 10 15 16 19
21 8 7 8 7 11 8 11 11 10 9 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 9 12 18 13 11 10 10 13 10 10 16 11 13 9 9 15 11 11 11 12 17 15 13 8 8 8 8 8 8
8 10 8 9 11 10 11 6 8 6 6 8 6 8 8 9 9 10 11 16 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 8 8 8 8 8 9
12 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 11 17 12 8 8 8 9 10 10 8 8 8 6 6 8 10 10 8 11 11 12 10 10 11 10 12 12 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 14 15 8 8 8 8 15 24 37 36 36 39 37 39 59 50 57 57 57 57 57 53 50 50 57 57 50 50 48 53 53 57 50 43 43 40 36 36 41 42 42 54 54 54 54 54 54
54 54 54 54 54 68 68 68 68 57 57 42 48 41 41 41 48 59 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 68 68 62 62 62 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 42 44 47 47 47 47 47 48 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 68 57
57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 32 23 15 15 13 13 14 14 18 18 30 28 21 29 15 15 13 13 13 15 19 19 12 15 19 32 30 39 48 48 48 59 59 59 59 59 59
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 43 43 37 37 30 32 30 37 39 59 59 44 44 30 32 32 37 37 43 46 59 59 59 59 48 48 48 48 54 57 59 59
57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 42 42 35 44 44 54 57 57 57 57 40 43 43 46 46 48 57 59 59 59 59 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68
68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 54 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 43 47 47 48 57 59 48 48 48 48 48 48 39 47 36 36 36
40 40 37 37 39 37 37 39 41 46 46 46 43 43 34 31 20 29 28 34 34 39 36 39 39 40 40 40 30 30 17 15 15 19 21 30 33 37 37 32 39 39 43 43 33 30 26 17 17 24
25 37 32 30 30 32 37 26 22 24 24 28 34 41 47 26 25 11 11 11 18 28 39 48 34 32 23 20 20 20 20 28 24 24 19 19 23 19 18 22 28 28 19 15 11 11 9 13 17 30
25 18 18 20 17 10 10 10 20 24 37 30 23 23 14 13 8 10 10 12 10 11 17 15 21 21 15 20 20 19 28 20 20 26 15 12 7 6 8 8 10 16 12 12 12 12 12 12 13 10
8 8 8 11 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 16 19 22 28 27 24 14 10 8 8 8 7 10 6 6 8 8 13 6 6 6 8 8 6 16 11 8 8 8 8 8
9 10 15 17 11 8 8 8 8 |