BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-232K23.T7 (MSMg01no232_k23.b1) | MSMg01-232K23.TJ (MSMg01no232_k23.g1) |
ACC | AG399116 | AG399117 |
length | 756 | 757 |
length of high quality (start - end) | 320 (46 - 365) | 292 (77 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no232_k23.b1 PHD_FILE: MSMg01no232_k23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:49:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no232_k23.g1 PHD_FILE: MSMg01no232_k23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:49:14 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCATGTTTGAAAACAGCTTGAAACTAGATGCTATGCTAATTTCTAAA
CTCCTGACAGCAGTGAAAGTCACGGACCAAGACAGGGGAGAGTGAAAAGT
GCAAATGGAAAACCTTTCCCACAGCACCACCGGTCACTTTTTTAAGTATG
CATAACATTTAGTGATGTGACAGCAGCTTCATAAAAACAGCTACAGCAAC
CAGTGAGAACCACTCAGTTCAAGTGCAGGAGAAAACCTTACACCGTGTAC
AGAAAGACCAGGAAAGCACTCTGCCTTATAAGTAATGGTGCCCACAGGAA
TCACAGGAGGAGGCAGTGTCTAAACCCACGCCTGACAGCATCAAGTCAGC
AAGAGACACAAACGCACAACACACAAAGTAAAAGGATTTGGTACATACTT
GTGACAAAAAATTTTTTTGTGAAAGTACAGCTATCAAAGGCAGCAATTTT
CTCCTGCAAGACTACGACGAGGATCCTAAAAGTAAAGAGGAAAAAACCGG
AAAAGGGACGTGAGTAAACGTGAGATTCTATGAACGGAATCATAAATAAT
TAAATTATACGTTTAAAACAGAACATTTTAATACATAGAATAAAAAAAGC
AAACTCTAAAAATCTCAAAGTAAAAACAATGAAAATTTTCATATAAACAA
AGAAAGTGACAGTTATTCTACAGCTGAAAAGTGCTCTACCAACACTTTCA
TTTTCN
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAATCCACTTGCCGTTTAAAAGA
AAAAAAAAAAAAAGAAAAAGCACTGATCTGATAGCTCAGCAGGGGAGAGT
TTGTTTTGAAATCGAGAAGACCTAAATTCAATTTCTCAGACTTGTAAAAA
GGCCATGCATGGCACCTCCATCTGTAGCCCCAGCACTATAGAAGAGGCAG
AGAGTAGGGGACTGACTGAGCTTGCTTGCCACTGGCCTAGTTCCAGGCTC
CTCAAGGAGAGAGCATGCCTCAGGGGAGTGAGGAGGAGAGTGATAGGGAA
GGACCTCAACTTAGCGATGTTTTCTGCACCCCCCCCGCAGCCCACATCCC
TGTGGAGATACTGCACACATGCACCACACACACACACACACACACACACA
CGCGCGCACACACACACACTCACACAGAGTGCAGCTGCTTAGGTTCAGCT
GAGGCTACCTATAAGTAATTGTTGGTAGAATAGGGAAATCAGGGGGCTGA
AGACTTGGCTCAGTGGTTAAGAGCTCTAAGTGCTCTTCCAGAGGTCCTGG
GCCCTGAGTTCAATTTCCCGCATATATATATAATCTTTTTAACAGAATAA
GGAAATCATAAAACCCGAGTGAGTTTGTGTTGGAAGCACATGGTGTTTGT
AAAGTTCTTATTCTAATTCAAAGAGATCAAAGCGGAAAGATGTAGACAAC
TCTCTGC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 13 32 59 43 37 37 37 31 31 37 37 37 37 37 41 37 39 43 48 35 32 36 36 36 36 47 47 43 43 36 43 43 43 59 42 42 28 26 26 42 41 59 59 47
47 47 47 48 47 47 47 47 57 59 57 68 68 68 48 48 47 47 47 47 57 57 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 51 50 51 50 50 50 57 57 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 25 20 10 10 10 25 32 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57
57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 39 43 31 41 28 30 41 43 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 50 50 59 41 30 22 15 16 11 13 10 8 8 10 10 24 25 25 10 10 10 10 10 12 14 12 15 15 23 30 59 59 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 47 23 15 8 8 8 10 17 23 32 32 40 40 48 48 41 41 35 35 35 35 36 33 29 30 30 43 43 59 59 59 59 59 59 59
48 48 48 48 48 57 57 57 54 54 54 54 54 68 68 59 59 47 43 43 43 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 44 44 37 37 43 47 44 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57
68 68 59 59 59 48 48 48 57 57 46 48 44 46 46 59 57 57 48 54 57 57 57 57 57 57 57 47 43 36 28 22 22 22 30 28 43 43 48 48 54 48 48 41 41 41 41 41 36 36
37 37 42 42 42 35 35 35 42 39 39 39 40 39 39 40 43 43 43 37 37 43 32 29 18 21 21 21 21 30 43 43 37 37 41 41 37 31 29 32 37 36 36 36 39 39 37 37 35 31
31 37 37 35 35 31 35 35 39 37 34 34 28 28 28 36 36 32 32 30 32 32 39 39 32 33 30 37 37 40 40 32 25 17 14 14 17 19 24 26 28 35 37 37 39 39 28 34 23 23
22 22 22 30 26 24 18 16 16 21 17 19 28 21 23 19 15 11 13 11 11 11 22 12 11 10 13 11 14 19 28 31 24 24 20 19 19 24 24 23 23 28 31 32 32 26 24 17 15 15
15 22 28 32 32 36 18 19 16 11 12 8 10 8 8 17 28 30 10 8 8 8 10 10 26 19 14 14 14 15 15 10 9 9 9 9 15 13 10 10 8 10 8 8 8 8 14 9 8 8
8 13 9 8 3 0 | Open.Hide.10 10 9 13 12 8 8 8 8 19 24 37 37 37 42 48 48 59 53 57 57 57 57 57 53 50 50 53 53 53 53 48 48 43 43 43 42 42 40 30 30 30 42 42 48 48 43 43 46 46
50 50 68 68 68 57 57 54 54 54 57 48 48 41 41 46 48 57 57 57 50 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 50 50 50 50 47 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 62 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 52 43 57 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 52 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 54 54
54 57 57 57 59 59 57 57 57 52 54 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 54 57 54 59 59 59 48 50 50 57 57 57 57 54 59 54 57 57 57 57 57 57 48 48 57
59 59 57 54 57 48 57 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 44 30 19 12 19 15 24 22 23 28 31 31 40 39 48 48 48 48 48 48 48 43 57 47 48 48 59
57 57 50 53 53 53 48 48 48 48 43 41 28 15 11 8 8 6 6 7 7 15 16 11 9 11 9 11 11 20 20 31 25 24 15 12 12 11 23 23 59 47 47 47 39 39 43 43 43 43
43 37 37 37 43 43 48 48 57 48 43 47 43 41 41 41 41 39 19 13 8 8 8 8 10 26 25 37 37 28 28 24 24 18 18 17 17 13 21 18 21 18 24 24 23 23 19 19 8 8
8 8 8 8 8 8 9 12 18 22 28 28 32 32 28 32 19 19 11 11 11 18 18 28 28 32 32 37 35 35 39 39 43 43 39 39 39 40 34 36 34 25 24 20 20 24 37 37 36 39
39 32 32 37 37 36 39 39 47 42 42 39 37 37 22 22 18 25 25 37 33 43 36 39 35 35 35 36 40 43 43 43 47 43 48 43 57 43 43 43 40 40 40 37 34 28 23 23 34 20
22 17 18 25 29 34 29 31 27 28 26 22 19 23 24 32 32 30 30 20 23 23 32 32 35 39 30 32 32 37 28 28 24 24 30 39 37 47 39 37 43 40 40 40 39 37 37 36 32 26
31 35 47 47 39 39 36 43 33 37 31 32 32 32 39 43 43 41 26 17 17 24 25 30 36 33 28 24 24 24 24 33 32 32 37 34 34 28 25 12 11 8 8 8 17 14 18 19 17 25
24 29 32 24 20 23 23 23 23 25 21 20 15 14 16 21 28 23 23 18 18 11 9 9 9 9 12 12 11 10 10 10 11 11 15 15 20 19 16 19 19 15 12 15 15 18 20 21 10 10
10 15 15 15 20 20 34 28 30 25 26 21 14 12 12 11 15 10 11 12 25 25 30 22 22 17 19 10 11 10 10 10 12 10 10 12 13 15 14 16 19 15 15 12 9 8 8 8 8 10
14 9 8 8 8 8 8 |