BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-280H04.T7 (MSMg01no280_h04.b1) | MSMg01-280H04.TJ (MSMg01no280_h04.g1) |
ACC | AG417538 | AG417539 |
length | 755 | 750 |
length of high quality (start - end) | 627 (129 - 755) | 332 (389 - 720) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no280_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:21:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no280_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:21:17 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCTGAAATCTCACACAACAGGTGAAGGAGTTGAACAAAACCATCCAT
GATCTAAAATCTGAAGTATAAACCCTAAAGAAATCACAAAGGGAGACAAC
TGTNGGGAATAAAAAACCTAGAAAAGAAATCAGAAGCCACAGATACAAGC
ATCACAACAGAATACAAGAGATAGAAGAGATAATCTCAGGTGCAGAAGAT
TACAAGGAAAACATTGACACAACAATCAGGTAAAATGCAAAATACAAAAA
GATTCTAACTCAAAACATCCAGGAAATCTAGCACACAACAAGAGCAAACC
TAAGGATAGTAAGTATATATGAGAATGAAGATGTTGAACTTATATGGCTA
GCAAATATCTTCAACCAAATTATAGAAGAAAACTTCCCTAACCTGAAGAA
AAAAATGCCCATGAACATACAAGGAGCCTACAGAACTCCAAATAGTTTGA
ACCAGAAAAGAAATTCCTCTCATCACATAATAATCAAAACACCAAATGTA
GAAAACAAAGGAAGAATATTAAAAGCAGTAAGGGGAAAAGGTCAAGTAAC
GTATAAAGGTAGACCTATTAAAAATACACCAGACATCTAACCAGAGAATA
TGAAAGCCAGAAGATCCTGGAAGACATCGTACAGACCCTAAGAAAACACA
AATGCCAGCTCAGCCTACATAGATGGGAAAAGCAAAGTATTCCATGACAA
AAACT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTTTAAGACAACCTGGCCTTGA
ACTCAGAAATTCGCCTGCTTTTGCTTCACAAGAGATGGGATTAAAGGTAT
GCATCACTACCACCCGGAGACAATATGTATTTTTAAGTGTCAACTCTAGT
GAGAATGCATCAGATGTCATTGGAGTAGGAGACATGGTCCAAGTATGAAT
GAAAAGCAAAGAAGACATGAATCCACAGAAACTGAGTGTCAAGAAAGATT
TTCATGCAAACAAGAGAGCAGAAAGCATCAAGGAGCACACTGACTGCAAA
TTAAATATATTCTATTGTTTTTTTACCCCCCCCCCCCTGTGGTAATTCAG
TTGAGTAAGACTATCTGAANAATATACATATATAATATATAAGTATATAG
TATAGATATGTTCATGTATATTTATTATAGGTCTGCAAAGCTGATAGTAT
ATTAGACACTGCGAACATAGGATAAAATTCAGACAATTAGTAATGACAAT
TGTGTTCATTTAGTTATCCTAGTTAGATCTTTAGAAAATTTTTTATCACT
TTGAATATAATTGAATTGAAGGAGAATAGAAGAAATTTTAAGACTTAAAG
AAAGGATTAAATAATAGTATAAATCTTTAAAAATTATTGAATGATGTTTT
TTATAGCAAAATCTCAATGTCTTCAATACACACACCAGCACCATCAAAAA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 10 12 18 28 28 30 30 29 26 28 37 23 23 25 28 28 28 48 48 36 31 31 31 26 21 21 10 10 11 11 11 19 24 34 29 25 21 19 18 30 41 50 57 36 36
36 36 33 33 50 50 42 30 23 23 11 8 7 6 6 6 6 8 8 12 12 22 29 29 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 53 53 47 43 43 43 47 43 43
43 57 57 57 57 57 53 53 50 44 39 37 41 41 23 23 11 11 11 11 11 16 13 13 11 13 11 20 19 28 22 32 29 33 33 33 40 43 43 57 57 53 53 50 50 50 59 59 59 59
27 17 3 0 3 14 15 24 25 28 29 31 50 50 53 53 57 57 53 59 57 57 57 57 59 59 50 47 47 47 47 47 57 68 59 59 59 59 59 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 48 48 48 48 48 46 43 46 46 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 50
53 59 59 53 53 53 53 53 50 59 59 59 59 36 25 23 11 11 11 23 23 20 20 31 34 37 37 33 30 30 25 28 25 25 25 33 37 43 47 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68
68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 59 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 43 43 43
47 59 59 57 57 57 48 48 57 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 50 48 48 48 48 42 42 42 47 47 44 44 41 41 44 59 59 59 59 41 41 41 41 41 43 47 47 41 40 43 43
43 48 57 59 59 57 43 43 40 39 39 43 43 43 41 41 41 41 39 39 39 37 41 44 41 41 41 41 40 40 48 43 43 40 41 37 39 37 33 30 31 30 41 41 47 37 37 37 33 36
37 41 39 39 39 35 31 31 39 39 37 30 34 28 32 32 37 32 37 37 39 30 34 25 28 25 34 34 43 46 46 47 59 59 41 36 36 43 43 37 37 41 37 34 37 41 37 39 39 39
47 37 37 30 25 25 37 37 41 41 41 39 35 28 28 35 35 31 37 30 30 30 37 37 36 31 31 31 36 31 36 35 37 35 25 30 24 22 22 22 21 21 15 15 14 26 26 28 25 25
27 25 25 16 16 | Open.Hide.10 10 9 13 12 8 8 8 8 13 17 30 32 37 35 36 37 44 37 37 41 41 37 37 48 48 42 47 47 34 27 12 8 6 8 8 8 8 12 9 10 10 21 19 32 29 39 39 44 44
47 47 47 53 41 50 50 50 42 25 25 11 9 11 11 12 15 20 15 12 9 9 15 15 23 25 33 33 33 50 50 53 53 59 53 53 53 57 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 57 53
53 42 36 36 36 36 36 53 53 41 41 37 59 59 34 29 18 11 11 13 17 11 11 7 6 6 6 8 8 15 11 8 6 6 6 10 10 15 26 37 37 37 44 59 53 53 53 38 42 42
42 43 53 53 53 53 57 59 57 57 57 57 57 68 68 47 47 47 47 47 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 43 47 47 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 32 28 25 15 15 13 13 13 13 15 18 31 34 41 39 50 50 53 47 50 53 50 50 50 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 34 34 28 15 6 6 6 6 7 7 24 27 27 25 29 16 16 14 15 14 16 16 16 12 10 10 10 12 10 15 25 34 43 59 59 59 48 48 48 57
57 59 59 59 59 59 59 53 53 50 50 50 50 59 59 59 27 27 3 0 3 23 25 47 47 41 41 19 19 12 12 12 11 11 11 11 11 12 12 20 20 30 30 47 59 47 48 39 39 35
35 35 39 39 43 43 48 59 57 59 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 59
59 43 43 35 35 35 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 54 59 59 57 57 44 43 43 44 50 50 44 41 41 20 20 20 32 40 57 57 57 48 48 48 57
59 54 54 54 57 57 57 57 54 57 57 44 44 54 57 57 57 57 57 57 43 46 46 43 39 40 46 46 48 48 42 43 39 41 48 48 48 54 54 54 57 59 59 59 59 47 43 43 43 43
43 57 57 43 43 43 43 43 43 48 48 59 31 28 28 28 25 23 39 35 31 31 41 30 30 30 31 30 28 35 35 30 26 32 28 41 31 32 32 22 20 31 23 34 34 27 21 26 39 32
31 31 31 24 23 19 14 14 13 13 17 19 31 31 37 35 30 28 34 34 37 30 30 20 22 24 33 28 30 30 39 25 23 10 10 10 23 25 29 29 26 32 39 37 39 36 39 39 48 48
46 43 34 32 23 23 23 24 27 26 28 32 32 47 39 37 26 26 14 13 13 19 18 15 14 12 15 11 11 11 21 22 39 43 39 32 30 18 18 19 19 21 24 13 14 14 13 21 16 16
|