BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313B24.T7 (MSMg01no313_b24.b1) | MSMg01-313B24.TJ (MSMg01no313_b24.g1) |
ACC | AG435143 | AG435144 |
length | 1,178 | 1,204 |
length of high quality (start - end) | 821 (54 - 874) | 312 (474 - 785) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_b24.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_b24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_b24.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_b24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NAATTTNNNNNNNGGATCACTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATGAGTCAGTTCCCGAATT
GCTCACCTTTTTAGGAGTCTCCTTCTCCTTCTTCCCCATCACGTTTGATT
TGTATCAAATGAAGATGATGCTAAGAATCATGACCTGGGCAGGTGGCCTA
GCTTTCATGGTTATCACTATAAGTCAGGAGATCAATATACTATGTTGTTC
TCTGTTTTTGACGCTCAGCTCTGTTTTGATTCTGATCTGTATGCATCCAT
CTATCAGGCTCTTCCACTGTGCTAACAATTCAGCTATCAATTTTTAAAAG
GCAGATTCTGTTTAAGTAGATATGAAACATGCCCAAAACCTTTCACATTT
TTATTAAGTTCCTGGATACTGCTGTGTTATCCCTCAGTACTTGAAATTCT
GCAGACTGTTTTCTCCTCCATCTCTAATCCTCTCCAAGAAGATAGAGAAG
ATAATGAATTAACTTGATCTATCTCCTTAAGCTTGACTGTCATCAGCAAA
TTGCCCTGCAGAACATTATAAATGGATACTACAAATTAGAAACTGTGTCT
TTAAATCACTTCCTTCCTCTGTCTCTTCTCTTATTTCAAAAACTTGCAAA
TCCACAGTCAATCTGTTGAGCTCTGTCAGACAAAAATGTTAGCAGGGTGC
TTCTTATCAAGGACTTTGTGGAAGAACATTTTTGTACTCAGGACTGTTAT
TTTGTTTGCTAGGATTATCTGAAAACTTCAACATACACATAGCAAGACTG
AACTGACTCAACAGGTTAAATTGATATATTTTTGTGTATATATGTATATG
TATACCTATATGTATATATATGCATATGCATATATGGNNACCCCCCCATT
CTCCCCCTTTCCCCTCTCCCTCTTTCTTTCCCTCCCCTCCTCCTTTTCCT
CTCCTTCTCACCCCTCTTTTATTCCCTCACCTCCTCTCCTTTTCCTATCT
CTTCCCTCTCTTTCTCTCCCCCTTCTTTCCCTCCTTTCCTCTTCCCTTCT
TTTTTTTTTACCCTCTCCTCTTTTTCCTCCTCTNCTCTTTTTCTCTCCCC
TCTCTCCTCCCCCCCCCTTTTTTCCTTTCTTCTCATCTTCTCCCAACTCT
CTTCTCCCTTCTCCCCCTTCTCTTCTTT
| NNTTCTATAACGGAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGAGGTTCTGTGTTTCAAGG
GAAAGGGAGAAGGGCAGCTAACCCCATGACCAGAGTTACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACACTCACAAACACAAACACACA
CACATGCACGCGCGCACGTGGAAGTAAAAATACATATGTAGCCAGGCAGT
GGTGGCGCACACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGTAGGCAGAT
TTCTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAAGACAGCCA
GGGCTATACTGAGAAACCATGTCTCAAAAACAACAAAAGACATACATGTA
CCTTCACATGAACATGCACATGATGGAAAAGGGAATTAACAATTTTATTT
ATTTTTATCTCACCCCCCCAGGNCCTGTCTAGTTGTTAAAAAAAAAAAGA
TGCTTAAGGAGAGTTAAAATCATCTGAGTATCTGCCTCATTTTGTATGCA
CTTAAATGTGTAACCACATAGAAGAGGGGACAGAAAGATCATAAGAACCA
GACCACTACATTTGCTGCAAGAAAACACCTTTTACATATACAACAGGAAG
TTCACCACTGAATCTCAACAATGTAGTCACCTAAACAAGATCTGCACAAT
GATACCACCATTTGATGTCCCATCCTGGGGATGGGGAAATCTCGAAAGGT
GCCACCTCTAGACCAAGTGCAATAGACAATTGGTAACTGCCAAGAGAAAG
AGAACCAGTATTTTCCACAGACAAGCCTGATAACTGACAGGTTATACAAT
TTCAATTGGTCATCCATAAACACATATACCTACAAGAAATATTAATATAC
TTATTAAACTGTATTTATATCACTGACTTTGTGGCTCTGTAAATTTAACC
CCTCGAAATTTTTTAAAAGGCAATTAAAAACCAATACCCCTTCCCCAACC
GAACTCTTTACCAAGTCTTCCCCATCCTATATAACTTCTTTCCCCTCTAA
CCTTCTCATTCTCACACCACAACCTTTTACCTTCCTTTTCCCTCATCTCC
CACATTTTCTCCTCTCCTTCTACTCCCTACTACCTACCACTCATCACCCT
CATATCTATTCTCCTCTACATCCTAACCCTATACTCCCACCTTCCTTCTT
CCTC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 13 17 20 18 20 17 18 18 23 23 35 36 33 33 33 36 33
33 33 33 28 28 24 24 24 30 30 28 37 30 20 21 28 33 29 30 33 36 36 38 38 39 36 36 37 43 43 43 44 57 53 50 44 44 37 37 34 42 42 37 43 42 48 48 48 46 48
48 39 39 39 34 37 37 42 43 42 44 53 53 50 43 43 43 42 42 34 32 36 36 36 31 33 33 33 33 29 19 13 11 11 11 10 18 18 24 29 32 39 44 33 36 36 57 57 57 57
53 53 53 47 43 39 39 39 44 44 57 57 59 68 68 68 68 68 68 47 47 47 47 50 51 59 59 44 54 54 54 57 57 54 54 44 32 21 14 15 21 27 32 40 40 37 37 28 40 35
44 39 43 57 57 48 44 44 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 50 50 54 57 59 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57
57 57 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68
68 68 59 44 32 23 20 20 23 41 44 59 59 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 22 23 10 15 12 14 18 16 23 18 30 30 36 37 28 28 28 37 37 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 50 50 50 37 37 22 24 13 13 13 13 13
13 15 26 32 34 39 39 39 46 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68
59 59 59 48 48 57 59 47 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 46 50 54 59 59 68 68 68 59 57 57 57 59 57 59 59 59 54 59
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 47 47 47 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59
47 47 43 43 43 46 48 46 39 39 39 46 43 57 48 59 59 59 59 59 59 43 47 47 43 43 43 43 43 43 48 57 59 57 53 50 50 50 42 47 47 47 44 44 44 41 41 43 59 47
47 59 47 47 48 37 37 36 36 36 39 44 48 48 48 48 48 46 50 47 41 39 39 39 36 36 39 44 44 59 59 59 59 59 59 48 39 37 28 28 28 37 43 43 43 43 43 44 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 40 40 39 41 47 43 18 9 9 9 9 18 23 39 39 30 25 25 37 43 47 59 41 41 41 47 43 48 48 48 42 42 47 47 44 44 39
39 36 35 39 39 41 37 34 28 28 28 36 34 44 39 31 31 32 32 37 32 37 43 41 41 41 47 47 33 28 31 29 35 23 36 39 47 39 47 43 57 43 48 48 48 48 48 41 59 41
41 41 28 25 18 18 22 28 37 41 41 40 34 30 30 32 39 47 47 31 30 14 14 14 26 16 13 8 8 8 18 10 20 18 15 12 3 0 0 3 15 8 11 14 16 15 17 12 12 10
12 9 8 8 8 9 9 10 10 10 7 9 7 6 6 6 6 8 8 9 9 9 12 9 9 9 9 9 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 12 14 16 17 14 11 10 6 6
8 8 8 10 10 12 11 10 9 9 9 16 13 10 9 9 9 10 13 9 9 9 9 9 9 8 8 12 12 8 8 8 8 8 10 10 10 8 7 8 8 9 9 16 15 11 8 8 8 8
10 10 8 9 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 9 10 10 13 10 10 10 10 13 8 10 19 17 11 8 10 8 8 11 11 13 13 14 9 9 9 9 9 13 16 13 11 10
10 9 9 9 10 10 9 8 8 6 6 10 6 8 8 8 10 10 12 9 8 8 8 8 13 13 10 8 8 6 6 8 3 0 3 15 10 11 23 11 11 22 19 26 10 15 12 15 10 10
6 7 10 15 15 6 7 8 8 9 9 9 10 10 12 15 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 8 12 12 10 9 10 15 11 11 10 10 11 10
10 8 8 8 12 12 10 10 10 12 11 13 11 10 10 10 15 15 17 13 13 10 10 10 13 16 13 13 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 9 6 6 8 6 8 15 8 8 8 11 7 8 10 8 8 7 9 15 15 19 8 9 10 21 19 24 16 19 25 36 36 36 36 37 37
37 37 37 37 43 43 57 48 48 48 44 48 48 32 32 23 23 43 43 57 48 42 42 26 22 26 26 41 42 47 51 53 68 68 51 42 42 41 40 36 36 36 40 37 37 47 42 32 29 20
20 20 35 32 43 40 43 43 43 57 48 53 59 59 47 41 28 23 23 22 15 12 8 8 8 8 8 9 22 23 28 28 30 37 29 36 36 36 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 59 36 25 21 12 12 13 13 15 15 13 18 13 12 12 25 28 48 48 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 57 59 59 57 48 48 48 41 41 43 46 46 54 57 57 57 68 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 44 40 36 36 23 44 44 57 68 57
57 57 57 59 59 54 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 57 50 57 44 44 44 57 57 59 59 68 68 59 59 59 43 43 43 57 52 52 52 52 52 52 59
59 57 57 50 59 59 59 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 52 57 57 59 44 44 32 42 44 57 57 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
52 57 52 52 57 57 59 59 57 50 50 50 57 57 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 41 37 18 24 19 20
20 20 19 34 28 48 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 27 27 11
8 8 8 8 11 7 9 9 10 8 8 8 8 13 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 27 27 59 47 36 32 22 18 14 15 18 12 12 13 14 27 36 41 37 36 39 28 24 12 12 11
11 11 18 18 22 27 33 41 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 48 48 48 59 57 43 48 48 48 48 34 34 37 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 59 54 54
54 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 48 57 57 48 48 48 34 34 44 44 57 57 57 59 59 57 57 57 48 57 57 57 57 57 68 57 57 50 50 54 38 41 44 57 44 44 44 50 37
50 38 38 38 52 52 50 50 52 52 57 59 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 68 57 57 57
40 44 36 42 47 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 46 43 43 57 59 59 59 59 59 41 41 20 28 28 39 47 46 48 48 57 57 57 54 46 46 46 46 48 48 48 48 54 57 48 53
57 57 57 43 47 43 43 43 43 43 57 59 59 59 59 59 48 48 37 41 37 41 41 37 18 9 9 9 9 17 10 28 15 19 24 37 37 26 25 39 26 26 14 21 19 30 32 34 32 39
25 21 14 25 20 29 34 28 28 18 20 18 30 28 31 25 34 34 41 41 37 21 25 11 11 11 23 17 32 25 30 29 20 17 8 8 8 10 16 27 13 15 11 23 11 11 10 19 10 10
10 10 10 23 16 25 22 19 9 10 14 13 15 16 16 16 16 16 12 12 16 12 12 9 11 11 16 21 30 24 13 11 13 15 14 18 21 18 10 10 13 19 10 13 15 15 12 11 11 11
11 11 10 9 9 17 17 10 9 9 9 11 11 21 21 24 30 37 23 27 11 11 11 16 16 34 23 18 12 12 17 24 14 13 9 9 9 12 12 12 14 12 21 12 14 18 16 15 12 13
12 22 22 16 16 11 11 15 12 13 11 19 18 12 9 10 9 9 9 10 6 6 8 10 8 6 9 10 13 10 10 10 11 8 8 9 9 9 9 9 10 13 12 13 10 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 11 12 11 18 16 18 18 18 14 12 10 11 11 11 18 12 13 12 12 12 12 9 9 9 10 12 9 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10
10 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 9 8 8 10 8 8 6 8 11 8 9 9 8 8 10 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 9 9 9 7 7 8
10 10 10 8 8 10 8 8 6 6 8 9 9 10 10 13 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 9 10 10 15 12 10 9 9 11 12 16 19 12 10 10 8 8 8 9 9 9 9
11 9 9 6 6 6 8 8 8 10 22 13 10 9 9 10 8 10 10 10 9 10 9 11 10 10 10 13 10 11 9 9 9 9 8 10 10 10 10 10 13 8 8 8 7 6 8 8 9 8
8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 13 15 17 15 17 10 8 8 6 6 10 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 10
8 8 8 8 |