BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313L16.T7 (MSMg01no313_l16.b1) | MSMg01-313L16.TJ (MSMg01no313_l16.g1) |
ACC | AG435576 | AG435577 |
length | 1,206 | 1,246 |
length of high quality (start - end) | 377 (88 - 464) | 387 (71 - 457) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l16.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_l16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_l16.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_l16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:46 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (49,697,998 - 49,698,367) | (49,783,721 - 49,784,097) |
---|
sequence | NAAATAANNNNNNNGGTCACTGGGCGCTATAGACTCCTATANGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCCTCAGATGTTCTAGAAGCATTCAGAAGAACACAGAAGA
AATATTCTAGAGAGTAGGGTTTCATTCTTGAATACCCTCTGATTTAAAAC
TGCTCACCTGAAATTGATACTTTCAGATCCTGATCTGTAATTTACTCAAG
ATTTCATAAGAGGCTGAGTTCTCTGTGTTGTTGCAGAAATGGAGTTGGGA
CGGTCATACCGTGGCTACCTGCGCTCAGAGCATTTTCTCCCTTGAGCTTA
TTTTGTTAACGATTCATATCTTGTGTTCAGTTACTTTGGGAGCTATGGAG
TGTGTTCTAGGAGGAAACTTGATAGCTTTTATGAAAAGTACCATCTAATA
TGTGATTTTGTCTGCACCCGTTGCATCCTAATGGTTGGTCTGATCATTGG
AACCTTTTTTTTTTTACCCCCCCCCGAAANCCCCCCCCTCCCCCAAAAAA
AAAGGGGAGANGGANANNNNCAGGNACAGAGNGGAAAGGCNAGNGNGGGN
GGGGGCNGAGACACCCGNCNANGGCNNCAGGNNANNGGGCCCCGGGAGCC
CGAAGNCCCACAGNGCACCAGCCAGCACCANGCNGNGCCCNNCCNGCNGA
NGCACANCCNNAAANGACNNCCCGGAAACNNAAGGAGGAAANACAGAAAG
GAGCGGNANCACCNGCCCCACACNGNAAGGGGAGNGNGCCAAGAAAGAGG
CCCACCCCGCNCCCACCGCCCAGGAGACAGCCGCGAGCGGACCCAGGCGC
CCCCCAAGAGCGGCNCCCACCCCCCCCCAAANCCGCCAAACCAAAGAGCC
CGANGNGGAAGGAGACCGGGCAGGCGGGCCAAGGCCCCGAGCCCAAACCC
CCCCCAACCAGCAAGGGCACCAAGACCCGCCACAAGCCCCCAAAAAACCG
CCCCCCACACCCGGCCCCCCCCCGGACCAAAACGCACGCACCAGGAAAAA
CACCGGNCACACCAAACACCGCAACACACCCCAGACCACGAAAACCCAAC
ACACGCCCACCCAACAACCCCAACCACCCCCCACCAACCAACCCCCCAAC
ACACCACGCCCCACCCCAACAACCGCCCACACCACCCCACCCACCCCCCC
CCCAACCCGACCCCACACAACACCCCAAACCACCGCCCCACCCAGCCCCC
CCACCC
| NNNCCGCTATGCGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGAGGGTGTTTTTTTTTTCTCCTCTTTTTG
GCTCCCCTACCATCAAGTGAGCCCTTTCATTTTATCATGTGTCTTAGCCA
TAAAAGGCCCACAGCAACAAAGTCAACCAATCAAGTACCGAAACCTCTGG
GGCTTGCAGGCAAAACTTGAACCTTTTCGAGTTATAACTTGGTTGTGTCA
GGTATTTGGTTACAGTGACAGAAAGCTGAAGAGTATATTGATACGGCCCA
CCTGAAATAATATGGGCGGAGCTATAAAGGCTGAAACTTCTAAGCTGCGA
AGGCTCTTTCCTACCTTCTCCCTGCTGCTGTGAGCAGTGAGTGATTGTTG
GGCTGCCCCACGCAGGGCTGTCCTATAGTTGCAGAAGTTCCCTGTTGTTT
TTTTTTCTCCCCCCCCAAGGAGACAGGCCCCCCTTAAAAAAAAGAGGGGG
GGGNATCNNATGGCCNCNACCCTTGGGCCAGCAACCCTGTTTACCTCCAG
AATGAAGAATTTGGCTGTTTTCACTTTGGCCCAAGTCTTCTTCAGCCTGG
AGACAGGGCTCATGTTCATGCCAGCTGGAAGAAGGTAAATAGAGCTGGGC
GGGCTCCTTCAGCCTGGGCAGCCCCATAAGAAGAGTGGCCTTGGTGTGCC
CTGAAGGTGGCTGAAGGGTACCTGAAAGGGCAGGGTACTGGTGTACATTG
TACTGAGGTGGACTTGTTTGCATGTAACCCTGACTGACCCACTTACACGG
CCCCCCCAAAAATAGCATCCAAACTTATTTTGGTCCCACCCTCGTCTGTG
GGTGAACCCCTGCAAAATTCTTCCAAGCACCCCCGGAATGTACACTTTCT
TTAAAAGGTAAACCTCTCTACTAGCCCTTGTGACCTGCCAACTAACTCCA
CTCTCCCTCCAAATAAAACCCTAAACTTGCTCCCCTCCTGCAATACCTTT
TCATTTTCTCCTCTCCGACTCCTCTCACCCGCTACTTTCTCATCTTACCC
AATCCACTCACACAAATCTCTTTAATATGTCTCTTCCCCCCCATTTATTC
ACCCCGTTATCTACTTCACACATCCCTCACTACACTTCCCTCGACCTCCT
CTTTATAACATCTCCTATCCTCATACTTCAATTCACTCTTATACATGACC
CAACTACTTATCTCTTTCCGACTTCCACATCTTTCCAACACTAATC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 8 7 7 7 7 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 10 15 9 8 8 15 15 11 3 0 3 15 15 20 19 21 28 33
37 37 36 31 26 24 24 29 30 37 39 39 37 37 33 28 22 28 29 29 36 31 33 37 25 24 12 12 8 8 8 8 10 13 10 18 22 22 21 24 32 34 44 36 47 42 42 42 43 43
43 43 48 48 44 36 31 31 22 31 34 44 33 33 25 25 10 10 15 12 18 24 37 36 30 33 33 33 33 33 28 21 10 10 8 8 9 12 19 20 37 47 33 33 33 33 36 36 57 57
53 50 42 43 42 42 42 47 57 57 57 57 59 59 59 53 53 43 43 43 43 47 47 48 48 48 48 57 53 53 50 50 50 50 42 33 21 21 9 9 9 12 12 12 22 23 32 32 28 15
12 18 10 8 8 8 11 17 21 28 41 59 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 48 48 43 59 48 57 54 59 59 59 68 59 59 54 54 54
54 54 54 54 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 43 44 42 42 47 44 41 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 68 68 68
68 57 59 57 57 57 59 59 57 50 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 54 54 54 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59
30 27 12 11 11 12 21 24 12 11 11 23 22 32 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 53 53 50 50 50 50
47 47 59 59 33 33 22 24 26 32 32 32 13 12 9 9 9 10 13 22 24 12 11 9 8 8 8 17 3 0 3 8 8 8 10 12 12 9 9 9 14 14 13 12 12 13 15 16 22 20
20 15 11 11 8 8 6 6 6 3 0 3 23 3 0 3 0 0 0 0 3 29 29 3 0 3 27 25 25 25 3 0 3 27 19 19 9 7 7 3 0 3 3 0 3 0 3 23 3 0
3 27 27 27 27 3 0 3 27 27 43 37 19 11 8 8 3 0 3 0 3 0 3 27 3 0 0 3 25 27 3 0 0 3 0 0 3 23 27 18 9 9 9 9 19 23 39 17 9 9
9 9 14 15 3 0 3 23 23 37 23 27 3 0 3 14 7 9 9 9 9 9 9 9 16 16 9 7 7 3 0 3 3 0 3 0 3 7 7 3 0 0 3 3 0 3 3 0 3 3
0 3 27 25 17 3 0 3 3 0 0 3 11 3 0 3 25 3 0 0 3 25 23 39 35 36 19 23 3 0 0 3 16 21 28 37 37 41 19 19 3 0 3 23 23 37 37 37 37 37
37 23 19 7 7 3 0 3 0 3 7 7 3 0 3 8 8 11 11 11 10 12 3 0 3 0 3 8 7 9 9 7 8 3 0 3 0 3 8 6 6 8 7 9 9 8 13 9 8 8
9 9 7 8 8 9 9 9 9 3 0 3 16 9 13 9 9 7 7 7 9 9 9 9 9 9 9 10 10 12 7 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 9 9 15 12 10 9 9 9 12
16 22 21 10 8 9 10 16 10 12 12 10 13 3 0 3 9 9 9 9 10 10 8 8 13 10 10 6 6 6 3 0 3 12 9 8 8 10 10 10 9 18 9 9 9 9 15 11 11 9
11 9 3 0 3 0 3 8 8 8 8 8 9 9 9 7 8 8 8 10 8 8 8 6 8 8 6 6 11 9 9 10 10 13 11 8 6 6 6 8 8 10 8 9 9 9 9 10 10 9
8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 10 10 10 10 10 13 6 8 6 6 8 7 8 8 10 15 10 8 8 8 8 9 10 11 9 9 8 8 8 8 11 16 19 19 10 10 10 17 7 7
9 10 12 14 10 8 8 7 7 6 8 8 8 8 8 15 16 21 27 22 14 15 16 18 19 20 14 17 20 17 17 11 8 6 8 8 8 8 8 14 12 8 8 8 8 8 9 10 15 13
13 14 10 10 10 3 0 3 9 10 8 10 10 19 15 16 12 10 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 12 15 12 11 11 11 11 10 8 8 9 9 10 10 19 17 14 13 15 12 10
10 9 10 8 8 10 8 9 9 8 10 7 6 8 8 8 8 10 8 9 10 10 15 12 12 10 10 12 11 8 8 9 9 11 11 10 10 10 8 8 8 8 10 10 13 14 10 10 9 11
11 11 11 10 14 15 10 10 9 14 9 9 9 10 13 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 11 12 11 12 11 10 8 10 6 6 8 10 9 12 11 9
9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 11 6 6 6 6 8 8 11 11 16 10 8 8 7 7 9 11 11 11 8 8 9 10 8 11 9 9 10 14 10 8 8 8 13 14 10
8 8 6 6 10 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 9 10 14 7 6 7 7 7 7 15 21 21 10 10 15 22 19 31 24 28 20 29 29 34 36 37 37 42 53
53 43 43 37 42 42 48 48 59 59 54 43 43 46 46 68 68 43 57 48 43 43 37 36 23 22 36 36 48 48 68 68 59 59 59 50 43 43 32 32 32 32 32 36 39 39 39 37 34 28
33 40 40 47 47 53 47 47 47 50 50 50 53 50 41 33 33 33 30 17 22 11 11 11 11 15 22 31 37 39 37 37 37 39 39 39 37 37 33 34 34 34 34 30 32 19 32 31 48 48
50 50 54 54 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 43 44 39 37 43 43 43 43 42 42 47 47 44 57 44 48 48 57 59 48 48 48 57 44 57 46
48 48 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 50 50 43 43 43 52 57 52 54 57 57 57 59 54 54 54 57 57 68 68 57 57 57 57 52 52 43 59 52 57 57 57 57 57 57 57
57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59 35 35 35 50 50 54 50 50 54 54 54 54 52 52 52 57 57 57 59 57 57
57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43 43 47 47 47 48 57 57 57 57 57 59 59 59 48 57 57 57 54 54 54 57 54 47 59 59 43 43 46 46 46 54 54
54 54 57 57 48 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 48 59 59 59 59 39 39 30 30 32 39 37 44 59 39 39 43 27 30 12 16 12 12 11 11 20 23
26 39 39 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 57 47 59 43 47 47 47 59 59 47 35 35 39 41 30 30 30 41 41 59 59 59 59 41 44 25 18 9 9 9 18 18
32 32 32 19 19 11 11 11 8 9 9 11 11 9 8 8 8 11 20 25 34 34 34 22 19 11 16 12 14 11 8 10 6 7 8 7 9 9 15 18 16 9 8 8 8 8 8 10 14 12
12 23 3 0 3 27 3 0 0 3 29 29 29 29 3 0 3 0 3 27 27 59 59 59 47 59 59 43 47 43 43 47 47 47 40 43 39 43 43 47 43 43 43 48 48 43 37 37 28 32
32 42 42 42 43 39 43 43 44 44 57 57 54 59 54 54 54 54 54 57 48 48 48 48 48 43 43 48 48 48 48 48 47 47 47 42 40 39 43 43 43 34 34 43 40 40 34 34 18 18
13 18 18 34 30 39 31 31 37 39 40 39 40 40 41 43 43 43 43 47 47 46 47 46 46 57 46 29 33 33 33 28 42 42 39 39 43 43 43 42 35 28 32 28 28 21 34 27 36 28
32 22 23 19 25 25 37 34 30 28 31 31 22 28 32 32 34 30 30 17 17 18 20 31 28 37 25 26 17 12 12 13 13 16 24 26 37 35 31 29 32 25 24 12 12 13 18 18 21 18
24 13 13 8 8 8 10 12 12 10 10 10 17 25 23 24 14 12 12 15 11 11 16 23 26 30 19 17 11 10 10 10 13 11 11 10 9 13 15 18 16 13 10 10 10 16 19 17 32 20
20 20 30 30 34 28 28 24 18 14 14 13 15 11 11 11 9 9 9 11 18 15 14 14 9 9 9 9 9 9 15 12 13 13 10 10 9 10 10 9 9 12 12 11 16 13 11 11 11 15
13 11 10 10 10 9 11 11 14 14 15 15 12 12 12 8 10 10 10 10 9 10 8 10 8 9 11 15 9 9 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11
10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 13 10 10 10 9 10 10 8 8 6 8 9 7 8 8 10 8 8 6 6 10 15 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 10 10 11 12 12 17
10 12 14 18 14 13 11 11 11 11 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 9 12 11 8 8 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 9 9 8 10 8 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 19 11 8 8 8 15 13 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 10 9 9 12 10 8 8
9 9 10 14 12 17 12 12 11 12 12 12 12 12 12 9 9 9 12 15 13 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 12 19 13 13 12 8 8 8 8 8 12 8 7 8 8 8
10 10 10 10 10 10 10 9 10 11 13 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 9 11 14 10 13 8 8 8 8 9 9 9 10 11 19 15 13 13 10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 12 16 11 9 9 12 15 15 10 10 9 7 7 8 8 8 16 10 10 8 6 6 8 8 11 8 8 8
9 9 9 9 11 11 13 13 14 14 14 13 15 8 8 8 8 8 13 12 15 11 8 8 12 8 11 10 8 8 8 9 16 13 10 9 10 9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8
14 14 13 16 11 12 15 13 10 10 9 8 8 7 6 8 8 8 8 10 11 12 11 10 8 8 8 8 8 12 14 12 12 10 11 11 11 12 16 16 12 10 8 8 8 7 |