BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323K18.T7 (MSMg01no323_k18.b1) | MSMg01-323K18.TJ (MSMg01no323_k18.g1) |
ACC | AG442027 | AG442028 |
length | 1,116 | 1,229 |
length of high quality (start - end) | 708 (133 - 840) | 650 (137 - 786) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_k18.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_k18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_k18.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_k18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:29 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCAGATCNNNNNNNGGTCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCAATGAGTGACCAGCACCTG
AAAAAATGTTCAGCATCCTTCTTCATAAGAGAAATGCAAATCAAAACAAC
CCTGAGATTCCATCTCACACCAGTCAGAATGGCTTCGATCAAAAATTCAG
GTGACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTTCAT
TGTTGGTGGGAGTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCG
GTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCAGAGGACTCAACAATACCAC
TTCTGAGCATATATCCAGAAGATGTCCCAAATGGTAAGAAGGACACATGC
TCCATTATGTTCATAGCAGTCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGA
ACCCAGATGCTCCTCAACAGAGGAATGGATACAAAAAATGCGGTACATTT
ACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTC
CTAGGCAAATGGTTGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAATGAGGTAACACA
ATCACAAAAGAACTCAAATGATATGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGT
CCAAAAACTTAGTATATCTGAGATATAAGAGATAATTTGTAAAACACATG
AAACTGAAGAAGAACGAAGACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAG
AATTGGAAACAATCACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGC
TGAGACAAACGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGTTCCATC
CCATAATTAGCCTCCAAACGATGTCACCATTGCATACACTAGCCAGTGTT
TGCTGAAAGGACCCTGATATAGCTGTCTTCTTTGAGACTATGCCGGGGCC
TAGCAAACACTTAAGTGGAAGTTCACAGTCAGCTATTGGAGGGAACCCAA
GGCCCCCCATGGTAGAAGGTAGAAAAAGATACCCGGGAGCTTAAGAAAAT
CTTGCACCCCGGTAGGGGCACAACAAAATTTAAATAACCCGGACCCCCCA
AGCTTTTTTATTTTTT
| NNCCATTTANNNNNNNGTCGATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAGCCCGCCCTTTTAGN
TCTATTACATTATGAACATTCTTATAATCCTACTTTATTCTTCCAACATA
GGAAATGGTAGGAAAACAATATCATATAGTCCATTTACCAATAAAAAAAG
AAGGCTAGAGTGTCTAACCTTCTCAGCCAGTATCATATGTAAGGAAAGGG
TGGAGGCGGAATTTAAGTCCAATTTTTCCTGACTCCAAATGTCATCTCCC
TAATTACCATTCCATCCTTCCTTTCCATCCTTTAATATACTAACTGAGAA
GACGTGAGGTCACCAAAGCCCTGGATTTCTGTTCCTGTGTGGGTGGGTGA
GCCAAACCACTGTTTTTGTGGGAAGAAACCAGAGAAGCCTTTGCCTTCTG
CAATCTATTTATCTTTTCCCACACAGCGGAGTTCTGCAGAATCCTAATAC
CAAGGCTTTGCTAATAAACGCCAGCAGATGTACAGATTTAGCTTACGCTT
TGCTAGACTAGAGCCTCTGAGAAACGTTCTGGTCTCAAACACCTAGAAGG
ACATAGGTGCATGGTTCATCTTCAAGCTGCGATGGATGGTACACGTGGAG
CCACCTGAGCCTCTTCTTTGCATTGTGGGTACTCAATGTGGATTTCATTC
AGCACTTATAGGTCATTCACTCAACTCCAGGCACTGTTTAAAGTGCCTCA
GATATACTGGGTTTTCTTGCCTAATCCTCTCAAGTGACCCCACAGGGTAG
ATGTCCAAGCACAGCAAGATGAAGTCACAGTGTCACACAGGTGGCCACTA
GAACTTCTAAGATTTGAACCCCAACTTGCTTCGTCACGGAACGTAAACGT
GTTATCTGCTAAGGATCCCAGCCACCACTGGCAAGTCATACTTTGTTGAG
TGACGCTTAACTCTTCCTCGGCTTGAAAAACATAAAACATATATGACCTC
TGCCTAAAGGGGAACCTTTCAGCCCCTAAATTTGGAAAGAATCTGGTTTT
GTAGTAGCTGGACGGCCCTTATTGAAGGGAAAAGATCCCTTTTCCTGACC
TGGAACCCCTTAAGTTGGAAATTTGGCCGGCCCCCCCCGGCGAAAGGTAA
TTTCTTTTCTTATTTTGGGGAAAAAAAAATATTTTTTGTGAGGGGGGGGC
CTCTCTCCTCGGGGATATGGGGGAGGGGG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 8 7 7 7 7 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 10 15 15 9 8 8 13 15 24 29 29 36 30 24 33 33 36
36 42 47 53 53 53 53 53 47 42 42 42 53 53 53 53 36 36 35 31 31 31 30 28 33 33 32 23 16 10 9 9 9 9 9 9 10 8 10 8 8 8 8 13 21 28 33 33 33 33
33 36 53 59 59 57 57 53 53 53 44 50 39 33 33 22 21 12 9 9 9 10 10 9 10 8 8 8 10 12 14 14 22 22 24 28 41 41 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 53
53 53 68 68 68 68 53 54 54 50 50 50 51 51 51 51 51 68 68 68 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 53 50 50 50 50 47 43
36 25 19 12 12 11 15 15 18 15 30 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54
54 54 54 48 57 57 44 44 39 48 48 48 46 47 47 42 42 35 37 37 39 44 46 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 59
59 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
59 54 52 52 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43
44 46 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 68 68 46 57 57 54 48 48 48 54 54 54 54 57 57 68 59 57 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 47
47 47 47 44 44 37 32 32 37 32 32 37 32 32 39 44 37 36 39 36 39 39 46 47 59 47 47 39 38 31 31 32 37 41 41 41 44 59 44 41 37 41 37 41 41 41 24 27 23 30
25 27 27 31 32 37 41 41 44 44 36 36 35 32 32 25 28 32 32 33 29 25 20 22 22 30 34 38 32 36 43 41 34 34 25 25 25 34 25 37 37 39 37 32 43 27 27 30 30 30
25 27 12 12 12 25 19 36 36 30 22 22 24 24 22 22 30 28 31 41 41 23 15 10 10 10 15 19 30 19 19 18 17 19 37 37 27 20 18 22 18 18 25 24 15 17 18 16 12 11
9 10 10 10 17 28 17 25 15 14 14 17 16 14 14 14 15 17 34 37 30 32 21 25 12 12 11 18 18 27 27 22 21 19 12 18 13 18 16 24 9 8 7 8 8 8 8 8 16 11
12 17 18 18 18 15 16 18 9 9 8 8 8 8 12 14 10 10 11 18 11 11 10 10 12 10 8 8 8 8 12 16 13 18 9 9 9 16 16 23 23 23 18 14 13 14 11 11 11 11
13 9 9 7 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 7 7 7 8 8 9 10 8 9 10 11 10 13 10 10 10 10 10 9 9 8 8 6 6 9 10 9 8 9 8 8 8 9 13 9 9
9 11 11 13 24 26 19 16 9 9 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 7 9 9 12 9 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 13 11 9
9 8 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 21 13 12 8 9 9 8 8 8 9 8 8 9 8 8 8 10 8 7 6 6 8 7 8 8 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8
6 6 6 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 7 7 9 9 10 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 6 6 6 7 8 12 15 9 7 9 8 11 9 18 19 19 8 9 10 22 19 22
20 22 28 35 36 36 35 37 37 37 35 35 36 38 38 36 36 41 41 50 50 47 41 25 23 12 9 9 9 14 14 10 11 8 7 8 8 8 8 8 8 12 22 25 30 29 21 21 3 0
3 23 23 37 37 37 31 31 31 31 31 31 31 31 37 25 27 11 9 9 9 13 10 10 9 13 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 11 24 26 39 44 44 53 53 57 53 53 53 53 53
53 53 59 57 57 57 50 53 53 53 50 68 68 68 68 68 50 47 47 47 47 50 50 68 68 68 51 50 50 50 50 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 44 44 47 47 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 57 54 54 54 68 54 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 50 50 47 37 39 20 20 11 15 12 15 15 13 17 16 16 30 30 50 50 50 50 53 53 57 57 53 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 44 39 41 41 41 41 44 30 30 30 42 28 28 35 37 44 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 59 59 59 68 68 68
68 59 59 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 59 59 59 57 59 57 59 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54
54 57 57 68 68 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 48 48 48 59 48 53 50 50 50 47 47 47 44 39 39 37 37 39 39 44 47 59 59 59 59 48
48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 53 48 48 41 41 40 41 47 37 32 29 29 32 37 41 39 41 41 42 43 43 39 39 39 39 39 39 37 36 43 37 37 35 31 31 34 34 24
24 20 31 31 39 39 37 37 31 36 39 41 39 43 43 41 37 37 41 37 34 41 37 37 41 37 37 41 41 39 38 30 30 28 22 18 19 14 14 19 16 19 19 20 16 19 19 23 12 12
12 26 21 34 34 43 37 32 39 36 36 36 39 39 40 37 37 37 37 37 25 27 18 20 20 24 24 24 30 17 17 17 26 19 23 23 32 28 32 28 18 20 18 27 27 15 12 12 13 9
9 9 11 13 11 11 9 9 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 14 14 23 23 17 17 12 17 10 10 10 12 13 10 11 11 11 10 12 16 17 17 18 24 13 13 10 10 12 10 12
10 19 12 15 16 18 24 18 22 13 12 12 10 10 9 9 9 8 8 12 15 10 8 8 8 8 8 12 12 8 8 10 9 9 10 10 10 8 8 8 12 9 9 10 9 12 11 13 11 9
9 10 10 9 11 11 9 10 12 9 10 9 10 8 8 8 8 8 10 8 9 13 8 11 12 9 9 11 16 10 12 13 15 18 26 17 12 15 10 10 10 10 10 13 21 10 10 10 10 11
11 12 15 14 21 15 10 9 9 10 9 13 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 9 13 11 12 10 10 10 8 8 8 8 17 9 8
6 6 6 6 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 11 10 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9
9 8 8 8 9 9 8 11 7 6 8 8 6 6 6 6 6 9 9 12 14 9 12 10 14 10 10 8 8 6 6 11 12 11 11 12 12 9 10 10 10 10 10 9 8 8 7 7 7 8
11 12 10 11 11 10 10 9 6 6 6 6 6 7 17 12 11 10 14 10 12 13 20 22 20 19 13 17 8 8 8 8 17 19 10 12 8 8 8 8 9 9 12 14 12 12 14 11 9 8
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 9 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 |