BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323P17.T7 (MSMg01no323_p17.b1) | MSMg01-323P17.TJ (MSMg01no323_p17.g1) |
ACC | AG442251 | AG442252 |
length | 1,287 | 1,276 |
length of high quality (start - end) | 617 (136 - 752) | 687 (138 - 824) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p17.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_p17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p17.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_p17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:10 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCCGACTCTTNNNNNNAACACTGGGCGCANTAGACTCCTAAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTATGGACAGTTCCAGCCGCTATAGAGCCCATAAGGAAC
AAAGACTCCTGCAGGGAGTGCATCATTACTACTCACTGTCAGTGTAGGCT
GACCGGTTCTCTCAGATGCCTCTTGCCACACTTCTTTGAAACTTGCTAAG
AGAGGCATGCAGTCAACCTCCATTCAGCAGGAGGATTACTGCTGTCCCCT
GGAAAGCACTAGTCCCATATTGCCTGTTCCAAGAACCTGGAGCACAGCCA
AGCAAGGAGGTCCAGGCCAAGCAACAGAAAGTTCATCTGAATTATCTCCT
GTTCTGCATTTCCTGGTTCCTCTCTCACTTCTTCCTCTTCACCTCAGACT
CATTGCCCCTCCTATCTTTGTTCTGCCCAGCTAATGACCACTCCCTGGAA
CCAATGACACCTTAAGCTGGGCTTACGTTGGATAGCTCTAATTGCCATTG
CCTGAGCTGTGAAAATGGTCCCTTGCTCATGTGTAGGGTAGGTGGTGTCC
TATTCCACATCTCCTGTAGGAAGTGAACCCAAGTCAGGAAGCATTTACCG
AATGCCAAGCAGATGTGAGTTCTCTGTTCTTTTCAGATGGGACAGAAACA
ATGAACAATGCCCCAGGGCCCTGAAGGGAGGTATTGAGAGGCAGCATTAC
TGCCTCCTGAAGAAGGCCAATGCAGAGGCACCATTAAAGCTTAGTGAATG
ANGGCTCCTACCTGAGGTGACTAACACAAAAGACAAGAGTGCTATTTGAA
AAAGAAGGGTGGGTGGCCCCAGGAAGGTAACCAGAGAAAATGGCGCGAAG
GCAGCGAGCAAAATTGCCCATAGATATAGAGACCCCATTGCGGGGGAGGT
GTGACTAAAGATGACCCACACAGATTCTCATCTGAACTGTCCAAGTGAAA
AATGAAAGGTTGATCCATAGTATTGTATGCCTGAATGAACCCATGAATGA
ATGAGGGAATGAATGATGGAATTAAATGATGGAATCTCCCCCTGGAAGGG
GATTAGATTCTAAATCAGGAAAATTCCCCCCTTTGGGAAAATTCCCCCCC
CCAAAAGATTTTTAAATTTTTTGGACCATTTCTCAAAAAAATAAAGGGCC
AAAAAAAAAAACTTTTAAGNTTTAATTATTATTTCTTCCCAAAAATATTT
TTGCGCCCAAAACACCAGCGCCTTTTTGGTTAAAAAAATATTACTCACAA
AAATGGGTTTTTCCTCTTTTTATAAAAAATATTTTTT
| NCCATCCCTNNNNNNAAGCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTAAAGTCACGAAACTCGAAT
GGCTGAGAAGCACCTAAACATATGTTCACCATCCTCAGTCATCAGGGAAG
TGGAAGCCAAAATGACTCTAAGATTCCACCTCACACCAGTAAGAATGGCT
AAGATAAAAAAACTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAA
GAGGAACACTCTTCCATTGCTGGTGGGATTGCAAGCTGGTACAATCACTC
TGGAATTCAGTCTGGCAACTTCTCAGAAAATTGGACTTAGTACTACCTGA
GAACCCAGCTACACTACTCCTGGGCTTATACCCAGAAGATGCTCCAAAAT
GTAGTAAAGATCTTTGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATA
GCCAGAAGCTGGAAAGTACACAGATGTTCCTCAACAGAGGAACGGATACA
GAAAATGTAGTATATTTACACAAGAAGTACTACTCAGCTCTTAAAAACAA
TGACTTCACAAAATTCGCAGGCAAATTGATGGATCTAGAAAATATCATTC
TGAGTGAGGTAACTCAGTCACAAAAGACCAGACATAGTATGTACTCACTG
ATAAGTGGATATTAGGCAAAAAGTGAAGAATACCTAAGATGAACCACATG
AACCACATGAAGTCAAGAGGAAGGAAGACCAAAGAGTGGATGCTTCAGTC
CTACTTAGAAGGGGGAACAATATAAGGGAAGTCCAAGGCTCTAGCTCTTG
CTCCTTTGCCTGCTTGCTGCGTGAGACTGAGTAACTGCTAGATCCTTGGA
CTTCCGTTCACAGCTGCAACTGAACAAATGTTGGNAATTGGGCTGCCGAC
TGTAAGTCATCAATAAATTCCTTTACTATCTAAAGACTGTCCATAAGTTC
TGTGACTCTAGAAAAACCTTGACTATTACAAAGTTGTTATTAAGGAAATT
AAAGGGTTNAAGGAACTTGGGAGGAAAAAAAGAAAAAAGGAAGAAAAGAG
TGGCAAAATTGGGTTTGGGAAAAAATTGGAGGGAAATGTCCCCAAGGTCC
CGTAAATTTCTACAAAGCTGCGTTCTAAATGCGCAAGTGGACATTTTTTC
TCCTTCCTACACCTTTCCCCGACCTCCAAATCTTCATCCTACCCAAATTC
AACTTCAATCTCATCACCATTTCACTTTACACTATATATAAGATCATCTA
TTAGACTACATCTCATTCTATTACAC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 9 7 6 6 6 8 8 9 10 10 8 3 0 3 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 21 21 36 29 29 29 33 33 33
37 37 37 37 33 32 32 32 24 19 12 14 14 22 26 33 33 33 31 31 30 28 27 24 24 13 8 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 10 10 12 21 26 28 33 37 39 44 44
53 53 53 53 53 53 36 35 35 31 31 31 37 37 33 21 21 10 9 9 10 10 10 10 11 19 17 25 24 21 24 21 21 20 21 18 28 20 34 34 42 50 42 47 47 47 47 47 57 57
57 57 68 57 57 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 41 41 39 28 21 8 8 8 8 8 15 25 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 39 43 59 57 27 22 8 8 8 22 23 48 48 47 43 43 43 54 54
54 54 46 46 43 43 43 46 46 48 48 47 47 43 43 37 37 39 39 30 41 24 15 15 12 12 12 24 32 42 43 43 59 59 68 68 68 68 68 57 57 44 44 37 57 57 59 59 59 57
57 59 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 41 41 20 20 20 41 41 44 42 42 35 59 59 68 59 59
59 59 59 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 54 54 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 44 44 42 42 43 43 44 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 25 21 10 10 10 23 32 59 59 59 54 54 57 57 57 47 47 47 54 59 59 68 68 57 57 48 42 43 43 37 37 47 47
48 57 41 43 35 30 33 37 30 30 21 23 11 11 9 19 19 30 19 19 23 26 26 28 25 37 41 48 59 59 43 47 39 47 39 34 43 25 28 32 43 30 28 14 14 21 31 41 48 48
34 34 23 23 23 34 34 41 27 30 32 37 29 29 27 29 25 29 29 29 37 37 39 37 37 30 37 37 41 41 36 37 41 43 41 41 41 47 37 30 18 21 11 13 15 32 34 41 27 27
3 0 3 16 21 25 19 17 21 24 20 19 16 16 10 10 10 15 17 11 10 15 23 11 8 8 8 8 10 13 28 37 37 35 25 22 27 28 28 28 32 32 30 33 22 26 24 30 28 32
34 30 26 15 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 13 11 13 13 16 25 25 25 27 26 30 29 19 15 9 9 10 10 9 12 10 12 13 24 25 32 28 22 14 15 11 11 10 14 16 19
25 28 30 30 26 23 16 11 11 9 8 8 8 8 12 10 10 10 18 18 21 17 12 13 13 13 12 20 22 12 13 10 8 8 8 8 8 8 11 8 9 8 9 11 11 9 9 8 8 8
8 8 8 15 10 12 8 9 8 10 12 19 15 11 11 9 10 9 11 11 13 10 10 11 18 15 15 15 12 10 10 13 13 9 9 9 10 10 14 14 9 9 9 9 12 12 11 8 8 8
8 8 11 13 16 17 13 12 11 11 10 13 10 8 9 9 9 8 8 10 10 13 10 11 11 11 11 10 10 8 8 8 11 10 10 10 10 15 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9
11 13 14 11 14 18 21 16 11 10 10 10 11 13 9 9 8 8 8 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 8 8 6 6 6 8 21 13 8 8 8 8 8 8 8 10 12
9 9 9 8 9 9 7 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 13 6 8 6 7 6 8 9 9 13 8 13 8 8 8 8 15 19 16 15 13 14
14 14 18 10 14 9 9 8 8 7 8 7 9 9 12 9 9 9 10 10 8 8 6 6 6 8 8 10 10 15 8 6 6 8 7 8 9 10 6 8 6 6 8 6 9 10 7 6 6 8
8 8 11 15 10 12 12 18 8 8 8 10 11 9 14 15 9 8 3 0 3 9 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 15 8 9 9 10 11 11 9 9 10 8 8 8 8 6 7 14 21
15 11 10 9 8 13 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 14 14 11 11 15 10 8 8 8 11 11 12 21 19 15 17 10 10 10 11 7 8 8 8 6 6 6 8 12
12 10 9 9 8 8 8 8 10 10 9 10 8 8 8 8 8 12 14 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 7 9 12 9 17 22 17 15 | Open.Hide. 0 3 8 8 9 8 8 7 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 6 6 6 6 8 12 13 8 7 9 8 9 8 14 13 17 8 9 9 17 17 20 17
17 24 28 28 32 32 37 37 37 35 35 36 38 38 53 53 50 50 50 50 42 41 23 23 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 7 7 7 8 8 8 15 21 28 33 33 44 44 53 53
53 47 47 47 47 47 47 47 44 44 50 33 28 25 24 19 15 9 9 9 9 9 9 11 12 12 15 16 16 11 15 15 17 13 11 10 10 15 21 33 33 37 39 44 50 50 59 59 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 50 50 50 50 54 50 47 47 47 47 43 48 54 57 54 68 57 50 50 50 57 68 68 68 68 68 50 50 50 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 44 44 39 37 43 44 57 57 68 68 68 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 53 57 50 50 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59
48 59 59 59 59 59 30 27 13 8 6 6 6 7 18 15 18 21 31 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 43 47 47 48 57 54 48 47 44 44 43 43 46 57 57 54 57 48 54 54 57 59 59 59 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57
57 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57
57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 46 39 39 39 39 37 39 41 44 44 41 41 43 41 41 39 39 28 24 24 28 30 30 41 46 41 30
28 28 22 22 28 39 44 47 47 47 46 43 47 39 36 36 41 39 39 39 37 37 39 39 37 32 32 32 29 29 32 37 59 59 47 37 32 29 29 32 37 47 59 59 59 37 33 32 27 25
26 39 39 39 26 25 18 16 16 18 24 22 26 23 23 31 24 21 18 18 21 23 37 37 37 37 31 20 18 20 18 19 17 22 22 22 26 24 30 28 34 34 39 34 34 28 34 31 36 32
37 32 29 29 31 35 39 37 36 31 36 35 39 31 37 35 39 39 34 34 28 19 19 18 18 25 24 19 23 10 10 10 21 21 27 27 33 19 19 12 12 12 18 10 12 9 11 10 11 11
14 9 13 9 9 9 12 17 13 13 13 22 21 28 28 31 33 34 31 31 27 13 14 11 11 11 9 10 12 22 16 15 8 3 0 3 8 8 8 9 8 9 12 17 28 25 25 24 24 19
19 11 11 18 17 24 24 21 16 10 13 11 13 12 8 8 8 10 11 11 11 12 9 10 10 10 10 10 12 15 16 15 15 10 10 10 15 15 16 22 22 15 19 15 10 10 10 11 12 12
12 11 11 11 20 11 10 8 8 6 6 6 7 9 8 8 8 12 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 13 10 12 8 6 6 6 6 6 11 13 11 11 11 11 11 11 10 8 6
6 8 8 8 8 8 11 3 0 3 10 9 11 9 9 9 10 12 11 14 14 11 13 12 14 10 19 19 13 14 10 10 11 11 9 10 9 11 9 8 9 9 11 19 17 23 10 9 9 9
9 9 9 13 17 16 14 14 18 10 10 6 7 8 8 8 10 12 14 21 18 20 17 19 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12 15 13 11 11 10 17 15 20 20 18 16 20 12 11 8 7
11 6 9 6 7 10 11 8 10 8 8 10 11 12 9 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 14 10 13 8 7 8 8 6 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8 21 17 17 13 12 10
10 16 16 11 12 10 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 11 9 9 9 10 13 25 19 16 11 12 12 21 11 10 10 8 8 7 9 10 14 8 8 7 7 10 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 7 12 10 10 6 7 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 13 10 12 9 12 9 9 9 9 10 9 9 9 8 8 9 8 10 10 8 6 6 6 8 8 6
8 8 8 8 8 7 7 11 10 10 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 8 |