BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332F10.T7 (MSMg01no332_f10.b1) | MSMg01-332F10.TJ (MSMg01no332_f10.g1) |
ACC | AG448397 | AG448398 |
length | 1,316 | 1,308 |
length of high quality (start - end) | 583 (131 - 713) | 606 (131 - 736) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_f10.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_f10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_f10.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_f10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:41 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGCCGGTCTTTGGNNNACATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCCGAGCCAAAGCGGGTCCTTCACTAACCCTCGATGAGTT
CTAACTGTGAGAACTGCCCCTTAAAAACTGGAGAAGCCAAGGCCTTGCCA
TCGTGAGGTGTCCCGGGATGACGGGGACATACAGCCGTGGAAAAGGTTCA
AAGGCTCAGATGTTAGTGGCTTTTAAATAAGTGTTTGTTACAGTTTTCCT
CTTAACCCAACTAGCTCTCAAATGATTAAGACTGGATTATTATATTTAAC
AAGCTTGAAGGGCACAACAACTGAGCAGTGGTATTCCACTTTAATCCTCT
AAACTACGAATCTGTACCTCCCAGGCAGAATCCCAGAGATACCTGCTGGC
TCTCTGGGCTCCAAGGGTTTTCTCACCGTGTCTCCGAGACTCTCTCTCCC
CTTGTCCAGTCCCCACTTCTTTCTCCATCCCTCCTTTCCTGGCTGGGAGG
GAAGTTCAGCCCTATTGGCTGATCAGCTCTTATTGACAAGTCAGAGAATA
AATGGGAAACGAAGCCCACACAGCATTGAGGCAGGAGACACTTAGAATAA
GCATTCCAATACCCTGTCTGCATTGCAACCAGACACGGAGGCAGAGACGT
CGGCATTTGAATATAAAGATAATTTTTACAGAGTATGCACATAACATTGT
GCCTATACTCAGGAGCCGCGCAGGTTTGACGATGGCTACAGAAGGACCCG
AAATGCTGGAGGACTCCCACCCCTTCCCCACCCAAGCCCCTGACCCGACT
CGGGAGCCGGCCCTTCTGCCCAGGCCTGTACATTTTGCATGGGACTCTCT
TACTGAATGGGACACTTACTGGACCGAGTCCACGAGAACAGGGAGAGCAG
CCGGCAGGGGACTGGGACGCTCTGACTGTGGCACCCCCCCGCTCCTGGCT
TTTTACCAACCACAAAAATTTTTATGTCTCGCGGGGGTCCAAGATTTCAA
GGGGTGGGGGGGAAATAAAGAAAGAAGCAAGGCCCCCCCCTAACCCCCTT
TTTATTTTTTTGTAAAGAAAAATTCTTTTTTCTTTCTCGAAAAAAAGGGG
GGGGGGAAGAAAGGGGATTTCTTTTTAATTGAAATTATTAAACGCGGGGG
AAGATCCTCCCCCCGCGCTTTTTGGGTTTCTGTGGTTTTTTTATCTCCTC
CTCAAAAGGGCGGGGGGGAAGGNCGGTGAATTAAAAAAAAAATCCCCTCG
GTTCCTGAGAGGGTAAGGTTCCCGAGTGTGTGGAGAGTTTTCATTTCANG
ATGAGAGTCTGTGGTA
| CGTCTCATTTNNNACAGATGTGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATAAGGTGCCCCTGAAATCAGA
AGCTAACGATGCTGCTCCTTCCTCTGCCAAAGAAAAGGGAGAGGAAAAGC
CTGAGTCTAAAGGCACGGTGACTGGGGAGAGGCAGAGCGGCGATGGGCAG
GTCAGTACACGGCAGGAGGGCACAGGGCCTCTCAAGTCCCTGGATGTGGA
AGAGTAAGGAGGCCCTTATCTTCCAGGAGAGCACAGAGCCTGTGGAGAAC
AAAGTGGGGAAAAAAGGCCCTAAGCACTTGGATGACGATGAGGATCGGAA
AAACCCAGCCTACATCCCCAGGAAAGGGCTCTTCTTTGAGCACGATCTTC
GAGGACAGACTCTGGAGGAGGAAGTCCGGTAACAGCCATTTTTGCTTTCC
TGCTGCTGACTGCTGTGCTTAGTGCTTTACCGCTCAGACATTAAGATGAG
CATCACTGCTGGGGAATTGAAGCTCGCAGTGCTCGGCAGCTAGGTGCCAG
GCACACTGCCACACACTTGCAGTCCTGGCACTCGGGTCTGAAGCAGGGTG
CTTGTGAGCTTGAGGCCGGTTTGGCTGCCTAATGAGACCCTGTCTCACAG
AGCAAAAAGAGGTGGGTGTGGTAGTGTGCAGCCCAACCCCAGCTCTCAGG
ATGAAGAGACAGGAACAATTCTAAGAGAGGTGAGTTCCAGGCCAGCCAGA
GTTACATGGTAAGACCTTGTCTTTACAAAAGGGAAGATTTGGTAACTGTT
GATGGTACAAGAGATAGGATCCAGATTTAAAGCAGGTGTCCCAGAACTTT
GGTCATTACCCCTCTACCTCCTTAATCTGTGCCTCCTGAAAAAGGAAGAA
TTTTTAGGCTTACTTTTTAGTAAACAGATTATTTTCCTAAGTATTAATTG
TTCTCCAGATACCCCTGGCTTGGTTTGGTCCCGAACCCCAGGGGACGCCT
CCTAAAGCTATGGCAAGAAGGAAGGCCCCTGGTAACTATGTAAACTTCCG
TGAGGATGAACATGGCCCTAACCTCTGCCAGGAGCTAATTGCCCCCTTAT
GGCTATAACATTTGGATCGCCCCAACCTCTGTGAGTTTATCTAACCCTCG
AAAATCCTGTAAACTCCGCAGGGAAAATTCCGGAGGTCGGGTTTCTCACT
CTTAAACGGTCTGTCCGGGACCTATTTCTACCCTCCCCACATTCCATTAC
TTGTGGTTGCTGGACTACTCTACTTCCTCACTCTTTCTTCTCTATTCTTC
CTTCTATC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 3 0 0 0 3 7 6 6 6 6 8 9 10 10 8 8 8 8 8 11 15 9 8 8 8 10 8 8 23 23 29 29 29 33 33 33
37 37 37 37 37 37 37 31 18 21 22 13 8 8 22 22 31 31 31 33 33 43 27 27 9 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 7 7 13 12 9 11 9 9 10 21 23 30 31 31 31
31 33 36 36 36 36 35 35 31 31 33 37 37 37 31 31 17 13 11 12 11 11 9 12 8 8 10 10 10 10 10 18 24 34 59 59 59 47 48 43 43 47 59 48 48 48 50 53 53 57
57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 54 54 59 57 57 57 57 57 59 59 59 54 50 48 48 48 48 54 54 57 68 57 57 57 57 57 43 39 35 42 42 59 59 59 57 57 57 48
48 48 59 57 57 57 57 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 47 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57
59 59 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 41 34 16 16 12 17 11 11 12 16 25 30 40 46 59 59 59 59 59 59 57 50 48 48 53 50 50 57 57 48 48 48 48 48 48 57 59 59 68 68 59 68 68 68 68
59 59 57 48 48 48 43 43 43 48 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 37 44 43
57 59 57 50 57 43 50 41 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 52 52 59 59 52 57 57 57 59 59 59 57 57 43 52 59 59 57 52 43 43 29 28 28 43 43 43
57 59 57 59 57 59 59 59 59 57 57 57 52 43 42 43 43 43 42 43 52 57 57 57 57 57 57 43 38 43 44 52 43 37 37 37 37 37 37 37 35 32 32 21 21 31 44 44 59 57
52 52 44 44 50 50 39 43 43 57 46 46 48 43 44 29 29 29 34 32 29 29 36 44 42 29 29 44 44 35 25 27 23 23 23 32 29 32 20 20 20 36 32 32 17 18 18 28 27 30
26 26 25 36 36 37 44 37 43 43 43 42 42 30 30 30 42 42 32 39 39 43 43 48 43 59 29 25 17 24 23 19 17 17 30 30 28 23 23 28 31 32 39 39 40 40 37 37 28 28
25 22 20 31 31 35 35 26 23 12 11 11 17 12 12 12 14 15 20 22 21 14 14 14 20 21 32 28 25 20 20 18 26 19 23 30 17 21 12 12 13 15 11 11 11 19 13 16 12 14
14 30 28 34 23 23 23 26 28 35 17 17 11 11 11 16 16 26 32 31 37 37 27 28 18 18 14 25 23 32 31 27 27 16 9 11 9 11 10 18 24 28 13 14 18 14 15 12 19 12
12 11 14 17 13 13 13 14 17 9 9 9 14 14 15 12 12 12 12 13 17 16 16 16 20 16 25 12 14 14 17 17 23 22 21 15 11 11 13 18 9 8 8 8 10 10 23 21 11 11
11 18 24 30 25 19 15 18 15 19 14 15 14 14 13 16 12 11 11 12 9 8 11 8 8 8 8 13 10 11 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 14 15 17 11 11 10 10 8 6 6
6 6 6 8 10 11 9 9 9 8 8 8 7 8 7 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 8 6 6 7 7 9 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8
10 19 11 10 10 8 8 8 8 8 8 11 13 15 15 11 14 10 15 11 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 7 9 9 13 18 16 14 16 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 7 8 8 8 19 19 24 39 19 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 15 17 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 10 9 9 9 9
8 11 8 8 8 8 15 15 15 10 8 8 8 8 8 8 8 10 15 19 8 6 6 6 6 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 10 18 17 15 12 11 12 10 22 16 12
11 11 11 18 14 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 6 6 6 8 8 9 8 7 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 10 12 8 8 8 9 9 10 9 10 8
6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 15 13 12 9 9 9 9 9 12 17 8 6 6 6 8 10 19 13 8 8 6 6 8 22 9 11 8 12 8 7 8 8 8 6 10 6 6 8 6 9
9 9 11 18 13 15 8 8 8 10 8 8 8 9 10 9 8 17 21 9 10 3 0 3 6 8 6 6 8 8 10 10 6 6 6 6 7 9 7 7 6 6 8 8 6 6 7 8 8 8
8 8 8 10 10 10 12 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 9 3 0 3
6 8 8 8 11 6 6 8 10 8 8 6 6 7 8 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 7 7 10 15 3 0 0 0 3 6 6 6 6 8 7 7 6 6 6 8 8 6 6 6 10 10 10 9 7 6 6 6 3 0 3 11 13 17 8 8 8 19 19 29 22
22 24 28 28 35 32 37 37 37 35 28 35 35 36 36 36 44 44 39 37 42 41 23 19 9 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 19 21 25 33 37 50 44 41 47 47
36 36 36 36 35 35 31 33 33 30 28 27 21 21 10 10 10 10 11 13 10 10 13 13 14 17 10 14 14 14 18 19 28 34 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 48 48
48 48 48 48 48 41 41 41 41 48 48 57 54 54 54 54 48 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 46 47 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57
57 50 48 50 47 57 57 57 57 48 57 48 57 57 68 68 68 68 57 59 52 52 52 59 57 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 52 52 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 43 32 27 15 10 8 8 8 8 8 20 38 62 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59
59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 57 57 57 59 57 59 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 54 46 57 57 48 44
57 50 50 48 48 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 57 57 57 68 68 57 57 44 44 43 47 46 48 57 57 57 57 57 57 57 37 39 39 59 59 59 59 48 47 47 43 46
47 43 43 43 43 43 48 59 47 46 46 47 47 43 43 40 44 43 48 48 48 48 48 48 57 59 59 43 43 43 43 43 43 47 47 47 59 59 43 41 32 31 35 36 37 39 37 34 31 30
37 39 59 47 48 43 43 40 40 43 43 43 47 42 42 48 57 48 48 59 59 57 48 54 54 48 48 42 42 48 57 57 57 50 47 42 39 42 42 41 46 42 47 47 48 48 48 48 43 48
46 46 43 43 43 43 43 39 43 43 43 43 32 32 19 19 19 32 32 48 48 48 43 43 40 39 39 34 34 25 30 29 26 26 19 22 17 20 30 32 31 31 31 30 37 34 28 23 31 22
31 31 30 29 37 37 40 34 32 20 20 20 24 27 25 18 25 24 22 24 25 37 33 37 32 32 37 37 43 40 40 40 39 23 19 15 8 8 8 10 16 26 26 17 15 15 13 13 18 19
22 19 21 22 12 12 26 23 29 34 28 32 24 28 32 32 29 22 13 10 10 16 20 23 17 14 13 13 17 18 27 26 24 20 18 10 11 12 23 18 13 13 15 11 11 21 19 10 10 9
19 19 21 17 10 11 8 7 7 11 11 19 16 15 24 21 26 26 22 22 16 11 11 11 13 19 16 13 10 10 13 18 22 18 13 11 8 8 11 11 13 18 10 8 8 8 8 9 21 15
12 11 11 10 9 11 25 15 13 13 10 10 10 10 10 10 10 15 12 9 9 10 8 10 13 12 12 15 10 10 11 12 10 12 17 14 10 8 10 10 8 8 8 10 10 10 8 10 10 11
13 19 16 12 10 10 9 12 13 11 9 9 10 12 11 21 14 14 8 8 8 10 8 8 9 12 16 14 11 11 12 19 17 11 13 9 9 7 11 8 9 10 9 10 16 16 20 17 15 10
10 10 13 15 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 13 8 8 7 8 8 8 10 10 10 12 13 17 11 14 14 13 12 11 10 10 11 11 11 10 8
10 10 10 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 13 13 12 12 12 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 6 6 6 8 11 11 11 12 10 9 7 8 8 9 10 9 10 10 10 10 6 6 8 8 9 10 8 10 11 10 10 10 11 8 8 8 15 8 6 8 8 8 8 8 8 13 7 6
6 6 8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 9 6 6 6 6 8 8 10 8 8 11 9 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8 9 8 8
8 10 10 9 8 8 8 8 8 10 12 8 8 7 7 10 8 11 11 11 12 12 11 11 10 13 16 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 10 14 17 14 14 8 8 8 12 10 12 10 10 10 10 9 9 10 12 10 10 10 8 8 8
9 9 10 10 10 11 8 9 9 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 8 9 8 8 8 8 10 10 15 11 11 9 8 8 7 7 10 8 7 6 12 10 21 11 15
8 8 8 8 8 10 8 8 |