BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332O15.T7 (MSMg01no332_o15.b1) | MSMg01-332O15.TJ (MSMg01no332_o15.g1) |
ACC | AG448815 | AG448816 |
length | 1,242 | 1,263 |
length of high quality (start - end) | 599 (153 - 751) | 784 (88 - 871) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_o15.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_o15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_o15.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_o15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:19:53 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (12,773,790 - 12,774,388) | (12,615,592 - 12,616,292) |
---|
sequence | NNGGCCGATTTTTGNNNCACATTGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCCTCAAGTAACTGAAACCTTAAACTGAAGGAAATAACGGG
AGATCTTATCTTGATGAACATTTAAATAAAANAGTTGGNTANAATANAAA
GNTCAGCATACCTAAGCTTAAGACCTAAGATTTGTATTATTGCAATAATA
CCCCAAGTGAACATGAAAAAGTGAGATAAATGATGAAAATTTTCTAGTAC
TTAGAAAATGGACTATTACTTGGGACACAGACACAATGCTCTTTGTCATA
GTCAAAAGCATCATATTTTTTCTTCATCACAAATTTAGAAGTCTCATTCT
GCAACCATGGTTCTTTACTAAAACACACCAAGCTTATTACTTTTGTCCCT
ACAGTCACTCTTCTTTAGCTTCTTTTCCAAACACTTGGCCATGCACAGAG
CATGACTAAAATACTGTATAGCTTTCCATCACACTAACCCACAATTCCAC
ACCTGAATGCTTACACACGTATGTTCTCCTTTCTCTTGGTGTCTCACTGG
TATTTCCACAGTTAACCATTTACCAGCTATTCCTTTGGACACTCCCTTTG
CACTGTACTGTTTAAAGTACCACATACAGTCTTCTGCAGACAATGTGAGA
GCTGGGACAGGCAATCACAGGCTGACTGTGCTATGCACTAAAGGACAGGT
TTGTGGGTGGCATGGAGGTCCATGGGTCTCTGTGACTCTTGGCACTGGAT
TGTTGAGATTTTCAGCTTTCCTTCACAAATAACCCTGCATGGTCCATTTC
CTTCATACATACAGATTCTTGGGGATGTCTTTAATGGAGGCTCACAATTT
ATTTGTTGAGACTGCTCTTTCCCCTTATGTTGTTACCTGGCTTCCACTCC
TTTATTAAGGGGAAAGGCGGGAGGCCCCCTTCGCAAATTATTATAACAAA
AATAAAGGACCCCTTTATTGGAGGGGCGTTTTACTTCCGCTACTACTCCT
TAATATTCCCAGAAAAAAAATAAATAAATTCCATATGGGAAACCCTGGGT
GGGGAAGCTTTAAATAAAAACCAAGGGCCCCCTCACATAATCCTGGACAG
GGGAAACCTGGGTTTTCCCCCTGGAAAACTCTCGAACCCGGAAGGTAGGT
GGGTGGACCCCATTTTACATAATGTAATAAGAGGGGGCGAAAACCGTGGG
GGGAGAAAATATAAATTTCAGGAGGGGAAGGGGAGAACCAAT
| NCCGGCTTTTNNNNAAATCAGTGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAGGCCCTTTCTGTCCCT
TTTCTAGATATCCAAGGGCCGTCCTTGAAACTCATAGCTCTTCTCCTGAA
GGACCTCTCTAACTTCTTCAGAATTCTTTGGGCTGTGCCATAACTTGGCC
CTTAAGTGACTATTAAAATACTTTTGTAAAGGCTTAGTCTTCAGCTCTCT
AATGTAATTGGGAGGAAAGTATTCAAGTGGTGCTCAGTAATACAAAGAAA
TTTGGGGCATTTCAGTGAAATGGATATTGGAATCCCGAATCTGCCTCTCC
ACCCTGTTTCCTGGTTACCTCAAGCAGAGTAACCCCCTTTGCCATGTGCT
TCCACCACCATGATGAACTGTGCTGTCACAGGGTGTGAAGAATAATAGCC
TACCATGGGCTAGAATCTCTGAAGCCTTGGGCTAAAATAAATCTTTCTTC
ATTTGATTTGAGTTTCTTGGGTATTTGTCACAGTGATGAGAGCTGTCTAA
TATTGTCTGAAGCTGCTTCTTCTCTTACACAGATGGCATCATCTAGTTCT
CAATGTAACATGGTGTCATTGATTTTCTGAGAAAATAGAACACCTAGATA
AAAAATGTGCAAACTACATTCTCTTCAGGAAGCACCTTTAGCTAGTTTTG
CCCTGGAAGAAGCATTCCTCTACAATTCTAGAGTCAACCATTCCTAGTTG
TCTGCTCATGGGTTGAAAATATCATTGGTTTTCTGACTGAACTTACAATC
CANATAGGCATCAGGTTTATAATTTATTTTCTTAACAAACAATATGACCC
CTGAGCTCCTTGTGGGCATTTTACTGTAAGGATGTGAGGATTGGATATGA
GAGCCAATCCCCAGCATGAGGGTGCTCAAAGTCTTGCTTTCTCCTTAGTC
AGCTGAGTCAGTGTGAAGAAATGTGAAACACCTAAGGGGGAAAAGATGAT
GTCTTGTAAAAATTTACATGGTCGGTACCCCGCCTGGGCCAATTGAAAGA
AAAACTTATATTTTTTGGAATTCTGCGAACATTTTAAAGGAGCTTTTGGT
TTCTATAACCCTCCCCAAACAAATGGAACAAAACCCCGCCAAAAACCCTT
GGGAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTCCCTGTTTCCCCAAGAGGGGGGGTGT
AATAATATAAAAAACCCCTGTTATTCCTTAGCCCCCGGCGGAGTGTGGGG
CACTTCTTTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 11 11 9 9 9 10 3 0 0 0 3 6 8 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 12 13 8 8 8 8 8 8 10 26 17 24 28 28 28 30 30 33
33 33 33 30 30 30 26 19 19 9 9 9 21 21 31 31 31 31 31 30 31 29 29 14 13 6 6 6 6 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 22 22 31 31 41 53 35 35
35 35 38 36 36 35 35 31 31 31 31 31 30 22 17 11 7 7 7 8 7 9 12 17 17 22 25 33 21 23 3 0 3 23 23 23 23 3 0 3 3 0 3 23 23 3 0 3 27 27
3 0 3 27 27 39 33 33 33 33 33 33 36 36 38 38 50 50 50 50 50 53 57 53 53 53 53 53 53 59 57 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 57 43 43 43 48 48 68 68 68
68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 50 57 43 43 52 57
57 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 45 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 35 35 47 47 62 62 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 59 59 35 35 35 59 47 62
62 52 52 52 52 52 44 44 43 38 43 35 35 35 38 38 35 35 39 59 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 57 57 52 43 43 43 35 35 44 44 57 52 45
45 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 44 44 31 31 31 44 44 57 57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 52 52 52 52 52
57 57 57 57 52 52 43 50 39 39 39 44 43 35 35 47 44 57 47 47 43 44 33 35 35 47 47 50 48 48 48 59 48 54 54 54 42 44 26 26 13 15 15 41 32 54 54 44 44 30
30 25 40 40 46 57 43 47 39 47 39 43 39 44 37 43 43 43 43 57 57 48 43 43 40 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 47 48 48 48 39 39 32
30 30 30 30 18 18 18 30 30 18 18 20 32 32 37 37 30 30 30 37 37 43 43 59 57 48 39 39 32 32 19 28 24 33 33 28 24 20 32 20 28 28 32 32 23 23 23 32 32 28
28 28 33 37 43 39 39 40 34 34 30 30 24 32 34 41 41 41 39 39 36 36 31 32 24 28 28 23 23 23 28 28 39 37 41 41 47 20 18 9 9 9 9 14 16 19 16 24 21 32
32 34 33 37 32 32 41 36 31 28 32 36 40 27 30 19 19 12 25 25 32 31 35 31 32 35 35 35 39 37 47 41 34 34 25 25 25 34 34 30 23 20 32 37 37 39 27 28 20 15
15 15 15 14 17 13 10 10 10 16 21 14 16 11 11 16 19 19 28 28 22 16 11 9 9 9 12 12 9 9 9 9 9 9 11 12 11 11 10 10 10 10 10 9 10 15 13 17 11 9
8 8 8 8 8 10 11 11 12 12 11 10 9 9 9 9 10 19 18 18 20 21 20 16 13 13 10 10 10 11 12 12 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 11 10 11 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 12 9 10 10 13 18 15 14 14 15 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11
11 14 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 7 7 8 8 8 8 8 7 7 12 9 11 8 8 8 7 8 8 8 8 8 15 9 9 10 10 10 10 10 12 10 14 12 12 18
11 10 10 10 10 10 10 10 17 15 18 16 11 12 10 9 9 9 8 8 9 10 10 12 21 11 10 10 12 8 8 9 6 8 6 9 9 8 11 8 8 8 9 12 11 12 10 10 11 12
7 10 6 6 8 8 6 6 8 7 8 6 6 9 17 10 8 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 11 6 8 8 10 10 11 12 12 14 18 17 16 14 14 13 12 8 9 9 9 9 9
9 12 18 15 15 10 10 10 10 12 13 12 9 9 9 9 12 13 17 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7
7 15 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 9 19 10 8 8 8 8 8 8 8 12 13 11 12 11 11 10 10 10 9 9 9 9 8 8
8 8 6 6 9 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 6 6 6 8 8 8 8 15 15 15 8 9 8 10 12 12 11 10 8 6 6 6 15 15
9 8 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 6 13 10 11 9 8 8 8 7 7 8 10 11 10 10 9 10 10 16 10 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 8 8 7 10 10 10 10 3 0 0 0 0 3 9 9 7 6 6 6 6 6 8 9 7 6 6 6 6 6 8 10 13 8 8 9 9 16 12 19 22 20 20 24 28 28 29 20 21
15 18 24 28 28 35 37 37 37 37 35 35 35 38 38 53 53 50 50 50 50 47 41 29 23 9 9 11 9 11 11 11 11 11 9 10 12 22 25 29 31 31 33 33 33 36 36 53 53 57
42 42 38 38 36 36 36 36 33 33 33 33 42 41 25 25 11 11 9 9 9 8 8 8 15 20 25 30 33 37 41 41 36 31 31 21 21 21 31 31 43 44 53 53 53 53 50 50 50 50
50 57 50 53 53 68 51 47 47 47 47 50 51 68 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 43 43 29 43 39 39 43 43 43 44 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 46 57 54 47 42 43 43 68 68 68
68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 47 48 46 41 39 39 39 39 39 37 41 41 37 37 37 37 37 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 43 43 31 22 22 22 28 26 29 39 43 59 59 59 47 47 47 41 39 39 39 34 34 41 41 39 39 39 37 39 39 39 41 37 37 44 44 44 59 44 41 36 40 36 32 28 31 37
39 41 59 59 59 47 47 44 41 37 39 36 32 34 39 37 39 39 41 41 41 41 41 41 39 37 29 30 30 30 32 37 39 39 41 41 41 39 28 22 22 24 22 26 41 41 37 34 37 17
16 3 0 3 23 23 29 29 37 39 44 39 37 31 30 30 24 32 37 32 25 25 25 25 27 39 59 59 59 47 41 37 39 31 20 21 10 10 10 21 21 37 41 39 39 39 39 37 36 39
32 19 15 10 10 10 17 19 29 25 25 24 20 19 26 26 35 37 23 23 18 15 19 15 25 15 19 19 24 19 29 32 37 25 27 37 32 22 22 25 17 17 16 12 11 17 19 22 23 11
11 11 17 11 18 19 17 18 25 24 16 11 9 9 8 10 13 17 10 10 10 11 12 14 21 13 16 15 8 8 8 9 11 14 16 14 22 19 19 11 10 10 10 15 12 8 6 6 6 8
8 8 9 9 11 8 8 8 8 8 10 11 11 8 9 10 9 7 7 12 12 21 10 10 12 11 9 10 8 8 8 10 12 11 10 14 10 11 8 9 9 11 8 8 10 10 11 11 9 9
9 9 9 6 6 6 6 8 9 17 14 14 14 12 17 10 8 8 6 7 6 8 9 9 9 9 9 9 9 8 10 10 10 9 11 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 9 10 11
19 12 9 9 9 6 6 9 8 8 9 13 18 10 11 11 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 8 8 9 9 13 19 17 14 12 13 10 13 11 8 8 8 8 8 9 11 12 11 8
8 8 8 6 6 8 8 8 11 11 10 10 10 12 13 8 8 8 8 8 8 15 9 9 9 9 9 10 10 16 24 24 19 12 8 11 8 8 8 10 8 12 15 20 11 10 10 10 10 10
9 12 13 14 20 17 16 11 18 11 11 18 11 11 12 16 9 8 10 9 8 8 6 6 6 6 8 8 11 12 12 12 14 12 9 8 6 8 8 8 8 12 12 10 10 8 8 6 8 8
10 6 6 6 6 6 6 6 8 15 16 26 25 9 12 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 9 10 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 9 9 10 10 13 11 10
8 8 6 6 6 6 11 15 13 9 9 8 8 |