BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-347H23.T7 (MSMg01no347_h23.b1) | MSMg01-347H23.TJ (MSMg01no347_h23.g1) |
ACC | AG459824 | AG459825 |
length | 763 | 753 |
length of high quality (start - end) | 502 (47 - 548) | 456 (81 - 536) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no347_h23.b1 PHD_FILE: MSMg01no347_h23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:38:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no347_h23.g1 PHD_FILE: MSMg01no347_h23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:38:29 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTAAGGGCTGTCCCAGGGTACAGAACCTCTCTTGGCCTAGAGGAT
CTCTTATCACTTAAACTAGCCAATGGAATTAACCTCCAGCAGGTTAGCCT
GGCCTGCATTTTCTGCTTTCCCAACTAGGCTGCTCTGATGGAATTGTCAC
AGACAGCAGTAGCTCCACTACCTATCACTCTCAGGAGCCCTGTGGGGACA
GGCTGTACTGGACATGTCTTGGGCTGATCCAGGGGGGACATGTTCCATCT
GGAGGAGGTCACCTCAACTAGGCCAGCAGTTACAGTGGTGGGATCTCTGG
CTTCTTTGCCAGGGGCTGCTTTGGCCATTGCCTTTGGAGTTAGTGTGTGG
GACGAGTTAGCGTGTAGGTCCAGTGGTGGTTCAGCTGTCCTGCAGCTGGA
TGGGTTGTTGTGCATTTCTATTGTGAGGCTTAAGAACAGTTGTAAATAAG
GCCCAGGGGGTTGGTCCCTCCTAACTAGGCTTTGTCAGTACCAGGGTGGA
GGGAGCCAGGGCCAGATGAGGGGGGCGGCTTTCATTCCTAGATGCTTCCA
CTTAGGTCCCCAGTCTGTGTATACTCCTGAATGCACTTATTGTTCAAATT
TTTTNNNNTCACGCCGGTGACGCCCTGCCCCGGCGAGACCCCNGAACACA
TAGGGCTTCCTGCTATTTCCATTATCTGAATTTTGTTCCCGCCTAAATCC
CTTGTTGGAACCG
| NNNNNCCGATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCTGGCCCCGGGGGTGTTT
TCTGCAGCCTGGCTAGCTCCAGACCTGTAATTAAGTCTAGTGGTATGCTG
GCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGCTGATGGGATTGCA
AGCTTGTACAAGCACTCTGGAAGTCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTG
GACATCATATTACCGGAAGATCCAGCAATACCTCTGCTGGGCATATACCC
AGAAGATGTTCCAACAGATAATAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAG
CAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTAGAAAGAACCCAGATGTCCCTTA
ACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTA
CTCAGCTATTAAAAACAATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGATCT
AGAGGATATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAACTCACTTG
ATATGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAGCTTANAATACCGG
AGATACAATTGCNAAACCCNAGAAATCCNGAAGAAGGAAGACACCGTGTG
GAACTTCATTCCTCCTTAAATAGGGAACAAAAACCCTGGGAGGATTTCTA
AAACAAGTTTGGAGTTAAACAAAGGAGGTCCTTCCCAAAGTACCCCCCCC
CGT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 12 9 12 12 22 19 29 37 39 30 30 28 24 24 30 22 24 19 18 20 30 37 44 27 20 21 21 20 21 22 11 11 9 12 10 10 10 15 15 22 22 29 29 31 48 48 57
36 36 36 36 50 36 53 41 41 37 43 22 22 11 15 12 14 12 23 22 28 28 36 33 33 33 41 47 53 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 42 42 42 42
42 51 57 68 68 51 50 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 42 43 39 39 39 42 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 54 68 68
57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 47 47 43 39 36 34 37 29 30 32 37 30 30 28 34 37 41 41 47 34 34 28 22
22 30 34 37 31 31 35 37 37 22 17 12 12 10 18 16 19 22 30 37 29 24 22 22 23 23 25 25 28 32 37 37 34 19 14 11 11 14 14 22 24 27 32 26 26 22 22 19 19 16
18 11 11 9 14 12 15 17 17 15 10 10 10 11 12 11 12 12 15 15 23 24 14 12 12 10 10 8 8 9 17 15 13 8 8 8 19 15 11 8 8 8 19 13 10 8 8 8 6 8
8 10 8 9 8 8 12 12 18 10 15 12 12 12 22 16 16 17 12 12 12 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 9 8 10 8 8 13 10 16 16 19 22 16 17 15 13 10 10 13 17
19 17 17 3 0 0 0 0 3 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 3 0 3 9 10 11 11 10 9
9 9 8 8 8 8 8 10 18 19 13 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 7 6 8 8 10 9 9 11 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 9 9 18 18 21 19 19 19 37 37 33 33 32 31 28 28 41 37 32 37 26 17 11 10 12 11 11 13 14 15 15 30 26 37
37 31 17 23 11 11 11 23 25 59 59 59 53 37 35 20 24 24 24 29 37 37 57 57 37 37 33 33 36 42 48 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 48 48 41 46 35 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 59
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 57 59 59 57 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 48
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 53 50 57 57 57 53 57 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 47 42 39 39 39 39 41 41 44 44 59 59 59 59 59
59 59 43 40 40 59 41 39 39 39 37 37 44 37 37 37 37 37 37 41 39 39 41 41 37 37 40 39 37 39 37 37 37 31 34 35 31 31 29 39 31 31 32 37 34 36 38 39 37 37
37 37 41 28 28 30 30 28 34 34 37 37 32 31 37 34 30 23 23 23 28 22 19 24 25 30 30 31 28 25 18 26 13 11 11 20 20 22 16 22 18 23 21 21 12 13 13 24 23 26
20 20 20 26 24 14 14 12 20 11 11 11 18 17 12 12 12 13 8 8 8 8 8 8 9 14 13 9 9 9 16 10 10 10 11 12 15 15 16 16 3 0 3 9 9 9 10 10 10 10
11 11 10 10 8 10 8 8 7 8 11 3 0 3 8 8 8 7 3 0 3 8 7 10 13 10 10 3 0 3 9 9 9 9 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9
9 9 10 10 6 6 6 6 6 7 10 17 9 9 8 8 8 8 8 7 9 9 12 11 11 10 9 9 9 14 10 16 23 22 21 14 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 11 11 12 12 12 10 10 6 6 6 6 8 8 9 10 9 9 8 8 8 8 10 8 10 12 9 9 8 8 8 8 8 8 9 11 8 9 9 9 9 9 24 24 18 17 16 10
11 10 10 |