BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-446K18.T7 (MSMg01no446_k18.b1) | MSMg01-446K18.TJ (MSMg01no446_k18.g1) |
ACC | AG535311 | AG535312 |
length | 759 | 746 |
length of high quality (start - end) | 510 (58 - 567) | 239 (61 - 299) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_k18.b1 PHD_FILE: MSMg01no446_k18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no446_k18.g1 PHD_FILE: MSMg01no446_k18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:15:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGCTATACGACTCACTATATGCAGAGAATCCGCGGAATTCCTTCCTTGTC
TCACAGGAAGGGTGGAACACCAAGCAAAGCCAGTGTGTGCAGAGATAAGA
GCCAGCTGTTCTTAATGAACTTGGAACTGGCTATAAATTGTCAAGGGTGT
ATCATCTGCAGCAAGCCCGAAGAAGAATTTTCAAAACATCACCTAAGAGG
CCAACAGAGGCTGCATATAAAATAATAAAATACAATTTCATAGAAAAGAC
AAGTGAAGAAACACAGGTAAATCGAGGATTTTTTTCCCAAGCCTCATCAA
GCCTGACAATATTTTTGATAAGCAATAGTTTTTCCTGGAGCTAAATATTG
GTCATGGCTCAAGAACACAGATTTAGGTCATCCCAAATTCCATGTTCCAA
CTTGGAAGCTGTTTCACACCTTTATAGTAACAGAACAAACGCAGTCACAA
GTCAAGACACTTTTAAACGCATTGATGGAAATATCAGAGAGGTGGGGTGG
AGCAAAGATGGGAGGAGTCTTCTGTTACAGATCTCAGGTTGTCTGACGAC
AATCCTAGACTTGGCGTTGGTGGAAGCCAGTGCTCTGCTGAGCTAATATG
TTTTAAAATATCATATTTAATTAATAGAATTAATTTAATACTTTGATAAT
ACTTTTTAAAGCCTTGATTTGATAGTCCCCCCGTGTAAGACCATACACCC
AGGTGGTCAAAGTAATGGCTAATTATGTGTAGTGCCCCCCCGTTCTCTCA
TCACTTTAT
| GCCTGGCGGCGCCTGGCTTCAAAAACAGGNGAACTATAGAAGGATTGCGA
CATCTCACTAATGTGTGAACTGCTATGTGGGTGCTGGAAAGTGTACCCTG
GTCCTCTGGAAGAGCAGGCAGTGCTCTTAACTGCTAAGCGGTCATCTCTC
CAACCACAGAGTAGAATTTTGTACAAGTAAGGTTTTTAATTGTTGGTCTG
GGATGGTAGACGGCTCAGTGGTTAATAGCACTGTTTTTCTTCTAGATGAT
CCAGGTTTGAATCTGTAACCCCAGTCCCAGGGGGGTCAATCCAACCCCAT
TGGCTGNATTCCTCACCAAGCATTCATGTGGNGCATGGGCCTATATGTAC
GCAAAACATTTAAGGAAATTTTAGAGGTCTTAGCTCTTCCTTTGGAATGG
ACTATCTCAAGTACCTTGTGTTCTTTTTCCTTGAATTTATGGTTAATTCA
ACTCAGTAGCACTGCCCTCCGTGGACCTTCCTGCTTTTTCATTACCAACT
TTCTCACTAAGTAGAGTTTTGGCATAAATTGCTCCTTCAGCCTGAAATCT
CAAGAACTTCCTCCCTGCAACAATTGTCACATCTTCTTTAGGGCCTTTGC
CAGCCCTTCCTGGTCGCATGAAGGTTACCCAGCCTTTGTTTTTTTTTTAA
GGACACTTCNAAAAGGAAGCTGTTTAAAAGCTCTGACTCAATTGGAAATT
TCTCCTTCCCTCCTTTAAAGATCGCCCTATAAGCTGTAATAATTTA
|
quality values | Open.Hide.16 19 9 9 9 12 15 21 29 43 26 19 17 15 16 19 19 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 11 13 18 30 28 31 31 31 33 33 33 59 59 59 59 33 33 10 10 10 7
7 7 9 9 10 11 15 16 27 27 39 43 48 50 50 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 57 48 47 43 43 43 43 57 68 68 59 57 57 57 57 50 53 68 68 68 68 68 59
44 40 47 47 43 43 43 41 37 37 39 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 53 50 53 57 57 57 57 50 53 50 50 50 50 42 37 21 14 10 10 10 10 17 24 32 47 47 50 50
50 48 48 48 48 59 59 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 50 50 50 68 53 53 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 30 27 15 11 9 9 9 11 11 13 12 15 21 30 31 34 34 50 50 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 46 47 59 59 59 68 68 68 59 59 47 35
35 35 47 47 57 54 54 43 40 36 23 23 23 36 37 44 57 48 48 48 57 57 57 59 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 50 50 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 43 43 43 43 46 46 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 36
36 25 28 30 36 39 48 48 54 54 57 68 48 48 48 48 48 57 57 54 54 54 54 43 43 40 40 43 47 47 57 50 48 43 37 28 28 28 37 33 43 43 37 37 25 28 28 28 28 32
32 37 37 35 26 26 23 23 23 30 28 20 20 28 31 32 34 34 48 37 37 43 43 39 39 37 36 32 39 39 42 43 47 42 42 24 24 16 15 10 15 15 15 21 21 37 28 28 23 23
23 23 34 41 43 47 39 35 37 37 37 30 21 12 11 11 11 10 19 17 13 10 10 9 8 10 10 10 11 13 14 12 10 8 8 8 8 10 18 21 19 19 19 16 16 11 10 10 15 13
13 11 8 8 8 10 14 17 19 8 8 8 8 10 19 21 26 23 19 19 19 22 15 12 16 16 10 10 12 15 17 17 13 10 10 10 10 10 9 9 12 9 10 12 15 8 8 8 10 10
11 13 16 17 22 27 21 16 13 15 11 11 11 19 19 19 11 11 11 12 12 10 10 10 10 12 17 17 20 11 11 14 11 11 10 10 8 8 8 9 14 13 15 12 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 13 12 15 15 16 15 15 11 11 8 8 6 6 8 8 11 11 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 11
12 12 13 13 13 15 17 23 17 | Open.Hide.11 11 19 27 39 39 25 28 30 30 26 22 15 24 15 9 9 9 10 10 10 11 6 7 6 6 6 8 3 0 3 12 12 15 27 27 50 42 41 27 29 9 9 9 9 9 9 8 8 7
7 7 8 8 9 13 11 13 11 10 10 23 23 53 53 57 57 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 32 24 15 19 21 12
12 22 22 19 19 21 34 34 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 34 18 10 9 10 10 14 26 44 57 57 57 50
43 50 50 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 57 57 59 59 57
41 40 47 47 42 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 41 59 23 24 11 16 19 16 14 12 29 25 47 59 59 59 50 50 50 50 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 57 48 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 47 59 34 30 15 8 6
6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 14 18 27 31 47 50 50 50 50 48 48 59 50 50 50 47 47 44 27 29 3 0 3 27 27 59 31 23 12 11 8 8 8 8 8 8 15 15 10 10
10 10 12 13 18 24 32 37 43 48 47 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 59 59 57 57 57 57 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 48 48 48 57
47 32 25 10 10 10 21 22 23 23 37 37 48 48 57 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 24 24 11 18 18 43 43 50 50
57 57 59 43 36 36 39 39 48 57 59 59 59 48 48 59 59 59 47 44 44 44 30 30 30 27 27 37 59 59 59 59 47 47 48 59 59 47 50 47 47 47 47 48 48 48 48 48 48 48
57 57 47 47 39 39 37 34 34 34 32 23 23 23 23 28 23 27 37 37 37 37 31 31 35 32 32 31 30 24 30 30 34 37 42 41 41 39 41 41 37 37 43 39 29 30 31 30 27 30
32 29 21 24 9 8 10 15 19 20 19 19 29 29 23 23 12 10 11 18 20 37 30 43 43 36 36 36 37 37 27 27 25 23 15 19 22 28 28 26 10 9 9 9 10 15 21 22 22 22
37 34 30 15 17 17 19 22 16 13 10 11 9 9 15 24 18 14 20 26 30 30 29 17 17 12 19 15 25 23 19 12 12 25 19 15 11 11 8 11 13 15 10 11 10 8 8 8 8 7
7 8 8 7 7 7 8 8 3 0 3 11 14 13 11 15 12 12 12 16 15 13 13 16 16 30 14 14 10 10 10 10 13 13 12 10 10 12 10 11 11 16 17 19 22 15 15 15 16 16
7 7 7 8 8 18 14 13 16 12 8 8 7 6 8 8 10 10 12 16 15 15 15 12 11 11 13 13 15 15 11 10 10 10 12 8 8 8 11 8 8 7 8 8 8 8 |