BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-461P02.T7 (MSMg01no461_p02.b1) | MSMg01-461P02.TJ (MSMg01no461_p02.g1) |
ACC | AG546946 | AG546947 |
length | 775 | 765 |
length of high quality (start - end) | 289 (76 - 364) | 305 (74 - 378) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_p02.b1 PHD_FILE: MSMg01no461_p02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no461_p02.g1 PHD_FILE: MSMg01no461_p02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:35:45 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCTCTCAAAATTTTGTGATGCCTATACGACTTACTATTTCCAGAGGATCC
GCGTAATTCCCTGATTCCACGGCAAGGGCTCTACACCAATAGGTTCCGTA
GCCACCTTATAGATAACAACTGCCCATCACCCAGGCCTTATCTGCTTTCT
CCCACCCTCTGCCAAACTCCTCTTCATATGAAAGGACACATCCCCTCTGC
TAAACACATCCCCTCTGCTAAACACATCCCCACTGTTGCCATGGATCCCT
GCTGATCCTGATCCTTGTTGAATGAACGAATTCTGTAGCAGGCTTCAAGC
TAGCCTGTGGTTTTCCGGGTTGAAGATAAGCTCTTAGAATTAACTTGTCA
CCAGCTCTAGAGTTCAGGCAAAAACTCAAGAATAATACAATAAAAGACAG
AGTGTCCCCAGGTTTAGATGCATCCGCCTGTCCTATCTGAAATGATTGTT
CTTTCTCATATTACCCTGCCCTTAATAGGTATGTATCGCAAAACCACACA
CCCATATTATCTCCCAAATTCTGTTCTCCAACATATCTCGTATCCATTGT
CCCCTCCCTTGACTCCTAACATTTACCTCCCACCTTTTTCCCTCAATTCT
CATACCCACTAATCAACCGACGGCATGTAAATAAATTCTCTCCTATGGAT
TAATTGTTCTACCCTCTTCTTCTCCATATCTAAAACTAAGTTTATCCCGT
CTCCTTCAACCATCTTATATTATATCACCCATACCTTCCTTGCCTAATCA
TCCCACCCCTCCTTCTTTATATCAT
| TCAATGATAGGGGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGTCTGGGGTCACTGGGATGATTAT
GCAGTAGCCAAGGGCGTTTGCTGCTATTTCAGAGTACCAGTGTTCAAACC
CTATACCCACATTGGATAGCTCACAACCACCTGTGGCTCCAGTTCCCGGG
GACCTGGCCTCATCTTGTGGTCTCCTTAGTCACCCATACACATGGCACAC
ACTCAACAGTCACATAAATAGAAAAGTATAAAAATAAATCATTTCCTGTG
CCACACAACAGTTTTACTCTCGAAAGTGTTTAAGGCTCAGACTTTCTGTC
CTTGGTAGAGACCCATCTTGAATCATCTTGGCGCTAACGCTGCCCTCACC
TAACAATGTGTGTTTTCTCATCCTCATGCCCCTACATAGAACAGCATATA
GCACAGAAGTTTTTAAAGATTCTCTGAGGTTTGAGGGAGCTGACCTCCTC
AATGTGTGATCCCCTATTTGGCCTGTTCTCTGCCGTCCCCTTAACACCCG
GTCTTCCACGATTGTTCCCTTATATTTTCCTTCGACCAGCCCTGTTTTTT
TACCCCCCCCTGTCCTGACTGGGTCTCTTCTGCTTGCTACCTTCCAATTA
TCCTGTCATTTCTACCATATCCCTCCTCTTTCCTGCCTTCTATCACATCC
TCTTATAAATTACTTTTCCCATCTTTCTTTTTCCCCCTCTTTCCCACCAC
TCACCTTATCTCCCG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 17 16 9 9 9 9 10 9 11 11 10 19 18 13 13 12 23 12 17 12 12 12 22 17 17 10 17 9 9 9 9 10 10 9 9 9 17 17 19
30 16 15 10 10 15 15 19 19 30 28 15 15 19 15 9 10 9 9 9 10 12 15 15 24 24 23 22 28 32 32 33 23 26 15 14 14 19 16 24 18 23 23 34 37 40 40 19 19 12
12 12 19 24 33 39 43 47 32 21 10 8 8 8 19 15 29 29 26 30 32 30 30 31 37 39 47 47 47 47 42 42 35 35 42 44 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
47 50 47 50 50 50 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 59 54 54 54 54 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 44 44 57 44 44 52 43 43 37 30 30 24 24 35 47 47
54 52 52 43 43 32 32 32 38 38 35 44 32 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 44 43 44 44 48 43 43 43 36 36 18 18 13 13 13 32 32 40 43 44 44 37 31 31 20 18
18 32 21 21 30 27 15 15 13 13 17 30 30 43 59 44 32 20 20 20 32 32 42 32 32 32 29 29 20 20 20 31 32 28 34 15 14 12 23 23 36 30 40 36 35 35 32 37 28 28
23 31 24 19 19 20 28 28 28 28 25 34 22 22 20 12 10 10 10 13 13 19 25 30 34 34 28 21 18 11 11 11 13 13 10 12 15 11 11 11 11 11 11 16 12 14 14 15 15 15
13 13 13 12 18 12 12 13 23 15 13 13 22 23 24 14 12 12 12 12 24 24 31 26 23 14 14 10 14 9 8 8 8 8 15 15 28 33 33 25 24 12 12 11 18 18 16 16 14 19
21 22 27 15 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 15 18 13 11 11 11 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10
10 11 11 11 11 11 11 15 11 10 10 10 9 12 8 8 8 8 11 13 15 16 10 10 10 10 11 15 13 9 8 8 8 8 8 8 11 19 11 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 15 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 8 10 10 10 13 9 8 8 8 8 10 15 16 13 10 8 8 6 6 7 12 12 16 16 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 13 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8
13 14 16 11 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 10 8 6 9 9 8 10 10 10 8 8 9 8 8 8 7 7 10 10 10 14 9 10 8 8 8 8 10 11 11 10 9 7 7 6
8 8 8 8 12 8 7 6 8 8 8 8 8 8 11 12 11 11 11 9 10 9 10 13 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 7 6 10 6 6 6 6 8 8 9 11 8 8 8 8
6 7 13 7 9 8 13 13 9 7 7 8 8 9 12 10 10 13 16 15 18 10 10 10 10 | Open.Hide. 7 8 8 8 21 10 8 8 8 8 8 10 9 9 10 15 12 31 39 39 43 39 40 40 40 41 47 35 25 23 9 7 7 8 7 7 8 9 9 10 19 19 37 28 28 22 23 11 11 11
21 21 41 41 36 23 18 18 12 13 15 12 18 17 18 21 18 12 14 24 24 31 36 59 59 59 59 57 57 39 39 32 32 30 32 32 43 43 40 32 20 20 20 31 32 48 54 50 50 54
54 54 54 54 54 54 54 54 54 50 43 43 24 23 20 24 31 44 44 59 57 54 54 54 57 54 54 54 42 42 36 36 36 44 43 32 32 19 18 13 32 32 38 43 37 35 35 50 59 59
50 54 54 54 54 57 57 57 57 52 52 52 57 37 37 37 50 43 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 59 50 57 52 52 52 59 59 57 52 52 52 52 57 43 38 24 13 12
28 38 57 57 57 52 57 57 57 59 57 57 57 59 59 43 35 35 43 43 52 59 44 57 57 38 38 14 14 14 19 34 39 52 57 57 57 57 57 57 57 38 28 15 11 11 12 24 27 42
43 43 36 23 23 36 43 43 39 39 43 43 38 43 28 23 20 36 32 42 35 33 38 27 28 24 24 11 11 11 24 24 35 43 44 31 28 28 32 43 43 52 57 59 54 50 43 41 35 35
35 43 43 43 43 39 43 43 43 43 31 35 24 32 24 35 35 44 32 46 42 42 37 42 42 35 25 25 30 40 27 32 20 20 20 34 32 32 17 17 17 32 30 43 47 44 32 32 19 19
23 26 26 16 13 13 10 10 11 21 26 32 32 39 43 43 47 43 39 40 32 30 21 15 10 14 14 26 19 21 18 13 12 21 27 24 15 10 10 10 10 10 10 11 21 20 18 18 24 23
20 20 15 21 13 13 12 23 10 10 10 17 12 12 13 13 15 26 28 35 32 32 21 19 12 12 12 12 15 16 21 21 13 10 11 13 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 8
8 8 8 8 9 12 10 10 10 14 14 11 11 14 10 10 8 8 6 6 10 8 11 11 11 16 11 12 12 13 16 15 15 10 12 9 9 9 9 11 18 18 13 11 10 10 10 13 11 8
8 8 8 8 8 12 8 10 10 8 8 8 11 9 10 13 14 15 15 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 12 15 12 11 10 10 11 15 16 13 10 10 8 8 8 8 8 8 6
6 11 12 12 6 6 8 8 10 10 13 10 10 10 10 12 19 32 18 18 13 14 14 19 17 17 19 21 17 15 10 10 11 11 8 8 6 6 6 6 15 11 12 10 8 8 8 9 16 17
11 10 10 11 11 11 15 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 11 12 13 13 13 9 8 8 9 10 10
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 10 10 10 8 10 10 10 14 13 8 10 6 6 8 8 8 10 9 9 9 11 15 15 11 11 10 10 9
10 10 9 9 13 17 7 7 6 6 8 8 9 9 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 12 9 9 7 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 8 8 8 8 |