BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-467A08.T7 (MSMg01no467_a08.b1) | MSMg01-467A08.TJ (MSMg01no467_a08.g1) |
ACC | AG550831 | AG550832 |
length | 739 | 773 |
length of high quality (start - end) | 442 (74 - 515) | 340 (75 - 414) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_a08.b1 PHD_FILE: MSMg01no467_a08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:42:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_a08.g1 PHD_FILE: MSMg01no467_a08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:42:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGAATCCGCGGAA
TTCACTTTGTTTTCCATGAAGGCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCT
GCCTCCCGAGTGCTTAAAGATGTATGCCACCACGCCCAGCTGACTATTAG
CATTCTGTCTAAGCTCCACCCCACAGTTACCTAGCAACAGCTGGGTATGC
TCCTCCCCACAGTAACCTGGCAACAGCCAAGTAGGCCTGACCCACTATAA
AAGGGGCTCCTTGCCCCCTCTTTGCTCTCTTGCCCTCTTGGGCTCTTCCC
TTCCCCTTTACCTTCCTGTTCTCTCCATGTGTTCATGCCTGGCCTCTACT
TCTCTACTCTCTTTCTCTGCCTTTCTCTGCCTCTACTACCCTCTTAACTC
CCCTCCCCATGCCCTGAATAAACTCTATTCTATACTATACCGTTGTGTGG
CTGGTTTCTCAGGGGGAAGGGATGCCTTGGCATGTGCCTGCTGAGACATC
CCCTTCCCCCACACCTCACCATACCCCGTAGAATTTATCTCCTCTTTCTT
TATCTTTTCCTAAACTCATCATTGACAGTCTCCTGCCTTCTGTCCCCTTC
TTTTAATGCTGTGTATCATCCCCTATTGCCAGTATTCCCCCATTACCAGG
CTGTTCTCCCCCTAACCCCCCACTAGGTTCTCCTCCATTTCCTTCTGTCT
TATCTTTCCTGCCTTTCAATTATAGCTNTCTTCAATGTN
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTAGGATGCTGCTAGGAGTCATTAA
TAGTTGAGAGTTAAACTGCTGGGAAGCCTGGGAGGACAGGCACAACCCAC
CTGCCTGGGGCTGTGGGCAGCCAGGAAGTCCCATTCATGTTGTACATTAC
CCTCCGAGATGGGCTGTGGGTCTCCCTTCTCTCCCAGGTCATTGTCCCAT
GAAGATGACAGGTGCAGAGTTGAAGAACAGGGTTTGGACGGCCCATGAGT
ATCGACAGTAATAATGACACACTGGAACCAGCTTTGGGGAGACAGATCAA
CTTTACTTGAGTGACTCACAGGTTATATAGTTTTGAGGAAGGGGGATAGG
AATATGCAGGGTGGGCAAAGCTCTTTGGCCCACTGCTAATATATTGTGTT
TGATTGCCGTTCCCTTTTATTATGTTTAGTCGCTTCCCGCTACTCCTTCA
TCCTTTCTCTTCACTATCTCCCCCCTTTTTTCTTCTCTTTTCCTTTTCTA
CCCCTTATCCTTTTCTTTTTTTTCCCCTCTACTTTCCTTTCTTACCCTTT
CTTTTCCCTTACTTTTTTTTCCTCCCCTTTCAATCTTCCCTTCCCTCCCT
CTTTTTTCTCCCCTTATTTCCCCTTTTCCTTTTTTGAAATCTTATCCTTT
TCACCCTCATTCCTCTCTTTCCCTTCCTTTTCAACACTCTTTCTTTTTTT
TTATCATTCTCTACTTTCTTTCG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 10 7 15 23 22 25 27 22 22 22 30 23 17 9 9 10 21 21 41 29 28 24 22 22 19 21 9 9 6 10 8 8 8 6 8 8 8 8 10 13 15 15 12 23 23 31
33 41 39 33 33 30 59 27 30 15 8 9 7 7 6 6 6 8 9 9 9 11 11 19 24 28 37 37 37 33 33 36 36 36 36 53 53 53 57 57 50 50 53 59 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 44 32 30 30 28 42 42 47 41 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 42 42
33 33 41 33 41 42 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 39 34 32 21 21 11 15 13 11 11 11 16 15 27 27 41 25 27 11 11 11 27 27 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57
68 68 68 59 59 47 48 43 46 46 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57
57 68 68 68 68 57 68 57 57 57 48 47 59 47 47 44 44 42 43 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 59 57 54 54 59 59 59 59 59 59 54 59 54 54 54 54 48 40 40
23 23 31 20 20 23 31 34 43 30 23 23 18 28 34 32 32 37 37 28 21 22 19 15 20 28 28 34 25 25 25 16 13 8 8 8 15 15 28 28 34 28 32 20 20 20 32 32 28 32
29 33 33 30 24 24 25 20 24 28 28 25 25 22 26 16 11 8 8 8 8 8 8 8 19 23 15 12 12 11 8 8 8 8 8 10 18 23 10 10 10 10 11 12 17 10 19 17 28 28
33 37 37 39 21 16 13 17 10 10 13 11 8 8 8 8 8 11 19 13 10 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 13 10 10 10 11 11 12 23 22 17 10 10 10 10 10 8 8 8 8
10 10 10 11 10 11 11 9 12 10 11 13 12 12 8 8 8 10 10 9 10 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8
8 8 10 8 8 8 8 10 12 10 10 12 9 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 11 11 11 11 21 12 10 9 10 10 10 15 9 9 10 9 9 9 9 9 10 10 10 9 9 3 0 3 8 8 8 8 8 9 11 12 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 9 15 9 9 9 18 22 24 25 30 30 37 39 39 33 32 37 32 31 37 41 37 25 23 11 9 9 10 10 9 7 9 10 10 18 17 33 31 33 43 37 47 47 39
39 47 41 50 50 50 47 33 27 18 11 11 12 15 12 12 12 15 10 19 19 28 28 28 33 33 36 48 36 36 36 36 36 42 59 57 57 57 57 53 53 53 47 47 53 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 48 48 44 47 47 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 59 54 54 54 59 59 57 57 57 54 54 57 59 59 68 59 57 57 50 50 50 51 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 43 43 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 57 57 52
52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 50 44 43 24 21 14 14 14 27 18 27 36 43 57 57 57 54 59 59 59 68 68 59 59 57 44 50 54 57 57 57 57 57 57 57 59
68 68 68 68 68 59 59 44 44 43 43 43 46 46 57 48 48 48 48 40 44 25 25 44 44 57 57 46 47 41 41 41 44 42 54 54 54 54 57 57 48 46 43 36 36 34 36 36 42 43
43 30 30 17 22 21 26 24 30 30 24 22 17 11 11 10 12 10 10 10 10 8 6 6 11 6 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 8 10 7 9 10 10 11
13 13 6 6 8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 9 9 16 17 11 11 11 8 8 10 11 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 13 16 10 10
10 10 10 11 12 12 11 8 8 8 8 8 9 10 9 9 10 11 11 10 8 8 8 10 12 14 13 12 11 8 8 8 8 8 10 9 9 10 8 10 8 8 10 12 14 13 15 10 8 9
9 9 13 15 13 13 15 8 8 8 8 8 8 15 13 11 11 10 22 24 12 12 8 17 11 12 18 27 23 13 8 8 8 11 10 12 9 10 7 8 8 8 7 8 8 8 8 10 22 11
8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 9 9 10 10 8 9 9 10 8 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 15 15 10 10 9 12 11 11 12 10 8
6 6 8 8 9 10 8 10 12 9 13 11 11 10 10 10 12 19 19 28 13 15 8 8 8 10 9 21 24 19 22 18 13 8 8 8 10 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 10 10 10 16 10 9 9 8 8 13 11 8 8 8 15 17 20 29 17 12 12 12 17 27 28 14 10 10 10 12 7 6 8 8 8 8 8 8 8 10 16 17 15 11 11 12 23 15 15
15 15 11 10 10 10 8 13 13 13 13 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 7 |