BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-474B20.T7 (MSMg01no474_b20.b1) | MSMg01-474B20.TJ (MSMg01no474_b20.g1) |
ACC | AG556253 | AG556254 |
length | 721 | 728 |
length of high quality (start - end) | 629 (74 - 702) | 533 (73 - 605) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_b20.b1 PHD_FILE: MSMg01no474_b20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:52:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no474_b20.g1 PHD_FILE: MSMg01no474_b20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:52:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAACATCCGCGG
AATTCTACTTCTATCACAAGAAAATTCAATCTAAATAGAAAATAGATAAG
TTGTGTATCAGAATTAAAATAACTCAAAGCAAATATTTTCCATATGAAAA
AGTGAAATTTAATGTCAATCTTTCAACATATATGAATATTTCTGGAAAAT
ACAGTACAGGATAATCACCCTACTTTATGTCTAGTATCTACTTCGATGTG
AGTATATACTATGCATGTCTTTTGGGGACTGAATTACTTTACTCAGTATG
ATGTTGTCTATTTTGATTCATTTTTCTGCAAAATTCATGATGCCTTTGCT
TTTAAAAGCTGAATAGCATTTCATTGTGTAAATGAACCACAATTTTTCTA
TCCATTCTTCAATTAAGGGGCAACTTAGTTGTTTCCAGATTTTGGCTAAT
ATGAATAAGGTTGATATGAATATAGGTGAGCAAGATTCTTTGTGGGATGT
TGGGGCATCTTTTGGGTATATGCCAGGAGTGAGAGGTATAGCTGGATTGT
GAAATAGAACTATTCCCAGGTTTCTGAGAAGCAAACAAATTGACTTAGAG
ATTGGTTGTACAAGTTTGTATTTCTATCAGCAATGGAAGACTGTTCCCCT
GCTCCACATCTTCGCCAGCATGTGCTATTCCTTGAGTTTTAATCTTAGCC
ACTCTGATGGGTATAAGATAG
| CGATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGGCTTAATTTAAATATTTTTAGAAAG
ATGGAGTGGCTAAAAGAAAGATTAAGGAGATGGTTTACATTGTTTTGTTA
GAAAGATATAGTACAGTTAGAATTAAGAGCAGAATGTGTCCTCTCCCTTG
TAGAATAGTGACATCTTCTTATGTGAGAAAAGTAGTACAGTAATCCTCCA
TGTGTTTCAAGCATGCAGTTTTAGTTGGAATAGAAAAACAGGCTCAGGAC
AAGTTTATAATTAAAGATTTTATTTCATTCTAGCATGGGTCTGAATTCTT
AGAACTTGTGATCTAGGGATATGGTCACAGGTTTCAATGTAAGCAATGGA
AATTCAGGGTTGTTAATAAATTGTAAATAGTTCTGCTACGAGTATAGTAA
TAGGGGATTGATGATTAGAAGTTTAGCCTAACAAACTTCAAACAATATAA
TGTAGGATAGATGGTGATTTGTTTCTTGGTGAACATAAATTGCCAGCAGC
TAAGCATAGGGAAAAAAAGTGCTACAATACACTGGCTTGTTTAAAGTTTG
TTAATCAGTGTCAAAAAGAATTATTGTTTTGAGCTTACAATGATTTGTTT
GATATAAAGACACATATGATATGTTTAGATAGATATTTGTTTAAAAAGAA
TATATAATCAATAACCATTGTCATTATG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 6 6 6 7 7 13 30 30 28 28 13 13 12 15 10 10 10 16 15 32 32 43 26 25 28 25 23 28 30 12 12 11 16 9 9 6 6 6 6 6 6 10 12 12 25 22 30
30 31 31 37 39 47 47 41 39 25 25 9 9 9 9 9 9 9 9 9 12 17 22 27 23 23 24 33 33 33 48 48 50 53 53 53 53 53 57 42 43 37 37 36 42 43 47 50 50 68
68 68 68 68 68 68 51 47 47 43 43 50 50 68 68 54 54 46 46 46 39 47 57 40 33 24 24 36 44 57 57 57 57 57 68 68 50 51 51 50 50 50 68 68 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50
50 50 57 57 57 57 68 68 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 42 42 42 42 48 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 47 36 34 22 17 17 12 25 8 9 9 10 10 15 20 37 41 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59
59 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 48 48 43 47 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 52 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 59
59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 57 54 54 54 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 47 47 47 47 57 57 57 59 54 54 59 54 54 54 59 57 57 57 59 54 54 54 54 54 54 59
59 59 59 47 47 35 35 35 59 59 57 57 57 57 50 47 39 39 39 37 43 41 50 59 36 34 28 28 25 25 32 37 37 41 59 47 46 48 48 48 53 57 53 59 41 41 30 30 22 25
21 37 25 24 22 22 19 22 24 37 37 37 37 39 43 39 41 40 40 37 37 43 48 48 43 47 30 30 17 26 19 27 27 25 22 29 41 32 32 20 28 28 37 37 59 59 59 41 41 25
17 17 30 26 29 35 39 39 41 41 37 37 18 17 14 16 21 28 37 35 39 39 41 30 28 14 18 21 34 26 29 37 37 30 18 15 12 16 19 21 15 15 17 22 22 34 28 21 17 17
22 22 28 15 17 17 21 20 12 8 9 9 10 13 12 12 12 9 11 11 11 | Open.Hide. 8 8 13 15 10 9 9 8 8 8 8 6 8 9 9 21 19 21 16 9 9 9 21 15 31 37 35 17 25 9 9 6 6 8 8 8 8 11 15 18 17 22 18 20 28 25 15 11 11 23
23 37 37 37 25 23 16 9 9 9 9 9 9 9 9 11 10 10 21 23 29 25 46 39 43 43 44 44 29 19 19 21 23 25 37 37 37 39 44 44 53 53 57 57 57 57 57 57 43 37
37 37 36 42 48 53 53 50 50 68 57 41 34 17 17 27 27 37 33 31 31 29 29 29 44 59 68 50 50 50 50 50 50 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 59 48 42 41 41 41 48 48 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 44 42 35 35
30 42 42 43 43 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 57 50 50 50
53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 23 12 11 12 12 13 12 9 9 9 25 25 39 41 42 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 54 57 59 57 46 43 43 43 46 46 57 57 57 59 68 68 50
50 48 48 48 48 48 48 48 50 50 57 57 57 57 48 48 48 48 50 50 59 50 47 47 44 59 44 37 37 44 41 41 41 40 34 32 23 23 23 34 34 39 39 35 35 35 47 47 59 57
40 40 28 25 25 30 43 33 43 43 59 43 43 43 36 39 34 37 34 34 28 28 21 27 15 15 15 30 27 33 33 28 29 22 20 20 18 22 25 31 31 39 31 27 32 30 24 27 28 28
25 29 24 18 19 14 10 8 8 8 10 9 17 17 18 23 22 24 26 20 23 28 28 23 18 10 10 10 22 23 36 28 23 23 23 28 24 10 10 10 15 14 10 9 9 9 10 9 9 10
11 9 8 11 11 11 15 15 11 6 6 6 8 8 12 20 15 17 10 9 9 10 10 14 14 23 11 10 10 10 15 19 14 15 13 19 15 15 10 17 16 11 10 6 6 8 8 8 9 9
8 8 8 13 8 7 10 10 10 10 10 12 12 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 |