BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-014J24
Chromosome12 (Build37)
Map Location 12,614,058 - 12,714,977
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC217390, LOC628327, LOC627110, LOC100043209, D12Ertd553e
Downstream geneLOC100043215, Mycn, EG668473, LOC628449, Ddx1, LOC627199, LOC627189, LOC100043243, LOC100042396
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-014J24.bB6Ng01-014J24.g
ACCDH849115DH849116
length1,1491,034
definitionDH849115|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014J24, 5' end.DH849116|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014J24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,614,058 - 12,615,229)(12,713,944 - 12,714,977)
sequence
gaattcactgagtcaaatttctgttatatgagctctccttcaaggtcagt
gtaccacaaaatagttattctgcctctgtagtcttcctcctggcttaatt
gtgaaaatgaacattagacaaatcccaagaaagttttctacaaaatacta
gattggaattccccaaactgacaaggtgagtaatagcaaggaccctcgga
ggcaggacaacgaagtgagacatggcatccaggatgagatgatcatgtat
aacaaagaaaatcagaaaaaaaacatgtgcttcagctggttaacaatgag
ccaatgctcatttctcaatcatagcatatatactgtgatgtgagaggcta
tgagagtaggccctgggttgtcatagtggcctctctaggaatctaaatct
gttcttaaatcgtaaagtatgttagaggtgcgtatgcttggcatataagc
agaaagatgtgacttcggatctccagtacctgtgtgcaggccctttctgt
aaccccagcagcaagatagtcaaacaggcagatccctggaactctgcagc
cagccatttcagaggacctgataagctccaggttcagtgagagactctca
gaaattcaagtggaggaaagcaatgtgaagcagtcagaacagctctgggg
actacaaaagcccagcgttactgcatccttcaatgtccttcttcctcctt
cctgtgtcccaaagaaaggggatgtcgaagggaatagagccaaggtgaag
gaaagggtcacagagaagatccacacagttatttgttatatctttccccc
cataactgtagccctagcctggaaaatcccctgcaaagaggggagaaaat
atatccaaagggcaagtgatgctggcaagcttgggaacaaccctgtagaa
aatgcaaatgcagacggcacagagagctgacgatgcagagccgaatgtga
gcatgcatttttgataactgtgtgcttctggggactgcacaagtatggga
atactattatatcaagctttagaaaaatgcagattcgtttctcatagtaa
ttataaggagctagtggttagccacagcacttcattattaggagaaggcc
atgtgtcactcacacgaaggtctcaagctgatattcggagaaacctttt
gaattctccatgggctcgctgggcctcctctgtcctgacccagtctagct
cggaaggtatgagagttgagagccatttattcagctgctacatgtgaata
ttctccatgtttaggccttacgtcttgctcagtgctgggccctacagatg
aatgtggtcttgcttcttgaacaaactaacagctcttattgatgcaaaat
cctgtcttgaggctggatagatggcttactgtacaaagcttttgaaacac
aaatgtgaagttggatctctagtactcagataaatgctgagcgggcatga
cagcccacctgtaatcccatcattttcgaggaagagagcttctggtctct
ggagcaaactggctatccagaaaattgtctttaccaaatcagacaattgt
ccctgcaattagactgatcaggtaattacatccaagccaggatactgtga
gggagaatgattagggactcataataaccatgccatgaaacaggtatgag
ttaggccacttcccatcatgtgagaatgcaggttctcaggctacactgca
tctcctggtgttgggctggccgttgaatgtgcatattagtatgagcatca
gtacactgatgctcagagcccatctactgccatatcttatggaactcttt
tctggtcctctttatcctggggacatgtctgagttctccatgggttctct
aggactcctttgtcctgatatgttggaggctggaaggaatgagaggtgag
gtcttgctgggggtagaaggctaaaagtcctaaatgtctcctaaggacac
ggaagtctaatttagttgagattccattaagtgtgaagaaatgggaagat
acccatgttcagggtggcctcaatggtgaaaggatgggctttggaagtca
agatgaaagcaatttggaaacatacccaggaccacatgtttctatgctgg
agagatggcccctgtagtacagcatcattactctgtcgaggacctggatt
cggtccaggtaccgacttgatgacttgttactcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_12614058_12615229
seq2: B6Ng01-014J24.b_48_1196

seq1  GAATTCACTGAGTCAAATTTCTGTTATATGAGCTCTCCTTCAAGGTCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGAGTCAAATTTCTGTTATATGAGCTCTCCTTCAAGGTCAGT  50

seq1  GTACCACAAAATAGTTATTCTGCCTCTGTAGTCTTCCTCCTGGCTTAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCACAAAATAGTTATTCTGCCTCTGTAGTCTTCCTCCTGGCTTAATT  100

seq1  GTGAAAATGAACATTAGACAAATCCCAAGAAAGTTTTCTACAAAATACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAATGAACATTAGACAAATCCCAAGAAAGTTTTCTACAAAATACTA  150

seq1  GATTGGAATTCCCCAAACTGACAAGGTGAGTAATAGCAAGGACCCTCGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGGAATTCCCCAAACTGACAAGGTGAGTAATAGCAAGGACCCTCGGA  200

seq1  GGCAGGACAACGAAGTGAGACATGGCATCCAGGATGAGATGATCATGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGACAACGAAGTGAGACATGGCATCCAGGATGAGATGATCATGTAT  250

seq1  AACAAAGAAAATCAGAAAAAAAACATGTGCTTCAGCTGGTTAACAATGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGAAAATCAGAAAAAAAACATGTGCTTCAGCTGGTTAACAATGAG  300

seq1  CCAATGCTCATTTCTCAATCATAGCATATATACTGTGATGTGAGAGGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTCATTTCTCAATCATAGCATATATACTGTGATGTGAGAGGCTA  350

seq1  TGAGAGTAGGCCCTGGGTTGTCATAGTGGCCTCTCTAGGAATCTAAATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGTAGGCCCTGGGTTGTCATAGTGGCCTCTCTAGGAATCTAAATCT  400

seq1  GTTCTTAAATCGTAAAGTATGTTAGAGGTGCGTATGCTTGGCATATAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTAAATCGTAAAGTATGTTAGAGGTGCGTATGCTTGGCATATAAGC  450

seq1  AGAAAGATGTGACTTCGGATCTCCAGTACCTGTGTGCAGGCCCTTTCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGATGTGACTTCGGATCTCCAGTACCTGTGTGCAGGCCCTTTCTGT  500

seq1  AACCCCAGCAGCAAGATAGTCAAACAGGCAGATCCCTGGAACTCTGCAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCAGCAGCAAGATAGTCAAACAGGCAGATCCCTGGAACTCTGCAGC  550

seq1  CAGCCATTTCAGAGGACCTGATAAGCTCCAGGTTCAGTGAGAGACTCTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATTTCAGAGGACCTGATAAGCTCCAGGTTCAGTGAGAGACTCTCA  600

seq1  GAAATTCAAGTGGAGGAAAGCAATGTGAAGCAGTCAGAACAGCTCTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTCAAGTGGAGGAAAGCAATGTGAAGCAGTCAGAACAGCTCTGGGG  650

seq1  ACTACAAAAGCCCAGCGTTACTGCATCCTTCAATGTCCTTCTTCCTCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAAAAGCCCAGCGTTACTGCATCCTTCAATGTCCTTCTTCCTCCTT  700

seq1  CCTGTGTCCCAAAGAAAGGGGATGTCGAAGGGAATAGAGCCAAGGTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTCCCAAAGAAAGGGGATGTCGAAGGGAATAGAGCCAAGGTGAAG  750

seq1  G-AAGGGTCACAGAGAAGATCCACACAGTTATTTGTTATATCTTTCCCCC  799
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGTCACAGAGAAGATCCACACAGTTATTTGTTATATCTTTCCCCC  800

seq1  CATAACTGTAGCCCTAGCCTGGAAAATCCCCTGCAAAGAGGGGAGAAAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTGTAGCCCTAGCCTGGAAAATCCCCTGCAAAGAGGGGAGAAAAT  850

seq1  ATATCCAAAGGGCAAGTGATGCTGGCAAGCTTGGGAACAACCCTGTAGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCAAAGGGCAAGTGATGCTGGCAAGCTTGGGAACAACCCTGTAGAA  900

seq1  AATGCAAATGCAGACGGGCACAGAGAGCTGACGATGCAGAAGCCGAATGT  949
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATGCAAATGCAGAC-GGCACAGAGAGCTGACGATGCAG-AGCCGAATGT  948

seq1  GAGGCATGCATTTTTGATAACTGTGTGCTTCTGGGGACTGCAC-AGTAT-  997
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
seq2  GA-GCATGCATTTTTGATAACTGTGTGCTTCTGGGGACTGCACAAGTATG  997

seq1  GGAATACTATTTATATCAAGCTTTAGAAAAATGCAGAATTTTGTTT-TCC  1046
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| || 
seq2  GGAATACTA-TTATATCAAGCTTTAGAAAAATGCAGA--TTCGTTTCTCA  1044

seq1  TTTTATTTATTTATTTTTTTAAAGGAGCTATGTGGTTAGCACACAGCACA  1096
      |  || ||||           ||||||||| ||||||||| |||||  ||
seq2  TAGTAATTAT-----------AAGGAGCTA-GTGGTTAGC-CACAG--CA  1079

seq1  CTTCATTATTTGGGAGGAAGGCGCATGTGTCACTCACA-GAATGTCTCCC  1145
      |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |
seq2  CTTCATTATTAGG--AGAAGGC-CATGTGTCACTCACACGAAGGTCT--C  1124

seq1  AAGCTGATATTGGGGAGAAACTCTTTT  1172
      |||||||||||  |||||||| |||||
seq2  AAGCTGATATT-CGGAGAAAC-CTTTT  1149

seq1: chr12_12713944_12714977
seq2: B6Ng01-014J24.g_67_1100 (reverse)

seq1  GGAGTTACAAGTCATCAAGTTGGGTACTAGGAACTGAATCCAGGTCCTCT  50
      ||||| ||||||||||||| | |||||  || || |||||||||||||| 
seq2  GGAGTAACAAGTCATCAAG-TCGGTACCTGG-ACCGAATCCAGGTCCTC-  47

seq1  GCAAGAGTAACTGATGCTTGTACT-CAGGGGCCATCTCTCCAGCCTAAGA  99
      |  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||
seq2  GACAGAGTAA-TGATGC-TGTACTACAGGGGCCATCTCTCCAGCAT-AGA  94

seq1  AACATGTGTTCCTGGTCTTGTTTCCAAACTGC-TTCCTCTTGACTTCCAA  148
      |||||||| ||||||   |||||||||| ||| ||| |||||||||||||
seq2  AACATGTGGTCCTGGGTATGTTTCCAAATTGCTTTCATCTTGACTTCCAA  144

seq1  AGCCCATCCTTCCACCACTGA-GCCACCCTG-ACATGGGTATCTTCC--A  194
      ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   
seq2  AGCCCATCCTTTCACCATTGAGGCCACCCTGAACATGGGTATCTTCCCAT  194

seq1  TTCTTCACACTTAATGGAATCTCAACTAAATTAGACTTCCGTGTCCTTAG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCACACTTAATGGAATCTCAACTAAATTAGACTTCCGTGTCCTTAG  244

seq1  GAGACATTTAGGACTTTTAGCCTTCTACCCCCAGCAAGACCTCACCTCTC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATTTAGGACTTTTAGCCTTCTACCCCCAGCAAGACCTCACCTCTC  294

seq1  ATTCCTTCCAGCCTCCAACATATCAGGACAAAGGAGTCCTAGAGAACCCA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTCCAGCCTCCAACATATCAGGACAAAGGAGTCCTAGAGAACCCA  344

seq1  TGGAGAACTCAGACATGTCCCCAGGATAAAGAGGACCAGAAAAGAGTTCC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAACTCAGACATGTCCCCAGGATAAAGAGGACCAGAAAAGAGTTCC  394

seq1  ATAAGATATGGCAGTAGATGGGCTCTGAGCATCAGTGTACTGATGCTCAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATATGGCAGTAGATGGGCTCTGAGCATCAGTGTACTGATGCTCAT  444

seq1  ACTAATATGCACATTCAACGGCCAGCCCAACACCAGGAGATGCAGTGTAG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATATGCACATTCAACGGCCAGCCCAACACCAGGAGATGCAGTGTAG  494

seq1  CCTGAGAACCTGCATTCTCACATGATGGGAAGTGGCCTAACTCATACCTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGAACCTGCATTCTCACATGATGGGAAGTGGCCTAACTCATACCTG  544

seq1  TTTCATGGCATGGTTATTATGAGTCCCTAATCATTCTCCCTCACAGTATC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGGCATGGTTATTATGAGTCCCTAATCATTCTCCCTCACAGTATC  594

seq1  CTGGCTTGGATGTAATTACCTGATCAGTCTAATTGCAGGGACAATTGTCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTGGATGTAATTACCTGATCAGTCTAATTGCAGGGACAATTGTCT  644

seq1  GATTTGGTAAAGACAATTTTCTGGATAGCCAGTTTGCTCCAGAGACCAGA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGTAAAGACAATTTTCTGGATAGCCAGTTTGCTCCAGAGACCAGA  694

seq1  AGCTCTCTTCCTCGAAAATGATGGGATTACAGGTGGGCTGTCATGCCCGC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTCTTCCTCGAAAATGATGGGATTACAGGTGGGCTGTCATGCCCGC  744

seq1  TCAGCATTTATCTGAGTACTAGAGATCCAACTTCACATTTGTGTTTCAAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATTTATCTGAGTACTAGAGATCCAACTTCACATTTGTGTTTCAAA  794

seq1  AGCTTTGTACAGTAAGCCATCTATCCAGCCTCAAGACAGGATTTTGCATC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTGTACAGTAAGCCATCTATCCAGCCTCAAGACAGGATTTTGCATC  844

seq1  AATAAGAGCTGTTAGTTTGTTCAAGAAGCAAGACCACATTCATCTGTAGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGAGCTGTTAGTTTGTTCAAGAAGCAAGACCACATTCATCTGTAGG  894

seq1  GCCCAGCACTGAGCAAGACGTAAGGCCTAAACATGGAGAATATTCACATG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGCACTGAGCAAGACGTAAGGCCTAAACATGGAGAATATTCACATG  944

seq1  TAGCAGCTGAATAAATGGCTCTCAACTCTCATACCTTCCGAGCTAGACTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGCTGAATAAATGGCTCTCAACTCTCATACCTTCCGAGCTAGACTG  994

seq1  GGTCAGGACAGAGGAGGCCCAGCGAGCCCATGGAGAATTC  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGGACAGAGGAGGCCCAGCGAGCCCATGGAGAATTC  1034