BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024A11
Chromosome12 (Build37)
Map Location 67,661,381 - 67,792,250
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMdga2
Upstream geneLOC100040700, EG238217
Downstream geneLOC100040745
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024A11.bB6Ng01-024A11.g
ACCDH855783DH855784
length842960
definitionDH855783|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024A11, 5' end.DH855784|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024A11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,661,381 - 67,662,110)(67,791,290 - 67,792,250)
sequence
cggggggagtagggatccctgcggaattcttgcatcaggtaaggggcagg
gccagctctctgatgctgatgacatatgggcaagctctctttcttgctgt
agatggcaaggcatgagtggggttgggggacatctctcccactcctatgt
cactgaatggcagacaagtggcagggccacctctcttatgcttgtatcct
tgggacagctcacggttagggaactcctacagtgtgctgcgctctcactc
ttctgagtactgcagctaggcaggccagctttcccaagatgcccaggtga
ggggtggggccggttctatacagccctcagatatcaccaggtctccatag
taacacaagggcatctgcctggcctttggtggtaactgcccactgctgct
tcagggccataaacccagacatagtcctccagggcagcataagccaggac
tccaccatggtcccaggtggcatcaccggctactaacatcaggctgttcc
tcactaccctcgagtttcagttctgcctgtattcattgtgcccacatcct
tctgtttctctttctcttcccctttcccaccacttacttgatcctctgag
tggtgctcagggtctttgagtgtctgggatcatctcaggagtggtctcat
gagtacgttatggtactggactgaggtcatcttgagcatggtttgaactc
ccaggcacgtgcaatgcaagtctggtggtcacctcaggctagttccctgt
catagcccccgtggcacccacctgttggtcatctcagtcttgttcttatg
ggcttgtctgcatggtcttattgcaagggttttctctccaat
gaattctcttgtttttcattttgcatagtttcgtacagaaaactcaccct
cctccaataagccttttgtataaaagaatactcttctatgtaatggaaac
ttgttgtttctatagtcctaatatacatccttaaactttgacttggtttc
ttttcatacaatttaaatgtggtgtaaaacacattaaacacggcttgata
agcattgggatttctaaaatactagtccaagaaaattcgaggtttatgct
ctttatacgaggatttcatttgcatcttgatggtggtatattaatcagta
aggtcaatacatattttataagatttaattggtagcatcttctagtcatt
agtttaatatttaataattccttgatacactttgttttctccccaactgt
ggtgactttcacatatcacctttaatatgtgtgtttcccaaaatcttttt
aataataaatctttataatttaatgctagaacatcagaggagctgatgtt
gtgacattttgaaaatttccatgctattttaatgatgttataagagtcag
caagcaacacggatgtttgaaaatgtcaaagagactccctccccccatga
atcctcatcacagagctgttgccctatcttcccttgttttcatttttaaa
gatagatggattttattaaaacacacaatttaataagtttgaattctaag
ctgcagctctaagctgagcttaataatttttaaattaatgcagttacatg
aatttgaaaacattaatctctctatatatactatacatatataatacata
tgtacataatacattcatgtatattaacatgtgatatttaaaagaaatga
aaaattgaagtcaaatataataacatatactatgtatataatatatatgc
tctaaatatatactatgtagagtatatatgtaatacatatgtatatatgt
atatggatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_67661381_67662110
seq2: B6Ng01-024A11.b_113_842

seq1  ATGAGTGGGGTTGGGGGACATCTCTCCCACTCCTATGTCACTGAATGGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTGGGGTTGGGGGACATCTCTCCCACTCCTATGTCACTGAATGGCA  50

seq1  GACAAGTGGCAGGGCCACCTCTCTTATGCTTGTATCCTTGGGACAGCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGTGGCAGGGCCACCTCTCTTATGCTTGTATCCTTGGGACAGCTCA  100

seq1  CGGTTAGGGAACTCCTACAGTGTGCTGCGCTCTCACTCTTCTGAGTACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTTAGGGAACTCCTACAGTGTGCTGCGCTCTCACTCTTCTGAGTACTG  150

seq1  CAGCTAGGCAGGCCAGCTTTCCCAAGATGCCCAGGTGAGGGGTGGGGCCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAGGCAGGCCAGCTTTCCCAAGATGCCCAGGTGAGGGGTGGGGCCG  200

seq1  GTTCTATACAGCCCTCAGATATCACCAGGTCTCCATAGTAACACAAGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTATACAGCCCTCAGATATCACCAGGTCTCCATAGTAACACAAGGGC  250

seq1  ATCTGCCTGGCCTTTGGTGGTAACTGCCCACTGCTGCTTCAGGGCCATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCCTGGCCTTTGGTGGTAACTGCCCACTGCTGCTTCAGGGCCATAA  300

seq1  ACCCAGACATAGTCCTCCAGGGCAGCATAAGCCAGGACTCCACCATGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGACATAGTCCTCCAGGGCAGCATAAGCCAGGACTCCACCATGGTC  350

seq1  CCAGGTGGCATCACCGGCTACTAACATCAGGCTGTTCCTCACTACCCTCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTGGCATCACCGGCTACTAACATCAGGCTGTTCCTCACTACCCTCG  400

seq1  AGTTTCAGTTCTGCCTGTATTCATTGTGCCCACATCCTTCTGTTTCTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCAGTTCTGCCTGTATTCATTGTGCCCACATCCTTCTGTTTCTCTT  450

seq1  TCTCTTCCCCTTTCCCACCACTTACTTGATCCTCTGAGTGGTGCTCAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCCCCTTTCCCACCACTTACTTGATCCTCTGAGTGGTGCTCAGGG  500

seq1  TCTTTGAGTGTCTGGGATCATCTCAGGAGTGGTCTCAGGAGTACGTTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCTTTGAGTGTCTGGGATCATCTCAGGAGTGGTCTCATGAGTACGTTATG  550

seq1  GCACTGGACTGAGGTCATCTTGAGCATGGTCTGAACTCCCAGGCACGTGC  600
      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GTACTGGACTGAGGTCATCTTGAGCATGGTTTGAACTCCCAGGCACGTGC  600

seq1  AATGCAAGTCTGGTGGTCACCTCAGGCTAGTTCCCTGTCAGAGCCCCCGT  650
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AATGCAAGTCTGGTGGTCACCTCAGGCTAGTTCCCTGTCATAGCCCCCGT  650

seq1  GGCACCCACCTGTTGGTCATCTCAGTCTTGTTCTTATGGGCCTGTCTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGCACCCACCTGTTGGTCATCTCAGTCTTGTTCTTATGGGCTTGTCTGCA  700

seq1  TGGCCTTATTGCAAGGGTTTTCTCTCCAAT  730
      ||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTTATTGCAAGGGTTTTCTCTCCAAT  730

seq1: chr12_67791290_67792250
seq2: B6Ng01-024A11.g_67_1026 (reverse)

seq1  ATATACATATACATATATTACATATGTATTACATATATACTCTACATAGT  50
      |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCATATACATATA-TACATATGTATTACATATATACTCTACATAGT  49

seq1  ATATATTTAGAGCATATATATTATATACATAGTATATGTTATTATATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTTAGAGCATATATATTATATACATAGTATATGTTATTATATTTG  99

seq1  ACTTCAATTTTTCATTTCTTTTAAATATCACATGTTAATATACATGAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAATTTTTCATTTCTTTTAAATATCACATGTTAATATACATGAATG  149

seq1  TATTATGTACATATGTATTATATATGTATAGTATATATAGAGAGATTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATGTACATATGTATTATATATGTATAGTATATATAGAGAGATTAAT  199

seq1  GTTTTCAAATTCATGTAACTGCATTAATTTAAAAATTATTAAGCTCAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAAATTCATGTAACTGCATTAATTTAAAAATTATTAAGCTCAGCT  249

seq1  TAGAGCTGCAGCTTAGAATTCAAACTTATTAAATTGTGTGTTTTAATAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTGCAGCTTAGAATTCAAACTTATTAAATTGTGTGTTTTAATAAA  299

seq1  ATCCATCTATCTTTAAAAATGAAAACAAGGGAAGATAGGGCAACAGCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCTATCTTTAAAAATGAAAACAAGGGAAGATAGGGCAACAGCTCT  349

seq1  GTGATGAGGATTCATGGGGGGAGGGAGTCTCTTTGACATTTTCAAACATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGAGGATTCATGGGGGGAGGGAGTCTCTTTGACATTTTCAAACATC  399

seq1  CGTGTTGCTTGCTGACTCTTATAACATCATTAAAATAGCATGGAAATTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTTGCTTGCTGACTCTTATAACATCATTAAAATAGCATGGAAATTTT  449

seq1  CAAAATGTCACAACATCAGCTCCTCTGATGTTCTAGCATTAAATTATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGTCACAACATCAGCTCCTCTGATGTTCTAGCATTAAATTATAAA  499

seq1  GATTTATTATTAAAAAGATTTTGGGAAACACACATATTAAAGGTGATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATTATTAAAAAGATTTTGGGAAACACACATATTAAAGGTGATATG  549

seq1  TGAAAGTCACCACAGTTGGGGAGAAAACAAAGTGTATCAAGGAATTATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTCACCACAGTTGGGGAGAAAACAAAGTGTATCAAGGAATTATTA  599

seq1  AATATTAAACTAATGACTAGAAGATGCTACCAATTAAATCTTATAAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAAACTAATGACTAGAAGATGCTACCAATTAAATCTTATAAAATA  649

seq1  TGTATTGACCTTACTGATTAATATACCACCATCAAGATGCAAATGAAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTGACCTTACTGATTAATATACCACCATCAAGATGCAAATGAAATC  699

seq1  CTCGTATAAAGAGCATAAACCTCGAATTTTCTTGGACTAGTATTTTAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGTATAAAGAGCATAAACCTCGAATTTTCTTGGACTAGTATTTTAGAA  749

seq1  ATCCCAATGCTTATCAAGCCGTGTTTAATGTGTTTTACACCACATTTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAATGCTTATCAAGCCGTGTTTAATGTGTTTTACACCACATTTAAA  799

seq1  TTGTATGAAAAGAAACCAAGTCAAAGTTTAAGGATGTATATTAGGACTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATGAAAAGAAACCAAGTCAAAGTTTAAGGATGTATATTAGGACTAT  849

seq1  AGAAACAACAAGTTTCCATTACATAGAAGAGTATTCTTTTATACAAAAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACAACAAGTTTCCATTACATAGAAGAGTATTCTTTTATACAAAAGG  899

seq1  CTTATTGGAGGAGGGTGAGTTTTCTGTACGAAACTATGCAAAATGAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTGGAGGAGGGTGAGTTTTCTGTACGAAACTATGCAAAATGAAAAA  949

seq1  CAAGAGAATTC  961
      |||||||||||
seq2  CAAGAGAATTC  960