BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026O14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 84,164,451 - 84,265,432
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRgs6
Upstream geneSipa1l1, LOC432675, EG666911
Downstream geneDpf3, Wdr21, Zfyve1, LOC626950, Rbm25, Psen1, Papln, Numb, LOC100042325
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026O14.bB6Ng01-026O14.g
ACCDH857803DH857804
length975989
definitionDH857803|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026O14, 5' end.DH857804|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026O14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,164,451 - 84,165,432)(84,264,448 - 84,265,432)
sequence
gaattcatctttatgcaagcagaagcacaagtgaagtaggtgaacactgc
agaagcctctgggagagaaaactctctaggtgtctagagatgctgtgagg
gtgtgggggcccaaagtgaagtttccagctaatttaatctctcccattcc
ctgggagaaactaaatgagtaggaagatcttgatgaacaggtttcatgtc
tggaaccaaggtcttgctgggacaatttcatcacacaaggaggatccttc
caattgcagagctaaaagatgtacccatttgtccaagagatttccataag
acttccaggataagagcctggaaaatgccaagccaggttcattagagatc
ttgatttcataggttggcatgttgaaacttaatcgcctttttcaaccttg
tggcagaagcaacctaggggaagaaaggttcatttgggcaaatggtttgt
ggaggcttcaatgtaccatgggagaggggtgtgtgtgagatgctacttgc
attacagagtatcaggaagccaagattgctagactggaattgggcctggg
ctatccctccaagagcctgcccccagtgaccctctaccactacccagacc
ccaccacttaaggacttcacattctccccaaacagttccaatagctgggg
ccaggtgctcaaactcagaagaacagataggttaactctcaccatcttcc
atataggagcaaagcttaaaactaatggaaaaataatgcatagagtttag
gcttctgggttcacttgctgaagccacgttgtgaagcatgaagagctatg
tatttcctgcgcagaggtgggtgtctatgggatccctctgccagggcaga
gctgactcctgtaagcttacctcgagatagatattctgagctcagctaac
ctagaagacagtgtgagcttcaatctaccaaaagttaatcattctcctcc
acggtggacacgagggggaagagga
gaattcagaatccagagcccaaggaagactctatgcagcctgtaggacaa
atgtgactatcaatgatggagatgtggtctcctctgtttctgcctccatc
ggggtctgaggggggagaaccctcctcaatggccaaccactccgttgcta
tggaggcacactgctgggtatccaccaaggtcatcccagtggcacaggga
ggaaaccaggcattcacttggagaagacagcaagcagtttgtgttagtca
cagagatagctgcctgcccgggccaacaagacccatagcctctggactgg
tgggaaggagtggcaccccaggccacaggggcacaggggacagttcccaa
atccatctcagatgtggtacttaacaccagagactatttcgggagcatct
gccatgtgccaggttcaggctcagttgttcacattagtttccacgctctt
cttctgggaagcaaatgtttagtcattgcagtcaggagctgttccctggt
ttgttggctgaagcaagccagaactgggcagtccaggctaaaacaggagg
agtgtgccaaacagagaactctgcccagctaagctcctcccacccccacc
ccctttatgttaaccagactctgacatctccacgactgtgtggcctatcc
ctcacggtgcagagtcaaggacatcccataacctccactctgggtacaaa
cactcgggatgaagaaagatgtgaccaacagctgcaggcactcacagtgc
cacctaaggagcccagagtttctggggagggagggacatgctgtgtagag
ctttgtgatcccaggaagggacatatctgaagaacacctggctttgaggc
tgtcacataccgagagacgtttctaggatagagcctccaagggcatcctg
gaggctgggaccagtgaacacggaaagcttgcacaaagggaagaatagtc
ttctgcccgtaggtcaaggtgtggaggaagtaaatgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_84164451_84165432
seq2: B6Ng01-026O14.b_49_1023

seq1  GAATTCATCTTTATGCAAGCAGAAGCACAAGTGAAGTAGGTGAACACTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTTATGCAAGCAGAAGCACAAGTGAAGTAGGTGAACACTGC  50

seq1  AGAAGCCTCTGGGAGAGAAAACTCTCTAGGTGTCTAGAGATGCTGTGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCTCTGGGAGAGAAAACTCTCTAGGTGTCTAGAGATGCTGTGAGG  100

seq1  GTGTGGGGGCCCAAAGTGAAGTTTCCAGCTAATTTAATCTCTCCCATTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGGGGCCCAAAGTGAAGTTTCCAGCTAATTTAATCTCTCCCATTCC  150

seq1  CTGGGAGAAACTAAATGAGTAGGAAGATCTTGATGAACAGGTTTCATGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAGAAACTAAATGAGTAGGAAGATCTTGATGAACAGGTTTCATGTC  200

seq1  TGGAACCAAGGTCTTGCTGGGACAATTTCATCACACAAGGAGGATCCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACCAAGGTCTTGCTGGGACAATTTCATCACACAAGGAGGATCCTTC  250

seq1  CAATTGCAGAGCTAAAAGATGTACCCATTTGTCCAAGAGATTTCCATAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGCAGAGCTAAAAGATGTACCCATTTGTCCAAGAGATTTCCATAAG  300

seq1  ACTTCCAGGATAAGAGCCTGGAAAATGCCAAGCCAGGTTCATTAGAGATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCAGGATAAGAGCCTGGAAAATGCCAAGCCAGGTTCATTAGAGATC  350

seq1  TTGATTTCATAGGTTGGCATGTTGAAACTTAATCGCCTTTTTCAACCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTCATAGGTTGGCATGTTGAAACTTAATCGCCTTTTTCAACCTTG  400

seq1  TGGCAGAAGCAACCTAGGGGAAGAAAGGTTCATTTGGGCAAATGGTTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGAAGCAACCTAGGGGAAGAAAGGTTCATTTGGGCAAATGGTTTGT  450

seq1  GGAGGCTTCAATGTACCATGGGAGAGGGGTGTGTGTGAGATGCTACTTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTTCAATGTACCATGGGAGAGGGGTGTGTGTGAGATGCTACTTGC  500

seq1  ATTACAGAGTATCAGGAAGCCAAGATTGCTAGACTGGAATTGGGCCTGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGAGTATCAGGAAGCCAAGATTGCTAGACTGGAATTGGGCCTGGG  550

seq1  CTATCCCTCCAAGAGCCTGCCCCCAGTGACCCTCTACCACTACCCAGACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCCTCCAAGAGCCTGCCCCCAGTGACCCTCTACCACTACCCAGACC  600

seq1  CCACCACTTAAGGACTTCACATTCTCCCCAAACAGTTCCAATAGCTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACTTAAGGACTTCACATTCTCCCCAAACAGTTCCAATAGCTGGGG  650

seq1  CCAGGTGCTCAAACTCAGAAGAACAGATAGGTTAACTCTCACCATCTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTGCTCAAACTCAGAAGAACAGATAGGTTAACTCTCACCATCTTCC  700

seq1  ATATAGGAGCAAAGCTTAAAACTAATGGAAAAATAATGCATAGAGTTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGGAGCAAAGCTTAAAACTAATGGAAAAATAATGCATAGAGTTTAG  750

seq1  GCTTCTGGGTTCACTTGCTGAAGCCACGTTGTGAAGCATGAAGAGCTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGGGTTCACTTGCTGAAGCCACGTTGTGAAGCATGAAGAGCTATG  800

seq1  TATTTCCTGCGCAGAGGTGGGTGTCTATGGGATCCCTCTGCCAGGGCAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCTGCGCAGAGGTGGGTGTCTATGGGATCCCTCTGCCAGGGCAGA  850

seq1  GCTGACTCCTGTAAGCTTACCTCGGAGAATAGATATTCTGAGCTCAGGCT  900
      ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||
seq2  GCTGACTCCTGTAAGCTTACCTC-GAG-ATAGATATTCTGAGCTCA-GCT  897

seq1  AACCTAGAAAGACCAGTGTGAGCTTCCAATCTACCAAAAGGTTAGATCAT  950
      ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||
seq2  AACCTAG-AAGA-CAGTGTGAGCTT-CAATCTACCAAAA-GTTA-ATCAT  942

seq1  TCATCTTCCACGGTGGACACGAGGGGG--GAGGA  982
      || || |||||||||||||||||||||  |||||
seq2  TC-TCCTCCACGGTGGACACGAGGGGGAAGAGGA  975

seq1: chr12_84264448_84265432
seq2: B6Ng01-026O14.g_69_1048 (reverse)

seq1  CTTCCTCACAACCTTTGACCTAACGGGCAGGAGGCTATTCTTCCCTTGGT  50
      ||||||| ||  | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||
seq2  CTTCCTC-CACACCTTGACCT-ACGGGCAGAAGACTATTCTTCCCTTTGT  48

seq1  GCAAGCTTTCCGTTGTTCACTGGTCCCAGCCTCCAGGATGCCCTTGGAGG  100
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCTTTCCG-TGTTCACTGGTCCCAGCCTCCAGGATGCCCTTGGAGG  97

seq1  CTCTAATCCTAGAAACGTCTCTCGGTATGTGACAGCCTTCAAAGCCAGGT  150
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTCT-ATCCTAGAAACGTCTCTCGGTATGTGACAGCC-TCAAAGCCAGGT  145

seq1  GTTCTTCAGATATGTCCCTTCCTGGGATCACAAAGCTCTACACAGCATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTCAGATATGTCCCTTCCTGGGATCACAAAGCTCTACACAGCATGT  195

seq1  CCCTCCCTCCCCAGAAACTCTGGGCTCCTTAGGTGGCACTGTGAGTGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCTCCCCAGAAACTCTGGGCTCCTTAGGTGGCACTGTGAGTGCCT  245

seq1  GCAGCTGTTGGTCACATCTTTCTTCATCCCGAGTGTTTGTACCCAGAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGTTGGTCACATCTTTCTTCATCCCGAGTGTTTGTACCCAGAGTG  295

seq1  GAGGTTATGGGATGTCCTTGACTCTGCACCGTGAGGGATAGGCCACACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTATGGGATGTCCTTGACTCTGCACCGTGAGGGATAGGCCACACAG  345

seq1  TCGTGGAGATGTCAGAGTCTGGTTAACATAAAGGGGGTGGGGGTGGGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGGAGATGTCAGAGTCTGGTTAACATAAAGGGGGTGGGGGTGGGAGG  395

seq1  AGCTTAGCTGGGCAGAGTTCTCTGTTTGGCACACTCCTCCTGTTTTAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAGCTGGGCAGAGTTCTCTGTTTGGCACACTCCTCCTGTTTTAGCC  445

seq1  TGGACTGCCCAGTTCTGGCTTGCTTCAGCCAACAAACCAGGGAACAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGCCCAGTTCTGGCTTGCTTCAGCCAACAAACCAGGGAACAGCTC  495

seq1  CTGACTGCAATGACTAAACATTTGCTTCCCAGAAGAAGAGCGTGGAAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTGCAATGACTAAACATTTGCTTCCCAGAAGAAGAGCGTGGAAACT  545

seq1  AATGTGAACAACTGAGCCTGAACCTGGCACATGGCAGATGCTCCCGAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAACAACTGAGCCTGAACCTGGCACATGGCAGATGCTCCCGAAAT  595

seq1  AGTCTCTGGTGTTAAGTACCACATCTGAGATGGATTTGGGAACTGTCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTGGTGTTAAGTACCACATCTGAGATGGATTTGGGAACTGTCCCC  645

seq1  TGTGCCCCTGTGGCCTGGGGTGCCACTCCTTCCCACCAGTCCAGAGGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCCTGTGGCCTGGGGTGCCACTCCTTCCCACCAGTCCAGAGGCTA  695

seq1  TGGGTCTTGTTGGCCCGGGCAGGCAGCTATCTCTGTGACTAACACAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCTTGTTGGCCCGGGCAGGCAGCTATCTCTGTGACTAACACAAACT  745

seq1  GCTTGCTGTCTTCTCCAAGTGAATGCCTGGTTTCCTCCCTGTGCCACTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTGTCTTCTCCAAGTGAATGCCTGGTTTCCTCCCTGTGCCACTGG  795

seq1  GATGACCTTGGTGGATACCCAGCAGTGTGCCTCCATAGCAACGGAGTGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACCTTGGTGGATACCCAGCAGTGTGCCTCCATAGCAACGGAGTGGT  845

seq1  TGGCCATTGAGGAGGGTTCTCCCCCCTCAGACCCCGATGGAGGCAGAAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCATTGAGGAGGGTTCTCCCCCCTCAGACCCCGATGGAGGCAGAAAC  895

seq1  AGAGGAGACCACATCTCCATCATTGATAGTCACATTTGTCCTACAGGCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGACCACATCTCCATCATTGATAGTCACATTTGTCCTACAGGCTG  945

seq1  CATAGAGTCTTCCTTGGGCTCTGGATTCTGAATTC  985
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAGTCTTCCTTGGGCTCTGGATTCTGAATTC  980