BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-027E19
Chromosome12 (Build37)
Map Location 72,668,487 - 72,772,210
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041061, Frmd6, Actr10, Psma3, 3110056K07Rik, Arid4a, Timm9, LOC100041035, 2700049A03Rik, LOC666162, Dact1, LOC100041190
Downstream geneDaam1, LOC666213, LOC666220, Gpr135, LOC100041239, 2810055F11Rik, 1200003C05Rik, 4930403N07Rik, Rtn1, Lrrc9, 1810048J11Rik, LOC209183, LOC100041323, Dhrs7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-027E19.bB6Ng01-027E19.g
ACCDH858081DH858082
length937826
definitionDH858081|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027E19, 5' end.DH858082|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-027E19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,771,270 - 72,772,210)(72,668,487 - 72,669,313)
sequence
gaattccttcagaacagtatagaagagcatggctagattatttcagtcac
gagtgatcttaatcatactctgccctcgccccctctctgacttgaccttc
actccttgtcatctgccaccttctccatcttccctgtttaggtgatctcc
atgctccagtcttccaggtctgtcctgcagttagaatgaactgttttgaa
gtctcatggaatttcactgactggcctcaccatgtggagagcaatcccat
ggccttgtctcttacctgcagcaagtgctctacagttttttttaaattat
cttggaatgttttggtttcagaaaatatatttcataccaactggccactg
tttccactgtatttcaaagtttctctccaaggcttgaaatatcattgccc
ccagcaggaggtaaatataagagtcatcagcagggtgcctttctaaactt
tggtgagttttctatttttcagagacaactatcagggtcagagaatacag
caagtcacttccctacagattcccaatgcaacaaaacaaaattaaaatct
ccaaatgtcaggcagactgttaatcttgagacaactatacaaaagaaaat
gaggcccaagcaatgtgagaagcagaaaaacaattttgcttttctcatga
gcatatacttctttatttatggaaaatgatggattgtactttgggggaga
tagggaagtcatggagggtcaaagttggccaagtaacccctttactccgc
ctccttagagtaagcttgttccagagtcacacatgagcttgtgtgcagca
atattggcacacagagatgtttttgcttcactgacgagatactcgtccat
cagtcagaccttcagtgacaagtgtgcaaactttcactgtacacatcagg
cttcattcttttgtctataaaatgtcacactaatagg
gaattcccactcatgaggactgcaagagcaggtatcctcagggagaggtg
gctttcaattaattaagaaaatgggggaaccccaactgcaaggagaggat
gaattttaggggaaataagacactggagtaggaacttggagttcaagaga
gggtgtgtagatggtcagtttggggacaagagaggttagggtatcatgac
agtgagcagattaaaggggtggaaggttaaccctatgttagctgcctgct
acagattgagatataagacatgcatggccatcatgacagtctctgggtag
aatgtgggacttgtatgcaaacagtgggctgagcttgagactggagatag
tttcaacctagagcccaaagcttcagggctcagagcttggggagcgtggg
agtcagcaagtctcaggcctgaagcatcagcaccagctattgcagtccct
ggggagtgatgcctgtcttgatggacaggcgccatttgaggccagagccg
cacattactgagcaagatgcctggcatcaagcacaatgctaacacttcgg
ggtaacttaaagaattaaagacagaacgtggattcaaactccaggatgct
gcagccaggatccataaccagggagtgaacaggggagattttctccaagg
ttgtgtgagaacagctcaaaatgttgacaaaagctgacagtgtcccagga
agttagatgaacagaaacactcaagtcagatatttcaggccaacttacat
gaacttgagataaattagtagaatttaccctatcctatgctgcctaacac
atatggcttcccttaacacacacaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_72771270_72772210
seq2: B6Ng01-027E19.b_32_968 (reverse)

seq1  CCTATTAGTGTGTACATTTTATAGACAAAGAAGTGAAGCCTGGGTGTGTA  50
      |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| | ||||| 
seq2  CCTATTAGTGTG-ACATTTTATAGACAAAAGAATGAAGCCT-GATGTGT-  47

seq1  ACAGTGAAAGTTTGCACAGCTAGTCACTGAAGGTCTGACTGATGGACGAG  100
      |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGAAAGTTTGCACA-CTTGTCACTGAAGGTCTGACTGATGGACGAG  96

seq1  TATCTCGTCAGTGAAGC-AAAACATCTCTGTGTGCCAATATTTGCTGCAC  149
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATCTCGTCAGTGAAGCAAAAACATCTCTGTGTGCCAATA-TTGCTGCAC  145

seq1  ACAAGCTCATGTGTGACTCTGGAACAAGCTTACTCTAAGGAGGCGGAGTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCTCATGTGTGACTCTGGAACAAGCTTACTCTAAGGAGGCGGAGTA  195

seq1  AAGGGGTTACTTGGCCAACTTTGACCCTCCATGACTTCCCTATCTCCCCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGTTACTTGGCCAACTTTGACCCTCCATGACTTCCCTATCTCCCCC  245

seq1  AAAGTACAATCCATCATTTTCCATAAATAAAGAAGTATATGCTCATGAGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACAATCCATCATTTTCCATAAATAAAGAAGTATATGCTCATGAGA  295

seq1  AAAGCAAAATTGTTTTTCTGCTTCTCACATTGCTTGGGCCTCATTTTCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAAATTGTTTTTCTGCTTCTCACATTGCTTGGGCCTCATTTTCTT  345

seq1  TTGTATAGTTGTCTCAAGATTAACAGTCTGCCTGACATTTGGAGATTTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATAGTTGTCTCAAGATTAACAGTCTGCCTGACATTTGGAGATTTTA  395

seq1  ATTTTGTTTTGTTGCATTGGGAATCTGTAGGGAAGTGACTTGCTGTATTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTTTTGTTGCATTGGGAATCTGTAGGGAAGTGACTTGCTGTATTC  445

seq1  TCTGACCCTGATAGTTGTCTCTGAAAAATAGAAAACTCACCAAAGTTTAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACCCTGATAGTTGTCTCTGAAAAATAGAAAACTCACCAAAGTTTAG  495

seq1  AAAGGCACCCTGCTGATGACTCTTATATTTACCTCCTGCTGGGGGCAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCACCCTGCTGATGACTCTTATATTTACCTCCTGCTGGGGGCAATG  545

seq1  ATATTTCAAGCCTTGGAGAGAAACTTTGAAATACAGTGGAAACAGTGGCC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTCAAGCCTTGGAGAGAAACTTTGAAATACAGTGGAAACAGTGGCC  595

seq1  AGTTGGTATGAAATATATTTTCTGAAACCAAAACATTCCAAGATAATTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGTATGAAATATATTTTCTGAAACCAAAACATTCCAAGATAATTTA  645

seq1  AAAAAAACTGTAGAGCACTTGCTGCAGGTAAGAGACAAGGCCATGGGATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAACTGTAGAGCACTTGCTGCAGGTAAGAGACAAGGCCATGGGATT  695

seq1  GCTCTCCACATGGTGAGGCCAGTCAGTGAAATTCCATGAGACTTCAAAAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCACATGGTGAGGCCAGTCAGTGAAATTCCATGAGACTTCAAAAC  745

seq1  AGTTCATTCTAACTGCAGGACAGACCTGGAAGACTGGAGCATGGAGATCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATTCTAACTGCAGGACAGACCTGGAAGACTGGAGCATGGAGATCA  795

seq1  CCTAAACAGGGAAGATGGAGAAGGTGGCAGATGACAAGGAGTGAAGGTCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACAGGGAAGATGGAGAAGGTGGCAGATGACAAGGAGTGAAGGTCA  845

seq1  AGTCAGAGAGGGGGCGAGGGCAGAGTATGATTAAGATCACTCGTGACTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGAGAGGGGGCGAGGGCAGAGTATGATTAAGATCACTCGTGACTGA  895

seq1  AATAATCTAGCCATGCTCTTCTATACTGTTCTGAAGGAATTC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATCTAGCCATGCTCTTCTATACTGTTCTGAAGGAATTC  937

seq1: chr12_72668487_72669313
seq2: B6Ng01-027E19.g_70_895

seq1  GAATTCCCACTCATGAGGACTGCAAGAGCAGGTATCCTCAGGGAGAGGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCACTCATGAGGACTGCAAGAGCAGGTATCCTCAGGGAGAGGTG  50

seq1  GCTTTCAATTAATTAAGAAAATGGGGGAACCCCAACTGCAAGGAGAGGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCAATTAATTAAGAAAATGGGGGAACCCCAACTGCAAGGAGAGGAT  100

seq1  GAATTTTAGGGGAAATAAGACACTGGAGTAGGAACTTGGAGTTCAAGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTAGGGGAAATAAGACACTGGAGTAGGAACTTGGAGTTCAAGAGA  150

seq1  GGGTGTGTAGATGGTCAGTTTGGGGACAAGAGAGGTTAGGGTATCATGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTGTAGATGGTCAGTTTGGGGACAAGAGAGGTTAGGGTATCATGAC  200

seq1  AGTGAGCAGATTAAAGGGGTGGAAGGTTAACCCTATGTTAGCTGCCTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCAGATTAAAGGGGTGGAAGGTTAACCCTATGTTAGCTGCCTGCT  250

seq1  ACAGATTGAGATATAAGACATGCATGGCCATCATGACAGTCTCTGGGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATTGAGATATAAGACATGCATGGCCATCATGACAGTCTCTGGGTAG  300

seq1  AATGTGGGACTTGTATGCAAACAGTGGGCTGAGCTTGAGACTGGAGATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGGGACTTGTATGCAAACAGTGGGCTGAGCTTGAGACTGGAGATAG  350

seq1  TTTCAACCTAGAGCCCAAAGCTTCAGGGCTCAGAGCTTGGGGAGCGTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACCTAGAGCCCAAAGCTTCAGGGCTCAGAGCTTGGGGAGCGTGGG  400

seq1  AGTCAGCAAGTCTCAGGCCTGAAGCATCAGCACCAGCTATTGCAGTCCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCAAGTCTCAGGCCTGAAGCATCAGCACCAGCTATTGCAGTCCCT  450

seq1  GGGGAGTGATGCCTGTCTTGATGGACAGGCGCCATTTGAGGCCAGAGCCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGTGATGCCTGTCTTGATGGACAGGCGCCATTTGAGGCCAGAGCCG  500

seq1  CACATTACTGAGCAAGATGCCTGGCATCAAGCACAATGCTAACACTTCGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTACTGAGCAAGATGCCTGGCATCAAGCACAATGCTAACACTTCGG  550

seq1  GGTAACTTAAAGAATTAAAGACAGAACGTGGATTCAAACTCCAGGATGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACTTAAAGAATTAAAGACAGAACGTGGATTCAAACTCCAGGATGCT  600

seq1  GCAGCCAGGATCCATAACCAGGGAGTGAACAGGGGAGATTTTCTCCAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCAGGATCCATAACCAGGGAGTGAACAGGGGAGATTTTCTCCAAGG  650

seq1  TTGTGTGAGAACAGCTCAAAATGTTGACAAAAGCTGACAGTGTCCCAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGAGAACAGCTCAAAATGTTGACAAAAGCTGACAGTGTCCCAGGA  700

seq1  AGTTAGATGAACAGAAACACTCAAGTCAGATATTTCAGGCCAACTTACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGATGAACAGAAACACTCAAGTCAGATATTTCAGGCCAACTTACAT  750

seq1  GAACTTGAGATAAATTAGTAGAATTTACCCTATCCTATGCTGCCTAACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTGAGATAAATTAGTAGAATTTACCCTATCCTATGCTGCCTAACAC  800

seq1  ATATGGCTTCCCTTAAACACACACACA  827
      |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATATGGCTTCCCTT-AACACACACACA  826