BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-036I12
Chromosome12 (Build37)
Map Location 9,006,427 - 9,140,805
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWdr35, Ttc32
Upstream geneApob, 1110057K04Rik, Gdf7, Hs1bp3, BC106175, Rhob, Slc7a15, LOC100043154, Pum2, F730043H23, Sdc1, Laptm4a, Matn3
Downstream geneLOC633030, LOC100042238, Osr1, LOC382567
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-036I12.bB6Ng01-036I12.g
ACCDH864676DH864677
length1,034886
definitionDH864676|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036I12, 5' end.DH864677|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036I12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,006,427 - 9,007,463)(9,139,914 - 9,140,805)
sequence
gaattcctaaattgttttaaatgattttacatctgggcttggctgttaac
gactgcctattagtgctaaggctcatttgagggaggcattgtttcttaca
ttctctccgcactaatctttctgcctagtttgaaacttgttgcatgtgta
tgttgtatgtgtgtttgtgcatatgcatgttcacatgtgtcggcacacac
gtgtgtatgtacgttgaggtctgaagttgaagttggaggtcttcctcaat
ctcattctactttaatttattgaggctgagcctcttgctaaacttggagt
tctatctcctaaaatgttcctttggggctggagagatggcttagcagtta
agaacatgggatgctcttctagagaacttgggtctaattcagttccaggg
gatcagatgtccttttttggcctcaaggtgcaccaggtatgtacgtggtg
cacagtcatacatgcaggcaaaatacccatatacataaaaagaaataaat
ctttaacaaagtttaccttcattttcaatatgctactttaattaatattt
tgatcatgtttaacctcccaccttgccccaatgacttctacttctcactt
ccaacttttatccttctgttttgttttaataacctactgagttcaacttg
tactgtccatatactcttgggtgtgaaggtgtccactgtagagtagctca
cctaccatactaagatacctgactctccttcctacagaagccatcgacca
tcaatcatttccttaggaatgcagagtcctgggccccgccccctcccaca
ctacagtgttgattggcttggtcttgagcaggtcttaaggcaagcacagc
tgctgtgaggccatgcctgcagcggcctgccatgtccagaggacactgtt
ttactttggtccttttctgacctcttctctgatggtcctgagctttgggg
cgggactataatggagatcacatctagctggtggtgggattgattgatga
tctctggtgctgaggaactcatgaccacttattc
gaattcctcctgaagcaagactcaacaatggacatcatgatataaagttt
ctgtgcttcagcgaaaggggattctcaaggcaccctgggctgaccctcat
acctgtcccctgtggattcacgactatcatctcatctgcctgaagacaag
ctagtaaactacaacatggtgggacataaatcagccttcagtctggaact
gtgagagaccctgcacagcactgtggctcaaaaggaccacagccccgatt
agagggaccttcctgtgggggtgaccaattgggggtggggggaacacaca
aagcagaaaacagaaacagaagccctgcttggggagcatgacaggaccct
gggacatgaggaactcaacaattgggacagcaattcctaggagaaggaaa
ggtacgcggtagctgctgaccactcaggagcacatgtgcagcatatggga
tgacctagggatatttgctggcaactctgaaaaggaatcatgtctgtgga
aacagatgggagtagtttagagtccacattattactgccactgttttgtt
ttttgtttttttgttttttgtttttaacttgtttgcgcagatttgacagt
gtttagactctcataagagaaaacaacagcacagttgatgggccaggacc
tcttaaggctttagctcagcttcatgttgccttgcatttctgatcagaaa
gtgggagctgatgtttgaaaataagtgagcctgtactgcttctctaagca
tggggtggtacaggaagcgatttgctttggcaattctcagcccctcagcc
ttcgagcataagtaaattgtggctgggctgtggggacaaagtggaaggaa
tttggcaggtcctctgctgttgcctacatggcagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_9006427_9007463
seq2: B6Ng01-036I12.b_45_1078

seq1  GAATTCCTAAATTGTTTTAAATGATTTTACATCTGGGCTTGGCTGTTAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAATTGTTTTAAATGATTTTACATCTGGGCTTGGCTGTTAAC  50

seq1  GACTGCCTATTAGTGCTAAGGCTCATTTGAGGGAGGCATTGTTTCTTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCCTATTAGTGCTAAGGCTCATTTGAGGGAGGCATTGTTTCTTACA  100

seq1  TTCTCTCCGCACTAATCTTTCTGCCTAGTTTGAAACTTGTTGCATGTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCCGCACTAATCTTTCTGCCTAGTTTGAAACTTGTTGCATGTGTA  150

seq1  TGTTGTATGTGTGTTTGTGCATATGCATGTTCACATGTGTCGGCACACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTATGTGTGTTTGTGCATATGCATGTTCACATGTGTCGGCACACAC  200

seq1  GTGTGTATGTACGTTGAGGTCTGAAGTTGAAGTTGGAGGTCTTCCTCAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGTACGTTGAGGTCTGAAGTTGAAGTTGGAGGTCTTCCTCAAT  250

seq1  CTCATTCTACTTTAATTTATTGAGGCTGAGCCTCTTGCTAAACTTGGAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTCTACTTTAATTTATTGAGGCTGAGCCTCTTGCTAAACTTGGAGT  300

seq1  TCTATCTCCTAAAATGTTCCTTTGGGGCTGGAGAGATGGCTTAGCAGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTCCTAAAATGTTCCTTTGGGGCTGGAGAGATGGCTTAGCAGTTA  350

seq1  AGAACATGGGATGCTCTTCTAGAGAACTTGGGTCTAATTCAGTTCCAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATGGGATGCTCTTCTAGAGAACTTGGGTCTAATTCAGTTCCAGGG  400

seq1  GATCAGATGTCCTTTTTTGGCCTCAAGGTGCACCAGGTATGTACGTGGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGATGTCCTTTTTTGGCCTCAAGGTGCACCAGGTATGTACGTGGTG  450

seq1  CACAGTCATACATGCAGGCAAAATACCCATATACATAAAAAGAAATAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTCATACATGCAGGCAAAATACCCATATACATAAAAAGAAATAAAT  500

seq1  CTTTAACAAAGTTTACCTTCATTTTCAATATGCTACTTTAATTAATATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACAAAGTTTACCTTCATTTTCAATATGCTACTTTAATTAATATTT  550

seq1  TGATCATGTTTAACCTCCCACCTTGCCCCAATGACTTCTACTTCTCACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATGTTTAACCTCCCACCTTGCCCCAATGACTTCTACTTCTCACTT  600

seq1  CCAAC-TTTATCCTTCTGTTTTGTTTTAATAACCTACTGAGTTCAACTTG  649
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTTTTATCCTTCTGTTTTGTTTTAATAACCTACTGAGTTCAACTTG  650

seq1  TACTGTCCATATACTCTTGGGTGTGAAGGTGTCCACTGTAGAGTAGCTCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTCCATATACTCTTGGGTGTGAAGGTGTCCACTGTAGAGTAGCTCA  700

seq1  CCTACCATACTAAGATACCTGACTCTCCTTCCTACAGAAGCCATCGACCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCATACTAAGATACCTGACTCTCCTTCCTACAGAAGCCATCGACCA  750

seq1  TCAATCA-TTCCTTAGGAATGCAGAGTCCTGGGCCCCGCCCCCTCCCACA  798
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCATTTCCTTAGGAATGCAGAGTCCTGGGCCCCGCCCCCTCCCACA  800

seq1  CTACAGTGTTGATTGGCTTGGTCTTGAGCAGGTCTT-AGGCAAGCACAGC  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTACAGTGTTGATTGGCTTGGTCTTGAGCAGGTCTTAAGGCAAGCACAGC  850

seq1  TGCTGTGAGGCCATGCCTGCAGCGGGCCTGCCATGTCCAGAGGACACTGT  897
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGAGGCCATGCCTGCAGC-GGCCTGCCATGTCCAGAGGACACTGT  899

seq1  TTTACTTTGGTCCTTTTCTGACCTCTTCTCTGATGGTCCCTGAGCTTTGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTTACTTTGGTCCTTTTCTGACCTCTTCTCTGATGGT-CCTGAGCTTTGG  948

seq1  GGCGGGACTAT-ATGGAGATCACATCTAAGGCTGGTGTGTGGGATTGAAT  996
      ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||
seq2  GGCGGGACTATAATGGAGATCACATCTA--GCTGGTG-GTGGGATTG-AT  994

seq1  TGATGATCTCTTGTGGCTGAGGACTCCATGAACACTTATTC  1037
      ||||||||||| || ||||||||   ||||| |||||||||
seq2  TGATGATCTCTGGT-GCTGAGGAACTCATGACCACTTATTC  1034

seq1: chr12_9139914_9140805
seq2: B6Ng01-036I12.g_69_954 (reverse)

seq1  TACTGCCATGTAGGCAACAAGCAGAGGTACCTGCCATATCTCCTACCACT  50
      |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||
seq2  TACTGCCATGTAGGCAAC-AGCAGAGG-ACCTGCCAAAT-TCCTTCCACT  47

seq1  TGTGTCACCCACAGCCCAGCCACTACTTTACTTAATGACTCGGAGGCTGA  100
      | |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||
seq2  T-TGTC-CCCACAGCCCAGCCAC-AATTTACTT-ATG-CTCGAAGGCTGA  92

seq1  GGGGCTGGGGATTTGCCAAAGCAAATCGCTTCCCGTACCACCCCATGCTT  150
      |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGGGCT-GAGAATTGCCAAAGCAAATCGCTTCCTGTACCACCCCATGCTT  141

seq1  AGAAGAAGCAGTACAGGCTCACTTATTTTCAAACATCAGCTCCCACCTTC  200
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AG-AGAAGCAGTACAGGCTCACTTATTTTCAAACATCAGCTCCCACTTTC  190

seq1  TGATCAGGAAATGC-AGGCAACAGGAAGCTGAGCT-AAGCCTT-AGAGGT  247
      |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  TGATCA-GAAATGCAAGGCAACATGAAGCTGAGCTAAAGCCTTAAGAGGT  239

seq1  CCTGGCCCATCAACTGTGCTGTTGTTTTCTCTTATGAGAGTCT-AACACT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCTGGCCCATCAACTGTGCTGTTGTTTTCTCTTATGAGAGTCTAAACACT  289

seq1  GTCAAATCTGCGCAAACAAGTTAAAAACAAAAAAC-AAAAAACAAAAAAC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTCAAATCTGCGCAAACAAGTTAAAAACAAAAAACAAAAAAACAAAAAAC  339

seq1  AAAACAGTGGCAGTAATAATGTGGACTCTAAACTACTCCCATCTGTTTCC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGTGGCAGTAATAATGTGGACTCTAAACTACTCCCATCTGTTTCC  389

seq1  ACAGACATGATTCCTTTTCAGAGTTGCCAGCAAATATCCCTAGGTCATCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATGATTCCTTTTCAGAGTTGCCAGCAAATATCCCTAGGTCATCC  439

seq1  CATATGCTGCACATGTGCTCCTGAGTGGTCAGCAGCTACCGCGTACCTTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCTGCACATGTGCTCCTGAGTGGTCAGCAGCTACCGCGTACCTTT  489

seq1  CCTTCTCCTAGGAATTGCTGTCCCAATTGTTGAGTTCCTCATGTCCCAGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCCTAGGAATTGCTGTCCCAATTGTTGAGTTCCTCATGTCCCAGG  539

seq1  GTCCTGTCATGCTCCCCAAGCAGGGCTTCTGTTTCTGTTTTCTGCTTTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGTCATGCTCCCCAAGCAGGGCTTCTGTTTCTGTTTTCTGCTTTGT  589

seq1  GTGTTCCCCCCACCCCCAATTGGTCACCCCCACAGGAAGGTCCCTCTAAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCCCCCCACCCCCAATTGGTCACCCCCACAGGAAGGTCCCTCTAAT  639

seq1  CGGGGCTGTGGTCCTTTTGAGCCACAGTGCTGTGCAGGGTCTCTCACAGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGCTGTGGTCCTTTTGAGCCACAGTGCTGTGCAGGGTCTCTCACAGT  689

seq1  TCCAGACTGAAGGCTGATTTATGTCCCACCATGTTGTAGTTTACTAGCTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACTGAAGGCTGATTTATGTCCCACCATGTTGTAGTTTACTAGCTT  739

seq1  GTCTTCAGGCAGATGAGATGATAGTCGTGAATCCACAGGGGACAGGTATG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAGGCAGATGAGATGATAGTCGTGAATCCACAGGGGACAGGTATG  789

seq1  AGGGTCAGCCCAGGGTGCCTTGAGAATCCCCTTTCGCTGAAGCACAGAAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCAGCCCAGGGTGCCTTGAGAATCCCCTTTCGCTGAAGCACAGAAA  839

seq1  CTTTATATCATGATGTCCATTGTTGAGTCTTGCTTCAGGAGGAATTC  892
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATATCATGATGTCCATTGTTGAGTCTTGCTTCAGGAGGAATTC  886