BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-046L21
Chromosome12 (Build37)
Map Location 15,714,330 - 15,818,435
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC217409, Trib2
Upstream geneMap1lc3-ps7, LOC668492, LOC100042426
Downstream geneLOC100043268, EG432636, LOC100043273, Lpin1, Ntsr2, Greb1, E2f6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-046L21.bB6Ng01-046L21.g
ACCDH871812DH871813
length1,0561,045
definitionDH871812|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046L21, 5' end.DH871813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-046L21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,714,330 - 15,715,384)(15,817,380 - 15,818,435)
sequence
gaattcttcatggtctaaccaggaagagtaagattcctatgatcaaggcc
tgtgagcctcagcgaacagaacagggaattgagatgactactgactctct
taagccccgagggaggagattaaaagattgtctcacaggcgtaatgaatg
agaattgaatagacttacctcgcctttaaaaaaaaataatgcattaattg
ccctgtctttactgtctcgcctttctgagtcctgcaatttgcaaattaac
tattggccaattcaggctattgatgggacaatatgtactaaagggagcct
ggtctctgaacttgacttgtgagtcatgacaattacagatgactcacact
gggctcttcaaagacttccccttaaggtgccagcggaggactcaatccac
actttctccactgtaggttgatggtgaagagagggcccaaggctctagtg
agttcaccaacagagagggtctggaagggtggatatgaatgagatggcct
tatggctggcagcatcagctggttgtcagttgtcacttgatggagaggat
ccacacaagacttttttaactctggaaggaacctgagatgtgtgcctgta
accaccatgttgaaggccaagacactatgccaagattcggctgctctgat
aatttgcttgcttttagagaacttagggaccttgtttattctcagagtga
gacagtctatggactaagtaggccactgacaaaaaattttgagagccttg
agggctgctcagaacaaaagaaaacattaaatggaatcctttttccttct
tttaatgagaaccattgggacaaaggtgattacgggcatctctgaaagga
aaggaactaaaagtaaatttaatatggccttgaaaagaactgaagtgtag
ctagggcaggaaggatgactcagatacttaaagtgcattaggacctgaat
tcaactcccaagaatccatgtacaaaagctgatatggtgctttgaatgag
aaagggttcctacttgctcacaattttgagtgttaaggtttgctggagga
aataca
gaattccctcagaaggattttagggtaacacgtgcattccggactgggcc
ttgttaacaaagcgaagggcgacagaggttcctgggtgggatcgggaccc
acaaaaggttgtgatgcctaagtcagggtacttatgatacaaaagggagg
ttctttgtgcactttatctatcctattcgggtgaatggtggcctagtgag
agcggtaagcacccccaggtagggttttttttcctgcttctctcctactg
cactccaaatactgatgaggaagaagagctcactgccacagaggatggct
agaccttcttttaaatgaacctcccccacccccttattcaccccatacca
ttttcaaacagcccctcccctccctgcacattctccccctgagcaaggga
aacccgttccagccctaggtgctgccctagctgagtaactacaggctgtg
acgtgaatgaaaagctccctttccacccttcaaatctttgttgtgcgttc
gttcgtttcttaggtctgttcagaaggtattgatggtgcatttttttctt
aagcaacagtgaggtggcatttcgcaggctaactctgattcatagaaaat
cgttgcataattgattcattgagttagatatctgtggagggaagagggaa
gccagcctggctctctacagagaaggcccctgtgctaatcctagagccac
cctggggggtgggagtgaggacaacagcgatgagagtttaggcttgtttc
tgtgcctcagtttgcacagctgtaaaactaatttatcacacataggaaac
catggaagaaagccttgaaagtaaatgatttaatttgttcattcatgtat
gtcttccatgcatttttaaaaagtaaagagttgtttggtgtttttcttgg
gctcactaagttttttcttctatagttttttctgcatcatttcttctaaa
tttgtaacataaaactatagggaagaataaagtatttggcttaaatgata
gccagacggtaaaatgcttgccatacaactgtaagatctgagttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_15714330_15715384
seq2: B6Ng01-046L21.b_42_1097

seq1  GAATTCTTCATGGTCTAACCAGGAAGAGTAAGATTCCTATGATCAAGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATGGTCTAACCAGGAAGAGTAAGATTCCTATGATCAAGGCC  50

seq1  TGTGAGCCTCAGCGAACAGAACAGGGAATTGAGATGACTACTGACTCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCTCAGCGAACAGAACAGGGAATTGAGATGACTACTGACTCTCT  100

seq1  TAAGCCCCGAGGGAGGAGATTAAAAGATTGTCTCACAGGCGTAATGAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCCCGAGGGAGGAGATTAAAAGATTGTCTCACAGGCGTAATGAATG  150

seq1  AGAATTGAATAGACTTACCTCGCCTTTAAAAAAAAATAATGCATTAATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGAATAGACTTACCTCGCCTTTAAAAAAAAATAATGCATTAATTG  200

seq1  CCCTGTCTTTACTGTCTCGCCTTTCTGAGTCCTGCAATTTGCAAATTAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTCTTTACTGTCTCGCCTTTCTGAGTCCTGCAATTTGCAAATTAAC  250

seq1  TATTGGCCAATTCAGGCTATTGATGGGACAATATGTACTAAAGGGAGCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGCCAATTCAGGCTATTGATGGGACAATATGTACTAAAGGGAGCCT  300

seq1  GGTCTCTGAACTTGACTTGTGAGTCATGACAATTACAGATGACTCACACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCTGAACTTGACTTGTGAGTCATGACAATTACAGATGACTCACACT  350

seq1  GGGCTCTTCAAAGACTTCCCCTTAAGGTGCCAGCGGAGGACTCAATCCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTTCAAAGACTTCCCCTTAAGGTGCCAGCGGAGGACTCAATCCAC  400

seq1  ACTTTCTCCACTGTAGGTTGATGGTGAAGAGAGGGCCCAAGGCTCTAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTCCACTGTAGGTTGATGGTGAAGAGAGGGCCCAAGGCTCTAGTG  450

seq1  AGTTCACCAACAGAGAGGGTCTGGAAGGGTGGATATGAATGAGATGGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCACCAACAGAGAGGGTCTGGAAGGGTGGATATGAATGAGATGGCCT  500

seq1  TATGGCTGGCAGCATCAGCTGGTTGTCAGTTGTCACTTGATGGAGAGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTGGCAGCATCAGCTGGTTGTCAGTTGTCACTTGATGGAGAGGAT  550

seq1  CCACACAAGACTTTTTTAACTCTGGAAGGAACCTGAGATGTGTGCCTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAAGACTTTTTTAACTCTGGAAGGAACCTGAGATGTGTGCCTGTA  600

seq1  ACCACCATGTTGAAGGCCAAGACACTATGCCAAGATTCGGCTGCTCTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCATGTTGAAGGCCAAGACACTATGCCAAGATTCGGCTGCTCTGAT  650

seq1  AATTTGCTTGCTTTTAGAGAACTTAGGGACCTTGTTTATTCTCAGAGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGCTTGCTTTTAGAGAACTTAGGGACCTTGTTTATTCTCAGAGTGA  700

seq1  GACAGTCTATGGACTAAGTAGGCCACTGACAAAAAATTTTGAGAGCCTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTCTATGGACTAAGTAGGCCACTGACAAAAAATTTTGAGAGCCTTG  750

seq1  AGGGCTGCTCAGAACAAAAGAAAACATTAAATGGAATCCTTTTTCCTTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGCTCAGAACAAAAGAAAACATTAAATGGAATCCTTTTTCCTTCT  800

seq1  TTTAATGAGAACCATTGGGACAAAGGTGATTACGGGCATCTCTGAAAGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGAGAACCATTGGGACAAAGGTGATTACGGGCATCTCTGAAAGGA  850

seq1  AAGGAACTAAAAGTAAATTTAATATGGCCTTGAAAAGAACTGAAGGTGTA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAGGAACTAAAAGTAAATTTAATATGGCCTTGAAAAGAACTGAA-GTGTA  899

seq1  GCTAGGGCAGGAAGGATGACTCAGATACTTAAAGTGCATTAGGACCTGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGGCAGGAAGGATGACTCAGATACTTAAAGTGCATTAGGACCTGAA  949

seq1  TTCAACTCCC-AGAATCCATGTAACAAAAGCTGATATGGTGCTTTGAATG  999
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTCCCAAGAATCCATGT-ACAAAAGCTGATATGGTGCTTTGAATG  998

seq1  AGAAAGGGTTCCTACTTGCTCAC-ATTTTGAGTGTT-AGGTTTGCTGGAG  1047
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGAAAGGGTTCCTACTTGCTCACAATTTTGAGTGTTAAGGTTTGCTGGAG  1048

seq1  GAAGTACA  1055
      ||| ||||
seq2  GAAATACA  1056

seq1: chr12_15817380_15818435
seq2: B6Ng01-046L21.g_69_1113 (reverse)

seq1  CAACTCAGATCTTTACAGTTGTATGGCAAGCATTTTACTGTCTGGGCTAT  50
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
seq2  CAACTCAGATC-TTACAGTTGTATGGCAAGCATTTTACCGTCT-GGCTAT  48

seq1  CATCTAAGCCCAAATACTATTATTCTTCCCTATAGTTTCTATAGTTACAT  100
      ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| 
seq2  CATTTAAG-CCAAATACT-TTATTCTTCCCTATAGTTT-TAT-GTTACAA  94

seq1  ATTTATAGAAGAAATGGATGCAGAAAAATACTAATAGAAGGAAAAAACTA  150
      |||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| 
seq2  ATT--TAGAAGAAAT-GATGCAGAAAAA-ACT-ATAGAA-GAAAAAACTT  138

seq1  AGTGAGCCCAGGAAAAACA-CAAACAACTCTTTACTTTTTAAAAATGCAT  199
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCCCAAGAAAAACACCAAACAACTCTTTACTTTTTAAAAATGCAT  188

seq1  GGAAGACATACATGAATGAAC-AATTAATTCATTTACTATCAAGGCTTTC  248
      ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  GGAAGACATACATGAATGAACAAATTAAATCATTTACTTTCAAGGCTTTC  238

seq1  TTCCATGGTTTCCTATGTGTGATAAATTAGTTTTACAGCTGTGCAAACTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATGGTTTCCTATGTGTGATAAATTAGTTTTACAGCTGTGCAAACTG  288

seq1  AGGCACAGAAAACAAGCCTAAACTCTCATCGCTGTTGTCCTCACTCCCAC  348
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACAG-AAACAAGCCTAAACTCTCATCGCTGTTGTCCTCACTCCCAC  337

seq1  CCCCCAGGGTGGCTCTAGGATTAGCACAGGGGCCTTCTCTGTAGAGAGCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAGGGTGGCTCTAGGATTAGCACAGGGGCCTTCTCTGTAGAGAGCC  387

seq1  AGGCTGGCTTCCCTCTTCCCTCCACAGATATCTAACTCAATGAATCAATT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGCTTCCCTCTTCCCTCCACAGATATCTAACTCAATGAATCAATT  437

seq1  ATGCAACGATTTTCTATGAATCAGAGTTAGCCTGCGAAATGCCACCTCAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAACGATTTTCTATGAATCAGAGTTAGCCTGCGAAATGCCACCTCAC  487

seq1  TGTTGCTTAAGAAAAAAATGCACCATCAATACCTTCTGAACAGACCTAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTTAAGAAAAAAATGCACCATCAATACCTTCTGAACAGACCTAAG  537

seq1  AAACGAACGAACGCACAACAAAGATTTGAAGGGTGGAAAGGGAGCTTTTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGAACGAACGCACAACAAAGATTTGAAGGGTGGAAAGGGAGCTTTTC  587

seq1  ATTCACGTCACAGCCTGTAGTTACTCAGCTAGGGCAGCACCTAGGGCTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACGTCACAGCCTGTAGTTACTCAGCTAGGGCAGCACCTAGGGCTGG  637

seq1  AACGGGTTTCCCTTGCTCAGGGGGAGAATGTGCAGGGAGGGGAGGGGCTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGGTTTCCCTTGCTCAGGGGGAGAATGTGCAGGGAGGGGAGGGGCTG  687

seq1  TTTGAAAATGGTATGGGGTGAATAAGGGGGTGGGGGAGGTTCATTTAAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAATGGTATGGGGTGAATAAGGGGGTGGGGGAGGTTCATTTAAAA  737

seq1  GAAGGTCTAGCCATCCTCTGTGGCAGTGAGCTCTTCTTCCTCATCAGTAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTCTAGCCATCCTCTGTGGCAGTGAGCTCTTCTTCCTCATCAGTAT  787

seq1  TTGGAGTGCAGTAGGAGAGAAGCAGGAAAAAAAACCCTACCTGGGGGTGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGTGCAGTAGGAGAGAAGCAGGAAAAAAAACCCTACCTGGGGGTGC  837

seq1  TTACCGCTCTCACTAGGCCACCATTCACCCGAATAGGATAGATAAAGTGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCGCTCTCACTAGGCCACCATTCACCCGAATAGGATAGATAAAGTGC  887

seq1  ACAAAGAACCTCCCTTTTGTATCATAAGTACCCTGACTTAGGCATCACAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAACCTCCCTTTTGTATCATAAGTACCCTGACTTAGGCATCACAA  937

seq1  CCTTTTGTGGGTCCCGATCCCACCCAGGAACCTCTGTCGCCCTTCGCTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTGGGTCCCGATCCCACCCAGGAACCTCTGTCGCCCTTCGCTTT  987

seq1  GTTAACAAGGCCCAGTCCGGAATGCACGTGTTACCCTAAAATCCTTCTGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACAAGGCCCAGTCCGGAATGCACGTGTTACCCTAAAATCCTTCTGA  1037

seq1  GGGAATTC  1056
      ||||||||
seq2  GGGAATTC  1045