BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-053I15
Chromosome12 (Build37)
Map Location 22,910,250 - 23,042,790
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2410018L13Rik
Upstream geneEG668645, EG668646, LOC100043416, LOC668650, EG668496, LOC668653, EG432637, LOC668656, EG629133, EG668660, EG668662, LOC668664
Downstream geneLOC77114, EG668669, EG668670, LOC668680, LOC100042895, LOC100043435, EG628081, LOC100042903
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-053I15.bB6Ng01-053I15.g
ACCDH876557DH876558
length930659
definitionDH876557|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053I15, 5' end.DH876558|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053I15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,910,250 - 22,911,182)(23,042,133 - 23,042,790)
sequence
gaattctcctcctctctagggacctgggtccaggcagcataacacactca
cctggtctggctgaatgcagctccctcctctatctgatccaatagatgtc
cctccccatccagtccaggctggttccttccaaggtttcaagtgttctgg
gctgtagggctccttccctgcccacagagggcctggagacccttaaggac
accagacaggacttttcagtatcttaaggagaccagcagatttattctat
gatcccaggtgagtttgtgaggatgaagaagatggagagtagacaggcaa
gcccttcctgtgcatggctccacctcccttgttcattttctctgaccaaa
gctgctttcatgtatataccgtggtatccttacttttaatatatacattt
tgtataaagtgagaaggttcagcccctgtatttaaagcctctgactgctg
ttaaagcatggtcccctgtggcctgtgattctccccacccccaagtctgg
ctgtgctgtggtatttatatagtcatttgtctaattacacaggagataca
tgcatgcccaaggctgtggacatctgccctctgtcctgcaaacacaggta
ttcctgtgtgctctgtccttcctttccattgacctggcatattaaaatga
tcaaataaaccaaggtctgtgagtttcctgtgttgccccaagcaccctgc
tcatggttcactctccagtgagtgtgggggatgaagcagtaagtggtaga
catggggaaagtacttgaatgtatggaacagcagagaatttagtcagaga
gtattccatgccagccttttttaccactcagtgagatccacacacaacaa
ggccttggtcctcctgcttaaagccacagacctgtagacttatccccaga
catttgataatgttcaggagcacccattga
gaattctagtctccctccctcaatcagagctgaatcaagtgggctggaaa
agggcaggcctccacagggcagagggtatatcccaaacacctctgtgcca
tcaacagtttcacagactcacctactcccctctccccacccccaccccct
ctcccaatcccctcttcccaccccacgtgctcactcctaccatgtttcct
accttcattgtttgtgtccatctgcctgaagatcttgtctgttcgattct
caggcatggacttgtcctcgggcatcttcatcatggaggacaccatcttg
tatatggcctgcaaaggggcatctgtgagtgtgctctggaggacggaggg
tgggttatggtcctcgctctgctaaccaaggagcatggacagggcagatt
caggacccttctctcatcacaacaagtctcacagacaaggtgctgggcaa
agggagccaggaaagtttaagtgacgttcaagagcacaggatacagctgg
ggcgtggaagaatggagggctccttggttcagagtataggggaggttgtg
tgacaaagcatctgtctgaaaggaaaatctttgatggggagctgggaaat
cctggaggtaaggtcaaaggggaaatactttgatccctgcccaaccatgg
gtcctgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_22910250_22911182
seq2: B6Ng01-053I15.b_41_970

seq1  GAATTCTCCTCCTCTCTAGGGACCTGGGTCCAGGCAGCATAACACACTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTCCTCTCTAGGGACCTGGGTCCAGGCAGCATAACACACTCA  50

seq1  CCTGGTCTGGCTGAATGCAGCTCCCTCCTCTATCTGATCCAATAGATGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCTGGCTGAATGCAGCTCCCTCCTCTATCTGATCCAATAGATGTC  100

seq1  CCTCCCCATCCAGTCCAGGCTGGTTCCTTCCAAGGTTTCAAGTGTTCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCATCCAGTCCAGGCTGGTTCCTTCCAAGGTTTCAAGTGTTCTGG  150

seq1  GCTGTAGGGCTCCTTCCCTGCCCACAGAGGGCCTGGAGACCCTTAAGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAGGGCTCCTTCCCTGCCCACAGAGGGCCTGGAGACCCTTAAGGAC  200

seq1  ACCAGACAGGACTTTTCAGTATCTTAAGGAGACCAGCAGATTTATTCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACAGGACTTTTCAGTATCTTAAGGAGACCAGCAGATTTATTCTAT  250

seq1  GATCCCAGGTGACTTTGTGAGGATGAAGAAGATGGAGAGTAGACAGGCAA  300
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCAGGTGAGTTTGTGAGGATGAAGAAGATGGAGAGTAGACAGGCAA  300

seq1  GCCCTTCCTGTGCATGGCTCCACCTCCCTTGTTCATTTTCTCTGACCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTTCCTGTGCATGGCTCCACCTCCCTTGTTCATTTTCTCTGACCAAA  350

seq1  GCTGCTTTCATGTATATACCGTGGTATCCTTACTTTTAATATATACATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTTCATGTATATACCGTGGTATCCTTACTTTTAATATATACATTT  400

seq1  TGTATAAAGTGAGAAGGTTCAGCCCCTGTATTTAAAGCCTCTGACTGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATAAAGTGAGAAGGTTCAGCCCCTGTATTTAAAGCCTCTGACTGCTG  450

seq1  TTAAAGCATGGTCCCCTGTGGCCTGTGATTCTCCCCACCCCCAAGTCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCATGGTCCCCTGTGGCCTGTGATTCTCCCCACCCCCAAGTCTGG  500

seq1  CTGTGCTGTGGTATTTATATAGTCATTTGTCTAATTACACAGGAGATACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTGTGGTATTTATATAGTCATTTGTCTAATTACACAGGAGATACA  550

seq1  TGCATGCCCAAGGCTGTGGACATCTGCCCTCTGTCCTGCAAACACAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCCCAAGGCTGTGGACATCTGCCCTCTGTCCTGCAAACACAGGTA  600

seq1  TTCCTGTGTGCTCTGTCCTTCCTTTCCATTGACCTGGCATATTAAAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGTGTGCTCTGTCCTTCCTTTCCATTGACCTGGCATATTAAAATGA  650

seq1  TCAAATAAACCAAGGTCTGTGAGTTTCCTGTGTTGCCCCAAGCACCCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAAACCAAGGTCTGTGAGTTTCCTGTGTTGCCCCAAGCACCCTGC  700

seq1  TCATGGTTCACTCTCCAGTGAGTGT-GGGGATGAAGCAGGTAAGTGGTAG  749
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  TCATGGTTCACTCTCCAGTGAGTGTGGGGGATGAAGCA-GTAAGTGGTAG  749

seq1  ACATGGGGAAAGTACTTGAATGTATGGAACAGCAGAGAATTTAGTCAGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGGAAAGTACTTGAATGTATGGAACAGCAGAGAATTTAGTCAGAG  799

seq1  AGTATTCCATGCCAGCC-TTTTTACCACTCAGTGGGATCCACACACAACA  848
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGTATTCCATGCCAGCCTTTTTTACCACTCAGTGAGATCCACACACAACA  849

seq1  AGGCCATTGGCCCTCCTGCTTAAAGCCACAGAACCTGTAGACTTAGCCCC  898
      ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  AGGCC-TTGGTCCTCCTGCTTAAAGCCACAG-ACCTGTAGACTTATCCCC  897

seq1  AGACCATCTGAAGATGTTCAGGAAGCACCCACTGA  933
      ||| ||| |||  ||||||||| |||||||| |||
seq2  AGA-CATTTGATAATGTTCAGG-AGCACCCATTGA  930

seq1: chr12_23042133_23042790
seq2: B6Ng01-053I15.g_71_728 (reverse)

seq1  TTCAGGACCCATGGTTGGGCAGGGATCAATGTATTTCCCCTTTGACCTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TTCAGGACCCATGGTTGGGCAGGGATCAAAGTATTTCCCCTTTGACCTTA  50

seq1  CCTCCAGGATTTCCCAGCTCCCCATCAAAGATTTTCCTTTCAGACAGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGGATTTCCCAGCTCCCCATCAAAGATTTTCCTTTCAGACAGATG  100

seq1  CTTTGTCACACAACCTCCCCTCTACTCTGAACCAAGGAGCCCTCCATTCT  150
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTCACACAACCTCCCCTATACTCTGAACCAAGGAGCCCTCCATTCT  150

seq1  TCCACGCCCCAGCTGTATCCTGTGCTCTTGAACGTCACTTAAACTTTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACGCCCCAGCTGTATCCTGTGCTCTTGAACGTCACTTAAACTTTCCT  200

seq1  GGCTCCCTTTGCCCAGCACCTTGTCTGTGAGACTTGTTGTGATGAGAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCCTTTGCCCAGCACCTTGTCTGTGAGACTTGTTGTGATGAGAGAA  250

seq1  GGGTCCTGAATCTGCCCTGTCCATGCTCCTTGGTTAGCAGAGCGAGGACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCTGAATCTGCCCTGTCCATGCTCCTTGGTTAGCAGAGCGAGGACC  300

seq1  ATAACCCACCCTCCGTCCTCCAGAGCACACTCACAGATGCCCCTTTGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCCACCCTCCGTCCTCCAGAGCACACTCACAGATGCCCCTTTGCAG  350

seq1  GCCATCTACAAGATGGTGTCCTCCATGATGAAGATGCCCGAGGACAAGTC  400
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATATACAAGATGGTGTCCTCCATGATGAAGATGCCCGAGGACAAGTC  400

seq1  CATGCCTGAGAATCGAACAGACAAGATCTTCAGGCAGATGGACACAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTGAGAATCGAACAGACAAGATCTTCAGGCAGATGGACACAAACA  450

seq1  ATGAAGGTAGGAAACATGGTAGGAGTGAGCACGTGGGGTGGGAAGAGGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGTAGGAAACATGGTAGGAGTGAGCACGTGGGGTGGGAAGAGGGG  500

seq1  ATTGGGAGAGGGGGTGGGGGTGGGGAGAGGGGAGTAGGTGAGTCTGTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGAGAGGGGGTGGGGGTGGGGAGAGGGGAGTAGGTGAGTCTGTGAA  550

seq1  ACTGTTGATGGCACAGAGGTGTTTGGGATATACCCTCTGCCCTGTGGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTGATGGCACAGAGGTGTTTGGGATATACCCTCTGCCCTGTGGAGG  600

seq1  CCTGCCCTTTTCCAGCCCACTTGATTCAGCTCTGATTGAGGGAGGGAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCTTTTCCAGCCCACTTGATTCAGCTCTGATTGAGGGAGGGAGAC  650

seq1  TAGAATTC  658
      ||||||||
seq2  TAGAATTC  658