BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054E07
Chromosome12 (Build37)
Map Location 30,825,719 - 30,967,333
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSntg2
Upstream geneLOC629608, Myt1l, LOC100043496, Pxdn, Tpo
Downstream geneTmem18, LOC100043055, Acp1, Sh3yl1, LOC629656, 9030611O19Rik, LOC668781, LOC100043065, LOC100043514, EG629667, LOC100043068, Lamb1-1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054E07.bB6Ng01-054E07.g
ACCDH877058DH877059
length1,111864
definitionDH877058|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054E07, 5' end.DH877059|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,825,719 - 30,826,848)(30,966,470 - 30,967,333)
sequence
gaattcatttataggtttcaagacaacctggaaattagagtgctttggga
gatttataaaaaataaatgtgccaattttaaaaagaaagaaaataagaca
gtggcttttcttacggtgacaaataatgtcaaggtcctgctcagttggtt
gtaaaaactaagggggctgcatttccacacagcattcaattaattttctt
gtgtctgagagccctggaacagcacttcatcttgatgtctggataaaatc
actaccagtgtcccagatctacacctcagtgccatgagcttcaggtgagc
atcccgtggatggcaaggtgctttgctgccgctacaacctttctaagggc
atggggagtgaatggtgcctcacggctcatcagtgttagcacagaatgaa
ttaaagcccctgggaggatgtgcagagaagaccattcatcatcatgtgcc
cgaaggctgcccatgagctttagcttttccctaccaactctggcactgct
cttctctctccttcctatctgtgtctccctctgtatcagcctatgacttc
caacgctcataggaaagtgaatttgccgctgtccctagggtcatgcgctg
attgaatggcatgatgacaaattcactcatgttccttccaagtctgtgat
cttccaaatgacagacttgctcaaagtggtctgctttctttgaagaggtc
ctgacatcctcttcctctcctgacccacactccctcctttaattgagagg
aagctcaggctttcacttctagaaggccaatgaccttcctgctgcaagag
gttgctaggggcaattaagcattaagccaatctatcttcacgtctcaaca
ctgtaggaagctgatcccctggtgtgagataccaggacgtgagatatccc
tagtccttgagctctagaatatgcagcaggactatgatgacagatggtca
aagttcagtttgctgttcttccatgttctggagctatagcaggagtggtg
attcagccaaattcctacaggctggggaagtctgtgatcaatacacattg
gcagggttgataatgctcagctagtctccatgctttcatgaagaaaacca
agtaacagttg
gaattctgctttgctagactggatatagagaggaggtctgagagaggcag
acataaggaagggttgaagagcaagacagattttaactttgctatagaca
ggtgtgcacacaacatagtttctctggcacaaggtgctgtgacatagcac
tggtccacgtggaagagcgcagcacagaatgaatgtggtgaatcatggag
taagtgtggtacagctttcagaaagctgggtagttgactttgtctgggat
gaggcaaaggtagatcgtactctgagaggggtaggctgacttagagtgaa
gccagactgtaagatggcgaatctgctggtgggaatacagggcacaccat
tcacgtaagcactaaatcaagatctctacttcatcagatgagtaaaaagg
aaaggtgtggtaggggagaggtgagagatgtcatcttgggaaatgcaggc
agggctagattctaaagtgtctgtatttattagagcccaacggccacaac
ttcagaccaggataaatccgaggcatttttctctgactgggttacacagc
ctggagtattcgctctaggatctcaattgatgaggcagagattaaagtca
cttaaatcaatttgagtgcaatttggtgtaaatcagcttggaaagtggat
ccctgagagactgtgcagtcctttcacagtgagcatgcccttcccacact
ctgatgttcagggtgaagataaggtgcaggtccatgaacaggcctttcca
ttcagctgaagtctagctggcaggctgcttgcacttcaataaggtggcta
acccttggtttctatgctcaatgaacaccagcagctggaaagggggaaat
gccaaatgaagtcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_30825719_30826848
seq2: B6Ng01-054E07.b_45_1155

seq1  GAATTCATTTATAGGTTTCAAGACAACCTGGAAATTAGAGTGCTTTGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTATAGGTTTCAAGACAACCTGGAAATTAGAGTGCTTTGGGA  50

seq1  GATTTATAAAAAATAAATGTGCCAATTTTAAAAAGAAAGAAAATAAGACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATAAAAAATAAATGTGCCAATTTTAAAAAGAAAGAAAATAAGACA  100

seq1  GTGGCTTTTCTTACGGTGACAAATAATGTCAAGGTCCTGCTCAGTTGGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTTTTCTTACGGTGACAAATAATGTCAAGGTCCTGCTCAGTTGGTT  150

seq1  GTAAAAACTAAGGGGGCTGCATTTCCACACAGCATTCAATTAATTTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAACTAAGGGGGCTGCATTTCCACACAGCATTCAATTAATTTTCTT  200

seq1  GTGTCTGAGAGCCCTGGAACAGCACTTCATCTTGATGTCTGGATAAAATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGAGAGCCCTGGAACAGCACTTCATCTTGATGTCTGGATAAAATC  250

seq1  ACTACCAGTGTCCCAGATCTACACCTCAGTGCCATGAGCTTCAGGTGAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACCAGTGTCCCAGATCTACACCTCAGTGCCATGAGCTTCAGGTGAGC  300

seq1  ATCCCGTGGATGGCAAGGTGCTTTGCTGCCGCTACAACCTTTCTAAGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCGTGGATGGCAAGGTGCTTTGCTGCCGCTACAACCTTTCTAAGGGC  350

seq1  ATGGGGAGTGAATGGTGCCTCACGGCTCATCAGTGTTAGCACAGAATGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAGTGAATGGTGCCTCACGGCTCATCAGTGTTAGCACAGAATGAA  400

seq1  TTAAAGCCCCTGGGAGGATGTGCAGAGAAGACCATTCATCATCATGTGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCCCCTGGGAGGATGTGCAGAGAAGACCATTCATCATCATGTGCC  450

seq1  CGAAGGCTGCCCATGAGCTTTAGCTTTTCCCTACCAACTCTGGCACTGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGGCTGCCCATGAGCTTTAGCTTTTCCCTACCAACTCTGGCACTGCT  500

seq1  CTTCTCTCTCCTTCCTATCTGTGTCTCCCTCTGTATCAGCCTATGACTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTCTCCTTCCTATCTGTGTCTCCCTCTGTATCAGCCTATGACTTC  550

seq1  CAACGCTCATAGGAAAGTGAATTTGCCGCTGTCCCTAGGGTCATGCGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGCTCATAGGAAAGTGAATTTGCCGCTGTCCCTAGGGTCATGCGCTG  600

seq1  ATTGAATGGCATGATGACAAATTCACTCATGTTCCTTCCAAGTCTGTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATGGCATGATGACAAATTCACTCATGTTCCTTCCAAGTCTGTGAT  650

seq1  CTTCCAAATGACAGACTTGCTCAAAGTGGTCTGCTTTCTTTGAAGAGGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAAATGACAGACTTGCTCAAAGTGGTCTGCTTTCTTTGAAGAGGTC  700

seq1  CTGACATCCTCTTCCTCTCCTGACCCACACTCCCTCCTTTAATTGAGAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACATCCTCTTCCTCTCCTGACCCACACTCCCTCCTTTAATTGAGAGG  750

seq1  AAGCTCAGGCTTTCACTTCTAGAAGGCCAATGACCTTCCTGCTGCAAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCAGGCTTTCACTTCTAGAAGGCCAATGACCTTCCTGCTGCAAGAG  800

seq1  GTTGCTAGGGGCAATTAAGCATTAAGGCCAATCTATCTTCACGTCTCAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTAGGGGCAATTAAGCATTAA-GCCAATCTATCTTCACGTCTCAAC  849

seq1  ACTGTAGGAAGCTGATCCCCTGGTGTGAGATACCAGGACGTGAGATATCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGGAAGCTGATCCCCTGGTGTGAGATACCAGGACGTGAGATATCC  899

seq1  CTAGGTCCTTGAGCTCTAGAATATGCAGGCAGGACTATGATGAACAGATG  950
      ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  CTA-GTCCTTGAGCTCTAGAATATGCA-GCAGGACTATGATG-ACAGATG  946

seq1  GTCAAAAGTTCAGTTTGCTGTTCTTCCCATGTTCTGGAGGCTATAAGCCA  1000
      ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||
seq2  GTC-AAAGTTCAGTTTGCTGTTCTT-CCATGTTCTGGA-GCTATA--GCA  991

seq1  GGAGTGGTGATTTCAGCCCAAATTCCTACAGGCT-GGGAAGTCTGTGATC  1049
      |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGAGTGGTGA-TTCAG-CCAAATTCCTACAGGCTGGGGAAGTCTGTGATC  1039

seq1  AATACACATTGGCAGGTGTGATAATGCTCAGCTAGGTTCTTCACATGCTT  1099
      ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||    ||||| |
seq2  AATACACATTGGCAGGGTTGATAATGCTCAGCTAGTCTC----CATGC-T  1084

seq1  TTCATGGAAAGAAAACCACAGTACACAGTTG  1130
      ||||||  |||||||||| |||| |||||||
seq2  TTCATG--AAGAAAACCA-AGTA-ACAGTTG  1111

seq1: chr12_30966470_30967333
seq2: B6Ng01-054E07.g_66_928 (reverse)

seq1  GACTTCATTTGGCATTTCCCCCTTTCCAGCTGCTGGTGTTCATTGAGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCATTTGGCATTTCCCCCTTTCCAGCTGCTGGTGTTCATTGAGCAT  50

seq1  AGAAACCAAGGGTTAGCCACCTTATTGAAGTGCAAGCAGCCTGCCAGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGAAACCAAGGGTTAGCCACCTTATTGAAGTGCAAGCAGCCTGCCAG-CT  99

seq1  AGACTTCAGCTGAATGGAAAGGCCTGTTCATGGACCTGCACCTTATCTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTCAGCTGAATGGAAAGGCCTGTTCATGGACCTGCACCTTATCTTC  149

seq1  ACCCTGAACATCAGAGTGTGGGAAGGGCATGCTCACTGTGAAAGGACTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGAACATCAGAGTGTGGGAAGGGCATGCTCACTGTGAAAGGACTGC  199

seq1  ACAGTCTCTCAGGGATCCACTTTCCAAGCTGATTTACACCAAATTGCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCTCTCAGGGATCCACTTTCCAAGCTGATTTACACCAAATTGCACT  249

seq1  CAAATTGATTTAAGTGACTTTAATCTCTGCCTCATCAATTGAGATCCTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTGATTTAAGTGACTTTAATCTCTGCCTCATCAATTGAGATCCTAG  299

seq1  AGCGAATACTCCAGGCTGTGTAACCCAGTCAGAGAAAAATGCCTCGGATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAATACTCCAGGCTGTGTAACCCAGTCAGAGAAAAATGCCTCGGATT  349

seq1  TATCCTGGTCTGAAGTTGTGGCCGTTGGGCTCTAATAAATACAGACACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTGGTCTGAAGTTGTGGCCGTTGGGCTCTAATAAATACAGACACTT  399

seq1  TAGAATCTAGCCCTGCCTGCATTTCCCAAGATGACATCTCTCACCTCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATCTAGCCCTGCCTGCATTTCCCAAGATGACATCTCTCACCTCTCC  449

seq1  CCTACCACACCTTTCCTTTTTACTCATCTGATGAAGTAGAGATCTTGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCACACCTTTCCTTTTTACTCATCTGATGAAGTAGAGATCTTGATT  499

seq1  TAGTGCTTACGTGAATGGTGTGCCCTGTATTCCCACCAGCAGATTCGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCTTACGTGAATGGTGTGCCCTGTATTCCCACCAGCAGATTCGCCA  549

seq1  TCTTACAGTCTGGCTTCACTCTAAGTCAGCCTACCCCTCTCAGAGTACGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACAGTCTGGCTTCACTCTAAGTCAGCCTACCCCTCTCAGAGTACGA  599

seq1  TCTACCTTTGCCTCATCCCAGACAAAGTCAACTACCCAGCTTTCTGAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCTTTGCCTCATCCCAGACAAAGTCAACTACCCAGCTTTCTGAAAG  649

seq1  CTGTACCACACTTACTCCATGATTCACCACATTCATTCTGTGCTGCGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACCACACTTACTCCATGATTCACCACATTCATTCTGTGCTGCGCTC  699

seq1  TTCCACGTGGACCAGTGCTATGTCACAGCACCTTGTGCCAGAGAAACTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACGTGGACCAGTGCTATGTCACAGCACCTTGTGCCAGAGAAACTAT  749

seq1  GTTGTGTGCACACCTGTCTATAGCAAAGTTAAAATCTGTCTTGCTCTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTGCACACCTGTCTATAGCAAAGTTAAAATCTGTCTTGCTCTTCA  799

seq1  ACCCTTCCTTATGTCTGCCTCTCTCAGACCTCCTCTCTATATCCAGTCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTCCTTATGTCTGCCTCTCTCAGACCTCCTCTCTATATCCAGTCTA  849

seq1  GCAAAGCAGAATTC  864
      ||||||||||||||
seq2  GCAAAGCAGAATTC  863