BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056O14
Chromosome12 (Build37)
Map Location 41,926,376 - 42,067,636
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneIfrd1, EG629820, Zfp277, Dock4, LOC638487, LOC100043157, LOC100043162
Downstream geneLrrn3, Immp2l
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056O14.bB6Ng01-056O14.g
ACCDH878930DH878931
length5411,025
definitionDH878930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056O14, 5' end.DH878931|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056O14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(42,067,090 - 42,067,636)(41,926,376 - 41,927,407)
sequence
tatcatctaaggcaataaaaatgcaaatttcagaaaactctataatcaaa
ggaggatcatttcaggcaataaaccattcaacttcagaaggcttggcttt
atggcttcatatcatcgctctgaaaactttttataggaaaagtgagcatg
tctgaccagtggaggaacagatgaaaagccgttttgtcactcggatgcag
atgacttgttctgtataaatatttaaagtaaaacctcaagtggcagcctg
gtttcctctttgtaagccaggcatggtggctcacacttttgatctcagca
tttgggaggcagagacaggtggatctctgtgagtctgaagccacccaggt
ttatagagtaagactctgttttgaataataatttctctgaaaaacataaa
catatattatccaaaatattctatgttctctctcccactccagctccctc
tcccccccctctctctctctctatctatctatctctcccctccccccccc
acacacacagagggagagatggggtgggaggaggagagaga
gaattcattgtgaatttgaactgctttgagggggtagtcattaatagtat
attcttgcttgggtctaggagataaaacttttataaagggagcaaagtct
cagggcctttcaaatatggttagtgcttggtaaatgctaatgttaactaa
tcacattcctcagagatgtgtttatgatgttagctgtcttggtgtaatca
ccatcctcagagatgtgtttatgatgttagctgtcttggtgtaagtgact
ttttaagaagagctcacttttacatttttagtgaattaccagtagcactt
tactgtagatgccctggtttccatactgaaattccttctgaccttatgtt
gtgaccactcactggtttttcattctcaccagtcaatggctaatgctcgt
ttaacatcctctggctgaatttgatgccagtaattttagatcttgtcaga
aagttgaaaccccagtactcttatgaatgtattttttttaagaaagtacc
ctagtcaattttatgcacatgtagcaaaacatgtctattaaataaccaac
aaaattttagaaggaattatttactcatttttacttgagacttttacata
aagctagcactttatgcatttaaagacattaggagaatacatttcagaag
aattttggggtattacaaaacattatgctttgccagtggatcttataaat
gaaatgatatttgatgtgcagtaatattttcaaaccaatttatttcttat
agctcagccttgtgagatgagctgcattactccagtatggtagcagtcga
gaggttttatttctgtttatttgtcataataaaattttgtgtttgtatgt
aaactatatagctaagatagaacaagagtactctatccaatggtgagaca
tgaagaagatttgaacaaggtctttattatggatcagcatcggttatgga
ttaatgatgtcttcattaaaacataacatcttaatgaattaaaacattct
gctcagttatctccattctttatta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_42067090_42067636
seq2: B6Ng01-056O14.b_51_597 (reverse)

seq1  TCTCTCTCCTCCTCCCACCCCATCTCTCCCTCTGTGTGTGTGGGGGGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCCTCCTCCCACCCCATCTCTCCCTCTGTGTGTGTGGGGGGGGG  50

seq1  AGGGGAGAGATAGATAGATAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGGAGAGGGAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGAGATAGATAGATAGAGAGAGAGAGAGGGGGGGGAGAGGGAGCT  100

seq1  GGAGTGGGAGAGAGAACATAGAATATTTTGGATAATATATGTTTATGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGGAGAGAGAACATAGAATATTTTGGATAATATATGTTTATGTTT  150

seq1  TTCAGAGAAATTATTATTCAAAACAGAGTCTTACTCTATAAACCTGGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGAAATTATTATTCAAAACAGAGTCTTACTCTATAAACCTGGGTG  200

seq1  GCTTCAGACTCACAGAGATCCACCTGTCTCTGCCTCCCAAATGCTGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGACTCACAGAGATCCACCTGTCTCTGCCTCCCAAATGCTGAGAT  250

seq1  CAAAAGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTTACAAAGAGGAAACCAGGCTGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTTACAAAGAGGAAACCAGGCTGCC  300

seq1  ACTTGAGGTTTTACTTTAAATATTTATACAGAACAAGTCATCTGCATCCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAGGTTTTACTTTAAATATTTATACAGAACAAGTCATCTGCATCCG  350

seq1  AGTGACAAAACGGCTTTTCATCTGTTCCTCCACTGGTCAGACATGCTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGACAAAACGGCTTTTCATCTGTTCCTCCACTGGTCAGACATGCTCAC  400

seq1  TTTTCCTATAAAAAGTTTTCAGAGCGATGATATGAAGCCATAAAGCCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTATAAAAAGTTTTCAGAGCGATGATATGAAGCCATAAAGCCAAG  450

seq1  CCTTCTGAAGTTGAATGGTTTATTGCCTGAAATGATCCTCCTTTGATTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTGAAGTTGAATGGTTTATTGCCTGAAATGATCCTCCTTTGATTAT  500

seq1  AGAGTTTTCTGAAATTTGCATTTTTATTGCCTTAGATGATAGAATTC  547
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTTCTGAAATTTGCATTTTTATTGCCTTAGATGATAGAATTC  547

seq1: chr12_41926376_41927407
seq2: B6Ng01-056O14.g_75_1099

seq1  GAATTCATTGTGAATTTGAACTGCTTTGAGGGGGTAGTCATTAATAGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGTGAATTTGAACTGCTTTGAGGGGGTAGTCATTAATAGTAT  50

seq1  ATTCAAGCTTGGGTCTAGGAGATAAAACTTTTATAAAGGGAGCAAAGTCT  100
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTGCTTGGGTCTAGGAGATAAAACTTTTATAAAGGGAGCAAAGTCT  100

seq1  CAGGGCCTTTCAAATATGGTTAGTGCTTGGTAAATGCTAATGTTAACTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCCTTTCAAATATGGTTAGTGCTTGGTAAATGCTAATGTTAACTAA  150

seq1  TCACATTCCTCAGAGATGTGTTTATGATGTTAGCTGTCTTGGTGTAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTCCTCAGAGATGTGTTTATGATGTTAGCTGTCTTGGTGTAATCA  200

seq1  CCATCCTCAGAGATGTGTTTATGATGTTAGCTGTCTTGGTGTAAGTGACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTCAGAGATGTGTTTATGATGTTAGCTGTCTTGGTGTAAGTGACT  250

seq1  TTTTAAGAAGAGCTCACTTTTACATTTTTAGTGAATTACCAGTAGCACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAAGAGCTCACTTTTACATTTTTAGTGAATTACCAGTAGCACTT  300

seq1  TACTGTAGATGCCCTGGTTTCCATACTGAAATTCCTTCTGACCTTATGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTAGATGCCCTGGTTTCCATACTGAAATTCCTTCTGACCTTATGTT  350

seq1  GTGACCACTCACTGGTTTTTCATTCTCACCAGTCAATGGCTAATGCTCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCACTCACTGGTTTTTCATTCTCACCAGTCAATGGCTAATGCTCGT  400

seq1  TTAACATCCTCTGGCTGAATTTGATGCCAGTAATTTTAGATCTTGTCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATCCTCTGGCTGAATTTGATGCCAGTAATTTTAGATCTTGTCAGA  450

seq1  AAGTTGAAACCCCAGTACTCTTATGAATGTATTTTTTTTAAGAAAGTACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGAAACCCCAGTACTCTTATGAATGTATTTTTTTTAAGAAAGTACC  500

seq1  CTAGTCAATTTTATGCACATGTAGCAAAACATGTCTATTAAATAACCAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTCAATTTTATGCACATGTAGCAAAACATGTCTATTAAATAACCAAC  550

seq1  AAAATTTTAGAAGGAATTATTTACTCATTTTTACTTGAGACTTTTACATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTAGAAGGAATTATTTACTCATTTTTACTTGAGACTTTTACATA  600

seq1  AAGCTAGCACTTTATGCATTTAAAGACATTAGGAGAATACATTTCAGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGCACTTTATGCATTTAAAGACATTAGGAGAATACATTTCAGAAG  650

seq1  AATTTTGGGGTATTACAAAACATTATGCTTTGCCAGTGGATCTTATAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTGGGGTATTACAAAACATTATGCTTTGCCAGTGGATCTTATAAAT  700

seq1  GAAATGATATTTGATGTGCAGTAATA-TTTCAAACCAATTTATTTCTTAT  749
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGATATTTGATGTGCAGTAATATTTTCAAACCAATTTATTTCTTAT  750

seq1  AGCTCAGCCTTGTGAGATGAGCTGCATTACTCCAGTATGGTAGCAGTCGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGCCTTGTGAGATGAGCTGCATTACTCCAGTATGGTAGCAGTCGA  800

seq1  GAGGTTTTATTTCTGTTTATTTGTCATATTAGAA-TTTGTGTTTGTATGT  848
      |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||
seq2  GAGGTTTTATTTCTGTTTATTTGTCATAATAAAATTTTGTGTTTGTATGT  850

seq1  AAACTAGTATAGCTAAAGATAG-AGAAGAGTACTCTATCCAATGGTGAGA  897
      |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTA-TATAGCT-AAGATAGAACAAGAGTACTCTATCCAATGGTGAGA  898

seq1  CATGAAGTAAAGATTTGAACAAGGTCTTTATTATTGATTCAGTCATTCGG  947
      |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||
seq2  CATGAAG--AAGATTTGAACAAGGTCTTTATTATGGA-TCAG-CA-TCGG  943

seq1  TTATTGGATCAATGATGTCTTCAATAAAACATAACATCTT-ATGAATTAA  996
      ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTA-TGGATTAATGATGTCTTCATTAAAACATAACATCTTAATGAATTAA  992

seq1  AAAACATTTCTGCTCAAGTTATCT-CATCTTTTATTA  1032
      || |   |||||||| |||||||| |||  |||||||
seq2  AACA---TTCTGCTC-AGTTATCTCCATTCTTTATTA  1025