BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057A08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 96,002,286 - 96,069,177
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2610022K04Rik-ps, EG633639
Downstream geneLOC217786, LOC100039603, LOC667688, Flrt2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057A08.bB6Ng01-057A08.g
ACCDH879011DH879012
length9031,157
definitionDH879011|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057A08, 5' end.DH879012|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057A08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,002,286 - 96,002,968)(96,067,994 - 96,069,177)
sequence
gaattcatgaacggaccttcccagatatgaaagctgtgaggtgcaataag
gaccaacttggacggtatgattctggccacactagtgacaagtgtgatct
gggatagcacctgctttctgattgggtttaaggcccggccaatggaagaa
acacatgtgtggctatataaatctcttcatgaaacttgctgtgccagccg
ctaactgaaacaaatgcagattcacagccaaacattagacgaagcatgag
gagtcttctggaagagttgagggaaggaatgaggggcccagtggcaaagt
agacctacaagtagacctacagagtcaactaacctggtctcttgggtgca
cccagagactgaaccaccagccacacaacatgcaggggctggacctagga
cccctacatatttgcagctaatatacatattggtcttcatgcttgtccca
caactgagtggatcacaggttgttcctgtcaccattgaattcctggggct
cctgttctcctaactggtgtgccttgtctggccgaattgggaaaggatgt
gcctagccctccagtgacttgtgccagactgggttgctacccagaagagt
ctccctcttctaagagtagaattcaatgggtgtgtgcagggggctatgtg
agtcactgggagtcactgggaggaactggagtgtgtgattgggatgtaaa
gtgaatatataaataagttgattgaaaaaaagtaactatggtgtggctca
tataggtcttaggggtaaacctattgttaatttattaagtatatatggta
ccaaagtgtcttctagattcaggtctgagtatcctcagattagtgcagct
ttgggacctcattagagaagttgtgtgtgtggcgggctggggtggggtgg
tgg
gaattcttatgaagttatttatatttctctctccttgtcctttcctatat
acattgctactagggtaggtacacctgagaaatgctaggtttcctcaacg
tcacatggtcctcatgtttatttccattttaacacacatgttgtcattaa
tattagcaggtagacacatatcaggaattcaagcatgagcctctttgaag
gagccttacagggaaacgcaccaataaatagtcctaatctacttgtcttc
attttaaattttctttatatctttgaatattatatttccaaagttagcat
cataattctttatttcaaacagaacaataatattatctcgtcatgttcct
taagtttgaatcaaggctagtttgggcacgaatacatattaaaaagaaat
ggaggcattccttaaaacatggttagagattcccatggatttatcttcat
ttatcttttgataatataaaattatatgtatggccaatgaagtaatgacc
aatgaagccgttagtgcttagatcacagtgtcatccttgattctacaggc
tgtaaaatacattccaggaaattttggctctcatagggccttgtcttgga
aatcacaattcttagtggcatttctttgacttgagcacgggtctttgatt
cctaattatttgccctttggactccttcatagaacctctttcaacctcaa
ctgtgtgtctgtcaaaatgtatgctttctaaatacttcagattataagaa
gaggacgttttgtgccacacctcatttatttcagcctctctgctagtgag
cacacttgagtgtgggggtgacattcaagttctccatcaatatatctcaa
gatttgaccagtgaagaaagtccggcagcacagaggcagcaagaacacac
catggctcactaaggtttctggatgttctgagggttttaaggcactaaga
tacaaaagaatcacttcagcatagagcaaatcaaaacgttctgaagagtg
acaacagaaaagtttgttgtttgtgtagattttggcttcccagtgtgaaa
agaaaaacgctatgctggagatgaggcctgtgaggaagaatacgagcctc
gatacttgactgttggcgatgaatgtgaagacctgtgctttctctttctg
tatgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_96002286_96002968
seq2: B6Ng01-057A08.b_264_946

seq1  TTCACAGCCAAACATTAGACGAAGCATGAGGAGTCTTCTGGAAGAGTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCCAAACATTAGACGAAGCATGAGGAGTCTTCTGGAAGAGTTGA  50

seq1  GGGAAGGAATGAGGGGCCCAGTGGCAAAGTAGACCTACAAGTAGACCTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGAATGAGGGGCCCAGTGGCAAAGTAGACCTACAAGTAGACCTAC  100

seq1  AGAGTCAACTAACCTGGTCTCTTGGGTGCACCCAGAGACTGAACCACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAACTAACCTGGTCTCTTGGGTGCACCCAGAGACTGAACCACCAG  150

seq1  CCACACAACATGCAGGGGCTGGACCTAGGACCCCTACATATTTGCAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACAACATGCAGGGGCTGGACCTAGGACCCCTACATATTTGCAGCTA  200

seq1  ATATACATATTGGTCTTCATGCTTGTCCCACAACTGAGTGGATCACAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACATATTGGTCTTCATGCTTGTCCCACAACTGAGTGGATCACAGGT  250

seq1  TGTTCCTGTCACCATTGAATTCCTGGGGCTCCTGTTCTCCTAACTGGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTGTCACCATTGAATTCCTGGGGCTCCTGTTCTCCTAACTGGTGT  300

seq1  GCCTTGTCTGGCCGAATTGGGAAAGGATGTGCCTAGCCCTCCAGTGACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGTCTGGCCGAATTGGGAAAGGATGTGCCTAGCCCTCCAGTGACTT  350

seq1  GTGCCAGACTGGGTTGCTACCCAGAAGAGTCTCCCTCTTCTAAGAGTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAGACTGGGTTGCTACCCAGAAGAGTCTCCCTCTTCTAAGAGTAGA  400

seq1  ATTCAATGGGTGTGTGCAGGGGGCTATGTGAGTCACTGGGAGTCACTGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATGGGTGTGTGCAGGGGGCTATGTGAGTCACTGGGAGTCACTGGG  450

seq1  AGGAACTGGAGTGTGTGATTGGGATGTAAAGTGAATATATAAATAAGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACTGGAGTGTGTGATTGGGATGTAAAGTGAATATATAAATAAGTTG  500

seq1  ATTGAAAAAAAGTAACTATGGTGTGGCTCATATAGGTCTTAGGGGTAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAAAAAAAGTAACTATGGTGTGGCTCATATAGGTCTTAGGGGTAAAC  550

seq1  CTATTGTTAATTTATTAAGTATATATGGTACCAAAGTGTCTTCTAGATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGTTAATTTATTAAGTATATATGGTACCAAAGTGTCTTCTAGATTC  600

seq1  AGGTCTGAGTATCCTCAGATTAGTGCAGCTTTGGGACCTCATTAGAGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGAGTATCCTCAGATTAGTGCAGCTTTGGGACCTCATTAGAGAAG  650

seq1  TTGTGTGTGTGGCGGGCTGGGGTGGGGTGGTGG  683
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGTGTGGCGGGCTGGGGTGGGGTGGTGG  683

seq1: chr12_96067994_96069177
seq2: B6Ng01-057A08.g_69_1225 (reverse)

seq1  TCTCATAACAGAAAAGAGAGAAAAGCAACAAGGTCTTCACATTCATCTCG  50
      |||||| ||||||   |||| ||||||   |||||||||||||||  |||
seq2  TCTCAT-ACAGAA---AGAG-AAAGCA--CAGGTCTTCACATTCA--TCG  41

seq1  CCACACAGTCACAGTATCTGAGGCTCTGTATTCTTCCCTCAACAGGCCCT  100
      ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||
seq2  CCA-ACAGTCA-AGTATC-GAGGCTC-GTATTCTT-CCTC-ACAGG-CCT  84

seq1  CATCTCCAGCACTAGCTGTTTTTCTATTTCCAACAACTGTGAAGCCAATA  150
      ||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||| |||||||| |
seq2  CATCTCCAGCA-TAGC-GTTTTTCT-TTTC--AC-ACTGGGAAGCCAAAA  128

seq1  TCTACACAAACCAACAAACTTTTCTGTTTGTCACTCTTTCAGAACGTTTT  200
      |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2  TCTACACAAA-CAACAAACTTTTCTG-TTGTCACTC-TTCAGAACGTTTT  175

seq1  GATTTGCTCTATGCTGAAGTGATTCCTTTTGTATCTTAGTGCCTTAAAAC  250
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGCTCTATGCTGAAGTGATT-CTTTTGTATCTTAGTGCCTTAAAAC  224

seq1  CCTCAGAACATCCAGAAACCCTTAGTGAGCCATGGTGTGTTCTTGCTGCC  300
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGAACATCCAGAAA-CCTTAGTGAGCCATGGTGTGTTCTTGCTGCC  273

seq1  TCTGTGCTGCCGGACTTTCTTCACTGGTCAAATCTTGAGATATATTGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCTGCCGGACTTTCTTCACTGGTCAAATCTTGAGATATATTGATG  323

seq1  GAGAACTTGAATGTCACCCCCACACTCAAGTGTGCTCACTAGCAGAGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTTGAATGTCACCCCCACACTCAAGTGTGCTCACTAGCAGAGAGG  373

seq1  CTGAAATAAATGAGGTGTGGCACAAAACGTCCTCTTCTTATAATCTGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATAAATGAGGTGTGGCACAAAACGTCCTCTTCTTATAATCTGAAG  423

seq1  TATTTAGAAAGCATACATTTTGACAGACACACAGTTGAGGTTGAAAGAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGAAAGCATACATTTTGACAGACACACAGTTGAGGTTGAAAGAGG  473

seq1  TTCTATGAAGGAGTCCAAAGGGCAAATAATTAGGAATCAAAGACCCGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATGAAGGAGTCCAAAGGGCAAATAATTAGGAATCAAAGACCCGTGC  523

seq1  TCAAGTCAAAGAAATGCCACTAAGAATTGTGATTTCCAAGACAAGGCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTCAAAGAAATGCCACTAAGAATTGTGATTTCCAAGACAAGGCCCT  573

seq1  ATGAGAGCCAAAATTTCCTGGAATGTATTTTACAGCCTGTAGAATCAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGCCAAAATTTCCTGGAATGTATTTTACAGCCTGTAGAATCAAGG  623

seq1  ATGACACTGTGATCTAAGCACTAACGGCTTCATTGGTCATTACTTCATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACACTGTGATCTAAGCACTAACGGCTTCATTGGTCATTACTTCATTG  673

seq1  GCCATACATATAATTTTATATTATCAAAAGATAAATGAAGATAAATCCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATACATATAATTTTATATTATCAAAAGATAAATGAAGATAAATCCAT  723

seq1  GGGAATCTCTAACCATGTTTTAAGGAATGCCTCCATTTCTTTTTAATATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATCTCTAACCATGTTTTAAGGAATGCCTCCATTTCTTTTTAATATG  773

seq1  TATTCGTGCCCAAACTAGCCTTGATTCAAACTTAAGGAACATGACGAGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCGTGCCCAAACTAGCCTTGATTCAAACTTAAGGAACATGACGAGAT  823

seq1  AATATTATTGTTCTGTTTGAAATAAAGAATTATGATGCTAACTTTGGAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTATTGTTCTGTTTGAAATAAAGAATTATGATGCTAACTTTGGAAA  873

seq1  TATAATATTCAAAGATATAAAGAAAATTTAAAATGAAGACAAGTAGATTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATATTCAAAGATATAAAGAAAATTTAAAATGAAGACAAGTAGATTA  923

seq1  GGACTATTTATTGGTGCGTTTCCCTGTAAGGCTCCTTCAAAGAGGCTCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTATTTATTGGTGCGTTTCCCTGTAAGGCTCCTTCAAAGAGGCTCAT  973

seq1  GCTTGAATTCCTGATATGTGTCTACCTGCTAATATTAATGACAACATGTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAATTCCTGATATGTGTCTACCTGCTAATATTAATGACAACATGTG  1023

seq1  TGTTAAAATGGAAATAAACATGAGGACCATGTGACGTTGAGGAAACCTAG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAAATGGAAATAAACATGAGGACCATGTGACGTTGAGGAAACCTAG  1073

seq1  CATTTCTCAGGTGTACCTACCCTAGTAGCAATGTATATAGGAAAGGACAA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTCAGGTGTACCTACCCTAGTAGCAATGTATATAGGAAAGGACAA  1123

seq1  GGAGAGAGAAATATAAATAACTTCATAAGAATTC  1184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAGAAATATAAATAACTTCATAAGAATTC  1157