BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-062I21
Chromosome12 (Build37)
Map Location 90,153,062 - 90,277,222
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrxn3
Upstream geneLOC100039076, LOC100039087, LOC100039100, LOC100039191, LOC100039203, LOC627873, LOC100039162, LOC627881, LOC100039129, LOC636517, LOC544884, LOC100039226, LOC432715, EG667350, LOC546543, EG667388, LOC627971, LOC667395, LOC100039315, EG638008, EG666862, EG435337, LOC100039154, LOC633093, LOC667440, LOC100039383, EG266459, LOC667475, LOC620915, LOC435314, Adck1, LOC100039261, EG666915
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-062I21.bB6Ng01-062I21.g
ACCDH882913DH882914
length1,0801,145
definitionDH882913|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062I21, 5' end.DH882914|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062I21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,276,138 - 90,277,222)(90,153,062 - 90,154,213)
sequence
gaattcatattggttccatacagatttggaatcactttcctagcaacctc
aacatctacctacgcatgccctcagctcattgagtcaacaagacagaatc
tgaatgtcccataagaagctcttacctcaactagaaccaaagtctcaccc
aattgtgtgaccgtattttacccaagtcaataatgaaaactgctgagcac
agcctctgacatcatcttctcatagacaagaccacaagagctcacaaaca
gatgcccatgacagaaatagaagagaactatctacatgaagttaacaaag
aacagtctactagataatttcactttaaaatccagttgtctctgtcttcc
catgagcaaatactctcatcaagaccagactctcatgagaagaaagagag
accatcacaaggtccaacaaatctagtatcataaatggactctcttttaa
tgtttaagataccctcagatataactctctctattgcataaatgccaaca
gattaatgaaaaggaaaagcaaagtatacacacatcccagctacaaacca
acttccttaaaaatgcttacaaattctaagaaaacatgaggcatatccta
ctaacatcctaaacaatgttgaggactgagaagatagtttggtgcataat
gtgtttccagcacaagtactaggacctgagtttgagtctgaagaacctgt
gtaaatttgggagtggcaaggacacatttataatcccagtgtttctgcag
tgatataggaggctaccagaagttcattgcccagctttagcaatactact
gacatggtttcacctagccatctcttctttttgttgttttggagtttcaa
catcaatctcagatatgagccagggagataatacgggaagtacttactgc
acaagcatatataccttagtcctgtcctcagataccacataaagaagttg
ggcatggagatgcatgcttctaatcctagttggtaagagcagagacattt
ttgagttggtcacagcttaggcacagcttagccctctcagtgagttcctc
aatgagaagtctttggggggtggggggtgg
gaattctcatctacctatcggaattttctgtggatgaggccttattactg
tattaaaaatcaattccattgattcttatacacatgaatgcttaagacca
gtgctctgtagatatttattgagtgtgtgcgatcttaatgtttggcaagc
tcatgtcacctttcattttcacatcggatgtttgctttatatctaagtta
cacactactgagagacagttgagaataaaaattttgagcatgagcccttt
gaccagtccacctgtggtggaatcccagctctgttttcacctgctgcttt
agcctcttccgatgggaaaatagtgtctatcttacagggctgaaggtaga
catggataagttaactcttataaagcatccagagtactgcctataaccag
tatgtgttccaaacagtgcctgttagattatataggttcatagtttttct
attcatataaaatctttatcctctcctaagctactgttaatgtaattgac
caaggtgcttcaaatatttgtccgctttcagtgtggttaattggtcctga
tacattgcttgaaaccatcgtctttcccctctgcatttaaagctgtcatt
ttaaatctgtttttcctcggatgcctcagtccacctgaagaatgtattga
ctctccatcagcaatgtagggacagcaatggttttcaccttctactcctc
agctaactgaacctatgaatttatggccttctaggctataccttctaatc
tggtaatatttacttgattataatatgccaagaaaaagaaaatacccaaa
gctagagaaggaataggattactaaagtcatagagaagtgtctgtcaaca
cttttctaaacctcataagcctttggagatatatcaggcttggtacgcaa
tattatcatctggggatgacactagtttcttgagagacaagccttgtatt
tgatgaactctatgcaacttactcagataaagaggctcaattaatggcaa
gagaacagctttcaaaagccacgaaggagatggttcatgaaccagatgat
gaatgtaccatctcccctagttaattccctagatctcttgtgctaatgat
tccaaatagcctatgtccatctgtcccttcacgcttcgtgggaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_90276138_90277222
seq2: B6Ng01-062I21.b_48_1127 (reverse)

seq1  CCA-CCCCCACCCCCAAAAGACTTCTCATTGAGGAACTCACTGAGAGGGC  49
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCCCACCCCCCAAAGACTTCTCATTGAGGAACTCACTGAGAGGGC  50

seq1  TAAGCTGGTTGGCCTAAGCTTGTTGACCAACTCAAAAATGTCTCTGCCTC  99
      |||||||    |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TAAGCTG---TGCCTAAGCT--GTGACCAACTCAAAAATGTCTCTG-CTC  94

seq1  TTACCAACTAGGATTAGAAGCATGCATCTCCATGCCCAACTTCTTTATGT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAACTAGGATTAGAAGCATGCATCTCCATGCCCAACTTCTTTATGT  144

seq1  GGTATCTGAGGACAGGACTAAGGTATATATGCTTGTGCAGTAAGTACTTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATCTGAGGACAGGACTAAGGTATATATGCTTGTGCAGTAAGTACTTC  194

seq1  CCGTATTATCTCCCTGGCTCATATCTGAGATTGATGTTGAAACTCCAAAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTATTATCTCCCTGGCTCATATCTGAGATTGATGTTGAAACTCCAAAA  244

seq1  CAACAAAAAGAAGAGATGGCTAGGTGAAACCATGTCAGTAGTATTGCTAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAAAAGAAGAGATGGCTAGGTGAAACCATGTCAGTAGTATTGCTAA  294

seq1  AGCTGGGCAATGAACTTCTGGTAGCCTCCTATATCACTGCAGAAACACTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGCAATGAACTTCTGGTAGCCTCCTATATCACTGCAGAAACACTG  344

seq1  GGATTATAAATGTGTCCTTGCCACTCCCAAATTTACACAGGTTCTTCAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTATAAATGTGTCCTTGCCACTCCCAAATTTACACAGGTTCTTCAGA  394

seq1  CTCAAACTCAGGTCCTAGTACTTGTGCTGGAAACACATTATGCACCAAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAACTCAGGTCCTAGTACTTGTGCTGGAAACACATTATGCACCAAAC  444

seq1  TATCTTCTCAGTCCTCAACATTGTTTAGGATGTTAGTAGGATATGCCTCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCTCAGTCCTCAACATTGTTTAGGATGTTAGTAGGATATGCCTCA  494

seq1  TGTTTTCTTAGAATTTGTAAGCATTTTTAAGGAAGTTGGTTTGTAGCTGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCTTAGAATTTGTAAGCATTTTTAAGGAAGTTGGTTTGTAGCTGG  544

seq1  GATGTGTGTATACTTTGCTTTTCCTTTTCATTAATCTGTTGGCATTTATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTGTATACTTTGCTTTTCCTTTTCATTAATCTGTTGGCATTTATG  594

seq1  CAATAGAGAGAGTTATATCTGAGGGTATCTTAAACATTAAAAGAGAGTCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGAGAGAGTTATATCTGAGGGTATCTTAAACATTAAAAGAGAGTCC  644

seq1  ATTTATGATACTAGATTTGTTGGACCTTGTGATGGTCTCTCTTTCTTCTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGATACTAGATTTGTTGGACCTTGTGATGGTCTCTCTTTCTTCTC  694

seq1  ATGAGAGTCTGGTCTTGATGAGAGTATTTGCTCATGGGAAGACAGAGACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGTCTGGTCTTGATGAGAGTATTTGCTCATGGGAAGACAGAGACA  744

seq1  ACTGGATTTTAAAGTGAAATTATCTAGTAGACTGTTCTTTGTTAACTTCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGATTTTAAAGTGAAATTATCTAGTAGACTGTTCTTTGTTAACTTCA  794

seq1  TGTAGATAGTTCTCTTCTATTTCTGTCATGGGCATCTGTTTGTGAGCTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATAGTTCTCTTCTATTTCTGTCATGGGCATCTGTTTGTGAGCTCT  844

seq1  TGTGGTCTTGTCTATGAGAAGATGATGTCAGAGGCTGTGCTCAGCAGTTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCTTGTCTATGAGAAGATGATGTCAGAGGCTGTGCTCAGCAGTTT  894

seq1  TCATTATTGACTTGGGTAAAATACGGTCACACAATTGGGTGAGACTTTGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATTGACTTGGGTAAAATACGGTCACACAATTGGGTGAGACTTTGG  944

seq1  TTCTAGTTGAGGTAAGAGCTTCTTATGGGACATTCAGATTCTGTCTTGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGTTGAGGTAAGAGCTTCTTATGGGACATTCAGATTCTGTCTTGTT  994

seq1  GACTCAATGAGCTGAGGGCATGCGTAGGTAGATGTTGAGGTTGCTAGGAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAATGAGCTGAGGGCATGCGTAGGTAGATGTTGAGGTTGCTAGGAA  1044

seq1  AGTGATTCCAAATCTGTATGGAACCAATATGAATTC  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATTCCAAATCTGTATGGAACCAATATGAATTC  1080

seq1: chr12_90153062_90154213
seq2: B6Ng01-062I21.g_70_1214

seq1  GAATTCTCATCTACCTATCGGAATTTTCTGTGGATGAGGCCTTATTACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATCTACCTATCGGAATTTTCTGTGGATGAGGCCTTATTACTG  50

seq1  TATTAAAAATCAATTCCATTGATTCTTATACACATGAATGCTTAAGACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAAATCAATTCCATTGATTCTTATACACATGAATGCTTAAGACCA  100

seq1  GTGCTCTGTAGATATTTATTGAGTGTGTGCGATCTTAATGTTTGGCAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTGTAGATATTTATTGAGTGTGTGCGATCTTAATGTTTGGCAAGC  150

seq1  TCATGTCACCTTTCATTTTCACATCGGATGTTTGCTTTATATCTAAGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTCACCTTTCATTTTCACATCGGATGTTTGCTTTATATCTAAGTTA  200

seq1  CACACTACTGAGAGACAGTTGAGAATAAAAATTTTGAGCATGAGCCCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTACTGAGAGACAGTTGAGAATAAAAATTTTGAGCATGAGCCCTTT  250

seq1  GACCAGTCCACCTGTGGTGGAATCCCAGCTCTGTTTTCACCTGCTGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTCCACCTGTGGTGGAATCCCAGCTCTGTTTTCACCTGCTGCTTT  300

seq1  AGCCTCTTCCGATGGGAAAATAGTGTCTATCTTACAGGGCTGAAGGTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTTCCGATGGGAAAATAGTGTCTATCTTACAGGGCTGAAGGTAGA  350

seq1  CATGGATAAGTTAACTCTTATAAAGCATCCAGAGTACTGCCTATAACCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGATAAGTTAACTCTTATAAAGCATCCAGAGTACTGCCTATAACCAG  400

seq1  TATGTGTTCCAAACAGTGCCTGTTAGATTATATAGGTTCATAGTTTTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTTCCAAACAGTGCCTGTTAGATTATATAGGTTCATAGTTTTTCT  450

seq1  ATTCATATAAAATCTTTATCCTCTCCTAAGCTACTGTTAATGTAATTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATATAAAATCTTTATCCTCTCCTAAGCTACTGTTAATGTAATTGAC  500

seq1  CAAGGTGCTTCAAATATTTGTCCGCTTTCAGTGTGGTTAATTGGTCCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGCTTCAAATATTTGTCCGCTTTCAGTGTGGTTAATTGGTCCTGA  550

seq1  TACATTGCTTGAAACCATCGTCTTTCCCCTCTGCATTTAAAGCTGTCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTGCTTGAAACCATCGTCTTTCCCCTCTGCATTTAAAGCTGTCATT  600

seq1  TTAAATCTGTTTTTCCTCGGATGCCTCAGTCCACCTGAAGAATGTATTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCTGTTTTTCCTCGGATGCCTCAGTCCACCTGAAGAATGTATTGA  650

seq1  CTCTCCATCAGCAATGTAGGGACAGCAATGGTTTTCACCTTCTACTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCATCAGCAATGTAGGGACAGCAATGGTTTTCACCTTCTACTCCTC  700

seq1  AGCTAACTGAACCTATGAATTTATGGCCTTCTAGGCTATACCTTCTAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAACTGAACCTATGAATTTATGGCCTTCTAGGCTATACCTTCTAATC  750

seq1  TGGTAATATTTACTTGATTATAATATGCCAAGAAAAAGAAAATACCCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAATATTTACTTGATTATAATATGCCAAGAAAAAGAAAATACCCAAA  800

seq1  GCTAGAGAAGGAATAGGATTACTAAAGTCATAGAGAAGTGTCTGTCAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGAAGGAATAGGATTACTAAAGTCATAGAGAAGTGTCTGTCAACA  850

seq1  C-TTTCTAAACCTCATAAGCCTTTGGAGATATATCAGGCTTGGTACGCAA  899
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTAAACCTCATAAGCCTTTGGAGATATATCAGGCTTGGTACGCAA  900

seq1  TATTATCATCTGGGGATGACACTAGTTTCTTGAGAGACAAGCCTTTGTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATTATCATCTGGGGATGACACTAGTTTCTTGAGAGACAAGCC-TTGTAT  949

seq1  TTGATGAACTCTATGCAACTTACTCAGATAAAGAGGCTCAAATATATGGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
seq2  TTGATGAACTCTATGCAACTTACTCAGATAAAGAGGCTCAATTA-ATGGC  998

seq1  AAGAGAACAGCCTGCAAAAGGCCACGAGGGAGATGGTTCATGAACCAGAT  1049
      ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAACAGCTTTCAAAA-GCCACGAAGGAGATGGTTCATGAACCAGAT  1047

seq1  GATTGAATGTACCATCTCCCCTAGTTAATTTCCCTAGATCTCTTGTGCTA  1099
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  
seq2  GA-TGAATGTACCATCTCCCCTAGTTAA-TTCCCTAGATCTCTTGTGC--  1093

seq1  TATTGATTTTGCAAATAGCTATTGTCACATCTGCCCCTTCA-GC-TCGTG  1147
      || |||  || ||||||||   |||| |||||| ||||||| || |||||
seq2  TAATGA--TTCCAAATAGCCTATGTC-CATCTGTCCCTTCACGCTTCGTG  1140

seq1  GGAAC  1152
      |||||
seq2  GGAAC  1145