BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067H19
Chromosome12 (Build37)
Map Location 70,759,128 - 70,930,892
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSos2, LOC100040879, L2hgdh, Atp5s, Cdkl1, Map4k5
Upstream geneLOC100040696, LOC665967, LOC665973, Rps29, Ppil5, Rpl36al, Mgat2, 1110034A24Rik, 9330151L19Rik, Pole2, Klhdc1, Klhdc2, Sdccag1, Arf6, LOC100040856, LOC100040862, Gm71
Downstream geneSpg3a, EG622339, Sav1, LOC100040999, Nin, ENSMUSG00000056391, Gm804, Pygl, Trim9, Txndc1, LOC100040965, LOC100041061, Frmd6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067H19.bB6Ng01-067H19.g
ACCDH886361DH886362
length1,072857
definitionDH886361|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067H19, 5' end.DH886362|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067H19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,759,128 - 70,760,209)(70,930,033 - 70,930,892)
sequence
gaattctacatgtagttaatattttactaaaatcattatataccaccata
aatacttttaaagcaaaaaaatgtacaagtagctggcggggtagctaagt
gatgaagaacacttgttgctcttgcaaaagacaaaaattaggttcccagc
accaatatggccactcaaaactctctgtgagtccagatccagggtgtcca
acgtcctgctctagcctatttgggcattgcatgcatgtggtacacagaca
tacatgcaggcaaaacacacatacacataaaatgaagatataattcaaaa
aagttttaagtaaaaacaatttgttggtctgtattcatttttcttaaccc
ttctttaaacttttttaaattctgagaatatgtagaaagttcactactag
taaaaagtacatatttaaggctgaggagacagtttttaataaagtgcttg
tcttgcatacatgagaacctgagctccatccccacagcccatgtaaaagc
tgggcaggatggcacatgctcgcaatcacagcactgaaactgaccagtca
cttgggttcccaagccaatctgtctagactatttggtgagctttaggcca
cagagagaccctgcctcaaaaagcaagatggggagtgatgattaagactg
acctctggcatccacatgcacatgaacatacatgcacccacacaaacaca
cacacacacacatgcacgcgcacacacccatacccacctacatacccacc
catgcacaaacacataatgacaaagcatacttccataaactattagatac
aatttagaggaatcatagatatctttagtccacctaaagtatccactaga
agacagaaaactagctccgagttccagcatcgacagagacactctggaaa
gcacgcattagagacactcagaagcaggtcgcactcagccttaacaatgc
cttgtgctcctaatgccactgcgcactatggtgagctctacaggtttttc
ctaaagccacaaccataagttatcctaataatccactgttactgatatat
ttaaaaccacaccacaacagta
gaattcattgaaaatgtagacttctgggtccccgcattaggcaaatagag
ctgaggttggcaaactgtaccctgtgggtcagagctagctgctgtccatt
cattaatagtatttggtagagagatggctcagcagttaagagcacttgct
ctctgcccaccacaccccccaatgacctgggttcacttcctagcaccaca
ttaggcagcttgcaacttcctatagctccattttcagaaaagccaatgcc
ctcttctggcttctgtaagcaattgtgcacatatggtgtgtgtgtataca
tatgtgtttgtatgtgtatatatatacatgtgcatacatacacataaaat
taataaataaagtttaagttaaaaagggatattggaatggataaaaataa
aagaatgaaattttgttatggaaagattgcattaaatcaatgtcagtgtc
agtcaagatttattaggacacaaccatagcaaccactttatgtaccgttt
ataactgctttcaccttatattggtagagctgtgactgctgtatgccatc
tcaagtgcataatagttcagatctggccccttacaaaaagtttgccaccc
cctgccagcagtcttagtgaacgggatctaaagaccccggcagcttccca
cttcactgaaaggttctggagaagtgtacgtgacattgagcagtgtcact
gtctctcacctggagctcttaagctgcaggttctgacgctgtgggtcttc
caagtgttcatttgtcagcggtctcagggcctcccttgactaacaaaggg
ttaatcatgcagcacatgcatcccatggctcagaattctgagtttcattg
ttggctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_70759128_70760209
seq2: B6Ng01-067H19.b_46_1117

seq1  GAATTCTACATGTAGTTAATATTTTACTAAAATCATTATATACCACCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACATGTAGTTAATATTTTACTAAAATCATTATATACCACCATA  50

seq1  AATACTTTTAAAGCAAAAAAATGTACAAGTAGCTGGCGGGGTAGCTAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTTTAAAGCAAAAAAATGTACAAGTAGCTGGCGGGGTAGCTAAGT  100

seq1  GATGAAGAACACTTGTTGCTCTTGCAAAAGACAAAAATTAGGTTCCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGAACACTTGTTGCTCTTGCAAAAGACAAAAATTAGGTTCCCAGC  150

seq1  ACCAATATGGCCACTCAAAACTCTCTGTGAGTCCAGATCCAGGGTGTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAATATGGCCACTCAAAACTCTCTGTGAGTCCAGATCCAGGGTGTCCA  200

seq1  ACGTCCTGCTCTAGCCTATTTGGGCATTGCATGCATGTGGTACACAGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCCTGCTCTAGCCTATTTGGGCATTGCATGCATGTGGTACACAGACA  250

seq1  TACATGCAGGCAAAACACACATACACATAAAATGAAGATATAATTCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCAGGCAAAACACACATACACATAAAATGAAGATATAATTCAAAA  300

seq1  AAGTTTTAAGTAAAAACAATTTGTTGGTCTGTATTCATTTTTCTTAACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTAAGTAAAAACAATTTGTTGGTCTGTATTCATTTTTCTTAACCC  350

seq1  TTCTTTAAACTTTTTTAAATTCTGAGAATATGTAGAAAGTTCACTACTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAAACTTTTTTAAATTCTGAGAATATGTAGAAAGTTCACTACTAG  400

seq1  TAAAAAGTACATATTTAAGGCTGAGGAGACAGTTTTTAATAAAGTGCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGTACATATTTAAGGCTGAGGAGACAGTTTTTAATAAAGTGCTTG  450

seq1  TCTTGCATACATGAGAACCTGAGCTCCATCCCCACAGCCCATGTAAAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCATACATGAGAACCTGAGCTCCATCCCCACAGCCCATGTAAAAGC  500

seq1  TGGGCAGGATGGCACATGCTCGCAATCACAGCACTGAAACTGACCAGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGGATGGCACATGCTCGCAATCACAGCACTGAAACTGACCAGTCA  550

seq1  CTTGGGTTCCCAAGCCAATCTGTCTAGACTATTTGGTGAGCTTTAGGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGTTCCCAAGCCAATCTGTCTAGACTATTTGGTGAGCTTTAGGCCA  600

seq1  CAGAGAGACCCTGCCTCAAAAAGCAAGATGGGGAGTGATGATTAAGACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGACCCTGCCTCAAAAAGCAAGATGGGGAGTGATGATTAAGACTG  650

seq1  ACCTCTGGCATCCACATGCACATGAACATACATGCACCCACACAAACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGGCATCCACATGCACATGAACATACATGCACCCACACAAACACA  700

seq1  CACACACACACATGCACGCGCACACACCCATACCCACCTACATACCCACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACATGCACGCGCACACACCCATACCCACCTACATACCCACC  750

seq1  CATGCACAAACACATAATGACAAAGCATACTTCCATAAACTATTAGATAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCACAAACACATAATGACAAAGCATACTTCCATAAACTATTAGATAC  800

seq1  AATTTAGAGGAATCATAGATATCTTTAGTCCACCTAAAGTATCCACTAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAGAGGAATCATAGATATCTTTAGTCCACCTAAAGTATCCACTAGA  850

seq1  AGACAGAAAACTAGCTCCGAGTTCCAGCAATCGACAGAGACACTCTGGAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAAAACTAGCTCCGAGTTCCAGC-ATCGACAGAGACACTCTGGAA  899

seq1  AGCACGCATTAGAGACACTCAGAAGCAGGTCGCACTCAGCCTTAACAATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACGCATTAGAGACACTCAGAAGCAGGTCGCACTCAGCCTTAACAATG  949

seq1  CCTTGTGCTCCTAATGCCACTGCGCAACTATGGTGAGCTCCTACAGGTTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||
seq2  CCTTGTGCTCCTAATGCCACTGCGC-ACTATGGTGAGCT-CTACAGG-TT  996

seq1  TTTCCTAAAGCCACAACCAATAAGTTATCCTAATAATCCACTGTTACTGA  1050
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTCCTAAAGCCACAACC-ATAAGTTATCCTAATAATCCACTGTTACTG-  1044

seq1  ATATATTTAAAAAACCACACACACATACAGTA  1082
      ||||||||  |||||||||| |||| ||||||
seq2  ATATATTT--AAAACCACAC-CACA-ACAGTA  1072

seq1: chr12_70930033_70930892
seq2: B6Ng01-067H19.g_72_928 (reverse)

seq1  CAGCCAACAATGAAACTCAGAATTCTGGAGCCCATGGATGCATGTGCCTG  50
      |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||
seq2  CAGCCAACAATGAAACTCAGAATTCT-GAGCCATGGGATGCATGTG-CTG  48

seq1  CATGATTAACCCTTTGTTAGTCAAGGGAGGCCCCTGAGACCGCTGACAAA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CATGATTAACCCTTTGTTAGTCAAGGGAGG-CCCTGAGACCGCTGACAAA  97

seq1  TGAACACTTGGAAGACCCACAGCGTCAGAACCTGCAGCTTAAGAGCTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACACTTGGAAGACCCACAGCGTCAGAACCTGCAGCTTAAGAGCTCCA  147

seq1  GGTGAGAGACAGTGACACTGCTCAATGTCACGTACACTTCTCCAGAACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAGACAGTGACACTGCTCAATGTCACGTACACTTCTCCAGAACCT  197

seq1  TTCAGTGAAGTGGGAAGCTGCCGGGGTCTTTAGATCCCGTTCACTAAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTGAAGTGGGAAGCTGCCGGGGTCTTTAGATCCCGTTCACTAAGAC  247

seq1  TGCTGGCAGGGGGTGGCAAACTTTTTGTAAGGGGCCAGATCTGAACTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCAGGGGGTGGCAAACTTTTTGTAAGGGGCCAGATCTGAACTATT  297

seq1  ATGCACTTGAGATGGCATACAGCAGTCACAGCTCTACCAATATAAGGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACTTGAGATGGCATACAGCAGTCACAGCTCTACCAATATAAGGTGA  347

seq1  AAGCAGTTATAAACGGTACATAAAGTGGTTGCTATGGTTGTGTCCTAATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGTTATAAACGGTACATAAAGTGGTTGCTATGGTTGTGTCCTAATA  397

seq1  AATCTTGACTGACACTGACATTGATTTAATGCAATCTTTCCATAACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTGACTGACACTGACATTGATTTAATGCAATCTTTCCATAACAAAA  447

seq1  TTTCATTCTTTTATTTTTATCCATTCCAATATCCCTTTTTAACTTAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTCTTTTATTTTTATCCATTCCAATATCCCTTTTTAACTTAAACT  497

seq1  TTATTTATTAATTTTATGTGTATGTATGCACATGTATATATATACACATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATTAATTTTATGTGTATGTATGCACATGTATATATATACACATA  547

seq1  CAAACACATATGTATACACACACACCATATGTGCACAATTGCTTACAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACATATGTATACACACACACCATATGTGCACAATTGCTTACAGAA  597

seq1  GCCAGAAGAGGGCATTGGCTTTTCTGAAAATGGAGCTATAGGAAGTTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAAGAGGGCATTGGCTTTTCTGAAAATGGAGCTATAGGAAGTTGCA  647

seq1  AGCTGCCTAATGTGGTGCTAGGAAGTGAACCCAGGTCATTGGGGGGTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCTAATGTGGTGCTAGGAAGTGAACCCAGGTCATTGGGGGGTGTG  697

seq1  GTGGGCAGAGAGCAAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCTACCAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCAGAGAGCAAGTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCTACCAAAT  747

seq1  ACTATTAATGAATGGACAGCAGCTAGCTCTGACCCACAGGGTACAGTTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTAATGAATGGACAGCAGCTAGCTCTGACCCACAGGGTACAGTTTG  797

seq1  CCAACCTCAGCTCTATTTGCCTAATGCGGGGACCCAGAAGTCTACATTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTCAGCTCTATTTGCCTAATGCGGGGACCCAGAAGTCTACATTTT  847

seq1  CAATGAATTC  860
      ||||||||||
seq2  CAATGAATTC  857