BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075O08
Chromosome12 (Build37)
Map Location 105,202,649 - 105,362,347
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpina11, Serpina9, Serpina12, Serpina4-ps1, Serpina5, Serpina3a
Upstream gene9030205A07Rik, LOC667269, Prima1, EG544888, Asb2, Otub2, Ddx24, D12Ertd647e, Ifi27, 1810023F06Rik, 8430415E04Rik, Serpina10, Serpina6, Gm46, Serpina1f, EG435316, Serpina1b, Serpina1d, LOC667951, LOC628801, Serpina1a, LOC667954, Serpina1c, Serpina1e
Downstream geneSerpina3b, Serpina3c, LOC435318, LOC628883, Serpina3f, LOC667997, Serpina3g, Serpina3h, EG628900, EG238395, Serpina3k, EG628916, Serpina3m, Serpina3n, Gsc, Dicer1, Clmn, 4831426I19Rik, Snhg10, Glrx5, LOC100040301
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075O08.bB6Ng01-075O08.g
ACCDH892325DH892326
length1,0551,007
definitionDH892325|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075O08, 5' end.DH892326|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075O08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(105,361,262 - 105,362,347)(105,202,649 - 105,203,670)
sequence
gaattcccctgttctggtatctcatgtctctgggtcacatgacacaggcc
ctactgtgtctgacttctttccctgtgagcatgttggcaggctcacacac
agggcagcagaaaatggcacctccctcatttgtctaatgcagtaatagtg
tgtggcctgagcaagctctgctcatccatgcatctgttggggaacccttg
agtcacaagccctttgccaactatgaagaagcatggtggacgctggctgc
agtgcctgtcatgtccttgcttcctgttcctctgagtacctgcctagagt
gcaattgctgcatcaacgtttcctaagacactgcaccattctccattcat
tctgctgtccaggaaggcttggaattctagccctgcaaccacacatcact
tagattgacaaggtcttgtcatatgcctgcatttggaattagtttctgag
atgtagctgcagggcttgagatagtgtgaaggtggaagtggcagtcagga
cattaatggttattatagttactgctggtattattactccctatcccata
gtgcagcatggcagacattctcatgaatacttaatcattgtgtattcatg
agacattagcaatgacctctgtcagatagtttggttaaaacctcaaggtg
actatatgtctgagtttcattagacccagtgtatcattggcagaagcaag
gaagaaagagcacatgtcatgtgtgagaccccacccctcagctaattcaa
ttgttaaatgttaaggaatgaatgctcagcatgtagaaaccactgagtca
tgcaggaagctcccaggcattgaaccgcagtgaacagcaatgtttccagg
ctcctatctttcccctccacaatctgtcacctctattgcacaccaggtct
ccctctttagagacttcttcaccaaggcaatatctggttggcaggaggca
tgcaaaacctcagccctcaagaaatgagaagtaaagcctgatatctatgt
tatagactctcttattagatggactctatgtcagccacaggttcagatcc
actgc
gaattctaggctagcctggtctaaatattgagaccctgtctcaagcatca
gccaccaaaaaggtgaggaaaaaaacagagaaattcataacactgtaaag
ggtaagggtatagatacatgtgcacatacacacacacacacacacacaca
cacacacacacagtatatgtatagaagatttcagaaggagacaaagtggt
gattatcccagaacacaaacttaccagcgagagccgctaagactttgttc
tttatcttctcatacattgcttatgtttctacaagaacagcatgcctctg
taagaaaggcctttacttcattttgacttaatcaaatggatgctgcattg
gaatgtgtggttgtttctttcatggtccttagatggcgcctttctgtggt
cctactaactcctgcctgggaacacagcctgaggaagcagactgttgccc
agcagactctgctggaactgggcttagatcttgtgtagttgcttcctggt
gtgagaacttaggataatatgtttatcttcctgcagcttctaccaggaac
atctccaggacattcagcacagcctgggagttggcaaggcttggcttttg
gaaattaacctgttgaccatctttcttgtggagagaccttggagaatgca
gtatttttatgtctaaagtcatgttttagatgcaaaggcaatgtctggag
atccatgcctggaagctttgcttccctgtaaagcatttgggtcattagcc
acctgtagcaggacacctggggtaggacacctgggcaggacacctggggc
aggacacctgggataggacatctggggtaggacatctggggcaggacacc
tggggtaggcacctggggcagacacctggggagacacctggggtagacat
ctgggcaggacactgggcagacactatggatattgtgactgtctcttgag
atgcaacctccctctcttaggacagtctctgaacagatcctgatgtggtt
cttcaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr12_105361262_105362347
seq2: B6Ng01-075O08.b_47_1097 (reverse)

seq1  TGGATCTGAACAAATCTCATGCTGTTCATGCAGTGGGTCTGGAACTTGTG  50
                                       ||| ||| |||| ||||
seq2  ---------------------------------TGGATCT-GAACCTGTG  16

seq1  GCTGACATAGAGTCCATCTAATAAGAGAGTCTATAACATAGATATCAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACATAGAGTCCATCTAATAAGAGAGTCTATAACATAGATATCAGGC  66

seq1  TTTACTTCTCATTTCTTGAGGGCTGAGGTTTTTGCATGCCTCCTGCCAAC  150
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTCTCATTTCTTGAGGGCTGAGG-TTTTGCATGCCTCCTGCCAAC  115

seq1  CAGATATTGCCTTGGTGAAGAAGTCTCTAAAGAGGGAGACCTGGTGTGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATTGCCTTGGTGAAGAAGTCTCTAAAGAGGGAGACCTGGTGTGCA  165

seq1  ATAGAGGTGACAGATTGTGGAGGGGAAAGATAGGAGCCTGGAAACATTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGTGACAGATTGTGGAGGGGAAAGATAGGAGCCTGGAAACATTGC  215

seq1  TGTTCACTGCGGTTCAATGCCTGGGAGCTTCCTGCATGACTCAGTGGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCACTGCGGTTCAATGCCTGGGAGCTTCCTGCATGACTCAGTGGTTT  265

seq1  CTACATGCTGAGCATTCATTCCTTAACATTTAACAATTGAATTAGCTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATGCTGAGCATTCATTCCTTAACATTTAACAATTGAATTAGCTGAG  315

seq1  GGGTGGGGTCTCACACATGACATGTGCTCTTTCTTCCTTGCTTCTGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGGGTCTCACACATGACATGTGCTCTTTCTTCCTTGCTTCTGCCAA  365

seq1  TGATACACTGGGTCTAATGAAACTCAGACATATAGTCACCTTGAGGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACACTGGGTCTAATGAAACTCAGACATATAGTCACCTTGAGGTTTT  415

seq1  AACCAAACTATCTGACAGAGGTCATTGCTAATGTCTCATGAATACACAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAACTATCTGACAGAGGTCATTGCTAATGTCTCATGAATACACAAT  465

seq1  GATTAAGTATTCATGAGAATGTCTGCCATGCTGCACTATGGGATAGGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAGTATTCATGAGAATGTCTGCCATGCTGCACTATGGGATAGGGAG  515

seq1  TAATAATACCAGCAGTAACTATAATAACCATTAATGTCCTGACTGCCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATACCAGCAGTAACTATAATAACCATTAATGTCCTGACTGCCACT  565

seq1  TCCACCTTCACACTATCTCAAGCCCTGCAGCTACATCTCAGAAACTAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTTCACACTATCTCAAGCCCTGCAGCTACATCTCAGAAACTAATT  615

seq1  CCAAATGCAGGCATATGACAAGACCTTGTCAATCTAAGTGATGTGTGGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATGCAGGCATATGACAAGACCTTGTCAATCTAAGTGATGTGTGGTT  665

seq1  GCAGGGCTAGAATTCCAAGCCTTCCTGGACAGCAGAATGAATGGAGAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGGCTAGAATTCCAAGCCTTCCTGGACAGCAGAATGAATGGAGAATG  715

seq1  GTGCAGTGTCTTAGGAAACGTTGATGCAGCAATTGCACTCTAGGCAGGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGTGTCTTAGGAAACGTTGATGCAGCAATTGCACTCTAGGCAGGTA  765

seq1  CTCAGAGGAACAGGAAGCAAGGACATGACAGGCACTGCAGCCAGCGTCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGAACAGGAAGCAAGGACATGACAGGCACTGCAGCCAGCGTCCA  815

seq1  CCATGCTTCTTCATAGTTGGCAAAGGGCTTGTGACTCAAGGGTTCCCCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTTCTTCATAGTTGGCAAAGGGCTTGTGACTCAAGGGTTCCCCAA  865

seq1  CAGATGCATGGATGAGCAGAGCTTGCTCAGGCCACACACTATTACTGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCATGGATGAGCAGAGCTTGCTCAGGCCACACACTATTACTGCAT  915

seq1  TAGACAAATGAGGGAGGTGCCATTTTCTGCTGCCCTGTGTGTGAGCCTGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAAATGAGGGAGGTGCCATTTTCTGCTGCCCTGTGTGTGAGCCTGC  965

seq1  CAACATGCTCACAGGGAAAGAAGTCAGACACAGTAGGGCCTGTGTCATGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGCTCACAGGGAAAGAAGTCAGACACAGTAGGGCCTGTGTCATGT  1015

seq1  GACCCAGAGACATGAGATACCAGAACAGGGGAATTC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAGAGACATGAGATACCAGAACAGGGGAATTC  1051

seq1: chr12_105202649_105203670
seq2: B6Ng01-075O08.g_71_1077

seq1  GAATTCTAGGCTAGCCTGGTCTAAATATTGAGACCCTGTCTCAAGCATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGCTAGCCTGGTCTAAATATTGAGACCCTGTCTCAAGCATCA  50

seq1  GCCACCAAAAAGGTGAGGAAAAAAACAGAGAAATTCATAACACTGTAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCAAAAAGGTGAGGAAAAAAACAGAGAAATTCATAACACTGTAAAG  100

seq1  GGTAAGGGTATAGATACATGTGCACATACACACACACACACACACACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGGGTATAGATACATGTGCACATACACACACACACACACACACACA  150

seq1  CACACACACACAGTATATGTATAGAAGATTTCAGAAGGAGACAAAGTGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACAGTATATGTATAGAAGATTTCAGAAGGAGACAAAGTGGT  200

seq1  GATTATCCCAGAACACAAACTTACCAGCGAGAGCCGCTAAGACTTTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATCCCAGAACACAAACTTACCAGCGAGAGCCGCTAAGACTTTGTTC  250

seq1  TTTATCTTCTCATACATTGCTTATGTTTCTACAAGAACAGCATGCCTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTTCTCATACATTGCTTATGTTTCTACAAGAACAGCATGCCTCTG  300

seq1  TAAGAAAGGCCTTTACTTCATTTTGACTTAATCAAATGGATGCTGCATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAGGCCTTTACTTCATTTTGACTTAATCAAATGGATGCTGCATTG  350

seq1  GAATGTGTGGTTGTTTCTTTCATGGTCCTTAGATGGCGCCTTTCTGTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGTGGTTGTTTCTTTCATGGTCCTTAGATGGCGCCTTTCTGTGGT  400

seq1  CCTACTAACTCCTGCCTGGGAACACAGCCTGAGGAAGCAGACTGTTGCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTAACTCCTGCCTGGGAACACAGCCTGAGGAAGCAGACTGTTGCCC  450

seq1  AGCAGACTCTGCTGGAACTGGGCTTAGATCTTGTGTAGTTGCTTCCTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACTCTGCTGGAACTGGGCTTAGATCTTGTGTAGTTGCTTCCTGGT  500

seq1  GTGAGAACTTAGGATAATATGTTTATCTTCCTGCAGCTTCTACCAGGAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAACTTAGGATAATATGTTTATCTTCCTGCAGCTTCTACCAGGAAC  550

seq1  ATCTCCAGGACATTCAGCACAGCCTGGGAGTTGGCAAGGCTTGGCTTTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCAGGACATTCAGCACAGCCTGGGAGTTGGCAAGGCTTGGCTTTTG  600

seq1  GAAATTAACCTGTTGACCATC-TTCTTGTGGAGAGACCTTGGAGAATGCA  649
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAACCTGTTGACCATCTTTCTTGTGGAGAGACCTTGGAGAATGCA  650

seq1  GTATTTTTATGTCTAAAGTCATGTTTTAGATGCAAAGGCAATGTCTGGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTTATGTCTAAAGTCATGTTTTAGATGCAAAGGCAATGTCTGGAG  700

seq1  ATCCATGCCTGGAAGCTTTGCTTCCCTGTAAAGCATTTGGGTCATTAGCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATGCCTGGAAGCTTTGCTTCCCTGTAAAGCATTTGGGTCATTAGCC  750

seq1  ACCTGTAGCAGGACACCTGGGGTAGGACACCTGGGGCAGGACACCTGGGG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACCTGTAGCAGGACACCTGGGGTAGGACACCT-GGGCAGGACACCTGGGG  799

seq1  CAGGACACCTGGGATAGGACATCTGGGGTAGGACATCTGGGGCAGGACAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACACCTGGGATAGGACATCTGGGGTAGGACATCTGGGGCAGGACAC  849

seq1  CTGGGGTAGGTCACCTGGGGCAGGACACCTGGGGGAAGACACCTGGGGTA  899
      |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||
seq2  CTGGGGTAGG-CACCTGGGGCA-GACACCTGGGG--AGACACCTGGGGTA  895

seq1  GGACATCTGGGGCAGGACACCTGGGGCAGGACACTATGGATATTGTGACT  949
       ||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  -GACATCT-GGGCAGGACAC--TGGGCA-GACACTATGGATATTGTGAC-  939

seq1  TGTCTCTTTGAGGATTGCAAACCTCCCTCTCTTAGGACAGT-TCTGAAAC  998
      |||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TGTCTC-TTGAG--ATGC-AACCTCCCTCTCTTAGGACAGTCTCTG-AAC  984

seq1  AGTATCCTGATGTGTTTCTCCAGA  1022
      || ||||||||||| |||| ||||
seq2  AG-ATCCTGATGTGGTTCTTCAGA  1007